Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489958
• Subject: XM_006510480.1
• Aligned Length: 1858
• Identities: 1596
• Gaps: 44

Alignment

Query    1  ATGTCCCAGCTCTCCTCCACCCTGAAGCGCTACACAGAATCGGCCCGCTACACAGATGCCCACTATGCCAAGTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||..|
Sbjct    1  ATGTCCCAGCTCTCCTCCACCCTGAAGCGCTATACAGAATCGTCCCGCTACACAGATGCCCCCTATGCCAAACC  74

Query   75  GGGCTATGGTGCCTACACCCCATCCTCCTATGGGGCCAATCTGGCTGCCTCCTTACTGGAGAAGGAGAAACTTG  148
            |||||||||..||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct   75  GGGCTATGGCACCTACACCCCTTCTTCCTATGGGGCCAACCTGGCCGCCTCCTTCCTGGAGAAGGAAAAACTTG  148

Query  149  GTTTCAAGCCGGTCCCCACCAGCAGCTTCCTCACCCGTCCCCGTACCTATGGCCCCTCCTCCCTCCTGGACTAT  222
            ||||||||||||||.||.|||.||||||||||.|.||.|||||.|||||.||||||||||||.|.|||||||.|
Sbjct  149  GTTTCAAGCCGGTCTCCCCCACCAGCTTCCTCCCACGGCCCCGCACCTACGGCCCCTCCTCCATTCTGGACTGT  222

Query  223  GACCGGGGCCGCCCCCTGCTGAGACCCGACATCACTGGGGGTGGTAAGCGGGCAGAGAGCCAGACCCGGGGTAC  296
            |||.||||||||||||||||||||.|.|||||||.||||.||.||||||||.||||||||||||||||.||.|.
Sbjct  223  GACAGGGGCCGCCCCCTGCTGAGATCTGACATCATTGGGAGTAGTAAGCGGTCAGAGAGCCAGACCCGTGGCAA  296

Query  297  TGAGCGGCCTTTAGGCAGTGGCCTCAGCGGGGGCAGCGGATTCCCTTATGGAGTGACCAACAACTGCCTCAGCT  370
            |||..||||.|..||||||||.||||.|||.|||||.|||||..||||||||||..|||.|||||.||||||||
Sbjct  297  TGAAAGGCCCTCGGGCAGTGGACTCAACGGAGGCAGTGGATTTTCTTATGGAGTTTCCAGCAACTCCCTCAGCT  370

Query  371  ACCTGCCCATCAATGCCTATGACCAGGGGGTGACCCTAACCCAGAAG----CTGGACAGCCAATCAGACCTGGC  440
            ||||||||||.||||||...|||||||||||||||||.|.|||||||    | |.|||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACCTGCCCATGAATGCCAGAGACCAGGGGGTGACCCTGAGCCAGAAGAAATC-GAACAGCCAATCAGACCTGGC  443

Query  441  CCGGGATTTCTCCAGCCTCCGGACCTCAGATAGCTACC------------------------------------  478
            ||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||                                    
Sbjct  444  CCGGGATTTCTCCAGCCTCCGGACTTCAGATGGCTACCGGACTTCAGATGGCTACCGGACCTCAGAGGGCTTTA  517

Query  479  GGATAGACCCCAGGAACCTGGGCCGCAGCCCCATGCTGGCCCGGACGCGCAAGGAGCTCTGCACCCTGCAGGGG  552
            ||||||||||..|.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||..||||||||||.
Sbjct  518  GGATAGACCCTGGAAACCTGGGTCGCAGCCCCATGCTGGCCCGCACGCGTAAGGAGCTCTGTGCCCTGCAGGGC  591

Query  553  CTCTACCAGACAGCCAGCTGCCCTGAATACCTGGTCGACTACCTGGAGAACTATGGTCGCAAGGGCAGTGCATC  626
            ||||||||..||||||||.|..||||.|||||....|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||.|
Sbjct  592  CTCTACCAAGCAGCCAGCCGTTCTGAGTACCTAACAGACTATCTGGAGAACTATGGTCGAAAGGGCAGTGCACC  665

Query  627  TCAGGTGCCCTCCCAGGCC---CCTCCCTCACGAGTCCCTGAAATCATCAGCCCAACCTACCGACCCATTGGCC  697
            .|||||||.|.|.||.|||   ||||||||.||||||||||||.||.||||.||.|||||||||||.|.|||||
Sbjct  666  ACAGGTGCTCACGCAAGCCCCTCCTCCCTCCCGAGTCCCTGAAGTCCTCAGTCCCACCTACCGACCAAGTGGCC  739

Query  698  GCTACACGCTGTGGGAGACGGGAAAGGGTCAGGCCCCTGGGCCCAGCCGCTCCAGCTCCCCGGGAAGAGACGGC  771
            |.|||||.||||||||||.|.|.|||||.||||||.|||||||||||||||||||.||.||.||..|||||..|
Sbjct  740  GTTACACACTGTGGGAGAAGAGCAAGGGCCAGGCCTCTGGGCCCAGCCGCTCCAGTTCTCCAGGGCGAGACACC  813

Query  772  ATGAATTCTAAGAGTGCCCAGGGTCTGGCTGGTCTTCGAAACCTTGGGAACACGTGCTTCATGAACTCAATTCT  845
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  ATGAATTCAAAGAGTGCCCAGGGTCTGGCTGGTCTTCGAAACCTTGGGAACACGTGCTTCATGAACTCAATTCT  887

