Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488943
• Subject: XM_005248671.3
• Aligned Length: 2982
• Identities: 1819
• Gaps: 1152

Alignment

Query    1  ATGGTTTTTCAAACTCGGTACCCTTCATGGATTATTTTATGCTACATCTGGCTGCTCCGCTTTGCACACACAGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTTTTTCAAACTCGGTACCCTTCATGGATTATTTTATGCTACATCTGGCTGCTCCGCTTTGCACACACAGG  74

Query   75  GGAGGCGCAGGCTGCGAAGGAAGTACTACTGCTGGATTCTAAAGCACAACAAACAGAGTTGGAGTGGATTTCCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGAGGCGCAGGCTGCGAAGGAAGTACTACTGCTGGATTCTAAAGCACAACAAACAGAGTTGGAGTGGATTTCCT  148

Query  149  CTCCACCCAATGGGTGGGAAGAAATTAGTGGTTTGGATGAGAACTATACCCCGATACGAACATACCAGGTGTGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTCCACCCAATGGGTGGGAAGAAATTAGTGGTTTGGATGAGAACTATACCCCGATACGAACATACCAGGTGTGC  222

Query  223  CAAGTCATGGAGCCCAACCAAAACAACTGGCTGCGGACTAACTGGATTTCCAAAGGCAATGCACAAAGGATTTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAAGTCATGGAGCCCAACCAAAACAACTGGCTGCGGACTAACTGGATTTCCAAAGGCAATGCACAAAGGATTTT  296

Query  297  TGTAGAATTGAAATTCACCCTGAGGGATTGTAACAGTCTTCCTGGAGTACTGGGAACTTGCAAGGAAACATTTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGTAGAATTGAAATTCACCCTGAGGGATTGTAACAGTCTTCCTGGAGTACTGGGAACTTGCAAGGAAACATTTA  370

Query  371  ATTTGTACTATTATGAAACAGACTATGACACTGGCAGGAATATAAGAGAAAACCTCTATGTAAAAATAGACACC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATTTGTACTATTATGAAACAGACTATGACACTGGCAGGAATATAAGAGAAAACCTCTATGTAAAAATAGACACC  444

Query  445  ATTGCTGCAGATGAAAGTTTTACCCAAGGTGACCTTGGTGAAAGAAAGATGAAGCTTAACACTGAGGTGAGAGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATTGCTGCAGATGAAAGTTTTACCCAAGGTGACCTTGGTGAAAGAAAGATGAAGCTTAACACTGAGGTGAGAGA  518

Query  519  GATTGGACCTTTGTCCAAAAAGGGATTCTATCTTGCCTTTCAGGATGTAGGGGCTTGCATAGCTTTGGTTTCTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GATTGGACCTTTGTCCAAAAAGGGATTCTATCTTGCCTTTCAGGATGTAGGGGCTTGCATAGCTTTGGTTTCTG  592

Query  593  TCAAAGTGTACTACAAGAAGTGCTGGTCCATTATTGAGAACTTAGCTATCTTTCCAGATACAGTGACTGGTTCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCAAAGTGTACTACAAGAAGTGCTGGTCCATTATTGAGAACTTAGCTATCTTTCCAGATACAGTGACTGGTTCA  666

Query  667  GAATTTTCCTCTTTAGTCGAGGTTCGAGGGACATGTGTCAGCAGTGCAGAGGAAGAAGCGGAAAACGCCCCCAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAATTTTCCTCTTTAGTCGAGGTTCGAGGGACATGTGTCAGCAGTGCAGAGGAAGAAGCGGAAAACGCCCCCAG  740

Query  741  GATGCACTGCAGTGCAGAAGGAGAATGGTTAGTGCCCATTGGAAAATGTATCTGCAAAGCAGGCTACCAGCAAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GATGCACTGCAGTGCAGAAGGAGAATGGTTAGTGCCCATTGGAAAATGTATCTGCAAAGCAGGCTACCAGCAAA  814

Query  815  AAGGAGACACTTGTGAACCCTGTGGCCGTGGGTTCTACAAGTCTTCCTCTCAAGATCTTCAGTGCTCTCGTTGT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAGGAGACACTTGTGAACCCTGTGGCCGTGGGTTCTACAAGTCTTCCTCTCAAGATCTTCAGTGCTCTCGTTGT  888

