Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491400
• Subject: NM_011947.3
• Aligned Length: 1879
• Identities: 1687
• Gaps: 13

Alignment

Query    1  ATGGACGAACAGGAGGCATTGAACTCAATCATGAACGATCTGGTGGCCCTCCAGATGAACCGACGTCACCGGAT  74
            |||||.|||||.||||||||..||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||.||||||...||||.|
Sbjct    1  ATGGATGAACAAGAGGCATTAGACTCGATCATGAAGGACCTGGTGGCCCTCCAGATGAGCCGACGAACCCGGTT  74

Query   75  GCCTGGATATGAGACCATGAAGAACAAAGACACAGGTCACTCAAATAGGCAGAGTGACGTCAGAATCAAGTTCG  148
            |.||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  GTCTGGATATGAGACCATGAAGAATAAGGACACAGGTCACCCAAACAGGCAGAGTGACGTCAGAATCAAGTTTG  148

Query  149  AGCACAACGGGGAGAGGCGAATTATAGCGTTCAGCCGGCCTGTGAAATATGAAGATGTGGAGCACAAGGTGACA  222
            |.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AACACAATGGGGAGAGACGAATTATAGCATTCAGCCGGCCTGTGAGATACGAAGATGTGGAGCACAAGGTGACA  222

Query  223  ACAGTATTTGGACAACCTCTTGATCTACATTACATGAACAATGAGCTCTCCATCCTGCTGAAAAACCAAGATGA  296
            |||||.|||||.||.|||||||||.|.|||||.|||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  223  ACAGTCTTTGGGCAGCCTCTTGATTTGCATTATATGAATAATGAGCTCTCCATCCTGTTGAAAAACCAAGATGA  296

Query  297  TCTTGATAAAGCAATTGACATTTTAGATAGAAGCTCAAGCATGAAAAGCCTTAGGATATTGCTGTTGTCCCAGG  370
            |||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.|.|||||.|||||.|
Sbjct  297  TCTCGATAAAGCCATTGACATTTTGGATAGAAGCTCAAGTATGAAAAGCCTTAGGATACTACTGTTATCCCAAG  370

Query  371  ACAGAAACCATAACAGTTCCTCTCCCCACTCTGGGGTGTCCAGACAGGTGCGGATCAAGGCTTCCCAGTCCGCA  444
            ||||||||||||..||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||.||||||||||.|||
Sbjct  371  ACAGAAACCATACTAGTTCCTCTCCCCACTCTGGAGTGTCCAGGCAGGTTCGGATCAAGCCTTCCCAGTCTGCA  444

Query  445  GGGGATATAAATACTATCTACCAGCCCCCCGAGCCCAGAAGCAGGCACCTCTCTGTCAGCTCCCAGAACCCTGG  518
            ||||||||||||||.||||||||..|.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGGGATATAAATACCATCTACCAAGCTCCTGAGCCCAGAAGCAGGCACCTGTCTGTCAGCTCCCAGAACCCTGG  518

Query  519  CCGAAGCTCACCTCCCCCTGGCTATGTTCCTGAGCGGCAGCAGCACATTGCCCGGCAGGGGTCCTACACCAGCA  592
            |||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.||||
Sbjct  519  CCGAAGCTCTCCTCCCCCGGGATATGTACCTGAGCGACAACAGCACATTGCCCGGCAAGGATCCTATACGAGCA  592

Query  593  TCAACAGTGAGGGGGAGTTCATCCCAGAGACCAGCGAGCAGTGCATGCTGGATCCCCTGAGCAGTGCAGAAAAT  666
            |||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||
Sbjct  593  TCAACAGCGAAGGTGAATTCATCCCAGAGACCAGCGAACAGTGTATGCTAGATCCCCTCAGCAGTGCCGAAAAT  666

Query  667  TCCTTGTCTGGAAGCTGCCAATCCTTG------------GACAGCCCATCCTTCCGGAAATCACGAATGTCCCG  728
            ||||||||.||||||||||||||||||            |||||||||||||||.|||||||||.|||||||||
Sbjct  667  TCCTTGTCAGGAAGCTGCCAATCCTTGGACAGGTCAGCAGACAGCCCATCCTTCAGGAAATCACAAATGTCCCG  740

Query  729  TGCCCAGAGCTTCCCTGACAACAGACAGGAATACTCAGATCGGGAAACTCAGCTTTATGACAAAGGGGTCAAAG  802
            .||||.|||||||||.|||||||||.||||||.||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct  741  AGCCCGGAGCTTCCCAGACAACAGAAAGGAATGCTCAGATCGGGAGACCCAGCTCTATGATAAAGGTGTCAAAG  814

Query  803  GTGGAACCTACCCCCGGCGCTACCACGTGTCTGTGCACCACAAGGACTACAGTGATGGCAGAAGAACATTTCCC  876
            ||||||||||.|||.||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTGGAACCTATCCCAGGCGCTACCATGTGTCTGTGCATCACAAAGACTACAATGATGGCAGAAGAACATTTCCC  888

Query  877  CGAATACGGCGTCATCAAGGCAACTTGTTCACCCTGGTGCCCTCCAGCCGCTCCCTGAGCACAAATGGCGAGAA  950
            ||||||||.||.||||||||||||.|.|||||.|||||||||||.||.||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  889  CGAATACGACGGCATCAAGGCAACCTATTCACTCTGGTGCCCTCAAGTCGCTCCTTGAGCACAAATGGCGAGAA  962

