Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489444
• Subject: XM_006532597.2
• Aligned Length: 1387
• Identities: 943
• Gaps: 358

Alignment

Query    1  ATGGCCAGCAACAGCAGCTCCTGCCCGACACCTGGGGGCGGGCACCTCAATGGGTACCCGGTGCCTCCCTACGC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CTTCTTCTTCCCCCCTATGCTGGGTGGACTCTCCCCGCCAGGCGCTCTGACCACTCTCCAGCACCAGCTTCCAG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TTAGTGGATATAGCACACCATCCCCAGCCACCATTGAGACCCAGAGCAGCAGTTCTGAAGAGATAGTGCCCAGC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CCTCCCTCGCCACCCCCTCTACCCCGCATCTACAAGCCTTGCTTTGTCTGTCAGGACAAGTCCTCAGGCTACCA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CTATGGGGTCAGCGCCTGTGAGGGCTGCAAGGGCTTCTTCCGCCGCAGCATCCAGAAGAACATGGTGTACACGT  370
                                                                         ||||||||.||||
Sbjct    1  -------------------------------------------------------------ATGGTGTATACGT  13

Query  371  GTCACCGGGACAAGAACTGCATCATCAACAAGGTGACCCGGAACCGCTGCCAGTACTGCCGACTGCAGAAGTGC  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.
Sbjct   14  GTCACCGGGACAAGAACTGCATCATCAACAAGGTGACCCGGAACCGCTGCCAGTACTGCCGGCTGCAGAAATGT  87

Query  445  TTTGAAGTGGGCATGTCCAAGGAGTCTGTGAGAAACGACCGAAACAAGAAGAAGAAGGAGGTGCCCAAGCCCGA  518
            ||.||.||||||||||||||||||||.|||.|||||||.||||||||.||||||||.||||..|||||||||||
Sbjct   88  TTCGACGTGGGCATGTCCAAGGAGTCGGTGCGAAACGATCGAAACAAAAAGAAGAAAGAGGCACCCAAGCCCGA  161

Query  519  GTGCTCTGAGAGCTACACGCTGACGCCGGAGGTGGGGGAGCTCATTGAGAAGGTGCGCAAAGCGCACCAGGAAA  592
            ||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  162  GTGCTCAGAGAGCTACACGCTGACGCCTGAGGTGGGCGAGCTCATTGAGAAGGTTCGCAAAGCGCACCAGGAGA  235

Query  593  CCTTCCCTGCCCTCTGCCAGCTGGGCAAATACACTACGAACAACAGCTCAGAACAACGTGTCTCTCTGGACATT  666
            |||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct  236  CCTTCCCGGCCCTCTGCCAGCTGGGCAAGTACACTACGAACAACAGCTCAGAACAACGAGTCTCCCTGGACATT  309

Query  667  GACCTCTGGGACAAGTTCAGTGAACTCTCCACCAAGTGCATCATTAAGACTGTGGAGTTCGCCAAGCAGCTGCC  740
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  310  GACCTCTGGGACAAGTTCAGTGAACTCTCCACCAAGTGCATCATTAAGACTGTGGAGTTCGCCAAGCAGCTTCC  383

Query  741  CGGCTTCACCACCCTCACCATCGCCGACCAGATCACCCTCCTCAAGGCTGCCTGCCTGGACATCCTGATCCTGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct  384  CGGCTTCACCACCCTCACCATCGCCGACCAGATCACCCTCCTCAAGGCTGCCTGCCTGGATATCCTGATTCTGC  457

Query  815  GGATCTGCACGCGGTACACGCCCGAGCAGGACACCATGACCTTCTCGGACGGGCTGACCCTGAACCGGACCCAG  888
            |.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct  458  GAATCTGCACGCGGTACACGCCTGAGCAAGACACAATGACCTTCTCAGATGGACTGACCCTGAACCGGACTCAG  531

Query  889  ATGCACAACGCTGGCTTCGGCCCCCTCACCGACCTGGTCTTTGCCTTCGCCAACCAGCTGCTGCCCCTGGAGAT  962
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  532  ATGCACAACGCTGGCTTTGGCCCCCTCACCGACTTGGTCTTTGCCTTCGCCAACCAGCTGCTGCCCCTGGAGAT  605

Query  963  GGATGATGCGGAGACGGGGCTGCTCAGCGCCATCTGCCTCATCTGCGGAGACCGCCAGGACCTGGAGCAGCCGG  1036
            |||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  606  GGACGATGCTGAGACTGGACTGCTCAGTGCCATCTGCCTCATCTGTGGAGACCGACAGGACCTGGAGCAGCCAG  679

Query 1037  ACCGGGTGGACATGCTGCAGGAGCCGCTGCTGGAGGCGCTAAAGGTCTACGTGCGGAAGCGGAGGCCCAGCCGC  1110
            ||..|||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct  680  ACAAGGTGGACATGCTGCAAGAGCCGCTGCTGGAAGCACTGAAAGTCTACGTCCGGAAACGGAGGCCCAGCCGA  753

Query 1111  CCCCACATGTTCCCCAAGATGCTAATGAAGATTACTGACCTGCGAAGCATCAGCGCCAAGGGGGCTGAGCGGGT  1184
            |||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  754  CCCCACATGTTCCCCAAGATGCTGATGAAGATCACAGACCTTCGGAGCATCAGCGCCAAGGGAGCTGAACGGGT  827

Query 1185  GATCACGCTGAAGATGGAGATCCCGGGCTCCATGCCGCCTCTCATCCAGGAAATGTTGGAGAACTCAGAGGGCC  1258
            ||||||..||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||.||||||||||.||||||.
Sbjct  828  GATCACATTGAAGATGGAGATCCCAGGCTCCATGCCACCGCTGATCCAGGAAATGCTGGAGAACTCTGAGGGCT  901

Query 1259  TGGACACTCTGAGCGGACAGCCGGGGGGTGGGGGGCGGGACGGGGGTGGCCTGGCCCCCCCGCCAGGCAGCTGT  1332
            ||||||||||.|||||||||.|||||||.||....||.||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct  902  TGGACACTCTAAGCGGACAGTCGGGGGGCGGAACACGAGATGGGGGTGGCCTGGCCCCCCCTCCGGGTAGCTGT  975

Query 1333  AGCCCCAGCCTCAGCCCCAGCTCCAACAGAAGCAGCCCGGCCACCCACTCCCCGG  1387
            ||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||.||||||||.|||||. 
Sbjct  976  AGCCCCAGCCTCAGTCCCAGCTCCCACAGAAGCAGCCCAGCCACCCAATCCCCA-  1029