Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489485
• Subject: NM_001038609.2
• Aligned Length: 1330
• Identities: 1111
• Gaps: 47

Alignment

Query    1  ATGGCTGAGCCCCGCCAGGAGTTCGAAGTGATGGAAGATCACGCTGGGACGTACGGGTTGGGGGACAGGAAAGA  74
            ||||||||.||.|||||||||||.||....||||||||.||.|||||                        |||
Sbjct    1  ATGGCTGACCCTCGCCAGGAGTTTGACACAATGGAAGACCATGCTGG------------------------AGA  50

Query   75  TCAGGGGGGCTACACCATGCACCAAGACCAAGAGGGTGACACGGACGCTGGCCTGAAAGAATCTCCCCTGCAGA  148
            |         |||||..|||.||||||||||||.||.||||.||||..||||.|.|||||.|||||||..|||.
Sbjct   51  T---------TACACTCTGCTCCAAGACCAAGAAGGAGACATGGACCATGGCTTAAAAGAGTCTCCCCCACAGC  115

Query  149  CCCCCACTGAGGACGGATCTGAGGAACCGGGCTCTGAAACCTCTGATGCTAAGAGCACTCCAACAGCGGAAGAT  222
            |||||.|.||.||.|||.|.||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct  116  CCCCCGCCGATGATGGAGCGGAGGAACCAGGGTCGGAGACCTCCGATGCTAAGAGCACTCCAACTGCTGAAGAC  189

Query  223  GTGACAGCACCCTTAGTGGATGAGGGAGCTCCCGGCAAGCAGGCTGCCGCGCAGCCCCACACGGAGATCCCAGA  296
            |||||.||.|||.|||||||||||.|||||||||.|||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  190  GTGACTGCGCCCCTAGTGGATGAGAGAGCTCCCGACAAGCAGGCCGCTGCCCAGCCCCACACGGAGATCCCAGA  263

Query  297  AGGAACCACAGCTGAAGAAGCAGGCATTGGAGACACCCCCAGCCTGGAAGACGAAGCTGCTGGTCACGTGACCC  370
            |||||..|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|.||.|||.|||.||||.|||||.||.|||||.|
Sbjct  264  AGGAATTACAGCCGAAGAAGCAGGCATCGGAGACACCCCGAACCAGGAGGACCAAGCCGCTGGGCATGTGACTC  337

Query  371  AAGCTCGCATGGTCAGTAAAAGCAAAGACGGGACTGGAAGCGATGACAAAAAAGCCAAGGGGGCTGATGGTAAA  444
            |||||||..|||.|      |||||||||.||||.||||..||.||.||.|||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  338  AAGCTCGTGTGGCC------AGCAAAGACAGGACAGGAAATGACGAGAAGAAAGCCAAGGGCGCTGATGGCAAA  405

Query  445  A------CGAAGATCGCCACACCGCGGGGAGCAGCCCCTCCAGGCCAGAAGGGCCAGGCCAACGCCACCAGGAT  512
            |      ||||||||||||||||.||||||||||||.||||.|.||||||||||..|.||||||||||||||||
Sbjct  406  ACCGGGGCGAAGATCGCCACACCTCGGGGAGCAGCCTCTCCGGCCCAGAAGGGCACGTCCAACGCCACCAGGAT  479

Query  513  TCCAGCAAAAACCCCGCCC-GCTCCAAAGACACCACCCAGCTCTGGTGAACCTCCAAAATCAGGGGATCGCAGC  585
            .||.||.||.|||.||||| || ||.|||||.||.||..|.||.||||||||.||||||||.||.||.||.|||
Sbjct  480  CCCGGCCAAGACCACGCCCAGC-CCTAAGACTCCTCCAGGGTCAGGTGAACCACCAAAATCCGGAGAACGAAGC  552

