Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491400
• Subject: XM_011249037.3
• Aligned Length: 1879
• Identities: 1662
• Gaps: 43

Alignment

Query    1  ATGGACGAACAGGAGGCATTGAACTCAATCATGAACGATCTGGTGGCCCTCCAGATGAACCGACGTCACCGGAT  74
                                          |||||.||.|||||||||||||||||||.||||||...||||.|
Sbjct    1  ------------------------------ATGAAGGACCTGGTGGCCCTCCAGATGAGCCGACGAACCCGGTT  44

Query   75  GCCTGGATATGAGACCATGAAGAACAAAGACACAGGTCACTCAAATAGGCAGAGTGACGTCAGAATCAAGTTCG  148
            |.||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   45  GTCTGGATATGAGACCATGAAGAATAAGGACACAGGTCACCCAAACAGGCAGAGTGACGTCAGAATCAAGTTTG  118

Query  149  AGCACAACGGGGAGAGGCGAATTATAGCGTTCAGCCGGCCTGTGAAATATGAAGATGTGGAGCACAAGGTGACA  222
            |.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  119  AACACAATGGGGAGAGACGAATTATAGCATTCAGCCGGCCTGTGAGATACGAAGATGTGGAGCACAAGGTGACA  192

Query  223  ACAGTATTTGGACAACCTCTTGATCTACATTACATGAACAATGAGCTCTCCATCCTGCTGAAAAACCAAGATGA  296
            |||||.|||||.||.|||||||||.|.|||||.|||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  193  ACAGTCTTTGGGCAGCCTCTTGATTTGCATTATATGAATAATGAGCTCTCCATCCTGTTGAAAAACCAAGATGA  266

Query  297  TCTTGATAAAGCAATTGACATTTTAGATAGAAGCTCAAGCATGAAAAGCCTTAGGATATTGCTGTTGTCCCAGG  370
            |||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.|.|||||.|||||.|
Sbjct  267  TCTCGATAAAGCCATTGACATTTTGGATAGAAGCTCAAGTATGAAAAGCCTTAGGATACTACTGTTATCCCAAG  340

Query  371  ACAGAAACCATAACAGTTCCTCTCCCCACTCTGGGGTGTCCAGACAGGTGCGGATCAAGGCTTCCCAGTCCGCA  444
            ||||||||||||..||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||.||||||||||.|||
Sbjct  341  ACAGAAACCATACTAGTTCCTCTCCCCACTCTGGAGTGTCCAGGCAGGTTCGGATCAAGCCTTCCCAGTCTGCA  414

Query  445  GGGGATATAAATACTATCTACCAGCCCCCCGAGCCCAGAAGCAGGCACCTCTCTGTCAGCTCCCAGAACCCTGG  518
            ||||||||||||||.||||||||..|.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  415  GGGGATATAAATACCATCTACCAAGCTCCTGAGCCCAGAAGCAGGCACCTGTCTGTCAGCTCCCAGAACCCTGG  488

Query  519  CCGAAGCTCACCTCCCCCTGGCTATGTTCCTGAGCGGCAGCAGCACATTGCCCGGCAGGGGTCCTACACCAGCA  592
            |||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.||||
Sbjct  489  CCGAAGCTCTCCTCCCCCGGGATATGTACCTGAGCGACAACAGCACATTGCCCGGCAAGGATCCTATACGAGCA  562

Query  593  TCAACAGTGAGGGGGAGTTCATCCCAGAGACCAGCGAGCAGTGCATGCTGGATCCCCTGAGCAGTGCAGAAAAT  666
            |||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||
Sbjct  563  TCAACAGCGAAGGTGAATTCATCCCAGAGACCAGCGAACAGTGTATGCTAGATCCCCTCAGCAGTGCCGAAAAT  636

Query  667  TCCTTGTCTGGAAGCTGCCAATCCTTG------------GACAGCCCATCCTTCCGGAAATCACGAATGTCCCG  728
            ||||||||.||||||||||||||||||            |||||||||||||||.|||||||||.|||||||||
Sbjct  637  TCCTTGTCAGGAAGCTGCCAATCCTTGGACAGGTCAGCAGACAGCCCATCCTTCAGGAAATCACAAATGTCCCG  710

Query  729  TGCCCAGAGCTTCCCTGACAACAGACAGGAATACTCAGATCGGGAAACTCAGCTTTATGACAAAGGGGTCAAAG  802
            .||||.|||||||||.|||||||||.||||||.||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct  711  AGCCCGGAGCTTCCCAGACAACAGAAAGGAATGCTCAGATCGGGAGACCCAGCTCTATGATAAAGGTGTCAAAG  784

Query  803  GTGGAACCTACCCCCGGCGCTACCACGTGTCTGTGCACCACAAGGACTACAGTGATGGCAGAAGAACATTTCCC  876
            ||||||||||.|||.||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  785  GTGGAACCTATCCCAGGCGCTACCATGTGTCTGTGCATCACAAAGACTACAATGATGGCAGAAGAACATTTCCC  858

Query  877  CGAATACGGCGTCATCAAGGCAACTTGTTCACCCTGGTGCCCTCCAGCCGCTCCCTGAGCACAAATGGCGAGAA  950
            ||||||||.||.||||||||||||.|.|||||.|||||||||||.||.||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  859  CGAATACGACGGCATCAAGGCAACCTATTCACTCTGGTGCCCTCAAGTCGCTCCTTGAGCACAAATGGCGAGAA  932

