Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000489417
- Subject:
- NM_008860.3
- Aligned Length:
- 1777
- Identities:
- 1579
- Gaps:
- 1
Alignment
Query 1 ATGCCCAGCAGGACCGGCCCCAAGATGGAAGGGAGCGGCGGCCGCGTCCGCCTCAAGGCGCATTACGGGGGGGA 74
||||||||||||||.|.||||||||||||..|||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1 ATGCCCAGCAGGACGGACCCCAAGATGGACCGGAGCGGCGGCCGCGTCCGTCTGAAGGCGCACTACGGCGGGGA 74
Query 75 CATCTTCATCACCAGCGTGGACGCCGCCACGACCTTCGAGGAGCTCTGTGAGGAAGTGAGAGACATGTGTCGTC 148
||||.|.||.|||||||||||.|||...||.||.|||.||||.|||||||||||||||.|||||||||||.|.|
Sbjct 75 CATCCTGATTACCAGCGTGGATGCCATGACAACATTCAAGGACCTCTGTGAGGAAGTGCGAGACATGTGTGGCC 148
Query 149 TGCACCAGCAGCACCCGCTCACCCTCAAGTGGGTGGACAGCGAAGGTGACCCTTGCACGGTGTCCTCCCAGATG 222
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||
Sbjct 149 TGCACCAGCAGCACCCACTCACCCTCAAGTGGGTGGACAGTGAAGGTGACCCTTGTACTGTGTCCTCACAGATG 222
Query 223 GAGCTGGAAGAGGCTTTCCGCCTGGCCCGTCAGTGCAGGGACGAAGGCCTCATCATTCATGTTTTCCCGAGCAC 296
||||||||.|||||.||||||||||.|.|||||.||||||||||||..||||||||||||||||||||.||||.
Sbjct 223 GAGCTGGAGGAGGCCTTCCGCCTGGTCTGTCAGGGCAGGGACGAAGTGCTCATCATTCATGTTTTCCCAAGCAT 296
Query 297 CCCTGAGCAGCCTGGCCTGCCATGTCCGGGAGAAGACAAATCTATCTACCGCCGGGGAGCCAGAAGATGGAGGA 370
|||.||||||||.|||.||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCCAGAGCAGCCGGGCATGCCTTGTCCTGGAGAAGACAAGTCCATCTACCGCCGTGGAGCCAGAAGATGGAGGA 370
Query 371 AGCTGTACCGTGCCAACGGCCACCTCTTCCAAGCCAAGCGCTTTAACAGGAGAGCGTACTGCGGTCAGTGCAGC 444
||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||
Sbjct 371 AGCTGTACCGAGCCAACGGCCACCTCTTCCAAGCCAAGCGCTTTAACAGGGGAGCGTACTGCGGCCAGTGCAGC 444
Query 445 GAGAGGATATGGGGCCTCGCGAGGCAAGGCTACAGGTGCATCAACTGCAAACTGCTGGTCCATAAGCGCTGCCA 518
||.|||||||||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 445 GAAAGGATATGGGGTCTCTCGAGGCAGGGCTACAGGTGCATCAACTGCAAGCTGCTGGTCCATAAACGCTGCCA 518
Query 519 CGGCCTCGTCCCGCTGACCTGCAGGAAGCATATGGATTCTGTCATGCCTTCCCAAGAGCCTCCAGTAGACGACA 592
||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 519 CGTCCTCGTCCCGCTGACCTGCAGGAGGCATATGGATTCTGTCATGCCTTCCCAAGAGCCTCCAGTAGATGACA 592
Query 593 AGAACGAGGACGCCGACCTTCCTTCCGAGGAGACAGATGGAATTGCTTACATTTCCTCATCCCGGAAGCATGAC 666
|||||||.|..|..|||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.