Query  889  CCAACTCACAGTTTTTCTGATAAAGAAGGCTCCTCCAGATGTGAATGTGAAGATGGGTATTACAGGGCTCCATC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCAACTCACAGTTTTTCTGATAAAGAAGGCTCCTCCAGATGTGAATGTGAAGATGGGTATTACAGGGCTCCATC  962

Query  963  TGACCCACCATACGTTGCATGCACAAGGCCTCCATCTGCACCACAGAACCTCATTTTCAACATCAACCAAACCA  1036
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGACCCACCATACGTTGCGTGCACAAGGCCTCCATCTGCACCACAGAACCTCATTTTCAACATCAACCAAACCA  1036

Query 1037  CAGTAAGTTTGGAATGGAGTCCTCCTGCAGACAATGGGGGAAGAAACGATGTGACCTACAGAATATTGTGTAAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGTAAGTTTGGAATGGAGTCCTCCTGCAGACAATGGGGGAAGAAACGATGTGACCTACAGAATATTGTGTAAG  1110

Query 1111  CGGTGCAGTTGGGAGCAGGGCGAATGTGTTCCCTGTGGGAGTAACATTGGATACATGCCCCAGCAGACTGGATT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CGGTGCAGTTGGGAGCAGGGCGAATGTGTTCCCTGTGGGAGTAACATTGGATACATGCCCCAGCAGACTGGATT  1184

Query 1185  AGAGGATAACTATGTCACTGTCATGGACCTGCTAGCCCACGCTAATTATACTTTTGAAGTTGAAGCTGTAAATG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGAGGATAACTATGTCACTGTCATGGACCTGCTAGCCCACGCTAATTATACTTTTGAAGTTGAAGCTGTAAATG  1258

Query 1259  GAGTTTCTGACTTAAGCCGATCCCAGAGGCTCTTTGCTGCTGTCAGTATCACCACTGGTCAAGCAGCTCCCTCG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GAGTTTCTGACTTAAGCCGATCCCAGAGGCTCTTTGCTGCTGTCAGTATCACCACTGGTCAAGCAGCTCCCTCG  1332

Query 1333  CAAGTGAGCGGAGTAATGAAGGAGAGAGTACTGCAGCGGAGTGTCGAGCTTTCCTGGCAGGAACCAGAGCATCC  1406
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CAAGTGAGTGGAGTAATGAAGGAGAGAGTACTGCAGCGGAGTGTCGAGCTTTCCTGGCAGGAACCAGAGCATCC  1406

Query 1407  CAATGGAGTCATCACAGAATATGAAATCAAGTATTACGAGAAAGATCAAAGGGAACGGACCTACTCAACAGTAA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAATGGAGTCATCACAGAATATGAAATCAAGTATTACGAGAAAGATCAAAGGGAACGGACCTACTCAACAGTAA  1480

Query 1481  AAACCAAGTCTACTTCAGCCTCCATTAATAATCTGAAACCAGGAACAGTGTATGTTTTCCAGATTCGGGCTTTT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AAACCAAGTCTACTTCAGCCTCCATTAATAATCTGAAACCAGGAACAGTGTATGTTTTCCAGATTCGGGCTTTT  1554

Query 1555  ACTGCTGCTGGTTATGGAAATTACAGTCCCAGACTTGATGTTGCTACACTAGAGGAAGCTACAGGTAAAATGTT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ACTGCTGCTGGTTATGGAAATTACAGTCCCAGACTTGATGTTGCTACACTAGAGGAAGCTACAGGTAAAATGTT  1628

Query 1629  TGAAGCTACAGCTGTCTCCAGTGAACAGAATCCTGTTATTATCATTGCTGTGGTTGCTGTAGCTGGGACCATCA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGAAGCTACAGCTGTCTCCAGTGAACAGAATCCTGTTATTATCATTGCTGTGGTTGCTGTAGCTGGGACCATCA  1702

Query 1703  TTTTGGTGTTCATGGTCTTTGGCTTCATCATTGGGAGAAGGCACTGTGGTTATAGCAAAGCTGACCAAGAAGGC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TTTTGGTGTTCATGGTCTTTGGCTTCATCATTGGGAGAAGGCACTGTGGTTATAGCAAAGCTGACCAAGAAGGC  1776

Query 1777  GATGAAGAGCTTTACTTTCATTGCACCAAAACCTACATTGACCCTGAAACCTATGAGGACCCAAATAGAGCTGT  1850
            ||||||||||||||||||||||             |.||     .|.|||..|||||          .|.||||
Sbjct 1777  GATGAAGAGCTTTACTTTCATT-------------CTTT-----AGTAACAAATGAG----------CATCTGT  1822

