Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488872
• Subject: XM_030249221.1
• Aligned Length: 1300
• Identities: 892
• Gaps: 340

Alignment

Query    1  ATGTCAGGGCGGCCCAGAACCACCTCCTTTGCGGAGAGCTGCAAGCCGGTGCAGCAGCCTTCAGCTTTTGGCAG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CATGAAAGTTAGCAGAGACAAGGACGGCAGCAAGGTGACAACAGTGGTGGCAACTCCTGGGCAGGGTCCAGACA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GGCCACAAGAAGTCAGCTATACAGACACTAAAGTGATTGGAAATGGATCATTTGGTGTGGTATATCAAGCCAAA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CTTTGTGATTCAGGAGAACTGGTCGCCATCAAGAAAGTATTGCAGGACAAGAGATTTAAGAATCGAGAGCTCCA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GATCATGAGAAAGCTAGATCACTGTAACATAGTCCGATTGCGTTATTTCTTCTACTCCAGTGGTGAGAAGAAAG  370
                ||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct    1  ----ATGAGAAAGCTAGACCACTGTAACATAGTCCGACTGCGGTATTTCTTCTACTCGAGTGGTGAGAAGAAAG  70

Query  371  ATGAGGTCTATCTTAATCTGGTGCTGGACTATGTTCCGGAAACAGTATACAGAGTTGCCAGACACTATAGTCGA  444
            ||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct   71  ATGAGGTCTACCTTAACCTGGTGCTGGACTATGTTCCGGAGACAGTGTACAGAGTCGCCAGACACTATAGTCGA  144

Query  445  GCCAAACAGACGCTCCCTGTGATTTATGTCAAGTTGTATATGTATCAGCTGTTCCGAAGTTTAGCCTATATCCA  518
            |||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  145  GCCAAGCAGACACTCCCTGTGATCTATGTCAAGTTGTATATGTATCAGCTGTTCAGAAGTCTAGCCTATATCCA  218

Query  519  TTCCTTTGGAATCTGCCATCGGGATATTAAACCGCAGAACCTCTTGTTGGATCCTGATACTGCTGTATTAAAAC  592
            |||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  219  TTCCTTTGGAATCTGCCATCGAGACATTAAACCACAGAACCTCTTGTTGGATCCTGATACAGCTGTATTAAAAC  292

Query  593  TCTGTGACTTTGGAAGTGCAAAGCAGCTGGTCCGAGGAGAACCCAATGTTTCGTATATCTGTTCTCGGTACTAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  293  TCTGTGACTTTGGAAGTGCAAAGCAGCTGGTCCGAGGAGAGCCCAATGTTTCATATATCTGTTCTCGGTACTAC  366

Query  667  AGGGCACCAGAGTTGATCTTTGGAGCCACTGATTATACCTCTAGTATAGATGTATGGTCTGCTGGCTGTGTGTT  740
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  367  AGGGCACCAGAGTTGATCTTTGGAGCCACTGATTACACGTCCAGTATAGATGTATGGTCTGCAGGCTGTGTGTT  440

Query  741  GGCTGAGCTGTTACTAGGACAACCAATATTTCCAGGGGATAGTGGTGTGGATCAGTTGGTAGAAATAATCAAGG  814
            ||||||..||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct  441  GGCTGAATTGTTGCTAGGACAACCAATATTTCCTGGGGACAGTGGTGTGGATCAGTTGGTGGAAATAATAAAGG  514

Query  815  TCCTGGGAACTCCAACAAGGGAGCAAATCAGAGAAATGAACCCAAACTACACAGAATTTAAATTCCCTCAAATT  888
            ||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  515  TCCTAGGAACACCAACAAGGGAGCAAATTAGAGAAATGAACCCAAATTATACAGAATTCAAATTCCCTCAAATC  588

Query  889  AAGGCACATCCTTGGACTAAGGATTCGTCAGGAACAGGACATTTCACCTCAGGAGTGCGGGTCTTCCGACCCCG  962
            |||||||||||||||||.||                                       |||||||||.|||||
Sbjct  589  AAGGCACATCCTTGGACAAA---------------------------------------GGTCTTCCGGCCCCG  623

Query  963  AACTCCACCGGAGGCAATTGCACTGTGTAGCCGTCTGCTGGAGTATACACCAACTGCCCGACTAACACCACTGG  1036
            |||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  624  AACTCCACCAGAGGCAATTGCACTGTGCAGCCGTCTGCTGGAGTACACACCTACCGCCCGGCTAACACCACTGG  697

Query 1037  AAGCTTGTGCACATTCATTTTTTGATGAATTACGGGACCCAAATGTCAAACTACCAAATGGGCGAGACACACCT  1110
            ||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  698  AAGCTTGTGCACATTCATTTTTCGATGAATTGCGGGACCCAAATGTCAAACTACCAAATGGGCGAGACACACCT  771

Query 1111  GCACTCTTCAACTTCACCACTCAAGAACTGTCAAGTAATCCACCTCTGGCTACCATCCTTATTCCTCCTCATGC  1184
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  772  GCACTCTTCAACTTTACCACTCAAGAACTGTCAAGTAACCCCCCTCTGGCCACCATCCTTATCCCTCCACATGC  845

Query 1185  TCGGATTCAAGCAGCTGCTTCAACCCCCACAAATGCCACAGCAGCGTCAGATGCTAATACTGGAGACCGTGGAC  1258
            |||||||||.||.|||||||||.|.||..|.||.|||||||||||.||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct  846  TCGGATTCAGGCCGCTGCTTCACCGCCTGCCAACGCCACAGCAGCCTCAGATACTAATGCTGGAGACCGTGGAC  919

Query 1259  AGACCAATAATGCTGCTTCTGCATCAGCTTCCAACTCCACCG  1300
            ||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  920  AGACCAATAACGCCGCTTCTGCATCAGCTTCCAACTCCACC-  960