Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489515
• Subject: XM_006519745.2
• Aligned Length: 2361
• Identities: 1968
• Gaps: 51

Alignment

Query    1  ATGGAGAGGCCTC-----TGTGCTCCCACCTCTGCAGCTGCCTGGCTATGCTGGCCCTCCTGTCCCCCCTGAGC  69
            ||||||    |||     || |||||..|||||.|.||||..|||||.||||.|.|.|.|||.|..||||||||
Sbjct    1  ATGGAG----CTCCATTTTG-GCTCCTGCCTCTCCGGCTGTTTGGCTCTGCTTGTCTTGCTGCCTTCCCTGAGC  69

Query   70  CTGGCACAGTATGACAGCTGGCC---------CCATTACCCCGAGTACTTCCAGCAACCGGCTCCTGAGTATCA  134
            ||.||||||||.||..|||||||         |||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||.|.||
Sbjct   70  CTAGCACAGTACGAGGGCTGGCCCTACCAGCTCCAGTACCCTGAGTACTTCCAGCAGCCCGCTCCTGAGCACCA  143

Query  135  CCAGCCCCAGGCCCCCGCCAACGTGGCCAAGATTCAGCTGCGCCTGGCTGGGCAGAAGAGGAAGCACAGCGAGG  208
            .||||..||||..|||.||.|.||||.||||||.|||.|.||||||||.||.||||||||||||||||..||||
Sbjct  144  TCAGCGGCAGGTGCCCTCCGATGTGGTCAAGATCCAGGTCCGCCTGGCGGGCCAGAAGAGGAAGCACAATGAGG  217

Query  209  GCCGGGTGGAGGTGTACTATGATGGCCAGTGGGGCACCGTGTGCGATGACGACTTCTCCATCCACGCTGCCCAC  282
            ||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.|||||.
Sbjct  218  GCCGCGTGGAGGTCTACTACGAAGGCCAGTGGGGCACGGTGTGCGACGATGACTTCTCGATCCATGCCGCCCAT  291

Query  283  GTCGTCTGCCGGGAGCTGGGCTACGTGGAGGCCAAGTCCTGGACTGCCAGCTCCTCCTACGG--CAAGGGAGAA  354
            ||.|||||||||.|..|||||||.||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||  ||  ||.|||
Sbjct  292  GTGGTCTGCCGGCAAGTGGGCTATGTAGAGGCCAAGTCCTGGGCTGCCAGCTCCTCCTACGGTCCA--GGCGAA  363

Query  355  GGGCCCATCTGGTTAGACAATCTCCACTGTACTGGCAACGAGGCGACCCTTGCAGCATGCACCTCCAATGGCTG  428
            ||.|||||||||||.||||||.||.|||||||||||||.|||.|||||||.|||.|.|||.|||||||||||||
Sbjct  364  GGCCCCATCTGGTTGGACAATATCTACTGTACTGGCAAAGAGTCGACCCTGGCATCTTGCTCCTCCAATGGCTG  437

Query  429  GGGCGTCACTGACTGCAAGCACACGGAGGATGTCGGTGTGGTGTGCAGCGACAAAAGGATTCCTGGGTTCAAAT  502
            |||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||||
Sbjct  438  GGGTGTCACTGACTGCAAGCACACTGAAGACGTTGGAGTGGTGTGTAGTGAGAAAAGAATTCCTGGCTTCAAAT  511

Query  503  TTGACAATTCGTTGATCAACCAGATAGAGAACCTGAATATCCAGGTGGAGGACATTCGGATTCGAGCCATCCTC  576
            ||||||||||||||||||||||.|||||||.|||.|||||.||||||||.|||||.||||||||..|||||||.
Sbjct  512  TTGACAATTCGTTGATCAACCAAATAGAGAGCCTAAATATACAGGTGGAAGACATCCGGATTCGGCCCATCCTT  585

Query  577  TCAACCTACCGCAAGCGCACCCCAGTGATGGAGGGCTACGTGGAGGTGAAGGAGGGCAAGACCTGGAAGCAGAT  650
            ||..|||..|||.|.||||..||.||||..||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||
Sbjct  586  TCTGCCTTTCGCCATCGCAAGCCTGTGACAGAGGGCTACGTGGAGGTGAAGGAGGGCAAGGCTTGGAAGCAGAT  659

Query  651  CTGTGACAAGCACTGGACGGCCAAGAATTCCCGCGTGGTCTGCGGCATGTTTGGCTTCCCTGGGGAGAGGACAT  724
            |||..||||.||||||||.|||||||||||||.|||||||||.||||||||.||||||||||..||||.|||.|
Sbjct  660  CTGCAACAAACACTGGACAGCCAAGAATTCCCACGTGGTCTGTGGCATGTTCGGCTTCCCTGCAGAGAAGACCT  733

