Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489298
• Subject: NM_145488.1
• Aligned Length: 2959
• Identities: 2503
• Gaps: 34

Alignment

Query    1  ATGGCGCTGGCTGTCTTGCGGGTCCTGGAGCCCTTTCCGACCGAGACACCCCCGTTGGCAGTGCTGCTGCCACC  74
            ||||||.||||||||.||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||.||||.||
Sbjct    1  ATGGCGTTGGCTGTCCTGCGCGTCCTGGACCCCTTCCCGACGGAGACACCACCGTTGGCGGTGCTGTTGCCTCC  74

Query   75  CGGGGGCCCGTGGCCGGCGGCGGAGCTGGGCCTGGTGCTGGCCCTGAGGCCTGCAGGGGAGAGCCCGGCAGGGC  148
            |||||||||||||||.|||.|||.||||||.|||||||||||.|||.||||.||..|.|||||.||.||...||
Sbjct   75  CGGGGGCCCGTGGCCAGCGACGGGGCTGGGGCTGGTGCTGGCACTGCGGCCGGCGAGCGAGAGTCCCGCGAAGC  148

Query  149  CGGCGCTGCTGGTGGCAGCCCTGG-AGGGGCCGGACGC---GGGCACCGAAGAGCAG---GGTCCCGGGCCGCC  215
            |.||||||||.|||||.|||.||| ||||.|||| |||   ||||      ||||||   ||.||.|||||.||
Sbjct  149  CCGCGCTGCTCGTGGCGGCCGTGGAAGGGTCCGG-CGCCCAGGGC------GAGCAGCGCGGGCCGGGGCCTCC  215

Query  216  GCAGCTACTGGTTAGCCGCGCGCTGCTGCGGCTCCTGGCACTGGGCTCCGGGGCCTGGGTGCGGGCGCGGGCGG  289
            ||.|||.|||||.||||||||||||||||||.||||.||.|||||..|||||||..|.||.||.||||||...|
Sbjct  216  GCCGCTGCTGGTGAGCCGCGCGCTGCTGCGGGTCCTAGCGCTGGGGCCCGGGGCGCGAGTACGAGCGCGGCTTG  289

Query  290  TGCGGCGGCCCCCGGCGCTAGGTTGGGCACTGCTTGGCACCTCGCTGGGGCCTGGGCTCGGACCGCGAGTCGGG  363
            |||||||.||||||||.||.||.|||||..||||||.|||..|.|.|||.||.|||||.||.||.|||||||||
Sbjct  290  TGCGGCGTCCCCCGGCCCTGGGCTGGGCGTTGCTTGCCACGGCTCCGGGACCCGGGCTAGGGCCTCGAGTCGGG  363

Query  364  CCGCTGCTGGTGAGGCGCGGAGAGACCCTCCCAGTGCCCGGACCGCGGGTGCTGGAGACGCGGCCGGCGTTGCA  437
            ||||||.|||||.|.|||||.|||||||||||.|||||||||.||||.|||.||||||||||.|||||..||||
Sbjct  364  CCGCTGTTGGTGCGCCGCGGGGAGACCCTCCCCGTGCCCGGATCGCGAGTGTTGGAGACGCGACCGGCCCTGCA  437

Query  438  AGGGCTGCTGGGCCCAGGGACTCGGCTGGCTGTGACTGAGCTCCGCGGGCGGGCCAGACTGTGTCC---AGAGT  508
            .|||.||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||| |.||   |||||
Sbjct  438  GGGGTTGCTGGGCCCGGGGACACGGCTGGCCGTGACTGAGCTCCGCGGGCGGGCCAAACTG-GGCCAGGAGAGT  510

Query  509  CTGGGGA-CAGCAGTCGGCCCCCACCCCCGCCCGTGGTGTCCTCCTTTGCGGTTTCTGGCACAGTGCGGCGACT  581
            |  |||| || |||.|..|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|.|||...|.|.||.||||||||
Sbjct  511  C--GGGATCA-CAGCCATCCCCCGCCCCCGCCCGTAGTGTCGTCCTTTGCAGCTTCCCACTCGGTCCGGCGACT  581

Query  582  CC-AGGGAGTTCTGGGAGGGACTGGAGATTCACTAGGGGTGAGCCGGAGCTGTCTCCGTGGCCTTGGCCTCTTC  654
            || |||| |||||||||||||||||||||.|.||.||.||||||||||||||||||||..|.||.||.||||||
Sbjct  582  CCGAGGG-GTTCTGGGAGGGACTGGAGATGCGCTGGGTGTGAGCCGGAGCTGTCTCCGGAGTCTCGGACTCTTC  654

