Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489722
• Subject: NM_001130028.1
• Aligned Length: 1915
• Identities: 1470
• Gaps: 445

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCCCGTCCTCTCCGCGCGCAGGAGGGAGTTGGCGGACCACGCGGGGTCGGGGCGACGGAGCGGGCCCAGCCC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CACGGCCAGGTCGGGGCCCCACCTCTCGGCTCTGAGAGCCCAGCCGGCCCGGGCCGCGCACCTGTCAGGTCGGG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GGACCTACGTGCGCCGCGACACGGCGGGAGGCGGGCCGGGCCAGGCTCGTCCCCTCGGCCCTCCCGGAACTAGT  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  CTCCTAGGCCGCGGCGCCCGCCGGAGCGGAGAGGGCTGGTGCCCCGGAGCCTTCGAGTCGGGGGCTAGAGCGGC  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  CAGGCCTCCGAGCCGGGTCGAGCCGAGGCTGGCGACGGCTGCGTCACGCGAGGGGGCGGGGCTGCCACGGGCGG  370

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  371  AGGTCGCAGCCGGAAGCGGAAGAGGCGCTCGGAGCGGGGAGTGGGGCCTAGCTGCAGCCGGAGCCTGGGAGACG  444

Query    1  ATGCATCACTGTAAGCGATACCGCTCCCCTGAACCAGACCCGTACCTGAGCTACCGATGGAAGAGGAGGAGGTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATGCATCACTGTAAGCGATACCGCTCCCCTGAACCAGACCCGTACCTGAGCTACCGATGGAAGAGGAGGAGGTC  518

Query   75  CTACAGTCGGGAACATGAAGGGAGACTGCGATACCCGTCCCGAAGGGAGCCTCCCCCACGAAGATCTCGGTCCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTACAGTCGGGAACATGAAGGGAGACTGCGATACCCGTCCCGAAGGGAGCCTCCCCCACGAAGATCTCGGTCCA  592

Query  149  GAAGCCATGACCGCCTGCCCTACCAGAGGAGGTACCGGGAGCGCCGTGACAGCGATACATACCGGTGTGAAGAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAAGCCATGACCGCCTGCCCTACCAGAGGAGGTACCGGGAGCGCCGTGACAGCGATACATACCGGTGTGAAGAG  666

Query  223  CGGAGCCCATCCTTTGGAGAGGACTACTATGGACCTTCACGTTCTCGTCATCGTCGGCGATCGCGGGAGAGGGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGGAGCCCATCCTTTGGAGAGGACTACTATGGACCTTCACGTTCTCGTCATCGTCGGCGATCGCGGGAGAGGGG  740

Query  297  GCCATACCGGACCCGCAAGCATGCCCACCACTGCCACAAACGCCGCACCAGGTCTTGTAGCAGCGCCTCCTCGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCCATACCGGACCCGCAAGCATGCCCACCACTGCCACAAACGCCGCACCAGGTCTTGTAGCAGCGCCTCCTCGA  814

Query  371  GAAGCCAACAGAGCAGTAAGCGCAGCAGCCGGAGTGTGGAAGATGACAAGGAGGGTCACCTGGTGTGCCGGATC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAAGCCAACAGAGCAGTAAGCGCAGCAGCCGGAGTGTGGAAGATGACAAGGAGGGTCACCTGGTGTGCCGGATC  888

Query  445  GGCGATTGGCTCCAAGAGCGATATGAGATTGTGGGGAACCTGGGTGAAGGCACCTTTGGCAAGGTGGTGGAGTG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGCGATTGGCTCCAAGAGCGATATGAGATTGTGGGGAACCTGGGTGAAGGCACCTTTGGCAAGGTGGTGGAGTG  962

Query  519  CTTGGACCATGCCAGAGGGAAGTCTCAGGTTGCCCTGAAGATCATCCGCAACGTGGGCAAGTACCGGGAGGCTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTTGGACCATGCCAGAGGGAAGTCTCAGGTTGCCCTGAAGATCATCCGCAACGTGGGCAAGTACCGGGAGGCTG  1036

