Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000489515
- Subject:
- NM_033325.2
- Aligned Length:
- 2340
- Identities:
- 1968
- Gaps:
- 30
Alignment
Query 1 ATGGAGAGGCCTC-----TGTGCTCCCACCTCTGCAGCTGCCTGGCTATGCTGGCCCTCCTGTCCCCCCTGAGC 69
|||||| ||| || |||||..|||||.|.||||..|||||.||||.|.|.|.|||.|..||||||||
Sbjct 1 ATGGAG----CTCCATTTTG-GCTCCTGCCTCTCCGGCTGTTTGGCTCTGCTTGTCTTGCTGCCTTCCCTGAGC 69
Query 70 CTGGCACAGTATGACAGCTGGCC---------CCATTACCCCGAGTACTTCCAGCAACCGGCTCCTGAGTATCA 134
||.||||||||.||..||||||| |||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||.|.||
Sbjct 70 CTAGCACAGTACGAGGGCTGGCCCTACCAGCTCCAGTACCCTGAGTACTTCCAGCAGCCCGCTCCTGAGCACCA 143
Query 135 CCAGCCCCAGGCCCCCGCCAACGTGGCCAAGATTCAGCTGCGCCTGGCTGGGCAGAAGAGGAAGCACAGCGAGG 208
.||||..||||..|||.||.|.||||.||||||.|||.|.||||||||.||.||||||||||||||||..||||
Sbjct 144 TCAGCGGCAGGTGCCCTCCGATGTGGTCAAGATCCAGGTCCGCCTGGCGGGCCAGAAGAGGAAGCACAATGAGG 217
Query 209 GCCGGGTGGAGGTGTACTATGATGGCCAGTGGGGCACCGTGTGCGATGACGACTTCTCCATCCACGCTGCCCAC 282
||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.|||||.
Sbjct 218 GCCGCGTGGAGGTCTACTACGAAGGCCAGTGGGGCACGGTGTGCGACGATGACTTCTCGATCCATGCCGCCCAT 291
Query 283 GTCGTCTGCCGGGAGCTGGGCTACGTGGAGGCCAAGTCCTGGACTGCCAGCTCCTCCTACGG--CAAGGGAGAA 354
||.|||||||||.|..|||||||.||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||| || ||.|||
Sbjct 292 GTGGTCTGCCGGCAAGTGGGCTATGTAGAGGCCAAGTCCTGGGCTGCCAGCTCCTCCTACGGTCCA--GGCGAA 363
Query 355 GGGCCCATCTGGTTAGACAATCTCCACTGTACTGGCAACGAGGCGACCCTTGCAGCATGCACCTCCAATGGCTG 428
||.|||||||||||.||||||.||.|||||||||||||.|||.|||||||.|||.|.|||.|||||||||||||
Sbjct 364 GGCCCCATCTGGTTGGACAATATCTACTGTACTGGCAAAGAGTCGACCCTGGCATCTTGCTCCTCCAATGGCTG 437
Query 429 GGGCGTCACTGACTGCAAGCACACGGAGGATGTCGGTGTGGTGTGCAGCGACAAAAGGATTCCTGGGTTCAAAT 502
|||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||||
Sbjct 438 GGGTGTCACTGACTGCAAGCACACTGAAGACGTTGGAGTGGTGTGTAGTGAGAAAAGAATTCCTGGCTTCAAAT 511
Query 503 TTGACAATTCGTTGATCAACCAGATAGAGAACCTGAATATCCAGGTGGAGGACATTCGGATTCGAGCCATCCTC 576
||||||||||||||||||||||.|||||||.|||.|||||.||||||||.|||||.||||||||..|||||||.
Sbjct 512 TTGACAATTCGTTGATCAACCAAATAGAGAGCCTAAATATACAGGTGGAAGACATCCGGATTCGGCCCATCCTT 585
Query 577 TCAACCTACCGCAAGCGCACCCCAGTGATGGAGGGCTACGTGGAGGTGAAGGAGGGCAAGACCTGGAAGCAGAT 650
||..|||..|||.|.||||..||.||||..||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||
Sbjct 586 TCTGCCTTTCGCCATCGCAAGCCTGTGACAGAGGGCTACGTGGAGGTGAAGGAGGGCAAGGCTTGGAAGCAGAT 659
Query 651 CTGTGACAAGCACTGGACGGCCAAGAATTCCCGCGTGGTCTGCGGCATGTTTGGCTTCCCTGGGGAGAGGACAT 724
|||..||||.||||||||.|||||||||||||.|||||||||.||||||||.||||||||||..||||.|||.|
Sbjct 660 CTGCAACAAACACTGGACAGCCAAGAATTCCCACGTGGTCTGTGGCATGTTCGGCTTCCCTGCAGAGAAGACCT 733
Query 725 ACAATACCAAAGTGTACAAAATGTTTGCCTCACGGAGGAAGCAGCGCTACTGGCCATTCTCCATGGACTGCACC 798
||||..||||||..||.||||..||||||||.||||||||||.|||.||||||...||.||.|||.|||||||.
