Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489417
• Subject: XM_011250207.2
• Aligned Length: 1777
• Identities: 1387
• Gaps: 220

Alignment

Query    1  ATGCCCAGCAGGACCGGCCCCAAGATGGAAGGGAGCGGCGGCCGCGTCCGCCTCAAGGCGCATTACGGGGGGGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CATCTTCATCACCAGCGTGGACGCCGCCACGACCTTCGAGGAGCTCTGTGAGGAAGTGAGAGACATGTGTCGTC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGCACCAGCAGCACCCGCTCACCCTCAAGTGGGTGGACAGCGAAGGTGACCCTTGCACGGTGTCCTCCCAGATG  222
                                                                                   |||
Sbjct    1  -----------------------------------------------------------------------ATG  3

Query  223  GAGCTGGAAGAGGCTTTCCGCCTGGCCCGTCAGTGCAGGGACGAAGGCCTCATCATTCATGTTTTCCCGAGCAC  296
            ||||||||.|||||.||||||||||.|.|||||.||||||||||||..||||||||||||||||||||.||||.
Sbjct    4  GAGCTGGAGGAGGCCTTCCGCCTGGTCTGTCAGGGCAGGGACGAAGTGCTCATCATTCATGTTTTCCCAAGCAT  77

Query  297  CCCTGAGCAGCCTGGCCTGCCATGTCCGGGAGAAGACAAATCTATCTACCGCCGGGGAGCCAGAAGATGGAGGA  370
            |||.||||||||.|||.||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct   78  CCCAGAGCAGCCGGGCATGCCTTGTCCTGGAGAAGACAAGTCCATCTACCGCCGTGGAGCCAGAAGATGGAGGA  151

Query  371  AGCTGTACCGTGCCAACGGCCACCTCTTCCAAGCCAAGCGCTTTAACAGGAGAGCGTACTGCGGTCAGTGCAGC  444
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||
Sbjct  152  AGCTGTACCGAGCCAACGGCCACCTCTTCCAAGCCAAGCGCTTTAACAGGGGAGCGTACTGCGGCCAGTGCAGC  225

Query  445  GAGAGGATATGGGGCCTCGCGAGGCAAGGCTACAGGTGCATCAACTGCAAACTGCTGGTCCATAAGCGCTGCCA  518
            ||.|||||||||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct  226  GAAAGGATATGGGGTCTCTCGAGGCAGGGCTACAGGTGCATCAACTGCAAGCTGCTGGTCCATAAACGCTGCCA  299

Query  519  CGGCCTCGTCCCGCTGACCTGCAGGAAGCATATGGATTCTGTCATGCCTTCCCAAGAGCCTCCAGTAGACGACA  592
            ||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  300  CGTCCTCGTCCCGCTGACCTGCAGGAGGCATATGGATTCTGTCATGCCTTCCCAAGAGCCTCCAGTAGATGACA  373

Query  593  AGAACGAGGACGCCGACCTTCCTTCCGAGGAGACAGATGGAATTGCTTACATTTCCTCATCCCGGAAGCATGAC  666
            |||||||.|..|..|||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.
Sbjct  374  AGAACGATGGTGTAGACCTTCCTTCAGAAGAAACTGATGGAATTGCTTATATTTCTTCATCTCGGAAACATGAT  447

Query  667  AGCATTAAAGACGACTCGGAGGACCTTAAGCCAGTTATCGATGGGATGGATGGAATCAAAATCTCTCAGGGGCT  740
            |..||.|||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  448  AATATCAAAGATGATTCTGAGGACCTTAAGCCTGTCATCGATGGGGTGGATGGGATCAAAATCTCTCAGGGGCT  521

Query  741  TGGGCTGCAGGACTTTGACCTAATCAGAGTCATCGGGCGCGGGAGCTACGCCAAGGTTCTCCTGGTGCGGTTGA  814
            .||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  522  GGGGCTGCAAGACTTCGACCTCATCAGAGTCATCGGGCGTGGAAGCTATGCCAAGGTCCTCCTGGTGCGGTTGA  595

Query  815  AGAAGAATGACCAAATTTACGCCATGAAAGTGGTGAAGAAAGAGCTGGTGCATGATGACGAGGATATTGACTGG  888
            ||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||||||
Sbjct  596  AGAAAAACGACCAGATTTACGCCATGAAGGTGGTAAAGAAGGAGCTTGTCCACGACGACGAGGATATCGACTGG  669

Query  889  GTACAGACAGAGAAGCACGTGTTTGAGCAGGCATCCAGCAACCCCTTCCTGGTCGGATTACACTCCTGCTTCCA  962
            ||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  670  GTGCAGACAGAGAAACATGTGTTTGAGCAGGCGTCCAGCAACCCCTTCCTGGTTGGCTTACACTCCTGCTTCCA  743

