Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000489298
- Subject:
- NM_000287.4
- Aligned Length:
- 2941
- Identities:
- 2939
- Gaps:
- 1
Alignment
Query 1 ATGGCGCTGGCTGTCTTGCGGGTCCTGGAGCCCTTTCCGACCGAGACACCCCCGTTGGCAGTGCTGCTGCCACC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGCTGGCTGTCTTGCGGGTCCTGGAGCCCTTTCCGACCGAGACACCCCCGTTGGCAGTGCTGCTGCCACC 74
Query 75 CGGGGGCCCGTGGCCGGCGGCGGAGCTGGGCCTGGTGCTGGCCCTGAGGCCTGCAGGGGAGAGCCCGGCAGGGC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CGGGGGCCCGTGGCCGGCGGCGGAGCTGGGCCTGGTGCTGGCCCTGAGGCCTGCAGGGGAGAGCCCGGCAGGGC 148
Query 149 CGGCGCTGCTGGTGGCAGCCCTGGAGGGGCCGGACGCGGGCACCGAAGAGCAGGGTCCCGGGCCGCCGCAGCTA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CGGCGCTGCTGGTGGCAGCCCTGGAGGGGCCGGACGCGGGCACCGAAGAGCAGGGTCCCGGGCCGCCGCAGCTA 222
Query 223 CTGGTTAGCCGCGCGCTGCTGCGGCTCCTGGCACTGGGCTCCGGGGCCTGGGTGCGGGCGCGGGCGGTGCGGCG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTGGTTAGCCGCGCGCTGCTGCGGCTCCTGGCACTGGGCTCCGGGGCCTGGGTGCGGGCGCGGGCGGTGCGGCG 296
Query 297 GCCCCCGGCGCTAGGTTGGGCACTGCTTGGCACCTCGCTGGGGCCTGGGCTCGGACCGCGAGTCGGGCCGCTGC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GCCCCCGGCGCTAGGTTGGGCACTGCTTGGCACCTCGCTGGGGCCTGGGCTCGGACCGCGAGTCGGGCCGCTGC 370
Query 371 TGGTGAGGCGCGGAGAGACCCTCCCAGTGCCCGGACCGCGGGTGCTGGAGACGCGGCCGGCGTTGCAAGGGCTG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGGTGAGGCGCGGAGAGACCCTCCCAGTGCCCGGACCGCGGGTGCTGGAGACGCGGCCGGCGTTGCAAGGGCTG 444
Query 445 CTGGGCCCAGGGACTCGGCTGGCTGTGACTGAGCTCCGCGGGCGGGCCAGACTGTGTCCAGAGTCTGGGGACAG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTGGGCCCAGGGACTCGGCTGGCTGTGACTGAGCTCCGCGGGCGGGCCAGACTGTGTCCAGAGTCTGGGGACAG 518
Query 519 CAGTCGGCCCCCACCCCCGCCCGTGGTGTCCTCCTTTGCGGTTTCTGGCACAGTGCGGCGACTCCAGGGAGTTC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAGTCGGCCCCCACCCCCGCCCGTGGTGTCCTCCTTTGCGGTTTCTGGCACAGTGCGGCGACTCCAGGGAGTTC 592
Query 593 TGGGAGGGACTGGAGATTCACTAGGGGTGAGCCGGAGCTGTCTCCGTGGCCTTGGCCTCTTCCAGGGCGAATGG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGGGAGGGACTGGAGATTCACTAGGGGTGAGCCGGAGCTGTCTCCGTGGCCTTGGCCTCTTCCAGGGCGAATGG 666
Query 667 GTGTGGGTGGCCCAGGCCAGAGAGTCATCGAACACTTCACAGCCGCACTTGGCTAGGGTGCAGGTCCTAGAACC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GTGTGGGTGGCCCAGGCCAGAGAGTCATCGAACACTTCACAGCCGCACTTGGCTAGGGTGCAGGTCCTAGAACC 740
Query 741 TCGCTGGGACCTCTCTGATAGACTGGGACCCGGCTCTGGACCGCTGGGAGAGCCCCTCGCTGACGGACTGGCGC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TCGCTGGGACCTCTCTGATAGACTGGGACCCGGCTCTGGACCGCTGGGAGAGCCCCTCGCTGACGGACTGGCGC 814
Query 815 TTGTCCCTGCCACTTTGGCTTTTAATCTTGGCTGTGACCCCCTGGAAATGGGAGAGCTCAGAATTCAGAGGTAC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTGTCCCTGCCACTTTGGCTTTTAATCTTGGCTGTGACCCCCTGGAAATGGGAGAGCTCAGAATTCAGAGGTAC 888
Query 889 TTGGAAGGCTCCATCGCCCCTGAAGACAAAGGAAGCTGCTCATTGCTGCCTGGGCCTCCATTTGCCAGAGAGTT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTGGAAGGCTCCATCGCCCCTGAAGACAAAGGAAGCTGCTCATTGCTGCCTGGGCCTCCATTTGCCAGAGAGTT 962
