Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000489588
- Subject:
- NM_001252578.1
- Aligned Length:
- 2630
- Identities:
- 2242
- Gaps:
- 78
Alignment
Query 1 ATGGGCCCCCCGAGCCTCGTGCTGTGCTTGCTGTCCGCAACTGTGTTCTCCCTGCTGGGTGGAAGCTCGGCCTT 74
||||..|||||..||||....||.||..||||||||.|..||.|..||||||||||||.|||.|||||||||||
Sbjct 1 ATGGCACCCCCTGGCCTGCCACTATGGCTGCTGTCCACCGCTCTCCTCTCCCTGCTGGCTGGCAGCTCGGCCTT 74
Query 75 CCTGTCGCACCACCGCCTGAAAGGCAGGTTTCAGAGGGACCGCAGGAACATCCGCCCCAACATCATCCTGGTGC 148
|||.||.||.|.|||||||||.||..|.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||
Sbjct 75 CCTCTCCCATCCCCGCCTGAAGGGACGCTTCCAGAGGGACCGCAGGAACATCCGGCCCAACATCATCTTGGTGC 148
Query 149 TGACGGACGACCAGGATGTGGAGCTGGGTTCCATGCAGGTGATGAACAAGACCCGGCGCATCATGGAGCAGGGC 222
|.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||..||||.|||||||||||||||
Sbjct 149 TTACGGATGACCAGGATGTGGAGCTGGGCTCCATGCAAGTGATGAACAAGACAAGGCGTATCATGGAGCAGGGC 222
Query 223 GGGACGCACTTCATCAACGCCTTCGTGACCACACCCATGTGCTGCCCCTCACGCTCCTCCATCCTCACCGGCAA 296
|||.|||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 223 GGGGCGCACTTCATCAATGCCTTCGTGACTACACCAATGTGCTGTCCGTCTCGCTCCTCCATTCTCACCGGCAA 296
Query 297 GTACGTCCACAACCACAACACCTACACCAACAATGAGAACTGCTCCTCGCCCTCCTGGCAGGCACAGCACGAGA 370
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 297 GTACGTCCACAACCACAACACCTACACCAACAATGAGAATTGTTCCTCGCCCTCCTGGCAGGCCCAGCACGAGA 370
Query 371 GCCGCACCTTTGCCGTGTACCTCAATAGCACTGGCTACCGGACAGCTTTCTTCGGGAAGTATCTTAATGAATAC 444
||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||
Sbjct 371 GCCGCACCTTCGCCGTGTATCTCAACAGCACAGGCTACCGGACAGCTTTCTTCGGAAAATACCTCAATGAGTAC 444
Query 445 AACGGCTCCTACGTGCCACCCGGCTGGAAGGAGTGGGTCGGACTCCTTAAAAACTCCCGCTTTTATAACTACAC 518
||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AACGGCTCATACGTGCCGCCCGGCTGGAAGGAGTGGGTCGGCCTACTTAAGAACTCCCGCTTTTATAACTACAC 518
Query 519 GCTGTGTCGGAACGGGGTGAAAGAGAAGCACGGCTCCGACTACTCCAAGGATTACCTCACAGACCTCATCACCA 592
.||.||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||.||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 519 ACTCTGCCGGAATGGGGTGAAGGAGAAACATGGCTCAGACTACTCCACGGATTACCTCACGGATCTCATCACCA 592
Query 593 ATGACAGCGTGAGCTTCTTCCGCACGTCCAAGAAGATGTACCCGCACAGGCCAGTCCTCATGGTCATCAGCCAT 666
|||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 593 ATGACAGTGTGAGCTTCTTCCGAACATCCAAGAAGATGTACCCACACAGGCCCGTGCTCATGGTCATCAGCCAC 666
Query 667 GCAGCCCCCCACGGCCCTGAGGATTCAGCCCCACAATATTCACGCCTCTTCCCAAACGCATCTCAGCACATCAC 740
||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.||.||.|||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||
Sbjct 667 GCGGCTCCCCATGGCCCCGAGGACTCAGCACCCCAGTACTCACGGCTCTTCCCCAATGCGTCCCAGCACATCAC 740