Sbjct 734 ACAACCCCAAAGCCTATAAAACCTTTGCCTCGCGGAGGAAGCTGCGTTACTGGAAGTTTTCTATGAACTGCACG 807
Query 799 GGCACAGAGGCCCACATCTCCAGCTGCAAGCTGGGCCC--CCAGGTGTCACTGGACCCCATGAAGAATGTCACC 870
|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||| || |||.|.|.||||||..|||||||.|.||||
Sbjct 808 GGCACTGAAGCGCATATCTCCAGCTGCAAGCTGGGCCCTTCC--GTGACCCGGGACCCTGTGAAGAACGCCACC 879
Query 871 TGCGAGAATGGGCTACCGGCCGTGGTGAGTTGTGTGCCTGGGCAGGTCTTCAGCCCTGACGGACCCTCGAGATT 944
||.|||||.||||..||.||.|||||.||||||||||||.|.|||.||||||||||.||.||||||||.||.||
Sbjct 880 TGTGAGAACGGGCAGCCAGCTGTGGTCAGTTGTGTGCCTAGCCAGATCTTCAGCCCCGATGGACCCTCAAGGTT 953
Query 945 CCGGAAAGCGTACAAGCCAGAGCAACCCCTGGTGCGACTGAGAGGCGGTGCCTACATCGGGGAGGGCCGCGTGG 1018
|||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.||||||||.||.|||.|..|||||||||||||.||||
Sbjct 954 CCGGAAAGCCTACAAGCCAGAGCAACCCTTGGTGCGCCTGAGAGGTGGAGCCCAGGTCGGGGAGGGCCGAGTGG 1027
Query 1019 AGGTGCTCAAAAATGGAGAGTGGGGGACCGTCTGCGACGACAAGTGGGACCTGGTGTCGGCCAGTGTGGTCTGC 1092
|||||||.||.||||||||.|||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1028 AGGTGCTGAAGAATGGAGAATGGGGAACCATCTGCGATGACAAGTGGGACCTGGTATCTGCCAGTGTGGTCTGC 1101
Query 1093 AGAGAGCTGGGCTTTGGGAGTGCCAAAGAGGCAGTCACTGGCTCCCGACTGGGGCAAGGGATCGGACCCATCCA 1166
.||||||||||||||||||..||.||||||||..||||.||||||.||||.|||||||||||.||.||||||||
Sbjct 1102 CGAGAGCTGGGCTTTGGGACCGCTAAAGAGGCCATCACAGGCTCCAGACTAGGGCAAGGGATTGGGCCCATCCA 1175
Query 1167 CCTCAACGAGATCCAGTGCACAGGCAATGAGAAGTCCATTATAGACTGCAAGTTCAATGCCGAGTCTCAGGGCT 1240
.|||||.||..|||||||||||||.|.||||||||||||.|||||||||||.|||||..|.||||||||.||||
Sbjct 1176 TCTCAATGAAGTCCAGTGCACAGGGACTGAGAAGTCCATCATAGACTGCAAATTCAACACAGAGTCTCAAGGCT 1249
Query 1241 GCAACCACGAGGAGGATGCTGGTGTGAGATGCAACACCCCTGCCATGGGCTTGCAGAAGAAGCTGCGCCTGAAC 1314
|||||||.||.||.|||||.||.|||.|||||||||.|||...||||||.||.|||||.|||.||||||||||.
Sbjct 1250 GCAACCATGAAGAAGATGCCGGGGTGCGATGCAACATCCCCATCATGGGTTTCCAGAAAAAGGTGCGCCTGAAT 1323
Query 1315 GGCGGCCGCAATCCCTACGAGGGCCGAGTGGAGGTGCTGGTGGAGAGAAACGGGTCCCTTGTGTGGGGGATGGT 1388
||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||....||||||||.|||||||||||.|||||||..||
Sbjct 1324 GGAGGCCGCAATCCTTATGAGGGCCGAGTGGAGGTGCTAACAGAGAGAAATGGGTCCCTTGTTTGGGGGACTGT 1397
Query 1389 GTGTGGCCAAAACTGGGGCATCGTGGAGGCCATGGTGGTCTGCCGCCAGCTGGGCCTGGGATTCGCCAGCAACG 1462
.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|
Sbjct 1398 ATGCGGCCAGAACTGGGGCATTGTGGAAGCCATGGTGGTCTGCCGGCAGCTAGGCCTGGGCTTTGCCAGCAATG 1471
Query 1463 CCTTCCAGGAGACCTGGTATTGGCACGGAGATGTCAACAGCAACAAAGTGGTCATGAGTGGAGTGAAGTGCTCG 1536
||||.||||||||||||||.|||||.|||.||.||..|..||||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1472 CCTTTCAGGAGACCTGGTACTGGCATGGAAATATCTTCGCCAACAACGTGGTCATGAGTGGAGTGAAGTGCTCA 1545
Query 1537 GGAACGGAGCTGTCCCTGGCGCACTGCCGCCACGACGGGGAGGACGTGGCCTGCCCCCAGGGCGGAGTGCAGTA 1610
|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||| |||||.||||||||||||.|||||||.||||.||.