Query  963  GACGACAAGTCGGTTGTTCCTGGTCATTGAGTACGTCAACGGCGGGGACCTGATGTTCCACATGCAGAGGCAGA  1036
            |||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  744  GACAACGAGCCGGTTGTTCCTGGTCATCGAGTATGTCAATGGCGGGGACCTCATGTTCCACATGCAGAGGCAGA  817

Query 1037  GGAAGCTCCCTGAGGAGCACGCCAGGTTCTACGCGGCCGAGATCTGCATCGCCCTCAACTTCCTGCACGAGAGG  1110
            |.||.||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||.||||.||||||
Sbjct  818  GAAAACTTCCAGAGGAGCATGCCAGGTTCTATGCTGCTGAGATCTGTATCGCTCTCAACTTCTTGCATGAGAGG  891

Query 1111  GGGATCATCTACAGGGACCTGAAGCTGGACAACGTCCTCCTGGATGCGGACGGGCACATCAAGCTCACAGACTA  1184
            ||||||||||||.|||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.|||||
Sbjct  892  GGGATCATCTACCGGGACCTAAAACTGGACAACGTCCTCCTTGATGCCGACGGACACATTAAGCTGACGGACTA  965

Query 1185  CGGCATGTGCAAGGAAGGCCTGGGCCCTGGTGACACAACGAGCACTTTCTGCGGAACCCCGAATTACATCGCCC  1258
            ||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct  966  CGGCATGTGCAAGGAAGGTCTAGGCCCCGGTGATACAACAAGCACTTTTTGTGGAACCCCGAACTATATCGCCC  1039

Query 1259  CCGAAATCCTGCGGGGAGAGGAGTACGGGTTCAGCGTGGACTGGTGGGCGCTGGGAGTCCTCATGTTTGAGATG  1332
            |||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1040  CCGAAATCCTGCGAGGAGAAGAGTACGGGTTCAGCGTGGACTGGTGGGCACTGGGTGTCCTTATGTTTGAGATG  1113

Query 1333  ATGGCCGGGCGCTCCCCGTTCGACATCATCACCGACAACCCGGACATGAACACAGAGGACTACCTTTTCCAAGT  1406
            |||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1114  ATGGCTGGGCGCTCCCCCTTTGACATCATCACGGACAACCCTGACATGAACACTGAAGACTACCTTTTCCAAGT  1187

Query 1407  GATCCTGGAGAAGCCCATCCGGATCCCCCGGTTCCTGTCCGTCAAAGCCTCCCATGTTTTAAAAGGATTTTTAA  1480
            .||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct 1188  TATCCTGGAAAAGCCAATCCGGATTCCCCGTTTCCTGTCTGTCAAGGCCTCACACGTCTTAAAAGGATTTTTAA  1261

Query 1481  ATAAGGACCCCAAAGAGAGGCTCGGCTGCCGGCCACAGACTGGATTTTCTGACATCAAGTCCCACGCGTTCTTC  1554
            |||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 1262  ATAAGGATCCCAAAGAGAGGCTTGGCTGCCGGCCACAGACTGGGTTTTCCGACATCAAGTCTCATGCTTTCTTC  1335

Query 1555  CGCAGCATAGACTGGGACTTGCTGGAGAAGAAGCAGGCGCTCCCTCCATTCCAGCCACAGATCACAGACGACTA  1628
            ||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||.|.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1336  CGCAGCATAGACTGGGACCTGCTGGAAAAGAAGCAGACCCTGCCTCCCTTCCAGCCCCAGATCACAGATGACTA  1409

Query 1629  CGGTCTGGACAACTTTGACACACAGTTCACCAGCGAGCCCGTGCAGCTGACCCCAGACGATGAGGATGCCATAA  1702
            .||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|.|||||
Sbjct 1410  TGGCCTGGACAACTTTGACACGCAGTTCACCAGCGAGCCTGTGCAGCTGACCCCAGATGATGAGGACGTCATAA  1483

Query 1703  AGAGGATCGACCAGTCAGAGTTCGAAGGCTTTGAGTATATCAACCCATTATTGCTGTCCACCGAGGAGTCGGTG  1776
            ||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||.|..|||||||..|.||||||||.|||
Sbjct 1484  AGAGGATCGACCAGTCCGAATTTGAAGGCTTTGAGTACATCAACCCACTTCTGCTGTCTGCTGAGGAGTCCGTG  1557

Query 1777  G  1777
             
Sbjct 1558  -  1557