Query 963 ACACATCGAAATTGTGTCTTCTCCCCACTACAGCACTAATGGAAATTATGACGGTGTTCTTTACCGGCACTTTC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ACACATCGAAATTGTGTCTTCTCCCCACTACAGCACTAATGGAAATTATGACGGTGTTCTTTACCGGCACTTTC 1036
Query 1037 AGATACCCAGGGTAGTCCAGGAAGGGGATGTTCTATGTGTGCCAACAATTGGGCAAGTAGAGATCCTGGAAGGA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGATACCCAGGGTAGTCCAGGAAGGGGATGTTCTATGTGTGCCAACAATTGGGCAAGTAGAGATCCTGGAAGGA 1110
Query 1111 AGTCCAGAGAAACTGCCCAGGTGGCGGGAAATGTTTTTTAAAGTGAAGAAAACAGTTGGGGAAGCTCCAGATGG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AGTCCAGAGAAACTGCCCAGGTGGCGGGAAATGTTTTTTAAAGTGAAGAAAACAGTTGGGGAAGCTCCAGATGG 1184
Query 1185 ACCAGCCAGTGCCTACTTGGCCGACACCACCCATACCTCCTTGTACATGGTGGGTTCTACCCTGAGCCCTGTTC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 ACCAGCCAGTGCCTACTTGGCCGACACCACCCATACCTCCTTGTACATGGTGGGTTCTACCCTGAGCCCTGTTC 1258
Query 1259 CATGGCTCCCTTCAGAGGAATCCACTCTCTGGAGCAGTTTGTCTCCTCCAGGCCTGGAGGCCTTGGTGTCTGAA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CATGGCTCCCTTCAGAGGAATCCACTCTCTGGAGCAGTTTGTCTCCTCCAGGCCTGGAGGCCTTGGTGTCTGAA 1332
Query 1333 CTCTGTGCTGTCCTGAAGCCTCGCCTCCAGCCAGGGGGTGCCCTGCTGACAGGAACTAGCAGTGTCCTTCTACG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CTCTGTGCTGTCCTGAAGCCTCGCCTCCAGCCAGGGGGTGCCCTGCTGACAGGAACTAGCAGTGTCCTTCTACG 1406
Query 1407 GGGCCCCCCAGGCTGTGGGAAGACCACAGTAGTTGCTGCTGCCTGTAGTCACCTTGGGCTCCACTTACTGAAGG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GGGCCCCCCAGGCTGTGGGAAGACCACAGTAGTTGCTGCTGCCTGTAGTCACCTTGGGCTCCACTTACTGAAGG 1480
Query 1481 TGCCCTGCTCCAGCCTCTGTGCAGAAAGTAGTGGGGCTGTGGAGACAAAACTGCAGGCCATCTTCTCCCGGGCC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TGCCCTGCTCCAGCCTCTGTGCAGAAAGTAGTGGGGCTGTGGAGACAAAACTGCAGGCCATCTTCTCCCGGGCC 1554
Query 1555 CGCCGTTGCCGGCCTGCAGTCCTGTTGCTCACAGCTGTGGACCTTCTGGGCCGGGACCGTGATGGGCTGGGTGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CGCCGTTGCCGGCCTGCAGTCCTGTTGCTCACAGCTGTGGACCTTCTGGGCCGGGACCGTGATGGGCTGGGTGA 1628
Query 1629 GGATGCCCGTGTGATGGCTGTGCTGCGTCACCTCCTCCTCAATGAGGACCCCCTCAACAGCTGCCCTCCCCTCA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GGATGCCCGTGTGATGGCTGTGCTGCGTCACCTCCTCCTCAATGAGGACCCCCTCAACAGCTGCCCTCCCCTCA 1702
Query 1703 TGGTTGTGGCCACCACAAGCCGGGCCCAGGACCTGCCTGCTGATGTGCAGACAGCATTTCCTCATGAGCTCGAG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TGGTTGTGGCCACCACAAGCCGGGCCCAGGACCTGCCTGCTGATGTGCAGACAGCATTTCCTCATGAGCTCGAG 1776
Query 1777 GTGCCTGCTCTGTCAGAGGGGCAGCGGCTCAGCATCCTGCGGGCCCTCACTGCCCACCTTCCCCTGGGCCAGGA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GTGCCTGCTCTGTCAGAGGGGCAGCGGCTCAGCATCCTGCGGGCCCTCACTGCCCACCTTCCCCTGGGCCAGGA 1850
Query 1851 GGTGAACTTGGCACAGCTAGCACGGCGGTGTGCAGGCTTTGTGGTAGGGGATCTCTATGCCCTTCTGACCCACA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GGTGAACTTGGCACAGCTAGCACGGCGGTGTGCAGGCTTTGTGGTAGGGGATCTCTATGCCCTTCTGACCCACA 1924
