Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488872
• Subject: NM_019827.7
• Aligned Length: 1300
• Identities: 1169
• Gaps: 40

Alignment

Query    1  ATGTCAGGGCGGCCCAGAACCACCTCCTTTGCGGAGAGCTGCAAGCCGGTGCAGCAGCCTTCAGCTTTTGGCAG  74
            |||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct    1  ATGTCGGGGCGACCGAGAACCACCTCCTTTGCGGAGAGCTGCAAGCCAGTGCAGCAGCCTTCAGCTTTTGGTAG  74

Query   75  CATGAAAGTTAGCAGAGACAAGGACGGCAGCAAGGTGACAACAGTGGTGGCAACTCCTGGGCAGGGTCCAGACA  148
            ||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct   75  CATGAAAGTTAGCAGAGATAAAGATGGCAGCAAGGTAACCACAGTAGTGGCAACTCCTGGCCAGGGTCCTGACA  148

Query  149  GGCCACAAGAAGTCAGCTATACAGACACTAAAGTGATTGGAAATGGATCATTTGGTGTGGTATATCAAGCCAAA  222
            |||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGCCACAGGAAGTCAGTTATACAGACACGAAAGTGATTGGAAATGGATCATTTGGTGTGGTATATCAAGCCAAA  222

Query  223  CTTTGTGATTCAGGAGAACTGGTCGCCATCAAGAAAGTATTGCAGGACAAGAGATTTAAGAATCGAGAGCTCCA  296
            |||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||..|.|||||||||.||||||||||.|||||||||||
Sbjct  223  CTTTGTGATTCTGGAGAACTGGTTGCCATCAAGAAAGTTCTACAGGACAAGCGATTTAAGAACCGAGAGCTCCA  296

Query  297  GATCATGAGAAAGCTAGATCACTGTAACATAGTCCGATTGCGTTATTTCTTCTACTCCAGTGGTGAGAAGAAAG  370
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  297  GATCATGAGAAAGCTAGACCACTGTAACATAGTCCGACTGCGGTATTTCTTCTACTCGAGTGGTGAGAAGAAAG  370

Query  371  ATGAGGTCTATCTTAATCTGGTGCTGGACTATGTTCCGGAAACAGTATACAGAGTTGCCAGACACTATAGTCGA  444
            ||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATGAGGTCTACCTTAACCTGGTGCTGGACTATGTTCCGGAGACAGTGTACAGAGTCGCCAGACACTATAGTCGA  444

Query  445  GCCAAACAGACGCTCCCTGTGATTTATGTCAAGTTGTATATGTATCAGCTGTTCCGAAGTTTAGCCTATATCCA  518
            |||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  445  GCCAAGCAGACACTCCCTGTGATCTATGTCAAGTTGTATATGTATCAGCTGTTCAGAAGTCTAGCCTATATCCA  518

Query  519  TTCCTTTGGAATCTGCCATCGGGATATTAAACCGCAGAACCTCTTGTTGGATCCTGATACTGCTGTATTAAAAC  592
            |||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  519  TTCCTTTGGAATCTGCCATCGAGACATTAAACCACAGAACCTCTTGTTGGATCCTGATACAGCTGTATTAAAAC  592

Query  593  TCTGTGACTTTGGAAGTGCAAAGCAGCTGGTCCGAGGAGAACCCAATGTTTCGTATATCTGTTCTCGGTACTAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  593  TCTGTGACTTTGGAAGTGCAAAGCAGCTGGTCCGAGGAGAGCCCAATGTTTCATATATCTGTTCTCGGTACTAC  666

Query  667  AGGGCACCAGAGTTGATCTTTGGAGCCACTGATTATACCTCTAGTATAGATGTATGGTCTGCTGGCTGTGTGTT  740
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  667  AGGGCACCAGAGTTGATCTTTGGAGCCACTGATTACACGTCCAGTATAGATGTATGGTCTGCAGGCTGTGTGTT  740

Query  741  GGCTGAGCTGTTACTAGGACAACCAATATTTCCAGGGGATAGTGGTGTGGATCAGTTGGTAGAAATAATCAAGG  814
            ||||||..||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct  741  GGCTGAATTGTTGCTAGGACAACCAATATTTCCTGGGGACAGTGGTGTGGATCAGTTGGTGGAAATAATAAAGG  814

Query  815  TCCTGGGAACTCCAACAAGGGAGCAAATCAGAGAAATGAACCCAAACTACACAGAATTTAAATTCCCTCAAATT  888
            ||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  815  TCCTAGGAACACCAACAAGGGAGCAAATTAGAGAAATGAACCCAAATTATACAGAATTCAAATTCCCTCAAATC  888

Query  889  AAGGCACATCCTTGGACTAAGGATTCGTCAGGAACAGGACATTTCACCTCAGGAGTGCGGGTCTTCCGACCCCG  962
            |||||||||||||||||.||                                       |||||||||.|||||
Sbjct  889  AAGGCACATCCTTGGACAAA---------------------------------------GGTCTTCCGGCCCCG  923

Query  963  AACTCCACCGGAGGCAATTGCACTGTGTAGCCGTCTGCTGGAGTATACACCAACTGCCCGACTAACACCACTGG  1036
            |||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  924  AACTCCACCAGAGGCAATTGCACTGTGCAGCCGTCTGCTGGAGTACACACCTACCGCCCGGCTAACACCACTGG  997

Query 1037  AAGCTTGTGCACATTCATTTTTTGATGAATTACGGGACCCAAATGTCAAACTACCAAATGGGCGAGACACACCT  1110
            ||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  998  AAGCTTGTGCACATTCATTTTTCGATGAATTGCGGGACCCAAATGTCAAACTACCAAATGGGCGAGACACACCT  1071

Query 1111  GCACTCTTCAACTTCACCACTCAAGAACTGTCAAGTAATCCACCTCTGGCTACCATCCTTATTCCTCCTCATGC  1184
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1072  GCACTCTTCAACTTTACCACTCAAGAACTGTCAAGTAACCCCCCTCTGGCCACCATCCTTATCCCTCCACATGC  1145

Query 1185  TCGGATTCAAGCAGCTGCTTCAACCCCCACAAATGCCACAGCAGCGTCAGATGCTAATACTGGAGACCGTGGAC  1258
            |||||||||.||.|||||||||.|.||..|.||.|||||||||||.||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1146  TCGGATTCAGGCCGCTGCTTCACCGCCTGCCAACGCCACAGCAGCCTCAGATACTAATGCTGGAGACCGTGGAC  1219

Query 1259  AGACCAATAATGCTGCTTCTGCATCAGCTTCCAACTCCACCG  1300
            ||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct 1220  AGACCAATAACGCCGCTTCTGCATCAGCTTCCAACTCCACC-  1260