Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489298
• Subject: XM_011514661.2
• Aligned Length: 2941
• Identities: 2855
• Gaps: 85

Alignment

Query    1  ATGGCGCTGGCTGTCTTGCGGGTCCTGGAGCCCTTTCCGACCGAGACACCCCCGTTGGCAGTGCTGCTGCCACC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGCTGGCTGTCTTGCGGGTCCTGGAGCCCTTTCCGACCGAGACACCCCCGTTGGCAGTGCTGCTGCCACC  74

Query   75  CGGGGGCCCGTGGCCGGCGGCGGAGCTGGGCCTGGTGCTGGCCCTGAGGCCTGCAGGGGAGAGCCCGGCAGGGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGGGGGCCCGTGGCCGGCGGCGGAGCTGGGCCTGGTGCTGGCCCTGAGGCCTGCAGGGGAGAGCCCGGCAGGGC  148

Query  149  CGGCGCTGCTGGTGGCAGCCCTGGAGGGGCCGGACGCGGGCACCGAAGAGCAGGGTCCCGGGCCGCCGCAGCTA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGGCGCTGCTGGTGGCAGCCCTGGAGGGGCCGGACGCGGGCACCGAAGAGCAGGGTCCCGGGCCGCCGCAGCTA  222

Query  223  CTGGTTAGCCGCGCGCTGCTGCGGCTCCTGGCACTGGGCTCCGGGGCCTGGGTGCGGGCGCGGGCGGTGCGGCG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGGTTAGCCGCGCGCTGCTGCGGCTCCTGGCACTGGGCTCCGGGGCCTGGGTGCGGGCGCGGGCGGTGCGGCG  296

Query  297  GCCCCCGGCGCTAGGTTGGGCACTGCTTGGCACCTCGCTGGGGCCTGGGCTCGGACCGCGAGTCGGGCCGCTGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCCCCCGGCGCTAGGTTGGGCACTGCTTGGCACCTCGCTGGGGCCTGGGCTCGGACCGCGAGTCGGGCCGCTGC  370

Query  371  TGGTGAGGCGCGGAGAGACCCTCCCAGTGCCCGGACCGCGGGTGCTGGAGACGCGGCCGGCGTTGCAAGGGCTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGGTGAGGCGCGGAGAGACCCTCCCAGTGCCCGGACCGCGGGTGCTGGAGACGCGGCCGGCGTTGCAAGGGCTG  444

Query  445  CTGGGCCCAGGGACTCGGCTGGCTGTGACTGAGCTCCGCGGGCGGGCCAGACTGTGTCCAGAGTCTGGGGACAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGGGCCCAGGGACTCGGCTGGCTGTGACTGAGCTCCGCGGGCGGGCCAGACTGTGTCCAGAGTCTGGGGACAG  518

Query  519  CAGTCGGCCCCCACCCCCGCCCGTGGTGTCCTCCTTTGCGGTTTCTGGCACAGTGCGGCGACTCCAGGGAGTTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAGTCGGCCCCCACCCCCGCCCGTGGTGTCCTCCTTTGCGGTTTCTGGCACAGTGCGGCGACTCCAGGGAGTTC  592

Query  593  TGGGAGGGACTGGAGATTCACTAGGGGTGAGCCGGAGCTGTCTCCGTGGCCTTGGCCTCTTCCAGGGCGAATGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGGAGGGACTGGAGATTCACTAGGGGTGAGCCGGAGCTGTCTCCGTGGCCTTGGCCTCTTCCAGGGCGAATGG  666

Query  667  GTGTGGGTGGCCCAGGCCAGAGAGTCATCGAACACTTCACAGCCGCACTTGGCTAGGGTGCAGGTCCTAGAACC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTGTGGGTGGCCCAGGCCAGAGAGTCATCGAACACTTCACAGCCGCACTTGGCTAGGGTGCAGGTCCTAGAACC  740

Query  741  TCGCTGGGACCTCTCTGATAGACTGGGACCCGGCTCTGGACCGCTGGGAGAGCCCCTCGCTGACGGACTGGCGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCGCTGGGACCTCTCTGATAGACTGGGACCCGGCTCTGGACCGCTGGGAGAGCCCCTCGCTGACGGACTGGCGC  814

Query  815  TTGTCCCTGCCACTTTGGCTTTTAATCTTGGCTGTGACCCCCTGGAAATGGGAGAGCTCAGAATTCAGAGGTAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTGTCCCTGCCACTTTGGCTTTTAATCTTGGCTGTGACCCCCTGGAAATGGGAGAGCTCAGAATTCAGAGGTAC  888

Query  889  TTGGAAGGCTCCATCGCCCCTGAAGACAAAGGAAGCTGCTCATTGCTGCCTGGGCCTCCATTTGCCAGAGAGTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTGGAAGGCTCCATCGCCCCTGAAGACAAAGGAAGCTGCTCATTGCTGCCTGGGCCTCCATTTGCCAGAGAGTT  962

