Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489203
• Subject: XM_017010714.2
• Aligned Length: 1874
• Identities: 1668
• Gaps: 174

Alignment

Query    1  ATGGTATCAAATGTTCATTCATTCCATCTCTTGATGCTCTACGATATTATCAGTCTACACT-----ATGCTTTC  69
                      ||||.| |.|...||       |.|||||               ||.|..|     .||||..|
Sbjct    1  ----------ATGTGC-TGCTGGCC-------GCTGCTC---------------CTGCTGTGGGGGCTGCTCCC  41

Query   70  CTGAAAGGC---------------CAGAAGTTCAAAGATGGACTAGTTTCCCAGGGACCTGATTCCCCAGTTGG  128
            |.|.|.|||               |.|||            .|||   |||   |.|||.||   |||...|||
Sbjct   42  CGGGACGGCGGCGGGGGGCTCGGGCCGAA------------CCTA---TCC---GCACCGGA---CCCTCCTGG  94

Query  129  AATACTCCAGCCCCTTGGAAATTCCCGGGATTTATACAATAACT--CT-------AGACAACAAGACTTTGTCT  193
            |            ||.|||       |||       |||..|||  ||       ||.||.|            
Sbjct   95  A------------CTCGGA-------GGG-------CAAGTACTGGCTGGGCTGGAGCCAGC------------  130

Query  194  TTAAAGGTCCTATGAATTCTTTTCTCTCTGTATTTAGGTATCCTGATTTTTCCTT-----TCCATATTTTCCAC  262
                 ||                             ||.|.||.||  |..||||     ||           |
Sbjct  131  -----GG-----------------------------GGCAGCCAGA--TCGCCTTCCGCCTC-----------C  157

Query  263  AGGATTATTTTACAAATGCAAATAGAGAGTTGAAAAAAGATGCTCAGCAAGATTACCATCTAGAATATGCCATG  336
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  158  AGGATTATTTTACAAATGCAAATAGAGAGTTGAAAAAAGATGCTCAGCAAGATTACCATCTAGAATATGCCATG  231

Query  337  GAAAATAGCACACACACAATAATTGAATTTACCAGAGAGCTGCATACATGTGACATAAATGACAAGAGTATAAC  410
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  232  GAAAATAGCACACACACAATAATTGAATTTACCAGAGAGCTGCATACATGTGACATAAATGACAAGAGTATAAC  305

Query  411  GGATAGCACTGTGAGAGTGATCTGGGCCTACCACCATGAAGATGCAGGAGAAGCTGGTCCCAAGTACCATGACT  484
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  306  GGATAGCACTGTGAGAGTGATCTGGGCCTACCACCATGAAGATGCAGGAGAAGCTGGTCCCAAGTACCATGACT  379

Query  485  CCAATAGGGGCACCAAGAGTTTGCGGTTATTGAATCCTGAGAAAACTAGTGTGCTATCTACAGCCTTACCATAC  558
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  380  CCAATAGGGGCACCAAGAGTTTGCGGTTATTGAATCCTGAGAAAACTAGTGTGCTATCTACAGCCTTACCATAC  453

Query  559  TTTGATCTGGTAAATCAGGACGTCCCCATCCCAAACAAAGATACAACATATTGGTGCCAAATGTTTAAGATTCC  632
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  454  TTTGATCTGGTAAATCAGGACGTCCCCATCCCAAACAAAGATACAACATATTGGTGCCAAATGTTTAAGATTCC  527

Query  633  TGTGTTCCAAGAAAAGCATCATGTAATAAAGGTTGAGCCAGTGATACAGAGAGGCCATGAGAGTCTGGTGCACC  706
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  528  TGTGTTCCAAGAAAAGCATCATGTAATAAAGGTTGAGCCAGTGATACAGAGAGGCCATGAGAGTCTGGTGCACC  601

Query  707  ACATCCTGCTCTATCAGTGCAGCAACAACTTTAACGACAGCGTTCTGGAGTCCGGCCACGAGTGCTATCACCCC  780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  602  ACATCCTGCTCTATCAGTGCAGCAACAACTTTAACGACAGCGTTCTGGAGTCCGGCCACGAGTGCTATCACCCC  675

Query  781  AACATGCCCGATGCATTCCTCACCTGTGAAACTGTGATTTTTGCCTGGGCTATTGGTGGAGAGGGCTTTTCTTA  854
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  676  AACATGCCCGATGCATTCCTCACCTGTGAAACTGTGATTTTTGCCTGGGCTATTGGTGGAGAGGGCTTTTCTTA  749

Query  855  TCCACCTCATGTTGGATTATCCCTTGGCACTCCATTAGATCCGCATTATGTGCTCCTAGAAGTCCATTATGATA  928
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  750  TCCACCTCATGTTGGATTATCCCTTGGCACTCCATTAGATCCGCATTATGTGCTCCTAGAAGTCCATTATGATA  823

