Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489444
• Subject: NM_001145302.3
• Aligned Length: 1387
• Identities: 1095
• Gaps: 292

Alignment

Query    1  ATGGCCAGCAACAGCAGCTCCTGCCCGACACCTGGGGGCGGGCACCTCAATGGGTACCCGGTGCCTCCCTACGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCAGCAACAGCAGCTCCTGCCCGACACCTGGGGGCGGGCACCTCAATGGGTACCCGGTGCCTCCCTACGC  74

Query   75  CTTCTTCTTCCCCCCTATGCTGGGTGGACTCTCCCCGCCAGGCGCTCTGACCACTCTCCAGCACCAGCTTCCAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTTCTTCTTCCCCCCTATGCTGGGTGGACTCTCCCCGCCAGGCGCTCTGACCACTCTCCAGCACCAGCTTCCAG  148

Query  149  TTAGTGGATATAGCACACCATCCCCAGCCACCATTGAGACCCAGAGCAGCAGTTCTGAAGAGATAGTGCCCAGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||                                            
Sbjct  149  TTAGTGGATATAGCACACCATCCCCAGCCA--------------------------------------------  178

Query  223  CCTCCCTCGCCACCCCCTCTACCCCGCATCTACAAGCCTTGCTTTGTCTGTCAGGACAAGTCCTCAGGCTACCA  296
                                                                                      
Sbjct  179  --------------------------------------------------------------------------  178

Query  297  CTATGGGGTCAGCGCCTGTGAGGGCTGCAAGGGCTTCTTCCGCCGCAGCATCCAGAAGAACATGGTGTACACGT  370
                                                                                      
Sbjct  179  --------------------------------------------------------------------------  178

Query  371  GTCACCGGGACAAGAACTGCATCATCAACAAGGTGACCCGGAACCGCTGCCAGTACTGCCGACTGCAGAAGTGC  444
                                                                                      
Sbjct  179  --------------------------------------------------------------------------  178

Query  445  TTTGAAGTGGGCATGTCCAAGGAGTCTGTGAGAAACGACCGAAACAAGAAGAAGAAGGAGGTGCCCAAGCCCGA  518
                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  179  -------------------------CTGTGAGAAACGACCGAAACAAGAAGAAGAAGGAGGTGCCCAAGCCCGA  227

Query  519  GTGCTCTGAGAGCTACACGCTGACGCCGGAGGTGGGGGAGCTCATTGAGAAGGTGCGCAAAGCGCACCAGGAAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  228  GTGCTCTGAGAGCTACACGCTGACGCCGGAGGTGGGGGAGCTCATTGAGAAGGTGCGCAAAGCGCACCAGGAAA  301

Query  593  CCTTCCCTGCCCTCTGCCAGCTGGGCAAATACACTACGAACAACAGCTCAGAACAACGTGTCTCTCTGGACATT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  302  CCTTCCCTGCCCTCTGCCAGCTGGGCAAATACACTACGAACAACAGCTCAGAACAACGTGTCTCTCTGGACATT  375

Query  667  GACCTCTGGGACAAGTTCAGTGAACTCTCCACCAAGTGCATCATTAAGACTGTGGAGTTCGCCAAGCAGCTGCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  376  GACCTCTGGGACAAGTTCAGTGAACTCTCCACCAAGTGCATCATTAAGACTGTGGAGTTCGCCAAGCAGCTGCC  449

Query  741  CGGCTTCACCACCCTCACCATCGCCGACCAGATCACCCTCCTCAAGGCTGCCTGCCTGGACATCCTGATCCTGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  450  CGGCTTCACCACCCTCACCATCGCCGACCAGATCACCCTCCTCAAGGCTGCCTGCCTGGACATCCTGATCCTGC  523

Query  815  GGATCTGCACGCGGTACACGCCCGAGCAGGACACCATGACCTTCTCGGACGGGCTGACCCTGAACCGGACCCAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  524  GGATCTGCACGCGGTACACGCCCGAGCAGGACACCATGACCTTCTCGGACGGGCTGACCCTGAACCGGACCCAG  597

Query  889  ATGCACAACGCTGGCTTCGGCCCCCTCACCGACCTGGTCTTTGCCTTCGCCAACCAGCTGCTGCCCCTGGAGAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  598  ATGCACAACGCTGGCTTCGGCCCCCTCACCGACCTGGTCTTTGCCTTCGCCAACCAGCTGCTGCCCCTGGAGAT  671

Query  963  GGATGATGCGGAGACGGGGCTGCTCAGCGCCATCTGCCTCATCTGCGGAGACCGCCAGGACCTGGAGCAGCCGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  672  GGATGATGCGGAGACGGGGCTGCTCAGCGCCATCTGCCTCATCTGCGGAGACCGCCAGGACCTGGAGCAGCCGG  745

Query 1037  ACCGGGTGGACATGCTGCAGGAGCCGCTGCTGGAGGCGCTAAAGGTCTACGTGCGGAAGCGGAGGCCCAGCCGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  746  ACCGGGTGGACATGCTGCAGGAGCCGCTGCTGGAGGCGCTAAAGGTCTACGTGCGGAAGCGGAGGCCCAGCCGC  819

Query 1111  CCCCACATGTTCCCCAAGATGCTAATGAAGATTACTGACCTGCGAAGCATCAGCGCCAAGGGGGCTGAGCGGGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  820  CCCCACATGTTCCCCAAGATGCTAATGAAGATTACTGACCTGCGAAGCATCAGCGCCAAGGGGGCTGAGCGGGT  893

Query 1185  GATCACGCTGAAGATGGAGATCCCGGGCTCCATGCCGCCTCTCATCCAGGAAATGTTGGAGAACTCAGAGGGCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  894  GATCACGCTGAAGATGGAGATCCCGGGCTCCATGCCGCCTCTCATCCAGGAAATGTTGGAGAACTCAGAGGGCC  967

Query 1259  TGGACACTCTGAGCGGACAGCCGGGGGGTGGGGGGCGGGACGGGGGTGGCCTGGCCCCCCCGCCAGGCAGCTGT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  968  TGGACACTCTGAGCGGACAGCCGGGGGGTGGGGGGCGGGACGGGGGTGGCCTGGCCCCCCCGCCAGGCAGCTGT  1041

Query 1333  AGCCCCAGCCTCAGCCCCAGCTCCAACAGAAGCAGCCCGGCCACCCACTCCCCGG  1387
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct 1042  AGCCCCAGCCTCAGCCCCAGCTCCAACAGAAGCAGCCCGGCCACCCACTCCCCG-  1095