Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000489367
- Subject:
- NM_177990.3
- Aligned Length:
- 2158
- Identities:
- 2126
- Gaps:
- 31
Alignment
Query 1 ATGTTTGGGAAGAAAAAGAAAAAGATTGAAATATCTGGCCCGTCCAACTTTGAACACAGGGTTCATACTGGGTT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTTTGGGAAGAAAAAGAAAAAGATTGAAATATCTGGCCCGTCCAACTTTGAACACAGGGTTCATACTGGGTT 74
Query 75 TGATCCACAAGAGCAGAAGTTTACCGGCCTTCCCCAGCAGTGGCACAGCCTGTTAGCAGATACGGCCAACAGGC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGATCCACAAGAGCAGAAGTTTACCGGCCTTCCCCAGCAGTGGCACAGCCTGTTAGCAGATACGGCCAACAGGC 148
Query 149 CAAAGCCTATGGTGGACCCTTCATGCATCACACCCATCCAGCTGGCTCCTATGAAGACAATCGTTAGAGGAAAC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CAAAGCCTATGGTGGACCCTTCATGCATCACACCCATCCAGCTGGCTCCTATGAAGACAATCGTTAGAGGAAAC 222
Query 223 AAACCCTGCAAGGAAACCTCCATCAACGGCCTGCTAGAGGATTTTGACAACATCTCGGTGACTCGCTCCAACTC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AAACCCTGCAAGGAAACCTCCATCAACGGCCTGCTAGAGGATTTTGACAACATCTCGGTGACTCGCTCCAACTC 296
Query 297 CCTAAGGAAAGAAAGCCCACCCACCCCAGATCAGGGAGCCTCCAGCCACGGTCCAGGCCACGCGGAAGAAAATG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCTAAGGAAAGAAAGCCCACCCACCCCAGATCAGGGAGCCTCCAGCCACGGTCCAGGCCACGCGGAAGAAAATG 370
Query 371 GCTTCATCACCTTCTCCCAGTATTCCAGCGAATCCGATACTACTGCTGACTACACGACCGAAAAGTACAGGGAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GCTTCATCACCTTCTCCCAGTATTCCAGCGAATCCGATACTACTGCTGACTACACGACCGAAAAGTACAGGGAG 444
Query 445 AAGAGTCTCTATGGAGATGATCTGGATCCGTATTATAGAGGCAGCCACGCAGCCAAGCAAAATGGGCACGTAAT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAGAGTCTCTATGGAGATGATCTGGATCCGTATTATAGAGGCAGCCACGCAGCCAAGCAAAATGGGCACGTAAT 518
Query 519 GAAAATGAAGCACGGGGAGGCCTACTATTCTGAGGTGAAGCCTTTGAAATCCGATTTTGCCAGATTTTCTGCCG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GAAAATGAAGCACGGGGAGGCCTACTATTCTGAGGTGAAGCCTTTGAAATCCGATTTTGCCAGATTTTCTGCCG 592
Query 593 ATTATCACTCACATTTGGACTCACTGAGCAAACCAAGTGAATACAGTGACCTCAAGTGGGAGTATCAGAGAGCC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATTATCACTCACATTTGGACTCACTGAGCAAACCAAGTGAATACAGTGACCTCAAGTGGGAGTATCAGAGAGCC 666
Query 667 TCGAGTAGCTCCCCTCTGGATTATTCATTCCAATTCACACCTTCTAGAACTGCAGGGACCAGCGGGTGCTCCAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TCGAGTAGCTCCCCTCTGGATTATTCATTCCAATTCACACCTTCTAGAACTGCAGGGACCAGCGGGTGCTCCAA 740
Query 741 GGAGAGCCTGGCGTACAGTGAAAGTGAATGGGGACCCAGCCTGGATGACTATGACAGGAGGCCAAAGTCTTCGT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGAGAGCCTGGCGTACAGTGAAAGTGAATGGGGACCCAGCCTGGATGACTATGACAGGAGGCCAAAGTCTTCGT 814
Query 815 ACCTGAATCAGACAAGCCCTCAGCCCACCATGCGGCAGAGGTCCAGGTCAGGCTCGGGACTCCAGGAACCGATG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ACCTGAATCAGACAAGCCCTCAGCCCACCATGCGGCAGAGGTCCAGGTCAGGCTCGGGACTCCAGGAACCGATG 888
Query 889 ATGCCATTTGGAGCAAGTGCATTTAAAACCCATCCCCAAGGACACTCCTACAACTCCTACACCTACCCTCGCTT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ATGCCATTTGGAGCAAGTGCATTTAAAACCCATCCCCAAGGACACTCCTACAACTCCTACACCTACCCTCGCTT 962
Query 963 GTCCGAGCCCACAATGTGCATTCCAAAGGTGGATTACGATCGAGCACAGATGGTCCTCAGCCCTCCACTGTCAG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GTCCGAGCCCACAATGTGCATTCCAAAGGTGGATTACGATCGAGCACAGATGGTCCTCAGCCCTCCACTGTCAG 1036