Query  951  CATGGGTCTGGCTGTGCAATACCTGGACCCCCGTGGGCGCCTGCGGAGTGCGGACAGCGAGAATGCCCTCTCTG  1024
            |||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||.|||
Sbjct  963  CATGGGTGTAGCTGTGCAATACCTGGACCCCCGTGGGCGCCTACGGAGTGCAGACAGTGAGAATGCCCTCACTG  1036

Query 1025  TGCAGGAGAGGAATGTGCCAACCAAGTCTCCCAGTGCCCCCATCAACTGGCGCCGGGGAAAGCTCCTGGGCCAG  1098
            |||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.
Sbjct 1037  TGCAGGAAAGGAATGTGCCAACCAAATCTCCTAGTGCTCCCATCAATTGGCGTCGGGGGAAGCTCCTGGGTCAA  1110

Query 1099  GGTGCCTTCGGCAGGGTCTATTTGTGCTATGACGTGGACACGGGACGTGAACTTGCTTCCAAGCAGGTCCAATT  1172
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1111  GGTGCCTTCGGCAGGGTCTACTTGTGCTATGATGTGGACACAGGACGTGAACTTGCTTCTAAGCAGGTCCAGTT  1184

Query 1173  TGATCCAGACAGTCCTGAGACAAGCAAGGAGGTGAGTGCTCTGGAGTGCGAGATCCAGTTGCTAAAGAACTTGC  1246
            |||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.|||
Sbjct 1185  TGACCCAGATAGTCCTGAGACAAGCAAGGAGGTGAGTGCTCTGGAGTGTGAGATCCAGTTGCTGAAGAACCTGC  1258

Query 1247  AGCATGAGCGCATCGTGCAGTACTATGGCTGTCTGCGGGACCGCGCTGAGAAGACCCTGACCATCTTCATGGAG  1320
            |||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||.|||.||||||||.||||||
Sbjct 1259  AGCATGAGCGCATTGTGCAGTACTACGGCTGCCTGCGGGACCGTGCTGAGAAGATCCTCACCATCTTTATGGAG  1332

Query 1321  TACATGCCAGGGGGCTCGGTGAAAGACCAGTTGAAGGCTTACGGTGCTCTGACAGAGAGCGTGACCCGAAAGTA  1394
            ||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1333  TATATGCCAGGGGGCTCTGTAAAAGACCAGTTGAAGGCCTACGGAGCTCTGACAGAGAGTGTGACCCGCAAGTA  1406

Query 1395  CACGCGGCAGATCCTGGAGGGCATGTCCTACCTGCACAGCAACATGATTGTTCACCGGGACATTAAGGGAGCCA  1468
            |||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1407  CACCCGGCAGATTCTGGAGGGCATGTCATACCTGCACAGCAACATGATTGTGCATCGGGACATCAAGGGAGCCA  1480

Query 1469  ACATCCTCCGAGACTCTGCTGGGAATGTAAAGCTGGGGGACTTTGGGGCCAGCAAACGCCTGCAGACGATCTGT  1542
            |.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.
Sbjct 1481  ATATCCTCCGAGACTCAGCTGGGAATGTGAAGCTTGGGGATTTTGGGGCCAGCAAACGCCTACAGACCATCTGC  1554

Query 1543  ATGTCGGGGACGGGCATGCGCTCCGTCACTGGCACACCCTACTGGATGAGCCCTGAGGTGATCAGCGGCGAGGG  1616
            |||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 1555  ATGTCAGGGACAGGCATTCGCTCTGTCACTGGCACACCCTACTGGATGAGTCCTGAAGTCATCAGTGGCGAGGG  1628

Query 1617  CTATGGAAGGAAAGCAGACGTGTGGAGCCTGGGCTGCACTGTGGTGGAGATGCTGACAGAGAAACCACCGTGGG  1690
            |||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1629  CTATGGAAGAAAGGCAGACGTGTGGAGCCTGGGCTGTACTGTGGTGGAAATGCTGACAGAGAAACCACCTTGGG  1702

Query 1691  CAGAGTATGAAGCTATGGCCGCCATCTTTAAGATTGCCACCCAGCCCACCAATCCTCAGCTGCCCTCCCACATC  1764
            |||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1703  CAGAGTATGAAGCTATGGCTGCCATTTTCAAGATTGCCACCCAGCCTACCAATCCTCAGCTGCCCTCTCACATC  1776

Query 1765  TCTGAACATGGCCGGGACTTCCTGAGGCGCATTTTTGTGGAGGCTCGCCAGAGACCTTCAGCTGAGGAGCTGCT  1838
            ||.|||||.|||.|||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1777  TCAGAACACGGCAGGGACTTCCTGAGGCGCATATTTGTGGAAGCTCGTCAGAGACCCTCAGCTGAGGAGCTGCT  1850

Query 1839  CACACACCACTTTGCACAGCTCATGTACG  1867
            |||||||||||||||||||||..||||| 
Sbjct 1851  CACACACCACTTTGCACAGCTAGTGTAC-  1878