Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489158
• Subject: XM_005249775.5
• Aligned Length: 1620
• Identities: 1283
• Gaps: 336

Alignment

Query    1  ATGCAGCAAGTCTTGGAAAACCTTACGGAGCTGCCCTCGTCTACTGGAGCAGAAGAAATAGACCTAATTTTCCT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CAAGGGAATTATGGAGAATCCTATTGTAAAATCACTTGCTAAGGCTCATGAGAGGCTAGAAGATTCCAAACTAG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AAGCTGTCAGTGACAATAACTTGGAATTAGTCAATGAAATTCTTGAAGACATCACTCCTCTAATAAATGTGGAT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GAAAATGTGGCAGAATTGGTTGGTATACTCAAAGAACCTCACTTCCAGTCACTGTTGGAGGCCCATGATATTGT  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GGCATCAAAGTGTTATGATTCACCTCCATCAAGCCCAGAAATGAATAATTCTTCTATCAATAATCAGTTATTAC  370
                                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------------------ATGAATAATTCTTCTATCAATAATCAGTTATTAC  34

Query  371  CAGTAGATGCCATTCGTATTCTTGGTATTCACAAAAGAGCTGGGGAACCACTGGGTGTGACATTTAGGGTTGAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   35  CAGTAGATGCCATTCGTATTCTTGGTATTCACAAAAGAGCTGGGGAACCACTGGGTGTGACATTTAGGGTTGAA  108

Query  445  AATAATGATCTGGTAATTGCCCGAATCCTCCATGGGGGAATGATAGATCGACAAGGTCTACTTCATGTGGGAGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  109  AATAATGATCTGGTAATTGCCCGAATCCTCCATGGGGGAATGATAGATCGACAAGGTCTACTTCATGTGGGAGA  182

Query  519  TATAATTAAAGAAGTCAATGGCCATGAGGTTGGAAATAATCCAAAGGAATTACAAGAATTACTGAAAAATATTA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  183  TATAATTAAAGAAGTCAATGGCCATGAGGTTGGAAATAATCCAAAGGAATTACAAGAATTACTGAAAAATATTA  256

Query  593  GTGGAAGTGTCACCCTAAAAATCTTACCAAGTTATAGAGATACCATTACTCCTCAACAGGTATTTGTGAAGTGT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  257  GTGGAAGTGTCACCCTAAAAATCTTACCAAGTTATAGAGATACCATTACTCCTCAACAGGTATTTGTGAAGTGT  330

Query  667  CATTTTGATTATAATCCATACAATGACAACCTAATACCTTGCAAAGAAGCAGGATTGAAGTTTTCCAAAGGAGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  331  CATTTTGATTATAATCCATACAATGACAACCTAATACCTTGCAAAGAAGCAGGATTGAAGTTTTCCAAAGGAGA  404

Query  741  AATTCTTCAGATTGTAAATAGAGAAGATCCAAATTGGTGGCAGGCTAGCCATGTAAAAGAGGGAGGAAGCGCTG  814
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  405  GATTCTTCAGATTGTAAATAGAGAAGATCCAAATTGGTGGCAGGCTAGCCATGTAAAAGAGGGAGGAAGCGCTG  478

Query  815  GTCTCATTCCAAGCCAGTTCCTGGAAGAGAAGAGAAAGGCATTTGTTAGAAGAGACTGGGACAATTCAGGACCT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  479  GTCTCATTCCAAGCCAGTTCCTGGAAGAGAAGAGAAAGGCATTTGTTAGAAGAGACTGGGACAATTCAGGACCT  552

Query  889  TTTTGTGGAACTATAAGTAGCAAAAAAAAGAAAAAGATGATGTATCTCACAACCAGAAATGCAGAATTTGATCG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  553  TTTTGTGGAACTATAAGTAGCAAAAAAAAGAAAAAGATGATGTATCTCACAACCAGAAATGCAGAATTTGATCG  626

Query  963  TCATGAAATCCAGATATATGAGGAGGTAGCCAAAATGCCTCCCTTCCAGAGAAAAACATTAGTATTGATAGGAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  627  TCATGAAATCCAGATATATGAGGAGGTAGCCAAAATGCCTCCCTTCCAGAGAAAAACATTAGTATTGATAGGAG  700

Query 1037  CTCAAGGTGTAGGCCGAAGAAGCTTGAAAAACAGGTTCATAGTATTGAATCCCACTAGATTTGGAACTACGGTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  701  CTCAAGGTGTAGGCCGAAGAAGCTTGAAAAACAGGTTCATAGTATTGAATCCCACTAGATTTGGAACTACGGTG  774

Query 1111  CCATTTACTTCACGGAAACCAAGGGAAGATGAAAAAGATGGCCAGGCATATAAGTTTGTGTCACGATCTGAGAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  775  CCATTTACTTCACGGAAACCAAGGGAAGATGAAAAAGATGGCCAGGCATATAAGTTTGTGTCACGATCTGAGAT  848

Query 1185  GGAAGCAGATATTAAAGCTGGAAAGTATTTGGAACATGGGGAATATGAAGGAAATCTCTATGGAACCAAAATTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  849  GGAAGCAGATATTAAAGCTGGAAAGTATTTGGAACATGGGGAATATGAAGGAAATCTCTATGGAACCAAAATTG  922

Query 1259  ATTCTATTCTTGAGGTTGTCCAAACTGGACGGACTTGCATTCTGGATGTCAACCCACAAGCACTGAAAGTATTG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  923  ATTCTATTCTTGAGGTTGTCCAAACTGGACGGACTTGCATTCTGGATGTCAACCCACAAGCACTGAAAGTATTG  996

Query 1333  AGGACATCAGAGTTTATGCCCTATGTGGTATTTATTGCGGCTCCGGAGCTAGAGACGTTACGTGCCATGCACAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  997  AGGACATCAGAGTTTATGCCCTATGTGGTATTTATTGCGGCTCCGGAGCTAGAGACGTTACGTGCCATGCACAA  1070

Query 1407  GGCTGTGGTGGATGCAGGAATCACTACCAAGCTTCTGACCGACTCTGACTTGAAGAAAACAGTGGATGAAAGTG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1071  GGCTGTGGTGGATGCAGGAATCACTACCAAGCTTCTGACCGACTCTGACTTGAAGAAAACAGTGGATGAAAGTG  1144

Query 1481  CACGGATTCAGAGAGCATACAACCACTATTTTGATTTGATCATCATAAATGATAATCTAGACAAAGCCTTTGAA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1145  CACGGATTCAGAGAGCATACAACCACTATTTTGATTTGATCATCATAAATGATAATCTAGACAAAGCCTTTGAA  1218

Query 1555  AAACTGCAAACTGCCATAGAGAAACTGAGAATGGAACCACAGTGGGTCCCAATCAGCTGGGTTTAC  1620
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1219  AAACTGCAAACTGCCATAGAGAAACTGAGAATGGAACCACAGTGGGTCCCAATCAGCTGGGTTTAC  1284