Query  655  CAGGGCGAATGGGTGTGGGTGGCCCAGGCCAGAGAGTCATCGAACACTTCACAGCCGCACTTGGCTAGGGTGCA  728
            ||||||||||||||.|||||||||||||.|..|||||.|.|.|||.|.||.|||||||.|||||||...||.||
Sbjct  655  CAGGGCGAATGGGTCTGGGTGGCCCAGGTCGCAGAGTTACCCAACTCCTCGCAGCCGCGCTTGGCTCAAGTCCA  728

Query  729  GGTCCTAGAACCTCGCTGGGACCTCTCTGATAGACTGGGACCCGGCTCTGG---ACCGCTGGGAGAGCCCCTCG  799
            |||.||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||..|||.||   .|.||.|||||||||.||||
Sbjct  729  GGTTCTAGAACCGCGCTGGGAGCTGTCTGAGAGACTGGGACCCAACTCCGGGCAGCAGCCGGGAGAGCCACTCG  802

Query  800  CTGACGGACTGGCGCTTGTCCCTGCCACTTTGGCTTTTAATCTTGGCTGTGACCCCCTGGAAATGGGAGAGCTC  873
            ||||||||||||.|.||.|.||.||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  803  CTGACGGACTGGTGTTTCTGCCCGCCACTCTGGCTTTTAATCTCGGCTGTGACCCCCTGGAAGTGGGAGAGCTC  876

Query  874  AGAATTCAGAGGTACTTGGAAGGCTCCATCGCCCCTGAAGACAAAGGAAGCTGCTCATTGCTGCCTGGGCCTCC  947
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||..|||||||||||||.|||...|||||.||||||||
Sbjct  877  AGAATTCAGAGGTATTTGGAAGGCTCCATCGCCCCAGAGAACAAAGGAAGCTGTTCACCACTGCCCGGGCCTCC  950

Query  948  ATTTGCCAGAGAGTTACACATCGAAATTGTGTCTTCTCCCCACTACAGCACTAATGGAAATTATGACGGTGTTC  1021
            .|||||..|||||||||||||.||.|||.||||.||.||.||||||||..|||||||||||||||||..|||.|
Sbjct  951  GTTTGCTCGAGAGTTACACATTGAGATTCTGTCCTCGCCTCACTACAGTGCTAATGGAAATTATGACCATGTCC  1024

Query 1022  TTTACCGGCACTTTCAGATACCCAGGGTAGTCCAGGAAGGGGATGTTCTATGTGTGCCAACAATTGGGCAAGTA  1095
            |.||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||..|.||||||.|||||..|||||||||.
Sbjct 1025  TGTACCGGCACTTTCAGACACCCAGGGTGGTCCAGGAAGGGGATGTGTTGTGTGTGTCAACAGCTGGGCAAGTT  1098

Query 1096  GAGATCCTGGAAGGAAGTCCAGAGAAACTGCCCAGGTGGCGGGAAATGTTTTTTAAAGTGAAGAAAACAGTTGG  1169
            |||||||||||||||||.|..||||.||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1099  GAGATCCTGGAAGGAAGCCTGGAGAGACTGCCCAGGTGGCGGGAGATGTTTTTCAAAGTGAAGAAAACGGTTGG  1172

Query 1170  GGAAGCTCCAGATGGACCAGCCAGTGCCTACTTGGCCGACACCACCCATACCTCCTTGTACATGGTGGGTTCTA  1243
            .|||||.|||||.||.|||||||||||||...||||.||.||||||||.|||||.||.|||.|||..||..|..
Sbjct 1173  AGAAGCCCCAGAGGGGCCAGCCAGTGCCTTTCTGGCTGATACCACCCACACCTCTTTATACCTGGCTGGCACCG  1246

Query 1244  CCCTGAGCCCTGTTCCATGGCTCCCTTCAGAGGAA--TCCACTCTCTGGAGCAGTTTGTCTCCTCCAGGCCTGG  1315
            |||||||.|.|||.||||.|||.|||||  |||||  |||.|.|.||||..|||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1247  CCCTGAGTCATGTGCCATCGCTGCCTTC--AGGAAGGTCCCCACCCTGGGACAGCTTGTCTCCTCCAGGCCTGG  1318

Query 1316  AGGCCTTGGTGTCTGAACTCTGTGCTGTCCTGAAGCCTCGCCTCCAGCCAGGGGGTGCCCTGCTGACAGGAACT  1389
            ||||||||||...|||.||.||||||.||||||||||||.|||.|||||.||.||..|..||||.||||||||.
Sbjct 1319  AGGCCTTGGTAAATGAGCTGTGTGCTATCCTGAAGCCTCACCTGCAGCCCGGAGGAACATTGCTCACAGGAACC  1392