Query  725  ACAATACCAAAGTGTACAAAATGTTTGCCTCACGGAGGAAGCAGCGCTACTGGCCATTCTCCATGGACTGCACC  798
            ||||..||||||..||.||||..||||||||.||||||||||.|||.||||||...||.||.|||.|||||||.
Sbjct  734  ACAACCCCAAAGCCTATAAAACCTTTGCCTCGCGGAGGAAGCTGCGTTACTGGAAGTTTTCTATGAACTGCACG  807

Query  799  GGCACAGAGGCCCACATCTCCAGCTGCAAGCTGGGCCC--CCAGGTGTCACTGGACCCCATGAAGAATGTCACC  870
            |||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||  ||  |||.|.|.||||||..|||||||.|.||||
Sbjct  808  GGCACTGAAGCGCATATCTCCAGCTGCAAGCTGGGCCCTTCC--GTGACCCGGGACCCTGTGAAGAACGCCACC  879

Query  871  TGCGAGAATGGGCTACCGGCCGTGGTGAGTTGTGTGCCTGGGCAGGTCTTCAGCCCTGACGGACCCTCGAGATT  944
            ||.|||||.||||..||.||.|||||.||||||||||||.|.|||.||||||||||.||.||||||||.||.||
Sbjct  880  TGTGAGAACGGGCAGCCAGCTGTGGTCAGTTGTGTGCCTAGCCAGATCTTCAGCCCCGATGGACCCTCAAGGTT  953

Query  945  CCGGAAAGCGTACAAGCCAG---------------------AGCAACCCCTGGTGCGACTGAGAGGCGGTGCCT  997
            |||||||||.||||||||||                     ||||||||.|||||||.||||||||.||.|||.
Sbjct  954  CCGGAAAGCCTACAAGCCAGAGCAGGACCGTGTGTCTCCCCAGCAACCCTTGGTGCGCCTGAGAGGTGGAGCCC  1027

Query  998  ACATCGGGGAGGGCCGCGTGGAGGTGCTCAAAAATGGAGAGTGGGGGACCGTCTGCGACGACAAGTGGGACCTG  1071
            |..|||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.|||.|||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1028  AGGTCGGGGAGGGCCGAGTGGAGGTGCTGAAGAATGGAGAATGGGGAACCATCTGCGATGACAAGTGGGACCTG  1101

Query 1072  GTGTCGGCCAGTGTGGTCTGCAGAGAGCTGGGCTTTGGGAGTGCCAAAGAGGCAGTCACTGGCTCCCGACTGGG  1145
            ||.||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||..||.||||||||..||||.||||||.||||.||
Sbjct 1102  GTATCTGCCAGTGTGGTCTGCCGAGAGCTGGGCTTTGGGACCGCTAAAGAGGCCATCACAGGCTCCAGACTAGG  1175

Query 1146  GCAAGGGATCGGACCCATCCACCTCAACGAGATCCAGTGCACAGGCAATGAGAAGTCCATTATAGACTGCAAGT  1219
            |||||||||.||.||||||||.|||||.||..|||||||||||||.|.||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1176  GCAAGGGATTGGGCCCATCCATCTCAATGAAGTCCAGTGCACAGGGACTGAGAAGTCCATCATAGACTGCAAAT  1249

Query 1220  TCAATGCCGAGTCTCAGGGCTGCAACCACGAGGAGGATGCTGGTGTGAGATGCAACACCCCTGCCATGGGCTTG  1293
            ||||..|.||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||.|||.|||||||||.|||...||||||.||.
Sbjct 1250  TCAACACAGAGTCTCAAGGCTGCAACCATGAAGAAGATGCCGGGGTGCGATGCAACATCCCCATCATGGGTTTC  1323

Query 1294  CAGAAGAAGCTGCGCCTGAACGGCGGCCGCAATCCCTACGAGGGCCGAGTGGAGGTGCTGGTGGAGAGAAACGG  1367
            |||||.|||.||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||....||||||||.||
Sbjct 1324  CAGAAAAAGGTGCGCCTGAATGGAGGCCGCAATCCTTATGAGGGCCGAGTGGAGGTGCTAACAGAGAGAAATGG  1397

Query 1368  GTCCCTTGTGTGGGGGATGGTGTGTGGCCAAAACTGGGGCATCGTGGAGGCCATGGTGGTCTGCCGCCAGCTGG  1441
            |||||||||.|||||||..||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1398  GTCCCTTGTTTGGGGGACTGTATGCGGCCAGAACTGGGGCATTGTGGAAGCCATGGTGGTCTGCCGGCAGCTAG  1471

Query 1442  GCCTGGGATTCGCCAGCAACGCCTTCCAGGAGACCTGGTATTGGCACGGAGATGTCAACAGCAACAAAGTGGTC  1515
            |||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||.||.||..|..||||||.||||||
Sbjct 1472  GCCTGGGCTTTGCCAGCAATGCCTTTCAGGAGACCTGGTACTGGCATGGAAATATCTTCGCCAACAACGTGGTC  1545