Query  846  GCAGTGCCTGAGCAACACTCGGGAGTTGAGAGATTACTGCCTCCAGAGGCTCTACATGCGGGACCTGCACCACG  919
            .|||||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||...||||.
Sbjct  888  TCAGTGCCTGAGCAACACCCGAGAGCTGAGAGATTACTGCCTCCAGAGGCTGTACATGCGGGACCTCGGCCACA  961

Query  920  GCAGCAATGCACACACAGCCCTCGTGGAAGAGTTTGCAAAACTAATTCAGACCATATGGACTTCATCCCCCAAT  993
            .|||||..||.|||||.||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  962  CCAGCAGCGCTCACACGGCCCTCATGGAAGAGTTTGCAAAACTAATCCAGACCATATGGACGTCGTCCCCCAAT  1035

Query  994  GATGTGGTGAGCCCATCTGAGTTCAAGACCCAGATCCAGAGATATGCACCGCGCTTTGTTGGCTATAATCAGCA  1067
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||..|.||||||||||||||
Sbjct 1036  GATGTGGTGAGCCCATCTGAGTTCAAGACCCAGATCCAGAGATATGCGCCACGCTTCATGGGCTATAATCAGCA  1109

Query 1068  GGATGCTCAGGAGTTCCTTCGCTTTCTTCTGGATGGGCTCCATAACGAGGTGAACCGAGTGACACTGAGACCTA  1141
            ||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||.||...||.||||
Sbjct 1110  GGATGCTCAGGAATTCCTTCGTTTCCTTCTGGATGGTCTCCACAATGAGGTGAACCGGGTGGCAGCAAGGCCTA  1183

Query 1142  AGTCCAACCCTGAGAACCTCGATCATCTTCCTGATGACGAGAAAGGCCGACAGATGTGGAGAAAATATCTAGAA  1215
            ||.|||.||||||||.|||.||||||||.||||||||.||.||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||
Sbjct 1184  AGGCCAGCCCTGAGACCCTTGATCATCTCCCTGATGAAGAAAAGGGGCGACAGATGTGGAGGAAGTATCTGGAA  1257

Query 1216  CGGGAAGACAGTAGGATCGGGGATCTCTTTGTTGGGCAGCTAAAGAGCTCGCTGACGTGTACAGATTGTGGTTA  1289
            .|||||||||||.||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||.||.||||||||.||
Sbjct 1258  AGGGAAGACAGTCGGATTGGGGATCTCTTCGTTGGGCAGCTGAAGAGCTCCCTCACATGCACCGATTGTGGCTA  1331

Query 1290  CTGTTCTACGGTCTTCGACCCCTTCTGGGACCTCTCACTGCCCATTGCTAAGCGAGGTTATCCTGAGGTGACAT  1363
            |||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||..|||||||.||.|||.|||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1332  CTGCTCTACAGTCTTCGATCCCTTCTGGGATCTCTCGTTGCCCATCGCAAAGAGAGGTTACCCTGAGGTGACGT  1405

Query 1364  TAATGGACTGCATGAGGCTCTTCACCAAAGAGGATGTGCTTGATGGAGATGAAAAGCCAACATGCTGTCGCTGC  1437
            |||||||.||.|||||||||||||||||||||||..|..|.|||||.|||||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1406  TAATGGATTGTATGAGGCTCTTCACCAAAGAGGACATATTGGATGGTGATGAGAAGCCAACTTGCTGCCGCTGC  1479

Query 1438  CGAGGCAGAAAACGGTGTATAAAGAAGTTCTCCATCCAGAGGTTCCCAAAGATCTTGGTGCTCCATCTGAAGCG  1511
            ||||.|||||||||.||.|||||.||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1480  CGAGCCAGAAAACGATGCATAAAAAAGTTCTCTGTCCAGAGGTTCCCAAAGATCTTGGTGCTCCACCTGAAGCG  1553

Query 1512  GTTCTCAGAATCCAGGATCCGAACCAGCAAGCTCACAACATTTGTGAACTTCCCCCTAAGAGACCTGGACTTAA  1585
            .|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1554  ATTCTCAGAATCCAGGATACGAACCAGCAAGCTCACAACATTTGTGAATTTCCCACTAAGAGACCTGGACTTGA  1627

Query 1586  GAGAATTTGCCTCAGAAAACACCAACCATGCTGTTTACAACCTGTACGCTGTGTCCAATCACTCCGGAACCACC  1659
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1628  GAGAATTTGCTTCAGAAAACACCAACCATGCTGTTTACAACCTGTATGCTGTGTCCAATCACTCCGGAACCACC  1701

Query 1660  ATGGGTGGCCACTATACAGCCTACTGTCGCAGTCCAGGGACAGGAGAATGGCACACTTTCAACGACTCCAGCGT  1733
            |||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|..|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||
Sbjct 1702  ATGGGAGGCCACTATACAGCCTACTGCCGAAGTCCGGTTACAGGCGAATGGCACACTTTCAATGATTCCAGTGT  1775

Query 1734  CACTCCCATGTCCTCCAGCCAAGTGCGCACCAGCGACGCCTACCTGCTCTTCTACGAACTGGCCAGCCCGCCCT  1807
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 1776  CACACCCATGTCCTCCAGCCAAGTGCGCACCAGCGACGCCTATTTGCTCTTCTATGAACTGGCCAGTCCACCCT  1849

Query 1808  CCCGAATG  1815
            ||||.|||
Sbjct 1850  CCCGTATG  1857