Query 1851  CCATCAATTCGCCAAGGAGCTAGATGCCTCCTGTATTAAAATTGAGCGTGTGATTGGTGCAGGAGAATTCGGTG  1924
                                          |.||.|||                                    
Sbjct 1823  ------------------------------CAGTTTTA------------------------------------  1830

Query 1925  AAGTCTGCAGTGGCCGTTTGAAACTTCCAGGGAAAAGAGATGTTGCAGTAGCCATAAAAACCCTGAAAGTTGGT  1998
                                                                                      
Sbjct 1831  --------------------------------------------------------------------------  1830

Query 1999  TACACAGAAAAACAAAGGAGAGACTTTTTGTGTGAAGCAAGCATCATGGGGCAGTTTGACCACCCAAATGTTGT  2072
                                                                                      
Sbjct 1831  --------------------------------------------------------------------------  1830

Query 2073  CCATTTGGAAGGGGTTGTTACAAGAGGGAAACCAGTCATGATAGTAATAGAGTTCATGGAAAATGGAGCCCTAG  2146
                                                                                      
Sbjct 1831  --------------------------------------------------------------------------  1830

Query 2147  ATGCATTTCTCAGGAAACATGATGGGCAATTTACAGTCATTCAGTTAGTAGGAATGCTGAGAGGAATTGCTGCT  2220
                                                                                      
Sbjct 1831  --------------------------------------------------------------------------  1830

Query 2221  GGAATGAGATATTTGGCTGATATGGGATATGTTCACAGGGACCTTGCAGCTCGCAATATTCTTGTCAACAGCAA  2294
                                                                                      
Sbjct 1831  --------------------------------------------------------------------------  1830

Query 2295  TCTCGTTTGTAAAGTGTCAGATTTTGGCCTGTCCCGAGTTATAGAGGATGATCCAGAAGCTGTCTATACAACTA  2368
                                                                                      
Sbjct 1831  --------------------------------------------------------------------------  1830

Query 2369  CTGGTGGAAAAATTCCAGTAAGGTGGACAGCACCCGAAGCCATCCAGTACCGGAAATTCACATCAGCCAGTGAT  2442
                                                                                      
Sbjct 1831  --------------------------------------------------------------------------  1830

Query 2443  GTATGGAGCTATGGAATAGTCATGTGGGAAGTTATGTCTTATGGAGAAAGACCTTATTGGGACATGTCAAATCA  2516
                                                                                      
Sbjct 1831  --------------------------------------------------------------------------  1830

Query 2517  AGATGTTATAAAAGCAATAGAAGAAGGTTATCGTTTACCAGCACCCATGGACTGCCCAGCTGGCCTTCACCAGC  2590
                                                                                      
Sbjct 1831  --------------------------------------------------------------------------  1830

Query 2591  TAATGTTGGATTGTTGGCAAAAGGAGCGTGCTGAAAGGCCAAAATTTGAACAGATAGTTGGAATTCTAGACAAA  2664
                                                                                      
Sbjct 1831  --------------------------------------------------------------------------  1830

Query 2665  ATGATTCGAAACCCAAATAGTCTGAAAACTCCCCTGGGAACTTGTAGTAGGCCAATAAGCCCTCTTCTGGATTA  2738
                                                                                      
Sbjct 1831  --------------------------------------------------------------------------  1830

Query 2739  AAACACTCCTGATTTCACTACCTTTTGTTCAGTTGGAGAATGGCTACAAGCTATTAAGATGGAAAGATATAAAG  2812
                                                                                      
Sbjct 1831  --------------------------------------------------------------------------  1830

Query 2813  ATAATTTCACGGCAGCTGGCTACAATTCCCTTGAATCAGTAGCCAGGATGACTATTGAGGATGTGATGAGTTTA  2886
                                                                                      
Sbjct 1831  --------------------------------------------------------------------------  1830

Query 2887  GGGATCACACTGGTTGGTCATCAAAAGAAAATCATGAGCAGCATTCAGACTATGAGAGCACAAATGCTACATTT  2960
                                                                                      
Sbjct 1831  --------------------------------------------------------------------------  1830

Query 2961  ACATGGAACTGGCATTCAAGTG  2982
                                  
Sbjct 1831  ----------------------  1830