Query 741 GCCGAGCTACAACTACGCGCCCAACCCGGACAAACACTGGATCATGCGCTACACGGGGCCCATGAAGCCCATCC 814
.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 741 ACCGAGTTACAACTATGCACCCAACCCAGACAAGCATTGGATCATGCGCTACACGGGACCCATGAAGCCCATTC 814
Query 815 ACATGGAATTCACCAACATGCTCCAGCGGAAGCGCTTGCAGACCCTCATGTCGGTGGACGACTCCATGGAGACG 888
||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||.|.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 815 ACATGGAATTCACCAACATGCTACAACGAAAACGCCTACAGACCCTCATGTCTGTGGATGACTCCATGGAGACG 888
Query 889 ATTTACAACATGCTGGTTGAGACGGGCGAGCTGGACAACACGTACATCGTATACACCGCCGACCACGGTTACCA 962
||.||..||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 889 ATCTATGACATGCTGGTGGAGACGGGGGAGCTGGACAACACGTACATCCTGTACACCGCCGACCACGGCTACCA 962
Query 963 CATCGGCCAGTTTGGCCTGGTGAAAGGGAAATCCATGCCATATGAGTTTGACATCAGGGTCCCGTTCTACGTGA 1036
|||.|||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 963 CATTGGCCAGTTTGGGCTGGTGAAGGGCAAGTCTATGCCGTATGAATTCGACATCAGAGTCCCGTTCTACGTGA 1036
Query 1037 GGGGCCCCAACGTGGAAGCCGGCTGTCTGAATCCCCACATCGTCCTCAACATTGACCTGGCCCCCACCATCCTG 1110
|||||||||||||||||||.||||.||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1037 GGGGCCCCAACGTGGAAGCTGGCTCTCTGAACCCCCACATTGTCCTCAACATTGACCTGGCCCCCACCATACTG 1110
Query 1111 GACATTGCAGGCCTGGACATACCTGCGGATATGGACGGGAAATCCATCCTCAAGCTGCTGGACACGGAGCGGCC 1184
||.||.||.||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.||.||||||.|.||||||||
Sbjct 1111 GATATCGCTGGACTGGACATCCCTGCAGACATGGACGGGAAGTCTATTCTCAAACTACTGGACTCAGAGCGGCC 1184
Query 1185 GGTGAATCGGTTTCACTTGAAAAAGAAGATGAGGGTCTGGCGGGACTCCTTCTTGGTGGAGAGAGGCAAGCTGC 1258
.|||||.|||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||.||||
Sbjct 1185 AGTGAACCGGTTCCACTTGAAAAAGAAGCTGAGGGTCTGGCGAGACTCCTTCCTGGTGGAGAGAGGCAAACTGC 1258
Query 1259 TACACAAGAGAGACAATGACAAGGTGGACGCCCAGGAGGAGAACTTTCTGCCCAAGTACCAGCGTGTGAAGGAC 1332
|.||||||||.||...||||||.|||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1259 TCCACAAGAGGGAGGGTGACAAAGTGAATGCCCAGGAGGAGAACTTCCTGCCCAAGTACCAGCGCGTGAAGGAC 1332
Query 1333 CTGTGTCAGCGTGCTGAGTACCAGACGGCGTGTGAGCAGCTGGGACAGAAGTGGCAGTGTGTGGAGGACGCCAC 1406
|||||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||..|
Sbjct 1333 CTGTGTCAGCGAGCTGAGTACCAGACAGCATGCGAACAGCTGGGGCAGAAGTGGCAGTGTGTGGAGGACGCTTC 1406
Query 1407 GGGGAAGCTGAAGCTGCATAAGTGCAAGGGCCCCATGCGGCT---------GGGCGGCAGCAGAGCCCTCTCCA 1471
.||||.||||||||||||.||.||.||.||||||||||||.| .||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGGGACGCTGAAGCTGCACAAATGTAAAGGCCCCATGCGGTTTGGTGGCGGCGGTGGCAGCAGAGCCCTCTCCA 1480
Query 1472 ACCTCGTGCCCAAGTACTACGGGCAGGGCAGCGAGGCCTGCACCTGTGACA---------GCGGGGACTACAAG 1536
||||.|||||||||||..||||.|||.|||||||||||||||.|||||||| |.|||||||||||.