Query 1516  ATGAGTGGAGTGAAGTGCTCGGGAACGGAGCTGTCCCTGGCGCACTGCCGCCACGACGGGGAGGACGTGGCCTG  1589
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||   |||||.||||||||
Sbjct 1546  ATGAGTGGAGTGAAGTGCTCAGGAACGGAGCTGTCCCTAGCACACTGCCGCCATGAC---GAGGAGGTGGCCTG  1616

Query 1590  CCCCCAGGGCGGAGTGCAGTACGGGGCCGGAGTTGCCTGCTCAGAAACCGCCCCTGACCTGGTCCTCAATGCGG  1663
            ||||.|||||||.||||.||..||.||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||.|
Sbjct 1617  CCCCGAGGGCGGGGTGCGGTTTGGTGCTGGAGTCGCCTGCTCGGAAACTGCACCTGACCTGGTGCTTAATGCTG  1690

Query 1664  AGATGGTGCAGCAGACCACCTACCTGGAGGACCGGCCCATGTTCCTGCTGCAGTGTGCCATGGAGGAGAACTGC  1737
            ||||.||.||||||||..||||||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1691  AGATTGTCCAGCAGACTGCCTACCTGGAGGACAGGCCCATGTCCTTGCTGCAGTGTGCCATGGAGGAGAACTGC  1764

Query 1738  CTCTCGGCCTCAGCCGCGCAGACCGACCCCACCACGGGCTACCGCCGGCTCCTGCGCTTCTCCTCCCAGATCCA  1811
            |||||.|||||.||.|.|||.|||||||||||||..|||.||||.||.||..|.||||||||||||||||||||
Sbjct 1765  CTCTCCGCCTCCGCTGTGCACACCGACCCCACCAGAGGCCACCGGCGCCTTTTACGCTTCTCCTCCCAGATCCA  1838

Query 1812  CAACAATGGCCAGTCCGACTTCCGGCCCAAGAACGGCCGCCACGCGTGGATCTGGCACGACTGTCACAGGCACT  1885
            |||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 1839  CAACAATGGCCAGTCTGACTTCCGCCCCAAGAATGGCCGCCATGCGTGGATTTGGCACGACTGCCACAGGCACT  1912

Query 1886  ACCACAGCATGGAGGTGTTCACCCACTATGACCTGCTGAACCTCAATGGCACCAAGGTGGCAGAGGGCCACAAG  1959
            |||||||||||||.||.|||||..|||||||||||||||.||||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1913  ACCACAGCATGGAAGTCTTCACTTACTATGACCTGCTGAGCCTCAACGGCACCAAGGTGGCTGAGGGCCACAAG  1986

Query 1960  GCCAGCTTCTGCTTGGAGGACACAGAATGTGAAGGAGACATCCAGAAGAATTACGAGTGTGCCAACTTCGGCGA  2033
            ||||||||||||.||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||.||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1987  GCCAGCTTCTGCCTGGAGGACACTGAGTGTGAGGGAGACATTCAGAAGAGTTACGAGTGTGCCAACTTTGGAGA  2060

Query 2034  TCAGGGCATCACCATGGGCTGCTGGGACATGTACCGCCATGACATCGACTGCCAGTGGGTTGACATCACTGACG  2107
            .||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.|.||||||||.||.|
Sbjct 2061  ACAAGGCATCACCATGGGCTGCTGGGACATGTACCGTCATGACATTGACTGCCAGTGGATAGACATCACCGATG  2134

Query 2108  TGCCCCCTGGAGACTACCTGTTCCAGGTTGTTATTAACCCCAACTTCGAGGTTGCAGAATCCGATTACTCCAAC  2181
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||..||.||..|||||||.||||.|||.|||
Sbjct 2135  TGCCCCCTGGAGACTACCTGTTCCAGGTTGTCATTAACCCCAACTATGAAGTGCCAGAATCAGATTTCTCTAAC  2208

Query 2182  AACATCATGAAATGCAGGAGCCGCTATGACGGCCACCGCATCTGGATGTACAACTGCCACATAGGTGGTTCCTT  2255
            |||||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||.|||.|||||||..||||
Sbjct 2209  AACATCATGAAGTGCAGGAGCCGCTATGATGGCTACCGCATCTGGATGTACAACTGTCACGTAGGTGGAGCCTT  2282

Query 2256  CAGCGAAGAGACGGAAAAAAAGTTTGAGCACTTCAGCGGGCTCTTAAACAACCAGCTGTCCCCGCAG  2322
            |||.||.|||||.|||.|.|||||.||.||||||||.||.||..||||.||||||||.||....|||
Sbjct 2283  CAGTGAGGAGACAGAACAGAAGTTCGAACACTTCAGTGGACTTCTAAATAACCAGCTCTCTGTACAG  2349