Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489298
• Subject: NR_133009.2
• Aligned Length: 3444
• Identities: 2689
• Gaps: 750

Alignment

Query    1  -------------------------------ATGGCGCTGGCTGTCTTGCGGGTCCTGGAGCCCTTTCCGACCG  43
                                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  CCTTCACCCTCCTCGTTGGTGTCCTGTCACCATGGCGCTGGCTGTCTTGCGGGTCCTGGAGCCCTTTCCGACCG  74

Query   44  AGACACCCCCGTTGGCAGTGCTGCTGCCACCCGGGGGCCCGTGGCCGGCGGCGGAGCTGGGCCTGGTGCTGGCC  117
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGACACCCCCGTTGGCAGTGCTGCTGCCACCCGGGGGCCCGTGGCCGGCGGCGGAGCTGGGCCTGGTGCTGGCC  148

Query  118  CTGAGGCCTGCAGGGGAGAGCCCGGCAGGGCCGGCGCTGCTGGTGGCAGCCCTGGAGGGGCCGGACGCGGGCAC  191
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTGAGGCCTGCAGGGGAGAGCCCGGCAGGGCCGGCGCTGCTGGTGGCAGCCCTGGAGGGGCCGGACGCGGGCAC  222

Query  192  CGAAGAGCAGGGTCCCGGGCCGCCGCAGCTACTGGTTAGCCGCGCGCTGCTGCGGCTCCTGGCACTGGGCTCCG  265
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGAAGAGCAGGGTCCCGGGCCGCCGCAGCTACTGGTTAGCCGCGCGCTGCTGCGGCTCCTGGCACTGGGCTCCG  296

Query  266  GGGCCTGGGTGCGGGCGCGGGCGGTGCGGCGGCCCCCGGCGCTAGGTTGGGCACTGCTTGGCACCTCGCTGGGG  339
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGGCCTGGGTGCGGGCGCGGGCGGTGCGGCGGCCCCCGGCGCTAGGTTGGGCACTGCTTGGCACCTCGCTGGGG  370

Query  340  CCTGGGCTCGGACCGCGAGTCGGGCCGCTGCTGGTGAGGCGCGGAGAGACCCTCCCAGTGCCCGGACCGCGGGT  413
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCTGGGCTCGGACCGCGAGTCGGGCCGCTGCTGGTGAGGCGCGGAGAGACCCTCCCAGTGCCCGGACCGCGGGT  444

Query  414  GCTGGAGACGCGGCCGGCGTTGCAAGGGCTGCTGGGCCCAGGGACTCGGCTGGCTGTGACTGAGCTCCGCGGGC  487
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCTGGAGACGCGGCCGGCGTTGCAAGGGCTGCTGGGCCCAGGGACTCGGCTGGCTGTGACTGAGCTCCGCGGGC  518

Query  488  GGGCCAGACTGTGTCCAGAGTCTGGGGACAGCAGTCGGCCCCCACCCCCGCCCGTGGTGTCCTCCTTTGCGGTT  561
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGGCCAGACTGTGTCCAGAGTCTGGGGACAGCAGTCGGCCCCCACCCCCGCCCGTGGTGTCCTCCTTTGCGGTT  592

Query  562  TCTGGCACAGTGCGGCGACTCCAGGGAGTTCTGGGAGGGACTGGAGATTCACTAGGGGTGAGCCGGAGCTGTCT  635
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCTGGCACAGTGCGGCGACTCCAGGGAGTTCTGGGAGGGACTGGAGATTCACTAGGGGTGAGCCGGAGCTGTCT  666

Query  636  CCGTGGCCTTGGCCTCTTCCAGGGCGAATGGGTGTGGGTGGCCCAGGCCAGAGAGTCATCGAACACTTCACAGC  709
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCGTGGCCTTGGCCTCTTCCAGGGCGAATGGGTGTGGGTGGCCCAGGCCAGAGAGTCATCGAACACTTCACAGC  740

Query  710  CGCACTTGGCTAGGGTGCAGGTCCTAGAACCTCGCTGGGACCTCTCTGATAGACTGGGACCCGGCTCTGGACCG  783
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CGCACTTGGCTAGGGTGCAGGTCCTAGAACCTCGCTGGGACCTCTCTGATAGACTGGGACCCGGCTCTGGACCG  814