Query 1390  AGCAGTGTCCTTCTACGGGGCCCCCCAGGCTGTGGGAAGACCACAGTAGTTGCTGCTGCCTGTAGTCACCTTGG  1463
            |||.||||.|||||.|.|||.|||||||||.|.|||||||||||||..||..|.|||||.||.||.|.||||||
Sbjct 1393  AGCTGTGTGCTTCTGCAGGGTCCCCCAGGCAGCGGGAAGACCACAGCCGTCACGGCTGCATGCAGCCGCCTTGG  1466

Query 1464  GCTCCACTTACTGAAGGTGCCCTGCTCCAGCCTCTGTGCAGAAAGTAGTGGGGCTGTGGAGACAAAACTGCAGG  1537
            ||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||.||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 1467  GCTCCATTTGCTGAAGGTGCCCTGCTCCAGCCTCTGTGCAGACAGCAGTAGGGCCGTGGAGACAAAGCTGCAGG  1540

Query 1538  CCATCTTCTCCCGGGCCCGCCGTTGCCGGCCTGCAGTCCTGTTGCTCACAGCTGTGGACCTTCTGGGCCGGGAC  1611
            |||.||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||..||.|.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1541  CCACCTTCTCCCGGGCCCGCCGCTGCAGGCCTGCAGTCCTCCTGTTGACAGCTGTGGACCTCCTGGGCCGGGAC  1614

Query 1612  CGTGATGGGCTGGGTGAGGATGCCCGTGTGATGGCTGTGCTGCGTCACCTCCTCCTCAATGAGGACCCCCTCAA  1685
            ||.||.||.||||||||||||||||||||...|||....||.|||||.||||||||..||||||||.|.||||.
Sbjct 1615  CGAGACGGACTGGGTGAGGATGCCCGTGTTGCGGCCACACTCCGTCATCTCCTCCTTGATGAGGACGCTCTCAG  1688

Query 1686  CAGCTGCCCTCCCCTCATGGTTGTGGCCACCACAAGCCGGGCCCAGGACCTGCCTGCTGATGTGCAGACAGCAT  1759
            |||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|.||||||||||||..|.|||||||||||.||||
Sbjct 1689  CAGGTGCCCTCCTCTCATGGTGGTGGCTACCACAAGCCGTGTCCAGGACCTGCCCACCGATGTGCAGACGGCAT  1762

Query 1760  TTCCTCATGAGCTCGAGGTGCCTGCTCTGTCAGAGGGGCAGCGGCTCAGCATCCTGCGGGCCCTCACTGCCCAC  1833
            |||||||||||||.||||||||.|..|||||.||||..||.||||||||.|||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1763  TTCCTCATGAGCTAGAGGTGCCAGTGCTGTCTGAGGCTCAACGGCTCAGTATCCTGCAGGCCCTCACTGCCCAC  1836

Query 1834  CTTCCCCTGGGCCAGGAGGTGAACTTGGCACAGCTAGCACGGCGGTGTGCAGGCTTTGTGGTAGGGGATCTCTA  1907
            ||||||.|.|||||||||||.|||.||.|.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1837  CTTCCCTTAGGCCAGGAGGTTAACCTGCCCCAGCTGGCACGGCGCTGTGCGGGCTTTGTGGTGGGGGACCTCTA  1910

Query 1908  TGCCCTTCTGACCCACAGCAGCCGGGCAGCCTGCACCAGGATCAAGA-ACTCAGGTTTGGCAGGTGGCTTGACT  1980
            |||||||||||||||.|.|.||||||||||||||||||||||| ||| .|||.||.|.|||||||||.||||.|
Sbjct 1911  TGCCCTTCTGACCCATACCTGCCGGGCAGCCTGCACCAGGATC-AGAGCCTCGGGCTCGGCAGGTGGTTTGAGT  1983

Query 1981  GAGGAGGATGAGGGGGAGCTGTGTGCTGCCGGCTTTCCTCTCCTGGCTGAGGACTTTGGGCAGGCACTGGAGCA  2054
            |||||||||||||||||.|||||||..||.|||||||||.|.||||||||||||||.|||||||||.|.||.||
Sbjct 1984  GAGGAGGATGAGGGGGACCTGTGTGTGGCTGGCTTTCCTTTGCTGGCTGAGGACTTCGGGCAGGCATTAGATCA  2057

Query 2055  ACTGCAGACAGCTCACTCCCAGGCCGTTGGAGCCCCCAAGATCCCCTCAGTGTCCTGGCATGATGTGGGTGGGC  2128
            |||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||.||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||
Sbjct 2058  ACTGCAGACAGCTCACTCCCAAGCTGTGGGAGCACCCAGGATCCCTTCAGTGTCCTGGCACGACGTGGGCGGGC  2131

