Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000489501
Subject:
NM_001017536.2
Aligned Length:
1432
Identities:
1272
Gaps:
160

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGAGTGGAGGAATAAGAAAAGGAGCGATTGGCTGTCGATGGTGCTCAGAACTGCTGGAGTGGAGGAAGCCTT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TGGGTCTGAAGTGTCTGTGAGACCTCACAGAAGAGCACCCCTGGGCTCCACTTACCTGCCCCCTGCTCCTTCAG  148

Query    1  -----------ATGGCGGCCAGCACTTCCCTGCCTGACCCTGGAGACTTTGACCGGAACGTGCCCCGGATCTGT  63
                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGATGGAGGCAATGGCGGCCAGCACTTCCCTGCCTGACCCTGGAGACTTTGACCGGAACGTGCCCCGGATCTGT  222

Query   64  GGGGTGTGTGGAGACCGAGCCACTGGCTTTCACTTCAATGCTATGACCTGTGAAGGCTGCAAAGGCTTCTTCAG  137
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGGGTGTGTGGAGACCGAGCCACTGGCTTTCACTTCAATGCTATGACCTGTGAAGGCTGCAAAGGCTTCTTCAG  296

Query  138  GCGAAGCATGAAGCGGAAGGCACTATTCACCTGCCCCTTCAACGGGGACTGCCGCATCACCAAGGACAACCGAC  211
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCGAAGCATGAAGCGGAAGGCACTATTCACCTGCCCCTTCAACGGGGACTGCCGCATCACCAAGGACAACCGAC  370

Query  212  GCCACTGCCAGGCCTGCCGGCTCAAACGCTGTGTGGACATCGGCATGATGAAGGAGTTCATTCTGACAGATGAG  285
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCCACTGCCAGGCCTGCCGGCTCAAACGCTGTGTGGACATCGGCATGATGAAGGAGTTCATTCTGACAGATGAG  444

Query  286  GAAGTGCAGAGGAAGCGGGAGATGATCCTGAAGCGGAAGGAGGAGGAGGCCTTGAAGGACAGTCTGCGGCCCAA  359
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAGTGCAGAGGAAGCGGGAGATGATCCTGAAGCGGAAGGAGGAGGAGGCCTTGAAGGACAGTCTGCGGCCCAA  518

Query  360  GCTGTCTGAGGAGCAGCAGCGCATCATTGCCATACTGCTGGACGCCCACCATAAGACCTACGACCCCACCTACT  433
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTGTCTGAGGAGCAGCAGCGCATCATTGCCATACTGCTGGACGCCCACCATAAGACCTACGACCCCACCTACT  592

Query  434  CCGACTTCTGCCAGTTCCGGCCTCCAGTTCGTGTGAATGATGGTGGAGGGAGCCATCCTTCCAGGCCCAACTCC  507
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCGACTTCTGCCAGTTCCGGCCTCCAGTTCGTGTGAATGATGGTGGAGGGAGCCATCCTTCCAGGCCCAACTCC  666

Query  508  AGACACACTCCCAGCTTCTCTGGGGACTCCTCCTCCTCCTGCTCAGATCACTGTATCACCTCTTCAGACATGAT  581
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGACACACTCCCAGCTTCTCTGGGGACTCCTCCTCCTCCTGCTCAGATCACTGTATCACCTCTTCAGACATGAT  740

Query  582  GGACTCGTCCAGCTTCTCCAATCTGGATCTGAGTGAAGAAGATTCAGATGACCCTTCTGTGACCCTAGAGCTGT  655
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGACTCGTCCAGCTTCTCCAATCTGGATCTGAGTGAAGAAGATTCAGATGACCCTTCTGTGACCCTAGAGCTGT  814

Query  656  CCCAGCTCTCCATGCTGCCCCACCTGGCTGACCTGGTCAGTTACAGCATCCAAAAGGTCATTGGCTTTGCTAAG  729
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCCAGCTCTCCATGCTGCCCCACCTGGCTGACCTGGTCAGTTACAGCATCCAAAAGGTCATTGGCTTTGCTAAG  888

Query  730  ATGATACCAGGATTCAGAGACCTCACCTCTGAGGACCAGATCGTACTGCTGAAGTCAAGTGCCATTGAGGTCAT  803
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATGATACCAGGATTCAGAGACCTCACCTCTGAGGACCAGATCGTACTGCTGAAGTCAAGTGCCATTGAGGTCAT  962

Query  804  CATGTTGCGCTCCAATGAGTCCTTCACCATGGACGACATGTCCTGGACCTGTGGCAACCAAGACTACAAGTACC  877
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CATGTTGCGCTCCAATGAGTCCTTCACCATGGACGACATGTCCTGGACCTGTGGCAACCAAGACTACAAGTACC  1036

Query  878  GCGTCAGTGACGTGACCAAAGCCGGACACAGCCTGGAGCTGATTGAGCCCCTCATCAAGTTCCAGGTGGGACTG  951
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCGTCAGTGACGTGACCAAAGCCGGACACAGCCTGGAGCTGATTGAGCCCCTCATCAAGTTCCAGGTGGGACTG  1110

Query  952  AAGAAGCTGAACTTGCATGAGGAGGAGCATGTCCTGCTCATGGCCATCTGCATCGTCTCCCCAGATCGTCCTGG  1025
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAGAAGCTGAACTTGCATGAGGAGGAGCATGTCCTGCTCATGGCCATCTGCATCGTCTCCCCAGATCGTCCTGG  1184

Query 1026  GGTGCAGGACGCCGCGCTGATTGAGGCCATCCAGGACCGCCTGTCCAACACACTGCAGACGTACATCCGCTGCC  1099
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGTGCAGGACGCCGCGCTGATTGAGGCCATCCAGGACCGCCTGTCCAACACACTGCAGACGTACATCCGCTGCC  1258

Query 1100  GCCACCCGCCCCCGGGCAGCCACCTGCTCTATGCCAAGATGATCCAGAAGCTAGCCGACCTGCGCAGCCTCAAT  1173
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GCCACCCGCCCCCGGGCAGCCACCTGCTCTATGCCAAGATGATCCAGAAGCTAGCCGACCTGCGCAGCCTCAAT  1332

Query 1174  GAGGAGCACTCCAAGCAGTACCGCTGCCTCTCCTTCCAGCCTGAGTGCAGCATGAAGCTAACGCCCCTTGTGCT  1247
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAGGAGCACTCCAAGCAGTACCGCTGCCTCTCCTTCCAGCCTGAGTGCAGCATGAAGCTAACGCCCCTTGTGCT  1406

Query 1248  CGAAGTGTTTGGCAATGAGATCTCCG  1273
            ||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct 1407  CGAAGTGTTTGGCAATGAGATCTCC-  1431