Query  963  ACACATCGAAATTGTGTCTTCTCCCCACTACAGCACTAATGGAAATTATGACGGTGTTCTTTACCGGCACTTTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACACATCGAAATTGTGTCTTCTCCCCACTACAGCACTAATGGAAATTATGACGGTGTTCTTTACCGGCACTTTC  1036

Query 1037  AGATACCCAGGGTAGTCCAGGAAGGGGATGTTCTATGTGTGCCAACAATTGGGCAAGTAGAGATCCTGGAAGGA  1110
            |||||                                                                     
Sbjct 1037  AGATA---------------------------------------------------------------------  1041

Query 1111  AGTCCAGAGAAACTGCCCAGGTGGCGGGAAATGTTTTTTAAAGTGAAGAAAACAGTTGGGGAAGCTCCAGATGG  1184
                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1042  ---------------CCCAGGTGGCGGGAAATGTTTTTTAAAGTGAAGAAAACAGTTGGGGAAGCTCCAGATGG  1100

Query 1185  ACCAGCCAGTGCCTACTTGGCCGACACCACCCATACCTCCTTGTACATGGTGGGTTCTACCCTGAGCCCTGTTC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1101  ACCAGCCAGTGCCTACTTGGCCGACACCACCCATACCTCCTTGTACATGGTGGGTTCTACCCTGAGCCCTGTTC  1174

Query 1259  CATGGCTCCCTTCAGAGGAATCCACTCTCTGGAGCAGTTTGTCTCCTCCAGGCCTGGAGGCCTTGGTGTCTGAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1175  CATGGCTCCCTTCAGAGGAATCCACTCTCTGGAGCAGTTTGTCTCCTCCAGGCCTGGAGGCCTTGGTGTCTGAA  1248

Query 1333  CTCTGTGCTGTCCTGAAGCCTCGCCTCCAGCCAGGGGGTGCCCTGCTGACAGGAACTAGCAGTGTCCTTCTACG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1249  CTCTGTGCTGTCCTGAAGCCTCGCCTCCAGCCAGGGGGTGCCCTGCTGACAGGAACTAGCAGTGTCCTTCTACG  1322

Query 1407  GGGCCCCCCAGGCTGTGGGAAGACCACAGTAGTTGCTGCTGCCTGTAGTCACCTTGGGCTCCACTTACTGAAGG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1323  GGGCCCCCCAGGCTGTGGGAAGACCACAGTAGTTGCTGCTGCCTGTAGTCACCTTGGGCTCCACTTACTGAAGG  1396

Query 1481  TGCCCTGCTCCAGCCTCTGTGCAGAAAGTAGTGGGGCTGTGGAGACAAAACTGCAGGCCATCTTCTCCCGGGCC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1397  TGCCCTGCTCCAGCCTCTGTGCAGAAAGTAGTGGGGCTGTGGAGACAAAACTGCAGGCCATCTTCTCCCGGGCC  1470

Query 1555  CGCCGTTGCCGGCCTGCAGTCCTGTTGCTCACAGCTGTGGACCTTCTGGGCCGGGACCGTGATGGGCTGGGTGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1471  CGCCGTTGCCGGCCTGCAGTCCTGTTGCTCACAGCTGTGGACCTTCTGGGCCGGGACCGTGATGGGCTGGGTGA  1544

Query 1629  GGATGCCCGTGTGATGGCTGTGCTGCGTCACCTCCTCCTCAATGAGGACCCCCTCAACAGCTGCCCTCCCCTCA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1545  GGATGCCCGTGTGATGGCTGTGCTGCGTCACCTCCTCCTCAATGAGGACCCCCTCAACAGCTGCCCTCCCCTCA  1618

Query 1703  TGGTTGTGGCCACCACAAGCCGGGCCCAGGACCTGCCTGCTGATGTGCAGACAGCATTTCCTCATGAGCTCGAG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1619  TGGTTGTGGCCACCACAAGCCGGGCCCAGGACCTGCCTGCTGATGTGCAGACAGCATTTCCTCATGAGCTCGAG  1692

Query 1777  GTGCCTGCTCTGTCAGAGGGGCAGCGGCTCAGCATCCTGCGGGCCCTCACTGCCCACCTTCCCCTGGGCCAGGA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1693  GTGCCTGCTCTGTCAGAGGGGCAGCGGCTCAGCATCCTGCGGGCCCTCACTGCCCACCTTCCCCTGGGCCAGGA  1766

Query 1851  GGTGAACTTGGCACAGCTAGCACGGCGGTGTGCAGGCTTTGTGGTAGGGGATCTCTATGCCCTTCTGACCCACA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1767  GGTGAACTTGGCACAGCTAGCACGGCGGTGTGCAGGCTTTGTGGTAGGGGATCTCTATGCCCTTCTGACCCACA  1840

Query 1925  GCAGCCGGGCAGCCTGCACCAGGATCAAGAACTCAGGTTTGGCAGGTGGCTTGACTGAGGAGGATGAGGGGGAG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1841  GCAGCCGGGCAGCCTGCACCAGGATCAAGAACTCAGGTTTGGCAGGTGGCTTGACTGAGGAGGATGAGGGGGAG  1914