Sbjct 593 AGAACGATGGTGTAGACCTTCCTTCAGAAGAAACTGATGGAATTGCTTATATTTCTTCATCTCGGAAACATGAT 666
Query 667 AGCATTAAAGACGACTCGGAGGACCTTAAGCCAGTTATCGATGGGATGGATGGAATCAAAATCTCTCAGGGGCT 740
|..||.|||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AATATCAAAGATGATTCTGAGGACCTTAAGCCTGTCATCGATGGGGTGGATGGGATCAAAATCTCTCAGGGGCT 740
Query 741 TGGGCTGCAGGACTTTGACCTAATCAGAGTCATCGGGCGCGGGAGCTACGCCAAGGTTCTCCTGGTGCGGTTGA 814
.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 741 GGGGCTGCAAGACTTCGACCTCATCAGAGTCATCGGGCGTGGAAGCTATGCCAAGGTCCTCCTGGTGCGGTTGA 814
Query 815 AGAAGAATGACCAAATTTACGCCATGAAAGTGGTGAAGAAAGAGCTGGTGCATGATGACGAGGATATTGACTGG 888
||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||||||
Sbjct 815 AGAAAAACGACCAGATTTACGCCATGAAGGTGGTAAAGAAGGAGCTTGTCCACGACGACGAGGATATCGACTGG 888
Query 889 GTACAGACAGAGAAGCACGTGTTTGAGCAGGCATCCAGCAACCCCTTCCTGGTCGGATTACACTCCTGCTTCCA 962
||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 889 GTGCAGACAGAGAAACATGTGTTTGAGCAGGCGTCCAGCAACCCCTTCCTGGTTGGCTTACACTCCTGCTTCCA 962
Query 963 GACGACAAGTCGGTTGTTCCTGGTCATTGAGTACGTCAACGGCGGGGACCTGATGTTCCACATGCAGAGGCAGA 1036
|||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GACAACGAGCCGGTTGTTCCTGGTCATCGAGTATGTCAATGGCGGGGACCTCATGTTCCACATGCAGAGGCAGA 1036
Query 1037 GGAAGCTCCCTGAGGAGCACGCCAGGTTCTACGCGGCCGAGATCTGCATCGCCCTCAACTTCCTGCACGAGAGG 1110
|.||.||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||.||||.||||||
Sbjct 1037 GAAAACTTCCAGAGGAGCATGCCAGGTTCTATGCTGCTGAGATCTGTATCGCTCTCAACTTCTTGCATGAGAGG 1110
Query 1111 GGGATCATCTACAGGGACCTGAAGCTGGACAACGTCCTCCTGGATGCGGACGGGCACATCAAGCTCACAGACTA 1184
||||||||||||.|||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.|||||
Sbjct 1111 GGGATCATCTACCGGGACCTAAAACTGGACAACGTCCTCCTTGATGCCGACGGACACATTAAGCTGACGGACTA 1184
Query 1185 CGGCATGTGCAAGGAAGGCCTGGGCCCTGGTGACACAACGAGCACTTTCTGCGGAACCCCGAATTACATCGCCC 1258
||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1185 CGGCATGTGCAAGGAAGGTCTAGGCCCCGGTGATACAACAAGCACTTTTTGTGGAACCCCGAACTATATCGCCC 1258
Query 1259 CCGAAATCCTGCGGGGAGAGGAGTACGGGTTCAGCGTGGACTGGTGGGCGCTGGGAGTCCTCATGTTTGAGATG 1332
|||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1259 CCGAAATCCTGCGAGGAGAAGAGTACGGGTTCAGCGTGGACTGGTGGGCACTGGGTGTCCTTATGTTTGAGATG 1332
Query 1333 ATGGCCGGGCGCTCCCCGTTCGACATCATCACCGACAACCCGGACATGAACACAGAGGACTACCTTTTCCAAGT 1406
|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1333 ATGGCTGGGCGCTCCCCCTTTGACATCATCACGGACAACCCTGACATGAACACTGAAGACTACCTTTTCCAAGT 1406
Query 1407 GATCCTGGAGAAGCCCATCCGGATCCCCCGGTTCCTGTCCGTCAAAGCCTCCCATGTTTTAAAAGGATTTTTAA 1480
.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct 1407 TATCCTGGAAAAGCCAATCCGGATTCCCCGTTTCCTGTCTGTCAAGGCCTCACACGTCTTAAAAGGATTTTTAA 1480
Query 1481 ATAAGGACCCCAAAGAGAGGCTCGGCTGCCGGCCACAGACTGGATTTTCTGACATCAAGTCCCACGCGTTCTTC 1554
|||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 1481 ATAAGGATCCCAAAGAGAGGCTTGGCTGCCGGCCACAGACTGGGTTTTCCGACATCAAGTCTCATGCTTTCTTC 1554
Query 1555 CGCAGCATAGACTGGGACTTGCTGGAGAAGAAGCAGGCGCTCCCTCCATTCCAGCCACAGATCACAGACGACTA 1628
||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||.|.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1555 CGCAGCATAGACTGGGACCTGCTGGAAAAGAAGCAGACCCTGCCTCCCTTCCAGCCCCAGATCACAGATGACTA 1628
Query 1629 CGGTCTGGACAACTTTGACACACAGTTCACCAGCGAGCCCGTGCAGCTGACCCCAGACGATGAGGATGCCATAA 1702
.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|.|||||
Sbjct 1629 TGGCCTGGACAACTTTGACACGCAGTTCACCAGCGAGCCTGTGCAGCTGACCCCAGATGATGAGGACGTCATAA 1702
Query 1703 AGAGGATCGACCAGTCAGAGTTCGAAGGCTTTGAGTATATCAACCCATTATTGCTGTCCACCGAGGAGTCGGTG 1776
||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||.|..|||||||..|.||||||||.|||
Sbjct 1703 AGAGGATCGACCAGTCCGAATTTGAAGGCTTTGAGTACATCAACCCACTTCTGCTGTCTGCTGAGGAGTCCGTG 1776
Query 1777 G 1777
Sbjct 1777 - 1776