Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000489367
- Subject:
- XM_017318217.1
- Aligned Length:
- 2160
- Identities:
- 1908
- Gaps:
- 35
Alignment
Query 1 ATGTTTGGGAAGAAAAAGAAAAAGATTGAAATATCTGGCCCGTCCAACTTTGAACACAGGGTTCATACTGGGTT 74
||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1 ATGTTTGGGAAGAAAAAGAAAAAGATCGAAATATCTGGCCCATCCAACTTTGAACACAGGGTTCATACTGGATT 74
Query 75 TGATCCACAAGAGCAGAAGTTTACCGGCCTTCCCCAGCAGTGGCACAGCCTGTTAGCAGATACGGCCAACAGGC 148
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 75 TGATCCACAAGAGCAGAAGTTTACTGGCCTTCCCCAGCAGTGGCACAGCCTGTTAGCAGACACAGCCAACAGGC 148
Query 149 CAAAGCCTATGGTGGACCCTTCATGCATCACACCCATCCAGCTGGCTCCTATGAAGACAATCGTTAGAGGAAAC 222
|.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 149 CCAAGCCCATGGTGGACCCATCATGCATCACACCCATACAGCTGGCTCCCATGAAGACAATCGTCAGAGGAAAT 222
Query 223 AAACCCTGCAAGGAAACCTCCATCAACGGCCTGCTAGAGGATTTTGACAACATCTCGGTGACTCGCTCCAACTC 296
|||.||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 223 AAATCCTGCAAGGAAACCTCTATCAATGGTCTGCTAGAGGATTTTGACAACATCTCCGTGACTCGCTCCAACTC 296
Query 297 CCTAAGGAAAGAAAGCCCACCCACCCCAGATCAGGGAGCCTCCAGCCACGGTCCAGGCCACGCGGAAGAAAATG 370
.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.||||.|..||.|||||||.|||||||.||.|
Sbjct 297 TCTAAGGAAAGAAAGCCCACCCACCCCAGATCAGGGAGCAGCTAGCCGCATTCAAGGCCACTCGGAAGAGAACG 370
Query 371 GCTTCATCACCTTCTCCCAGTATTCCAGCGAATCCGATACTACTGCTGACTACACGACCGAAAAGTACAGGGAG 444
||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.||.
Sbjct 371 GCTTCATCACTTTCTCACAATATTCCAGTGAATCCGATACGACTGCGGACTACACAACTGAAAAGTACAGAGAC 444
Query 445 AAGAGTCTCTATGGAGATGATCTGGATCCGTATTATAGAGGCAGCCACGCAGCCAAGCAAAATGGGCACGTAAT 518
|.||||||||||||||||||.|||||||.|||.||||.|.|||||||.||||||||||||||||||||.|..||
Sbjct 445 AGGAGTCTCTATGGAGATGACCTGGATCTGTACTATAAAAGCAGCCATGCAGCCAAGCAAAATGGGCATGCCAT 518
Query 519 GAAAATGAAGCACGGGGAGGCCTACTATTCTGAGGTGAAGCCTTTGAAATCCGATTTTGCCAGATTTTCTGCCG 592
|||.|||||.||.||.||.||.|||||..|||||.|||||.||||||||.||||..|.|||.||||..|||.||
Sbjct 519 GAAGATGAAACATGGAGACGCTTACTACCCTGAGATGAAGTCTTTGAAAACCGACCTGGCCGGATTCCCTGTCG 592
Query 593 ATTATCACTCACATTTGGACTCACTGAGCAAACCAAGTGAATACAGTGACCTCAAGTGGGAGTATCAGAGAGCC 666
|.||||||.|.||.||||||||.|||||.|||.||||||||||..|||||||.|.||||||.||||||||||||
Sbjct 593 ACTATCACACCCACTTGGACTCTCTGAGAAAATCAAGTGAATATGGTGACCTTAGGTGGGATTATCAGAGAGCC 666
Query 667 TCGAGTAGCTCCCCTCTGGATTATTCATTCCAATTCACACCTTCTAGAACTGCAGGGACCAGCGGGTGCTCCAA 740