Query 1999  CTGTGTGCTGCCGGCTTTCCTCTCCTGGCTGAGGACTTTGGGCAGGCACTGGAGCAACTGCAGACAGCTCACTC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1915  CTGTGTGCTGCCGGCTTTCCTCTCCTGGCTGAGGACTTTGGGCAGGCACTGGAGCAACTGCAGACAGCTCACTC  1988

Query 2073  CCAGGCCGTTGGAGCCCCCAAGATCCCCTCAGTGTCCTGGCATGATGTGGGTGGGCTGCAGGAGGTGAAGAAGG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1989  CCAGGCCGTTGGAGCCCCCAAGATCCCCTCAGTGTCCTGGCATGATGTGGGTGGGCTGCAGGAGGTGAAGAAGG  2062

Query 2147  AGATCCTGGAGACCATTCAGCTCCCCCTGGAGCACCCTGAGCTACTGAGCCTGGGCCTGAGACGCTCAGGCCTT  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2063  AGATCCTGGAGACCATTCAGCTCCCCCTGGAGCACCCTGAGCTACTGAGCCTGGGCCTGAGACGCTCAGGCCTT  2136

Query 2221  CTGCTCCATGGGCCCCCTGGCACCGGCAAGACCCTTCTGGCCAAGGCAGTAGCCACTGAGTGCAGCCTTACCTT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2137  CTGCTCCATGGGCCCCCTGGCACCGGCAAGACCCTTCTGGCCAAGGCAGTAGCCACTGAGTGCAGCCTTACCTT  2210

Query 2295  CCTCAGCGTGAAGGGGCCAGAGCTCATTAACATGTATGTGGGCCAAAGTGAGGAGAATGTGCGGGAAGTATTTG  2368
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2211  CCTCAGCGTGAAGGGGCCAGAGCTCATTAACATGTATGTGGGCCAAAGTGAGGAGAATGTGCGGGAAGTGTTTG  2284

Query 2369  CCAGGGCCAGGGCTGCAGCTCCATGCATTATCTTCTTTGATGAACTGGACTCTTTGGCCCCAAGCCGGGGGCGA  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2285  CCAGGGCCAGGGCTGCAGCTCCATGCATTATCTTCTTTGATGAACTGGACTCTTTGGCCCCAAGCCGGGGGCGA  2358

Query 2443  AGTGGAGATTCTGGAGGAGTGATGGACAGGGTGGTGTCTCAGCTCCTTGCCGAGCTAGATGGGCTGCACAGCAC  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2359  AGTGGAGATTCTGGAGGAGTGATGGACAGGGTGGTGTCTCAGCTCCTTGCCGAGCTAGATGGGCTGCACAGCAC  2432

Query 2517  TCAGGATGTGTTTGTGATTGGAGCCACCAACAGACCAGATCTCCTGGACCCTGCCCTTCTGCGGCCTGGCAGAT  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2433  TCAGGATGTGTTTGTGATTGGAGCCACCAACAGACCAGATCTCCTGGACCCTGCCCTTCTGCGGCCTGGCAGAT  2506

Query 2591  TTGACAAGCTGGTGTTTGTGGGGGCAAATGAGGACCGGGCCTCCCAGCTACGCGTTCTAAGTGCCATCACACGC  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2507  TTGACAAGCTGGTGTTTGTGGGGGCAAATGAGGACCGGGCCTCCCAGCTACGCGTTCTAAGTGCCATCACACGC  2580

Query 2665  AAATTCAAGCTAGAGCCATCTGTGAGCCTGGTAAACGTGCTAGATTGCTGCCCTCCCCAGCTGACGGGCGCGGA  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2581  AAATTCAAGCTAGAGCCATCTGTGAGCCTGGTAAACGTGCTAGATTGCTGCCCTCCCCAGCTGACGGGCGCGGA  2654

Query 2739  CCTCTACTCTCTCTGCTCTGATGCTATGACAGCTGCCCTCAAACGCAGGGTTCATGACCTGGAGGAAGGGCTGG  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2655  CCTCTACTCTCTCTGCTCTGATGCTATGACAGCTGCCCTCAAACGCAGGGTTCATGACCTGGAGGAAGGGCTGG  2728

Query 2813  AGCCAGGTAGCTCAGCACTGATGCTCACCATGGAGGACTTGCTGCAGGCTGCCGCCCGGCTGCAACCCTCAGTC  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2729  AGCCAGGTAGCTCAGCACTGATGCTCACCATGGAGGACTTGCTGCAGGCTGCCGCCCGGCTGCAACCCTCAGTC  2802

Query 2887  AGTGAGCAGGAGCTGCTCCGGTACAAGCGCATCCAGCGCAAGTTTGCTGCCTGCG  2941
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct 2803  AGTGAGCAGGAGCTGCTCCGGTACAAGCGCATCCAGCGCAAGTTTGCTGCCTGC-  2856