Query  929  ATCCCACTTATGAGGAAGGCTTAATAGATAATTCTGGACTGAGGTTATTTTACACAATGGATATAAGGAAATAT  1002
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  824  ATCCCACTTATGAGGAAGGCTTAATAGATAATTCTGGACTGAGGTTATTTTACACAATGGATATAAGGAAATAT  897

Query 1003  GATGCTGGGGTGATTGAGGCTGGCCTCTGGGTGAGCCTCTTCCATACCATCCCTCCAGGGATGCCTGAGTTCCA  1076
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  898  GATGCTGGGGTGATTGAGGCTGGCCTCTGGGTGAGCCTCTTCCATACCATCCCTCCAGGGATGCCTGAGTTCCA  971

Query 1077  GTCTGAGGGTCACTGCACTTTGGAGTGCCTGGAAGAGGCTCTGGAAGCCGAAAAGCCAAGTGGAATTCATGTGT  1150
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  972  GTCTGAGGGTCACTGCACTTTGGAGTGCCTGGAAGAGGCTCTGGAAGCCGAAAAGCCAAGTGGAATTCATGTGT  1045

Query 1151  TTGCTGTTCTTCTCCATGCTCACCTGGCTGGCAGAGGCATCAGGCTGCGTCATTTTCGAAAAGGGAAGGAAATG  1224
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1046  TTGCTGTTCTTCTCCATGCTCACCTGGCTGGCAGAGGCATCAGGCTGCGTCATTTTCGAAAAGGGAAGGAAATG  1119

Query 1225  AAATTACTTGCCTATGATGATGATTTTGACTTCAATTTCCAGGAGTTTCAGTATCTAAAGGAAGAACAAACAAT  1298
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1120  AAATTACTTGCCTATGATGATGATTTTGACTTCAATTTCCAGGAGTTTCAGTATCTAAAGGAAGAACAAACAAT  1193

Query 1299  CTTACCAGGAGATAACCTAATTACTGAGTGTCGCTACAACACGAAAGATAGAGCTGAGATGACTTGGGGAGGAC  1372
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1194  CTTACCAGGAGATAACCTAATTACTGAGTGTCGCTACAACACGAAAGATAGAGCTGAGATGACTTGGGGAGGAC  1267

Query 1373  TAAGCACCAGGAGTGAAATGTGTCTCTCATACCTTCTTTATTACCCAAGAATTAATCTTACTCGATGTGCAAGT  1446
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1268  TAAGCACCAGGAGTGAAATGTGTCTCTCATACCTTCTTTATTACCCAAGAATTAATCTTACTCGATGTGCAAGT  1341

Query 1447  ATTCCAGACATTATGGAACAACTTCAGTTCATTGGGGTTAAGGAGATCTACAGACCAGTCACGACCTGGCCTTT  1520
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1342  ATTCCAGACATTATGGAACAACTTCAGTTCATTGGGGTTAAGGAGATCTACAGACCAGTCACGACCTGGCCTTT  1415

Query 1521  CATTATCAAAAGTCCCAAGCAATATAAAAACCTTTCTTTCATGGATGCTATGAATAAGTTTAAATGGACTAAAA  1594
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1416  CATTATCAAAAGTCCCAAGCAATATAAAAACCTTTCTTTCATGGATGCTATGAATAAGTTTAAATGGACTAAAA  1489

Query 1595  AGGAAGGTCTCTCCTTCAACAAGCTGGTCCTCAGCCTGCCAGTGAATGTGAGATGTTCCAAGACAGACAATGCT  1668
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1490  AGGAAGGTCTCTCCTTCAACAAGCTGGTCCTCAGCCTGCCAGTGAATGTGAGATGTTCCAAGACAGACAATGCT  1563

Query 1669  GAGTGGTCGATTCAAGGAATGACAGCATTACCTCCAGATATAGAAAGACCCTATAAAGCAGAACCTTTGGTGTG  1742
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1564  GAGTGGTCGATTCAAGGAATGACAGCATTACCTCCAGATATAGAAAGACCCTATAAAGCAGAACCTTTGGTGTG  1637

Query 1743  TGGCACGTCTTCTTCCTCTTCCCTGCACAGAGATTTCTCCATCAACTTGCTTGTTTGCCTTCTGCTACTCAGCT  1816
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1638  TGGCACGTCTTCTTCCTCTTCCCTGCACAGAGATTTCTCCATCAACTTGCTTGTTTGCCTTCTGCTACTCAGCT  1711

Query 1817  GCACGCTGAGCACCAAGAGCTTGG  1840
            ||||||||||||||||||||||| 
Sbjct 1712  GCACGCTGAGCACCAAGAGCTTG-  1734