Query 2129  TGCAGGAGGTGAAGAAGGAGATCCTGGAGACCATTCAGCTCCCCCTGGAGCACCCTGAGCTACTGAGCCTGGGC  2202
            |||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 2132  TGCAGGATGTGAAGAAGGAGATCCTAGAAACCATCCAGCTGCCTCTGGAACACCCTGAGCTGCTCAGCCTGGGC  2205

Query 2203  CTGAGACGCTCAGGCCTTCTGCTCCATGGGCCCCCTGGCACCGGCAAGACCCTTCTGGCCAAGGCAGTAGCCAC  2276
            ||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 2206  CTAAGACGATCAGGCCTTCTGCTCCATGGGCCCCCAGGCACTGGCAAGACCCTGCTGGCCAAGGCCGTAGCCAC  2279

Query 2277  TGAGTGCAGCCTTACCTTCCTCAGCGTGAAGGGGCCAGAGCTCATTAACATGTATGTGGGCCAAAGTGAGGAGA  2350
            ||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2280  TGAGTGCAGCCTCACCTTCCTCAGTGTAAAGGGACCGGAGCTCATCAACATGTATGTGGGCCAAAGCGAGGAGA  2353

Query 2351  ATGTGCGGGAAGTATTTGCCAGGGCCAGGGCTGCAGCTCCATGCATTATCTTCTTTGATGAACTGGACTCTTTG  2424
            ||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct 2354  ATGTCCGGGAAGTGTTTGCCAGGGCCAGGGCTGCTGCTCCCTGTATCATCTTCTTTGATGAACTGGATTCCTTA  2427

Query 2425  GCCCCAAGCCGGGGGCGAAGTGGAGATTCTGGAGGAGTGATGGACAGGGTGGTGTCTCAGCTCCTTGCCGAGCT  2498
            ||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2428  GCTCCAAGCCGCGGACGGAGTGGAGATTCTGGAGGGGTGATGGACAGAGTTGTGTCTCAGCTCCTAGCCGAGCT  2501

Query 2499  AGATGGGCTGCACAGCACTCAGGATGTGTTTGTGATTGGAGCCACCAACAGACCAGATCTCCTGGACCCTGCCC  2572
            .||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 2502  GGATGGGCTCCACAGCACCCAGGATGTGTTTGTGATCGGAGCCACCAACAGACCAGACCTCCTGGACCCTGCCC  2575

Query 2573  TTCTGCGGCCTGGCAGATTTGACAAGCTGGTGTTTGTGGGGGCAAATGAGGACCGGGCCTCCCAGCTACGCGTT  2646
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|.|||||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct 2576  TTCTGCGGCCTGGCAGATTTGACAAGCTGGTGTTTGTAGGGGCGAGTGAGGACCGGGCCTCCCAGCTGCGTGTG  2649

Query 2647  CTAAGTGCCATCACACGCAAATTCAAGCTAGAGCCATCTGTGAGCCTGGTAAACGTGCTAGATTGCTGCCCTCC  2720
            ||.||.|||||||||||.||.||||||||.|||.|.|||||||||||||.|||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 2650  CTGAGCGCCATCACACGGAAGTTCAAGCTGGAGGCCTCTGTGAGCCTGGCAAACGTGCTGGATTGCTGCCCACC  2723

Query 2721  CCAGCTGACGGGCGCGGACCTCTACTCTCTCTGCTCTGATGCTATGACAGCTGCCCTCAAACGCAGGGTTCATG  2794
            |||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.||.||||...|||||||||||||||||||||..|
Sbjct 2724  CCAGCTGACTGGTGCAGATCTCTATTCTCTCTGCTCTGACGCCATGATGACTGCCCTCAAACGCAGGGTTCGAG  2797

Query 2795  ACCTGGAGGAAGGGCTGGAGCCAGGTAGCTCAGCACTGATGCTCACCATGGAGGACTTGCTGCAGGCTGCCGCC  2868
            ||||.|||||||||||.||||...|.||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||.|||
Sbjct 2798  ACCTAGAGGAAGGGCTAGAGCTGCGGAGCTCAGCACTGCTGCTCACCATGGAGGACCTGTTGCAGGCTGCAGCC  2871

Query 2869  CGGCTGCAACCCTCAGTCAGTGAGCAGGAGCTGCTCCGGTACAAGCGCATCCAGCGCAAGTTTGCTGCCTGCG  2941
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||.|.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||| 
Sbjct 2872  CGGCTGCAGCCCTCAGTCAGTGAGCAGGAGCTGTTGCGATACAAGCGCATCCAACGCAAGTTTGCCGCCTGC-  2943