||.|||||||||||||||||.||.||||||||..||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 667 TCTAGTAGCTCCCCTCTGGACTACTCATTCCAGCTCACGCCTTCTAGAACTGCAGGGACCAGCAGGTGCTCCAA 740
Query 741 GGAGAGCCTGGCGTACAGTGAAAGTGAATGGGGACCCAGCCTGGATGACTATGACAGGAGGCCAAAGTCTTCGT 814
||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|
Sbjct 741 GGAGAGTCTGGCATACAGTGAAAGTGATTGGGGACCCAGCCTGGATGACTATGACAGGAGGCCAAAATCATCAT 814
Query 815 ACCTGAATCAGACAAGCCCTCAGCCCACCATGCGGCAGAGGTCCAGGTCAGGCTCGGGACTCCAGGAACCGATG 888
|||||.|||||||.|||||||||||..|||||||.|||||.||||.|||.|||||.||.||.||||||||.|||
Sbjct 815 ACCTGCATCAGACGAGCCCTCAGCCAGCCATGCGCCAGAGATCCAAGTCCGGCTCAGGGCTTCAGGAACCCATG 888
Query 889 ATGCCATTTGGAGCAAGTGCATTTAAAACCCATCCCCAAGGACACTCCTACAACTCCTACACCTACCCTCGCTT 962
|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 889 ATGCCATTTGGAGCAAGTGCATTTAAAACTCATCCTCAAGGACACTCGTACAACTCCTACACCTACCCTCGATT 962
Query 963 GTCCGAGCCCACAATGTGCATTCCAAAGGTGGATTACGATCGAGCACAGATGGTCCTCAGCCCTCCACTGTCAG 1036
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||
Sbjct 963 GTCCGAGCCCACAATGTGCATTCCAAAGGTGGATTACGATCGAGCACAGATGGTCTTCAGTCCTCCACTGTCAG 1036
Query 1037 GGTCTGACACCTACCCCAGGGGCCCTGCCAAACTACCTCAAAGTCAAAGCAAATCGGGCTATTCCTCAAGCAGT 1110
||||.|||||.||||||||.|||||..||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||.|||.||||.
Sbjct 1037 GGTCCGACACTTACCCCAGAGGCCCCACCAAACTACCTCAAAGTCAAAGCAAAGCAGGCTACTCTTCAGGCAGC 1110
Query 1111 CACCAGTACCCGTCTGGGTACCACAAAGCCACCT-TGTACCATCACCCCTCCCTGCAGAGCAGTTCGCAGTACA 1183
|||||||||||.|||||||||||||||| ||.|| |.|||||.||.||.||||||||.|.||||||.|||||||
Sbjct 1111 CACCAGTACCCTTCTGGGTACCACAAAG-CATCTCTATACCACCATCCATCCCTGCAAACCAGTTCTCAGTACA 1183
Query 1184 TCTCCACGGCTTCCTACCTGAGCTCCCTCAGCCTCTCATCCAGCACCTACCCGCCGCCCAGCTGGGGCTCCTCC 1257
|||||||.|||||.|||.|.|||||.|||||..||||.||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1184 TCTCCACCGCTTCTTACTTAAGCTCTCTCAGTATCTCCTCGAGCACCTACCCTCCACCTAGCTGGGGCTCCTCC 1257
Query 1258 TCCGACCAGCAGCCCTCCAGGGTGTCCCATGAACAGTTTCGGGCGGCCCTGCAGCTGGTGGTCAGCCCAGGAGA 1331
||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 TCAGACCAGCAGCCCTCAAGGGTATCCCATGAACAATTCCGAGCTGCCCTGCAACTGGTGGTCAGCCCAGGAGA 1331
Query 1332 CCCCAGGGAATACTTGGCCAACTTTATCAAAATCGGGGAAGGCTCAACCGGCATCGTATGCATCGCCACCGAGA 1405
||||||||||||.||||..||||||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||.||.||.||||
Sbjct 1332 CCCCAGGGAATATTTGGATAACTTTATTAAAATCGGAGAAGGGTCGACAGGCATCGTGTGCATTGCAACAGAGA 1405