Query  593  CCCGGCTAGAAATCAACGTGCTCAAAAAAATCAAGGAGAAGGACAAAGAAAACAAGTTCCTGTGTGTCTTGATG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCCGGCTAGAAATCAACGTGCTCAAAAAAATCAAGGAGAAGGACAAAGAAAACAAGTTCCTGTGTGTCTTGATG  1110

Query  667  TCTGACTGGTTCAACTTCCACGGTCACATGTGCATCGCCTTTGAGCTCCTGGGCAAGAACACCTTTGAGTTCCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCTGACTGGTTCAACTTCCACGGTCACATGTGCATCGCCTTTGAGCTCCTGGGCAAGAACACCTTTGAGTTCCT  1184

Query  741  GAAGGAGAATAACTTCCAGCCTTACCCCCTACCACATGTCCGGCACATGGCCTACCAGCTCTGCCACGCCCTTA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAAGGAGAATAACTTCCAGCCTTACCCCCTACCACATGTCCGGCACATGGCCTACCAGCTCTGCCACGCCCTTA  1258

Query  815  GATTTCTGCATGAGAATCAGCTGACCCATACAGACTTGAAACCAGAGAACATCCTGTTTGTGAATTCTGAGTTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GATTTCTGCATGAGAATCAGCTGACCCATACAGACTTGAAACCAGAGAACATCCTGTTTGTGAATTCTGAGTTT  1332

Query  889  GAAACCCTCTACAATGAGCACAAGAGCTGTGAGGAGAAGTCAGTGAAGAACACCAGCATCCGAGTGGCTGACTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAAACCCTCTACAATGAGCACAAGAGCTGTGAGGAGAAGTCAGTGAAGAACACCAGCATCCGAGTGGCTGACTT  1406

Query  963  TGGCAGTGCCACATTTGACCATGAGCACCACACCACCATTGTGGCCACCCGTCACTATCGCCCGCCTGAGGTGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGGCAGTGCCACATTTGACCATGAGCACCACACCACCATTGTGGCCACCCGTCACTATCGCCCGCCTGAGGTGA  1480

Query 1037  TCCTTGAGCTGGGCTGGGCACAGCCCTGTGACGTCTGGAGCATTGGCTGCATTCTCTTTGAGTACTACCGGGGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCCTTGAGCTGGGCTGGGCACAGCCCTGTGACGTCTGGAGCATTGGCTGCATTCTCTTTGAGTACTACCGGGGC  1554

Query 1111  TTCACACTCTTCCAGACCCACGAAAACCGAGAGCACCTGGTGATGATGGAGAAGATCCTAGGGCCCATCCCATC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TTCACACTCTTCCAGACCCACGAAAACCGAGAGCACCTGGTGATGATGGAGAAGATCCTAGGGCCCATCCCATC  1628

Query 1185  ACACATGATCCACCGTACCAGGAAGCAGAAATATTTCTACAAAGGGGGCCTAGTTTGGGATGAGAACAGCTCTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ACACATGATCCACCGTACCAGGAAGCAGAAATATTTCTACAAAGGGGGCCTAGTTTGGGATGAGAACAGCTCTG  1702

Query 1259  ACGGCCGGTATGTGAAGGAGAACTGCAAACCTCTGAAGAGTTACATGCTCCAAGACTCCCTGGAGCACGTGCAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ACGGCCGGTATGTGAAGGAGAACTGCAAACCTCTGAAGAGTTACATGCTCCAAGACTCCCTGGAGCACGTGCAG  1776

Query 1333  CTGTTTGACCTGATGAGGAGGATGTTAGAATTTGACCCTGCCCAGCGCATCACACTGGCCGAGGCCCTGCTGCA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CTGTTTGACCTGATGAGGAGGATGTTAGAATTTGACCCTGCCCAGCGCATCACACTGGCCGAGGCCCTGCTGCA  1850

Query 1407  CCCCTTCTTTGCTGGCCTGACCCCTGAGGAGCGGTCCTTCCACACCAGCCGCAACCCAAGCAGAG  1471
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct 1851  CCCCTTCTTTGCTGGCCTGACCCCTGAGGAGCGGTCCTTCCACACCAGCCGCAACCCAAGCAGA-  1914