Query  951  CATGGGTCTGGCTGTGCAATACCTGGACCCCCGTGGGCGCCTGCGGAGTGCGGACAGCGAGAATGCCCTCTCTG  1024
            |||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||.|||
Sbjct  933  CATGGGTGTAGCTGTGCAATACCTGGACCCCCGTGGGCGCCTACGGAGTGCAGACAGTGAGAATGCCCTCACTG  1006

Query 1025  TGCAGGAGAGGAATGTGCCAACCAAGTCTCCCAGTGCCCCCATCAACTGGCGCCGGGGAAAGCTCCTGGGCCAG  1098
            |||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.
Sbjct 1007  TGCAGGAAAGGAATGTGCCAACCAAATCTCCTAGTGCTCCCATCAATTGGCGTCGGGGGAAGCTCCTGGGTCAA  1080

Query 1099  GGTGCCTTCGGCAGGGTCTATTTGTGCTATGACGTGGACACGGGACGTGAACTTGCTTCCAAGCAGGTCCAATT  1172
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1081  GGTGCCTTCGGCAGGGTCTACTTGTGCTATGATGTGGACACAGGACGTGAACTTGCTTCTAAGCAGGTCCAGTT  1154

Query 1173  TGATCCAGACAGTCCTGAGACAAGCAAGGAGGTGAGTGCTCTGGAGTGCGAGATCCAGTTGCTAAAGAACTTGC  1246
            |||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.|||
Sbjct 1155  TGACCCAGATAGTCCTGAGACAAGCAAGGAGGTGAGTGCTCTGGAGTGTGAGATCCAGTTGCTGAAGAACCTGC  1228

Query 1247  AGCATGAGCGCATCGTGCAGTACTATGGCTGTCTGCGGGACCGCGCTGAGAAGACCCTGACCATCTTCATGGAG  1320
            |||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||.|||.||||||||.||||||
Sbjct 1229  AGCATGAGCGCATTGTGCAGTACTACGGCTGCCTGCGGGACCGTGCTGAGAAGATCCTCACCATCTTTATGGAG  1302

Query 1321  TACATGCCAGGGGGCTCGGTGAAAGACCAGTTGAAGGCTTACGGTGCTCTGACAGAGAGCGTGACCCGAAAGTA  1394
            ||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1303  TATATGCCAGGGGGCTCTGTAAAAGACCAGTTGAAGGCCTACGGAGCTCTGACAGAGAGTGTGACCCGCAAGTA  1376

Query 1395  CACGCGGCAGATCCTGGAGGGCATGTCCTACCTGCACAGCAACATGATTGTTCACCGGGACATTAAGGGAGCCA  1468
            |||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1377  CACCCGGCAGATTCTGGAGGGCATGTCATACCTGCACAGCAACATGATTGTGCATCGGGACATCAAGGGAGCCA  1450

Query 1469  ACATCCTCCGAGACTCTGCTGGGAATGTAAAGCTGGGGGACTTTGGGGCCAGCAAACGCCTGCAGACGATCTGT  1542
            |.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.
Sbjct 1451  ATATCCTCCGAGACTCAGCTGGGAATGTGAAGCTTGGGGATTTTGGGGCCAGCAAACGCCTACAGACCATCTGC  1524

Query 1543  ATGTCGGGGACGGGCATGCGCTCCGTCACTGGCACACCCTACTGGATGAGCCCTGAGGTGATCAGCGGCGAGGG  1616
            |||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 1525  ATGTCAGGGACAGGCATTCGCTCTGTCACTGGCACACCCTACTGGATGAGTCCTGAAGTCATCAGTGGCGAGGG  1598

Query 1617  CTATGGAAGGAAAGCAGACGTGTGGAGCCTGGGCTGCACTGTGGTGGAGATGCTGACAGAGAAACCACCGTGGG  1690
            |||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1599  CTATGGAAGAAAGGCAGACGTGTGGAGCCTGGGCTGTACTGTGGTGGAAATGCTGACAGAGAAACCACCTTGGG  1672

Query 1691  CAGAGTATGAAGCTATGGCCGCCATCTTTAAGATTGCCACCCAGCCCACCAATCCTCAGCTGCCCTCCCACATC  1764
            |||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1673  CAGAGTATGAAGCTATGGCTGCCATTTTCAAGATTGCCACCCAGCCTACCAATCCTCAGCTGCCCTCTCACATC  1746

Query 1765  TCTGAACATGGCCGGGACTTCCTGAGGCGCATTTTTGTGGAGGCTCGCCAGAGACCTTCAGCTGAGGAGCTGCT  1838
            ||.|||||.|||.|||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1747  TCAGAACACGGCAGGGACTTCCTGAGGCGCATATTTGTGGAAGCTCGTCAGAGACCCTCAGCTGAGGAGCTGCT  1820

Query 1839  CACACACCACTTTGCACAGCTCATGTACG  1867
            |||||||||||||||||||||..||||| 
Sbjct 1821  CACACACCACTTTGCACAGCTAGTGTAC-  1848