Query  784  CTGGGAGAGCCCCTCGCTGACGGACTGGCGCTTGTCCCTGCCACTTTGGCTTTTAATCTTGGCTGTGACCCCCT  857
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTGGGAGAGCCCCTCGCTGACGGACTGGCGCTTGTCCCTGCCACTTTGGCTTTTAATCTTGGCTGTGACCCCCT  888

Query  858  GGAAATGGGAGAGCTCAGAATTCAGAGGTACTTGGAAGGCTCCATCGCCCCTGAAGACAAAGGAAGCTGCTCAT  931
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGAAATGGGAGAGCTCAGAATTCAGAGGTACTTGGAAGGCTCCATCGCCCCTGAAGACAAAGGAAGCTGCTCAT  962

Query  932  TGCTGCCTGGGCCTCCATTTGCCAGAGAGTTACACATCGAAATTGTGTCTTCTCCCCACTACAGCACTAATGGA  1005
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGCTGCCTGGGCCTCCATTTGCCAGAGAGTTACACATCGAAATTGTGTCTTCTCCCCACTACAGCACTAATGGA  1036

Query 1006  AATTATGACGGTGTTCTTTACCGGCACTTTCAGATACCCAGGGTAGTCCAGGAAGGGGATGTTCTATGTGTGCC  1079
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AATTATGACGGTGTTCTTTACCGGCACTTTCAGATACCCAGGGTAGTCCAGGAAGGGGATGTTCTATGTGTGCC  1110

Query 1080  AACAATTGGGCAAGTAGAGATCCTGGAAGGAAGTCCAGAGAAACTGCCCAGGTGGCGGGAAATGTTTTTTAAAG  1153
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AACAATTGGGCAAGTAGAGATCCTGGAAGGAAGTCCAGAGAAACTGCCCAGGTGGCGGGAAATGTTTTTTAAAG  1184

Query 1154  TGAAGAAAACAGTTGGGGAAGCTCCAGATGGACCAGCCAGTGCCTACTTGGCCGACACCACCCATACCTCCTTG  1227
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGAAGAAAACAGTTGGGGAAGCTCCAGATGGACCAGCCAGTGCCTACTTGGCCGACACCACCCATACCTCCTTG  1258

Query 1228  TACATGGTGGGTTCTACCCTGAGCCCTGTTCCATGGCTCCCTTCAGAGGAATCCACTCTCTGGAGCAGTTTGTC  1301
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TACATGGTGGGTTCTACCCTGAGCCCTGTTCCATGGCTCCCTTCAGAGGAATCCACTCTCTGGAGCAGTTTGTC  1332

Query 1302  TCCTCCAGGCCTGGAGGCCTTGGTGTCTGAACTCTGTGCTGTCCTGAAGCCTCGCCTCCAGCCAGGGGGTGCCC  1375
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TCCTCCAGGCCTGGAGGCCTTGGTGTCTGAACTCTGTGCTGTCCTGAAGCCTCGCCTCCAGCCAGGGGGTGCCC  1406

Query 1376  TGCTGACAGGAACTAGCAGTGTCCTTCTACGGGGCCCCCCAGGCTGTGGGAAGACCACAGTAGTTGCTGCTGCC  1449
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGCTGACAGGAACTAGCAGTGTCCTTCTACGGGGCCCCCCAGGCTGTGGGAAGACCACAGTAGTTGCTGCTGCC  1480

Query 1450  TGTAGTCACCTTGGGCTCCACTTACTGAAGGTGCCCTGCTCCAGCCTCTGTGCAGAAAGTAGTGGGGCTGTGGA  1523
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGTAGTCACCTTGGGCTCCACTTACTGAAGGTGCCCTGCTCCAGCCTCTGTGCAGAAAGTAGTGGGGCTGTGGA  1554

Query 1524  GACAAAACTGCAGGCCATCTTCTCCCGGGCCCGCCGTTGCCGGCCTGCAGTCCTGTTGCTCACAGCTGTGGACC  1597
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GACAAAACTGCAGGCCATCTTCTCCCGGGCCCGCCGTTGCCGGCCTGCAGTCCTGTTGCTCACAGCTGTGGACC  1628