Query 1406 AACACACAGGGAAACAAGTTGCAGTGAAGAAAATGGACCTCCGGAAGCAACAGAGACGAGAACTGCTTTTCAAT 1479
||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.|||
Sbjct 1406 AACACACAGGCAAGCAAGTGGCAGTGAAGAAAATGGACCTCCGAAAGCAGCAGAGACGGGAACTCCTTTTTAAT 1479
Query 1480 GAGGTCGTGATCATGCGGGATTACCACCATGACAATGTGGTTGACATGTACAACAGCTACCTTGTCGGCGATGA 1553
|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1480 GAGGTCGTGATAATGCGTGATTACCACCATGACAACGTAGTTGACATGTACAACAGCTACCTTGTTGGAGATGA 1553
Query 1554 GCTCTGGGTGGTCATGGAGTTTCTAGAAGGTGGTGCCTTGACAGACATTGTGACTCACACCAGAATGAATGAAG 1627
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 1554 GCTCTGGGTGGTCATGGAGTTTCTAGAAGGTGGTGCCTTGACAGACATTGTCACTCATACCAGAATGAATGAAG 1627
Query 1628 AACAGATAGCTACTGTCTGCCTGTCAGTTCTGAGAGCTCTCTCCTACCTTCATAACCAAGGAGTGATTCACAGG 1701
|.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1628 AGCAGATAGCTACTGTCTGCCTGTCAGTTCTGAAAGCTCTGTCCTACCTTCATAACCAAGGAGTGATTCACAGG 1701
Query 1702 GACATAAAAAGTGACTCCATCCTCCTGACAAGCGATGGCCGGATAAAGTTGTCTGATTTTGGTTTCTGTGCTCA 1775
||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1702 GACATAAAGAGTGACTCCATTCTTCTGACAAGCGATGGCCGGATAAAGTTATCTGACTTTGGTTTCTGTGCTCA 1775
Query 1776 AGTTTCCAAAGAGGTGCCGAAGAGGAAATCATTGGTTGGCACTCCCTACTGGATGGCCCCT------------- 1836
||||||||||||||||||.||||||||.|||.||||.||.||.||.|||||||||||.|||
Sbjct 1776 AGTTTCCAAAGAGGTGCCAAAGAGGAAGTCACTGGTGGGTACCCCATACTGGATGGCACCTGAGGTGATTTCCA 1849
Query 1837 -----------------GAGGTGGACATCTGGTCCCTCGGGATCATGGTGATAGAAATGATTGATGGCGAGCCC 1893
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1850 GGCTACCTTATGGGACAGAGGTGGACATCTGGTCCCTCGGGATAATGGTGATAGAGATGATTGATGGGGAGCCC 1923
Query 1894 CCCTACTTCAATGAGCCTCCCCTCCAGGCGATGCGGAGGATCCGGGACAGTTTACCTCCAAGAGTGAAGGACCT 1967
|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1924 CCCTATTTCAATGAGCCTCCTCTGCAGGCCATGAGGAGGATCCGGGACAGTTTACCTCCAAGAGTGAAGGACCT 1997
Query 1968 ACACAAGGTTTCTTCAGTGCTCCGGGGATTCCTAGA-CTTGATGTTGGTGAGGGAGCCCTCTCAGAGAGCAACA 2040
|||||||||||||||..|||||||.||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1998 ACACAAGGTTTCTTCCATGCTCCGAGGATTCCTAGATCTT-ATGTTGGTGAGGGAGCCCTCTCAAAGAGCCACA 2070
Query 2041 GCCCAGGAACTCCTCGGACATCCATTCTTAAAACTAGCAGGTCCACCGTCTTGCATCGTCCCCCTCATGAGACA 2114
||.||.||||||||.||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 2071 GCTCAAGAACTCCTTGGACATCCATTCTTAAAATTGGCAGGTCCACCATCTTGCATTGTTCCTCTCATGAGACA 2144
Query 2115 ATACAGGCATCACG 2128
||||||.||||||
Sbjct 2145 ATACAGACATCAC- 2157