Sbjct 1546 GGAACGGAGCTGTCCCTAGCACACTGCCGCCATGAC---GAGGAGGTGGCCTGCCCCGAGGGCGGGGTGCGGTT 1616
Query 1611 CGGGGCCGGAGTTGCCTGCTCAGAAACCGCCCCTGACCTGGTCCTCAATGCGGAGATGGTGCAGCAGACCACCT 1684
.||.||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||..|||
Sbjct 1617 TGGTGCTGGAGTCGCCTGCTCGGAAACTGCACCTGACCTGGTGCTTAATGCTGAGATTGTCCAGCAGACTGCCT 1690
Query 1685 ACCTGGAGGACCGGCCCATGTTCCTGCTGCAGTGTGCCATGGAGGAGAACTGCCTCTCGGCCTCAGCCGCGCAG 1758
|||||||||||.|||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|.|||.
Sbjct 1691 ACCTGGAGGACAGGCCCATGTCCTTGCTGCAGTGTGCCATGGAGGAGAACTGCCTCTCCGCCTCCGCTGTGCAC 1764
Query 1759 ACCGACCCCACCACGGGCTACCGCCGGCTCCTGCGCTTCTCCTCCCAGATCCACAACAATGGCCAGTCCGACTT 1832
|||||||||||||..|||.||||.||.||..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1765 ACCGACCCCACCAGAGGCCACCGGCGCCTTTTACGCTTCTCCTCCCAGATCCACAACAATGGCCAGTCTGACTT 1838
Query 1833 CCGGCCCAAGAACGGCCGCCACGCGTGGATCTGGCACGACTGTCACAGGCACTACCACAGCATGGAGGTGTTCA 1906
|||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1839 CCGCCCCAAGAATGGCCGCCATGCGTGGATTTGGCACGACTGCCACAGGCACTACCACAGCATGGAAGTCTTCA 1912
Query 1907 CCCACTATGACCTGCTGAACCTCAATGGCACCAAGGTGGCAGAGGGCCACAAGGCCAGCTTCTGCTTGGAGGAC 1980
|..|||||||||||||||.||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1913 CTTACTATGACCTGCTGAGCCTCAACGGCACCAAGGTGGCTGAGGGCCACAAGGCCAGCTTCTGCCTGGAGGAC 1986
Query 1981 ACAGAATGTGAAGGAGACATCCAGAAGAATTACGAGTGTGCCAACTTCGGCGATCAGGGCATCACCATGGGCTG 2054
||.||.|||||.||||||||.|||||||.||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1987 ACTGAGTGTGAGGGAGACATTCAGAAGAGTTACGAGTGTGCCAACTTTGGAGAACAAGGCATCACCATGGGCTG 2060
Query 2055 CTGGGACATGTACCGCCATGACATCGACTGCCAGTGGGTTGACATCACTGACGTGCCCCCTGGAGACTACCTGT 2128
|||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.|.||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 2061 CTGGGACATGTACCGTCATGACATTGACTGCCAGTGGATAGACATCACCGATGTGCCCCCTGGAGACTACCTGT 2134
Query 2129 TCCAGGTTGTTATTAACCCCAACTTCGAGGTTGCAGAATCCGATTACTCCAACAACATCATGAAATGCAGGAGC 2202
||||||||||.|||||||||||||..||.||..|||||||.||||.|||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 2135 TCCAGGTTGTCATTAACCCCAACTATGAAGTGCCAGAATCAGATTTCTCTAACAACATCATGAAGTGCAGGAGC 2208
Query 2203 CGCTATGACGGCCACCGCATCTGGATGTACAACTGCCACATAGGTGGTTCCTTCAGCGAAGAGACGGAAAAAAA 2276
||||||||.|||.||||||||||||||||||||||.|||.|||||||..|||||||.||.|||||.|||.|.||
Sbjct 2209 CGCTATGATGGCTACCGCATCTGGATGTACAACTGTCACGTAGGTGGAGCCTTCAGTGAGGAGACAGAACAGAA 2282
Query 2277 GTTTGAGCACTTCAGCGGGCTCTTAAACAACCAGCTGTCCCCGCAG 2322
|||.||.||||||||.||.||..||||.||||||||.||....|||
Sbjct 2283 GTTCGAACACTTCAGTGGACTTCTAAATAACCAGCTCTCTGTACAG 2328