Query 1598  TTCTGGGCCGGGACCGTGATGGGCTGGGTGAGGATGCCCGTGTGATGGCTGTGCTGCGTCACCTCCTCCTCAAT  1671
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TTCTGGGCCGGGACCGTGATGGGCTGGGTGAGGATGCCCGTGTGATGGCTGTGCTGCGTCACCTCCTCCTCAAT  1702

Query 1672  GAGGACCCCCTCAACAGCTGCCCTCCCCTCATGGTTGTGGCCACCACAAGCCGGGCCCAGGACCTGCCTGCTGA  1745
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GAGGACCCCCTCAACAGCTGCCCTCCCCTCATGGTTGTGGCCACCACAAGCCGGGCCCAGGACCTGCCTGCTGA  1776

Query 1746  TGTGCAGACAGCATTTCCTCATGAGCTCGAGGTGCCTGCTCTGTCAGAGGGGCAGCGGCTCAGCATCCTGCGGG  1819
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TGTGCAGACAGCATTTCCTCATGAGCTCGAGGTGCCTGCTCTGTCAGAGGGGCAGCGGCTCAGCATCCTGCGGG  1850

Query 1820  CCCTCACTGCCCACCTTCCCCTGGGCCAGGAGGTGAACTTGGCACAGCTAGCACGGCGGTGTGCAGGCTTTGTG  1893
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CCCTCACTGCCCACCTTCCCCTGGGCCAGGAGGTGAACTTGGCACAGCTAGCACGGCGGTGTGCAGGCTTTGTG  1924

Query 1894  GTAGGGGATCTCTATGCCCTTCTGACCCACAGCAGCCGGGCAGCCTGCACCAGGATCAAGAACTCAGGTTTGGC  1967
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GTAGGGGATCTCTATGCCCTTCTGACCCACAGCAGCCGGGCAGCCTGCACCAGGATCAAGAACTCAGGTTTGGC  1998

Query 1968  AGGTGGCTTGACTGAGGAGGATGAGGGGGAGCTGTGTGCTGCCGGCTTTCCTCTCCTGGCTGAGGACTTTGGGC  2041
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AGGTGGCTTGACTGAGGAGGATGAGGGGGAGCTGTGTGCTGCCGGCTTTCCTCTCCTGGCTGAGGACTTTGGGC  2072

Query 2042  AGGCACTGGAGCAACTGCAGACAGCTCACTCCCAGGCCGTTGGAGCCCCCAAGATCCCCTCAGTGTCCTGGCAT  2115
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     
Sbjct 2073  AGGCACTGGAGCAACTGCAGACAGCTCACTCCCAGGCCGTTGGAGCCCCCAAG---------------------  2125

Query 2116  GATGTGGGTGGGCTGCAGGAGGTGAAGAAGGAGATCCTGGAGACCATTCAGCTCCCCCTGGAGCACCCTGAGCT  2189
                                                .|||||||||                            
Sbjct 2126  ------------------------------------GTGGAGACCA----------------------------  2135

Query 2190  ACTGAGCCTGGGCCTGAGACGCTCAGGCCTTCTGCTCCATGGGCCCCCTGGCACCGGCAAGACCCTTCTGGCCA  2263
                                    ||.||||                                           
Sbjct 2136  ------------------------AGTCCTT-------------------------------------------  2142

Query 2264  AGGCAGTAGCCACTGAGTGCAGCCTTACCTTCCTCAGCGTGAAGGGGCCAGAGCTCATTAACATGTATGTGGGC  2337
                                                                                      
Sbjct 2143  --------------------------------------------------------------------------  2142

Query 2338  CAAAGTGAGGAGAATGTGCGGGAAGTATTTGCCAGGGCCAGGGCTGCAGCTCCATGCATTATCTTCTTTGATGA  2411
                                 |.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2143  ---------------------GGAGTGTTTGCCAGGGCCAGGGCTGCAGCTCCATGCATTATCTTCTTTGATGA  2195

Query 2412  ACTGGACTCTTTGGCCCCAAGCCGGGGGCGAAGTGGAGATTCTGGAGGAGTGATGGACAGGGTGGTGTCTCAGC  2485
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2196  ACTGGACTCTTTGGCCCCAAGCCGGGGGCGAAGTGGAGATTCTGGAGGAGTGATGGACAGGGTGGTGTCTCAGC  2269