Query  586  GGCTACAGCAGCCCCGGCTCCCCAGGCACTCCCGGCAGCCGCTCCCGCACCCCGTCCCTTCCAACCCCACCCAC  659
            ||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||
Sbjct  553  GGCTACAGCAGCCCCGGCTCTCCCGGAACGCCTGGCAGTCGCTCGCGCACCCCATCCCTACCAACACCGCCCAC  626

Query  660  CCGGGAGCCCAAGAAGGTGGCAGTGGTCCGTACTCCACCCAAGTCGCCGTCTTCCGCCAAGAGCCGCCTGCAGA  733
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||..|....||||||||||||||||
Sbjct  627  CCGGGAGCCCAAGAAGGTGGCAGTGGTCCGCACTCCCCCTAAGTCACCATCAGCTAGTAAGAGCCGCCTGCAGA  700

Query  734  CAGCCCCCGTGCCCATGCCAGACCTGAAGAATGTCAAGTCCAAGATCGGCTCCACTGAGAACCTGAAGCACCAG  807
            |.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||.|||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  701  CTGCCCCTGTGCCCATGCCAGACCTAAAGAATGTCAGGTCGAAGATTGGCTCTACTGAGAACCTGAAGCACCAG  774

Query  808  CCGGGAGGCGGGAAGGTGCAGATAATTAATAAGAAGCTGGATCTTAGCAACGTCCAGTCCAAGTGTGGCTCAAA  881
            ||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  775  CCAGGAGGTGGCAAGGTGCAGATAATTAATAAGAAGCTGGATCTTAGCAACGTCCAGTCCAAGTGTGGCTCGAA  848

Query  882  GGATAATATCAAACACGTCTCGGGAGGCGGCAGTGTGCAAATAGTCTACAAACCAGTTGACCTGAGCAAGGTGA  955
            |||||||||||||||||||.||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||
Sbjct  849  GGATAATATCAAACACGTCCCGGGTGGAGGCAGTGTGCAAATAGTCTACAAGCCGGTGGACCTGAGCAAAGTGA  922

Query  956  CCTCCAAGTGTGGCTCATTAGGCAACATCCATCATAAACCAGGAGGTGGCCAGGTGGAAGTAAAATCTGAGAAG  1029
            ||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  923  CCTCCAAGTGTGGCTCGTTAGGGAACATCCATCACAAGCCAGGAGGTGGCCAGGTGGAAGTAAAATCAGAGAAG  996

Query 1030  CTTGACTTCAAGGACAGAGTCCAGTCGAAGATTGGGTCCCTGGACAATATCACCCACGTCCCTGGCGGAGGAAA  1103
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||.||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct  997  CTGGACTTCAAGGACAGAGTCCAGTCGAAGATTGGCTCCTTGGATAATATCACCCACGTCCCTGGAGGAGGGAA  1070

Query 1104  TAAAAAGATTGAAACCCACAAGCTGACCTTCCGCGAGAACGCCAAAGCCAAGACAGACCACGGGGCGGAGATCG  1177
            |||.|||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|
Sbjct 1071  TAAGAAGATTGAAACCCACAAGCTGACCTTCAGGGAGAATGCCAAAGCCAAGACAGACCATGGAGCAGAAATTG  1144

Query 1178  TGTACAAGTCGCCAGTGGTGTCTGGGGACACGTCTCCACGGCATCTCAGCAATGTCTCCTCCACCGGCAGCATC  1251
            ||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 1145  TGTATAAGTCACCCGTGGTGTCTGGGGACACATCTCCACGGCACCTCAGCAATGTGTCTTCCACGGGCAGCATC  1218

Query 1252  GACATGGTAGACTCGCCCCAGCTCGCCACGCTAGCTGACGAGGTGTCTGCCTCCCTGGCCAAGCAGGGTTTG  1323
            ||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||.||||||||.|||.|||||||||||||||||
Sbjct 1219  GACATGGTGGACTCACCACAGCTTGCCACACTAGCCGATGAAGTGTCTGCTTCCTTGGCCAAGCAGGGTTTG  1290