Query 1925 GCAGCCGGGCAGCCTGCACCAGGATCAAGAACTCAGGTTTGGCAGGTGGCTTGACTGAGGAGGATGAGGGGGAG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 GCAGCCGGGCAGCCTGCACCAGGATCAAGAACTCAGGTTTGGCAGGTGGCTTGACTGAGGAGGATGAGGGGGAG 1998
Query 1999 CTGTGTGCTGCCGGCTTTCCTCTCCTGGCTGAGGACTTTGGGCAGGCACTGGAGCAACTGCAGACAGCTCACTC 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CTGTGTGCTGCCGGCTTTCCTCTCCTGGCTGAGGACTTTGGGCAGGCACTGGAGCAACTGCAGACAGCTCACTC 2072
Query 2073 CCAGGCCGTTGGAGCCCCCAAGATCCCCTCAGTGTCCTGGCATGATGTGGGTGGGCTGCAGGAGGTGAAGAAGG 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 CCAGGCCGTTGGAGCCCCCAAGATCCCCTCAGTGTCCTGGCATGATGTGGGTGGGCTGCAGGAGGTGAAGAAGG 2146
Query 2147 AGATCCTGGAGACCATTCAGCTCCCCCTGGAGCACCCTGAGCTACTGAGCCTGGGCCTGAGACGCTCAGGCCTT 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 AGATCCTGGAGACCATTCAGCTCCCCCTGGAGCACCCTGAGCTACTGAGCCTGGGCCTGAGACGCTCAGGCCTT 2220
Query 2221 CTGCTCCATGGGCCCCCTGGCACCGGCAAGACCCTTCTGGCCAAGGCAGTAGCCACTGAGTGCAGCCTTACCTT 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CTGCTCCATGGGCCCCCTGGCACCGGCAAGACCCTTCTGGCCAAGGCAGTAGCCACTGAGTGCAGCCTTACCTT 2294
Query 2295 CCTCAGCGTGAAGGGGCCAGAGCTCATTAACATGTATGTGGGCCAAAGTGAGGAGAATGTGCGGGAAGTATTTG 2368
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2295 CCTCAGCGTGAAGGGGCCAGAGCTCATTAACATGTATGTGGGCCAAAGTGAGGAGAATGTGCGGGAAGTGTTTG 2368
Query 2369 CCAGGGCCAGGGCTGCAGCTCCATGCATTATCTTCTTTGATGAACTGGACTCTTTGGCCCCAAGCCGGGGGCGA 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 CCAGGGCCAGGGCTGCAGCTCCATGCATTATCTTCTTTGATGAACTGGACTCTTTGGCCCCAAGCCGGGGGCGA 2442
Query 2443 AGTGGAGATTCTGGAGGAGTGATGGACAGGGTGGTGTCTCAGCTCCTTGCCGAGCTAGATGGGCTGCACAGCAC 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 AGTGGAGATTCTGGAGGAGTGATGGACAGGGTGGTGTCTCAGCTCCTTGCCGAGCTAGATGGGCTGCACAGCAC 2516
Query 2517 TCAGGATGTGTTTGTGATTGGAGCCACCAACAGACCAGATCTCCTGGACCCTGCCCTTCTGCGGCCTGGCAGAT 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 TCAGGATGTGTTTGTGATTGGAGCCACCAACAGACCAGATCTCCTGGACCCTGCCCTTCTGCGGCCTGGCAGAT 2590
Query 2591 TTGACAAGCTGGTGTTTGTGGGGGCAAATGAGGACCGGGCCTCCCAGCTACGCGTTCTAAGTGCCATCACACGC 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 TTGACAAGCTGGTGTTTGTGGGGGCAAATGAGGACCGGGCCTCCCAGCTACGCGTTCTAAGTGCCATCACACGC 2664
Query 2665 AAATTCAAGCTAGAGCCATCTGTGAGCCTGGTAAACGTGCTAGATTGCTGCCCTCCCCAGCTGACGGGCGCGGA 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 AAATTCAAGCTAGAGCCATCTGTGAGCCTGGTAAACGTGCTAGATTGCTGCCCTCCCCAGCTGACGGGCGCGGA 2738
Query 2739 CCTCTACTCTCTCTGCTCTGATGCTATGACAGCTGCCCTCAAACGCAGGGTTCATGACCTGGAGGAAGGGCTGG 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 CCTCTACTCTCTCTGCTCTGATGCTATGACAGCTGCCCTCAAACGCAGGGTTCATGACCTGGAGGAAGGGCTGG 2812
Query 2813 AGCCAGGTAGCTCAGCACTGATGCTCACCATGGAGGACTTGCTGCAGGCTGCCGCCCGGCTGCAACCCTCAGTC 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 AGCCAGGTAGCTCAGCACTGATGCTCACCATGGAGGACTTGCTGCAGGCTGCCGCCCGGCTGCAACCCTCAGTC 2886
Query 2887 AGTGAGCAGGAGCTGCTCCGGTACAAGCGCATCCAGCGCAAGTTTGCTGCCTGCG 2941
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 AGTGAGCAGGAGCTGCTCCGGTACAAGCGCATCCAGCGCAAGTTTGCTGCCTGC- 2940