Query 2486  TCCTTGCCGAGCTAGATGGGCTGCACAGCACTCAGGATGTGTTTGTGATTGGAGCCACCAACAGACCAGATCTC  2559
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2270  TCCTTGCCGAGCTAGATGGGCTGCACAGCACTCAGGATGTGTTTGTGATTGGAGCCACCAACAGACCAGATCTC  2343

Query 2560  CTGGACCCTGCCCTTCTGCGGCCTGGCAGATTTGACAAGCTGGTGTTTGTGGGGGCAAATGAGGACCGGGCCTC  2633
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2344  CTGGACCCTGCCCTTCTGCGGCCTGGCAGATTTGACAAGCTGGTGTTTGTGGGGGCAAATGAGGACCGGGCCTC  2417

Query 2634  CCAGCTACGCGTTCTAAGTGCCATCACACGCAAATTCAAGCTAGAGCCATCTGTGAGCCTGGTAAACGTGCTAG  2707
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2418  CCAGCTACGCGTTCTAAGTGCCATCACACGCAAATTCAAGCTAGAGCCATCTGTGAGCCTGGTAAACGTGCTAG  2491

Query 2708  ATTGCTGCCCTCCCCAGCTGACGGGCGCGGACCTCTACTCTCTCTGCTCTGATGCTATGACAGCTGCCCTCAAA  2781
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2492  ATTGCTGCCCTCCCCAGCTGACGGGCGCGGACCTCTACTCTCTCTGCTCTGATGCTATGACAGCTGCCCTCAAA  2565

Query 2782  CGCAGGGTTCATGACCTGGAGGAAGGGCTGGAGCCAGGTAGCTCAGCACTGATGCTCACCATGGAGGACTTGCT  2855
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2566  CGCAGGGTTCATGACCTGGAGGAAGGGCTGGAGCCAGGTAGCTCAGCACTGATGCTCACCATGGAGGACTTGCT  2639

Query 2856  GCAGGCTGCCGCCCGGCTGCAACCCTCAGTCAGTGAGCAGGAGCTGCTCCGGTACAAGCGCATCCAGCGCAAGT  2929
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2640  GCAGGCTGCCGCCCGGCTGCAACCCTCAGTCAGTGAGCAGGAGCTGCTCCGGTACAAGCGCATCCAGCGCAAGT  2713

Query 2930  TTGCTGCCTGCG--------------------------------------------------------------  2941
            |||||||||||.                                                              
Sbjct 2714  TTGCTGCCTGCTAGGAGCCCCCCAGGGTCTGGGACCCCGCTCAGCATGGCTGCAGGTACCTTGATAGCCCACAG  2787

Query 2942  --------------------------------------------------------------------------  2941
                                                                                      
Sbjct 2788  AGAGATCTGGGAAGGAAGGGCTCCTCCTCAGGCTGCTGCCAACCCACCTGGAGGCCACCTCCCTCCAGGAGATC  2861

Query 2942  --------------------------------------------------------------------------  2941
                                                                                      
Sbjct 2862  CCAGGGTGCAAAGTGGCATTGAGACAGCAGCAACAGCTCAAGAGATATCTCCTGCCTACTTGCCCCTCCTTCCA  2935

Query 2942  --------------------------------------------------------------------------  2941
                                                                                      
Sbjct 2936  GGCCGGCTCTAAGAGAAAGGCCCATCTACTCAGGAAGAGGGCCAGGGCCTTGGGTTCTGGGGATTGGGCCCTGA  3009

Query 2942  --------------------------------------------------------------------------  2941
                                                                                      
Sbjct 3010  GAGGGCTAGTTCTGTGGCTGAAAATAAAGCATGTCCCGCCCCCTACTGGTGTTGTGGCATGAAAGGTTGGAGTG  3083

Query 2942  --------------------------------------------------------------------------  2941
                                                                                      
Sbjct 3084  AGAAAGAGCAGGGTTGTGGGAGGAGTAAGCCCTGGGAGAGGGTGGGGGGGTGGGCAGCATGGGAGCCTGATCCT  3157

Query 2942  ----------------------------------------  2941
                                                    
Sbjct 3158  TCTGACATAAATAAACACAATGCATGCAGGAACTGAAAAA  3197