Sbjct 1481 ACCTGGTGCCCAAGTATGACGGCCAGAGCAGCGAGGCCTGCAGCTGTGACAGTGGCGGTGGAGGGGACTACAAA 1554
Query 1537 CTCAGCCTGGCCGGACGCCGGAAAAAACTCTTCAAGAAGAAGTACAAGGCCAGCTATGTCCGCAGTCGCTCCAT 1610
||..|||||||.|||||||| .||.|||||.|||||.|||||.|||.|||||||||.|||.|..||||||||
Sbjct 1555 CTGGGCCTGGCTGGACGCCG---TAAGCTCTTTAAGAAAAAGTATAAGACCAGCTATGCCCGGAACCGCTCCAT 1625
Query 1611 CCGCTCAGTGGCCATCGAGGTGGACGGCAGGGTGTACCACGTAGGCCTGGGTGATGCCGCC-CAGCCCCGAAAC 1683
|||.||.||||||||||||||||||||...|.|.||||||||||||.|||.|..|| .||| ||||||||.|||
Sbjct 1626 CCGTTCCGTGGCCATCGAGGTGGACGGTGAGATATACCACGTAGGCTTGGATACTG-TGCCTCAGCCCCGCAAC 1698
Query 1684 CTCACCAAGCGGCACTGGCCAGGGGCCCCTGAGGACCAAGATGACAAGGATGGTGGGGACTTCAGTGGCACTGG 1757
||.|.|||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||....||||||||.|||||
Sbjct 1699 CTTAGCAAGCCGCACTGGCCAGGGGCCCCTGAAGACCAAGATGACAAGGATGGTGGCAGTTTCAGTGGTACTGG 1772
Query 1758 AGGCCTTCCCGACTACTCAGCCGCCAACCCCATTAAAGTGACACATCGGTGCTACATCCTAGAGAACGACACAG 1831
.||||||||.||.||.||.|||.||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1773 TGGCCTTCCAGATTATTCTGCCCCCAATCCCATCAAAGTGACCCATCGGTGCTACATCCTTGAGAATGACACAG 1846
Query 1832 TCCAGTGTGACCTGGACCTGTACAAGTCCCTGCAGGCCTGGAAAGACCACAAGCTGCACATCGACCACGAGATT 1905
|||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1847 TCCAGTGCGACTTGGACCTGTACAAGTCCCTGCAGGCTTGGAAAGACCACAAGCTGCACATCGACCATGAGATC 1920
Query 1906 GAAACCCTGCAGAACAAAATTAAGAACCTGAGGGAAGTCCGAGGTCACCTGAAGAAAAAGCGGCCAGAAGAATG 1979
|||||||||||||||||||||||||||||..|.||||||.|.||||||||||||||.|||||.||.||||||||
Sbjct 1921 GAAACCCTGCAGAACAAAATTAAGAACCTTCGAGAAGTCAGGGGTCACCTGAAGAAGAAGCGACCGGAAGAATG 1994
Query 1980 TGACTGTCACAAAATCAGCTACCACACCCAGCACAAAGGCCGCCTCAAGCACAGAGGCTCCAGTCTGCATCCTT 2053
||||||.||.|.||||||.|||||||.|||.|||||||||||.||||||||||.|||||||||.|||||.||||
Sbjct 1995 TGACTGCCATAGAATCAGTTACCACAGCCAACACAAAGGCCGTCTCAAGCACAAAGGCTCCAGCCTGCACCCTT 2068
Query 2054 TCAGGAAGGGCCTGCAAGAGAAGGACAAGGTGTGGCTGTTGCGGGAGCAGAAGCGCAAGAAGAAACTCCGCAAG 2127
||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 2069 TCAGGAAGGGTCTGCAGGAGAAGGACAAGGTGTGGCTGCTGCGGGAGCAGAAACGCAAGAAGAAACTGCGCAAG 2142
Query 2128 CTGCTCAAGCGCCTGCAGAACAACGACACGTGCAGCATGCCAGGCCTCACGTGCTTCACCCACGACAACCAGCA 2201
||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 2143 CTGCTCAAACGGCTGCAGAACAACGATACGTGCAGCATGCCCGGCCTCACGTGCTTTACCCACGACAACCACCA 2216
Query 2202 CTGGCAGACGGCGCCTTTCTGGACACTGGGGCCTTTCTGTGCCTGCACCAGCGCCAACAATAACACGTACTGGT 2275
|||||||||||||||..|||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2217 CTGGCAGACGGCGCCACTCTGGACGCTGGGGCCGTTCTGCGCCTGCACCAGCGCCAACAACAACACGTACTGGT 2290
Query 2276 GCATGAGGACCATCAATGAGACTCACAATTTCCTCTTCTGTGAATTTGCAACTGGCTTCCTAGAGTACTTTGAT 2349
||.||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||.||||.||||||||.
Sbjct 2291 GCTTGAGGACCATAAATGAGACCCACAACTTCCTCTTCTGCGAATTTGCAACCGGCTTCATAGAATACTTTGAC 2364
Query 2350 CTCAACACAGACCCCTACCAGCTGATGAATGCAGTGAACACACTGGACAGGGATGTCCTCAACCAGCTACACGT 2423
||||..|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||
Sbjct 2365 CTCAGTACAGACCCCTACCAGCTGATGAACGCGGTGAACACACTGGACAGGGACGTCCTTAACCAACTGCACGT 2438
Query 2424 ACAGCTAATGGAGCTGAGGAGCTGCAAGGGTTACAAGCAGTGTAACCCCCGGACTCGAAACATGGACCTGGGAC 2497
.|||||.||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 2439 GCAGCTCATGGAGCTAAGGAGCTGTAAAGGCTACAAGCAGTGCAACCCCCGGACCCGCAACATGGACCTGGGGC 2512
Query 2498 TTAAAGATGGAGGAAGCTATGAGCAATACAG------------------------------------------- 2528
|||.|||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2513 TTAGAGACGGAGGAAGCTATGAACAATACAGGCAGTTTCAGCGTCGAAAATGGCCAGAAATGAAGAGACCTTCT 2586
Query 2529 -----------GGGACAACTGTGGGAAGGCTGGGAAGGTG 2557
||||||.||.||||||||.||||||||.
Sbjct 2587 TCCAAATCACTGGGACAGCTATGGGAAGGTTGGGAAGGC- 2625