Query 1037 GGTCTGACACCTACCCCAGGGGCCCTGCCAAACTACCTCAAAGTCAAAGCAAATCGGGCTATTCCTCAAGCAGT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GGTCTGACACCTACCCCAGGGGCCCTGCCAAACTACCTCAAAGTCAAAGCAAATCGGGCTATTCCTCAAGCAGT 1110
Query 1111 CACCAGTACCCGTCTGGGTACCACAAAGCCACCTTGTACCATCACCCCTCCCTGCAGAGCAGTTCGCAGTACAT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CACCAGTACCCGTCTGGGTACCACAAAGCCACCTTGTACCATCACCCCTCCCTGCAGAGCAGTTCGCAGTACAT 1184
Query 1185 CTCCACGGCTTCCTACCTGAGCTCCCTCAGCCTCTCATCCAGCACCTACCCGCCGCCCAGCTGGGGCTCCTCCT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CTCCACGGCTTCCTACCTGAGCTCCCTCAGCCTCTCATCCAGCACCTACCCGCCGCCCAGCTGGGGCTCCTCCT 1258
Query 1259 CCGACCAGCAGCCCTCCAGGGTGTCCCATGAACAGTTTCGGGCGGCCCTGCAGCTGGTGGTCAGCCCAGGAGAC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CCGACCAGCAGCCCTCCAGGGTGTCCCATGAACAGTTTCGGGCGGCCCTGCAGCTGGTGGTCAGCCCAGGAGAC 1332
Query 1333 CCCAGGGAATACTTGGCCAACTTTATCAAAATCGGGGAAGGCTCAACCGGCATCGTATGCATCGCCACCGAGAA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CCCAGGGAATACTTGGCCAACTTTATCAAAATCGGGGAAGGCTCAACCGGCATCGTATGCATCGCCACCGAGAA 1406
Query 1407 ACACACAGGGAAACAAGTTGCAGTGAAGAAAATGGACCTCCGGAAGCAACAGAGACGAGAACTGCTTTTCAATG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 ACACACAGGGAAACAAGTTGCAGTGAAGAAAATGGACCTCCGGAAGCAACAGAGACGAGAACTGCTTTTCAATG 1480
Query 1481 AGGTCGTGATCATGCGGGATTACCACCATGACAATGTGGTTGACATGTACAACAGCTACCTTGTCGGCGATGAG 1554
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGGTCGTGATCATGCGGGATTACCACCATGACAATGTGGTTGACATGTACAGCAGCTACCTTGTCGGCGATGAG 1554
Query 1555 CTCTGGGTGGTCATGGAGTTTCTAGAAGGTGGTGCCTTGACAGACATTGTGACTCACACCAGAATGAATGAAGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CTCTGGGTGGTCATGGAGTTTCTAGAAGGTGGTGCCTTGACAGACATTGTGACTCACACCAGAATGAATGAAGA 1628
Query 1629 ACAGATAGCTACTGTCTGCCTGTCAGTTCTGAGAGCTCTCTCCTACCTTCATAACCAAGGAGTGATTCACAGGG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 ACAGATAGCTACTGTCTGCCTGTCAGTTCTGAGAGCTCTCTCCTACCTTCATAACCAAGGAGTGATTCACAGGG 1702
Query 1703 ACATAAAAAGTGACTCCATCCTCCTGACAAGCGATGGCCGGATAAAGTTGTCTGATTTTGGTTTCTGTGCTCAA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 ACATAAAAAGTGACTCCATCCTCCTGACAAGCGATGGCCGGATAAAGTTGTCTGATTTTGGTTTCTGTGCTCAA 1776
Query 1777 GTTTCCAAAGAGGTGCCGAAGAGGAAATCATTGGTTGGCACTCCCTACTGGATGGCCCCT-------------- 1836
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GTTTCCAAAGAGGTGCCGAAGAGGAAATCATTGGTTGGCACTCCCTACTGGATGGCCCCTGAGGTGATTTCTAG 1850
Query 1837 ----------------GAGGTGGACATCTGGTCCCTCGGGATCATGGTGATAGAAATGATTGATGGCGAGCCCC 1894
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GCTACCTTATGGGACAGAGGTGGACATCTGGTCCCTCGGGATCATGGTGATAGAAATGATTGATGGCGAGCCCC 1924
Query 1895 CCTACTTCAATGAGCCTCCCCTCCAGGCGATGCGGAGGATCCGGGACAGTTTACCTCCAAGAGTGAAGGACCTA 1968
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CCTACTTCAATGAGCCTCCCCTCCAGGCGATGCGGAGGATCCGGGACAGTTTACCTCCAAGAGTGAAGGACCTA 1998
Query 1969 CACAAGGTTTCTTCAGTGCTCCGGGGATTCCTAGACTTGATGTTGGTGAGGGAGCCCTCTCAGAGAGCAACAGC 2042
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CACAAGGTTTCTTCAGTGCTCCGGGGATTCCTAGACTTGATGTTGGTGAGGGAGCCCTCTCAGAGAGCAACAGC 2072
Query 2043 CCAGGAACTCCTCGGACATCCATTCTTAAAACTAGCAGGTCCACCGTCTTGCATCGTCCCCCTCATGAGACAAT 2116
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 CCAGGAACTCCTCGGACATCCATTCTTAAAACTAGCAGGTCCACCGTCTTGCATCGTCCCCCTCATGAGACAAT 2146
Query 2117 ACAGGCATCACG 2128
|||||||||||
Sbjct 2147 ACAGGCATCAC- 2157