Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491406
• Subject: NM_001024698.3
• Aligned Length: 1258
• Identities: 1075
• Gaps: 14

Alignment

Query    1  ATGAGGTTGATCCTGTTTTTTGGTGCCCTTTTTGGGCATATCTACTGTCTAGAAACATTTGTGGGAGACCAAGT  74
            ||||||||||.||.|||.||.|.||||||.||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGAGGTTGACCCCGTTATTGGTTGCCCTATTTGGGTATATCTACTGTCAAGAAACATTTGTGGGAGATCAAGT  74

Query   75  TCTTGAGATTGTACCAAGCAATGAAGAACAAATTAAAAATCTGCTACAATTGGAGGCTCAAGAACATCTCCAGC  148
            |||||||.|..|.||.|...|||||||.||||||||.|.||||||.|||.|||||||..||||.||.||..|||
Sbjct   75  TCTTGAGGTGATCCCGAATGATGAAGAGCAAATTAAGACTCTGCTGCAACTGGAGGCCGAAGAGCACCTTGAGC  148

Query  149  TTGATTTTTGGAAATCACCCA-CCACCCCAGGGGAGACAGCCCACGTCCGAGTTCCCTTCGTCAACGTCCAGGC  221
            ||||||||||||||||.|||| |..||||| ||.||||||.|||.|||||||||||.||.|.||.|.||||||.
Sbjct  149  TTGATTTTTGGAAATCCCCCAGCGTCCCCA-GGCAGACAGTCCATGTCCGAGTTCCTTTTGCCAGCATCCAGGA  221

Query  222  AGTCAAAGTGTTCTTGGGGTCCCAGGGAATTGCCTATTCCATCATGATTGAAGACGTGCAGGTCCTGTTGGACA  295
            .||||||||.|||.|||.|||||||||.|||.|.||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||..
Sbjct  222  CGTCAAAGTTTTCCTGGAGTCCCAGGGGATTACTTATTCCATCATGATCGAAGATGTTCAAGTTCTGTTGGATC  295

Query  296  AAGAGAATGAAGAAATGCTTTTTAA-TAGGAGAAGAGAACGGAGTGG---TAACTTCAATTTTGGGGCCTACCA  365
            |||||..||||||.|||||.||.|| .||.| ||||||   |.||||   |||||||||.||||||||||||||
Sbjct  296  AAGAGCGTGAAGAGATGCTGTTCAACCAGCA-AAGAGA---GCGTGGCACTAACTTCAACTTTGGGGCCTACCA  365

Query  366  TACCCTGGAAGAGATTTCCCAAGAAATGGATAACCTCGTGGCTGAGCACCCCGGTCTAGTGAGCAAAGTGAATA  439
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  366  TACCCTGGAAGAGATTTACCAAGAAATGGATAACCTCGTGGCTGAGAACCCTGGTCTAGTGAGCAAAGTGAATA  439

Query  440  TTGGCTCTTCTTTTGAGAACCGGCCTATGAACGTGCTCAAGTTCAGCACCGGAGGAGACAAGCCAGCTATCTGG  513
            |.||.||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  440  TCGGTTCATCTTTTGAAAATCGGCCCATGAATGTGCTCAAGTTCAGCACCGGAGGAGACAAGCCAGCCATCTGG  513

Query  514  CTGGATGCTGGGATCCATGCTCGAGAGTGGGTTACACAAGCTACGGCACTTTGGACAGCAAATAAGATTGTTTC  587
            ||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||..||
Sbjct  514  CTTGATGCGGGGATCCACGCTCGAGAGTGGGTTACGCAAGCTACTGCACTGTGGACAGCAAATAAGATTGCGTC  587

Query  588  TGATTATGGAAAGGACCCATCCATCACTTCCATTCTGGACGCCCTGGATATCTTCCTCCTGCCAGTCACAAACC  661
            |||||||||.|..||.|||.||||||||||..||||..|..|.||||||.|||||||.|||||.|||||.||||
Sbjct  588  TGATTATGGGACTGATCCAGCCATCACTTCTCTTCTCAATACTCTGGATGTCTTCCTGCTGCCTGTCACGAACC  661

Query  662  CTGATGGATACGTGTTCTCTCAAACCAAAAATCGTATGTGGCGGAAGACCCGGTCCAA--GGTATCTGGAAGCC  733
            ||||||||||.||||||||.||||||...||||||||||||||.|||||||||||.||  ||  ||.||||||.
Sbjct  662  CTGATGGATATGTGTTCTCCCAAACCTCCAATCGTATGTGGCGAAAGACCCGGTCTAAACGG--TCGGGAAGCT  733

Query  734  TCTGTGTTGGTGTGGATCCTAACCGGAACTGGGATGCAGGTTTTGGAGGACCTGGAGCCAGCAGCAACCCTTGC  807
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||..|||.|||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  734  TCTGTGTTGGTGTGGATCCTAATCGGAACTGGGACGCAAATTTCGGAGGACCTGGAGCCAGTAGCAACCCTTGC  807

Query  808  TCTGATTCATACCACGGACCCAGTGCCAACTCTGAAGTTGAAGTGAAATCCATAGTGGACTTCATCAAGAGTCA  881
            ||||||||||||||.|||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  808  TCTGATTCATACCATGGACCCAGTCCCAATTCTGAAGTTGAAGTGAAATCCATAGTGGACTTCATCAAGAGCCA  881

Query  882  TGGAAAAGTCAAGGCCTTCATTACCCTCCACAGCTATTCCCAGCTGCTGATGTTCCCCTATGGGTACAAATGTA  955
            .||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||.
Sbjct  882  CGGGAAAGTCAAAGCGTTCATTACCCTTCACAGCTATTCCCAACTGCTCATGTTCCCCTATGGCTATAAATGTG  955

Query  956  CCAAGTTAGATGACTTTGATGAGCTGAGTGAAGTGGCCCAAAAGGCTGCCCAATCTCTGAGAAGCCTGCATGGC  1029
            |||||..||||||||||.||||||||..||||||||||||||.|||||||||.|||.|||.|||.||.||.|||
Sbjct  956  CCAAGCCAGATGACTTTAATGAGCTGGATGAAGTGGCCCAAAGGGCTGCCCAGTCTTTGAAAAGACTCCACGGC  1029

Query 1030  ACCAAGTACAAAGTGGGACCAATCTGCTCTGTCATCTACCAAGCCAGTGGAGGAAGCATTGACTGGTCCTATGA  1103
            ||||..||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||.|.|||||
Sbjct 1030  ACCAGTTACAAAGTGGGACCCATCTGTTCTGTCATCTACCAGGCCAGTGGCGGAAGCATCGACTGGGCTTATGA  1103

Query 1104  TTATGGCATCAAGTACTCATTTGCCTTTGAACTGAGAGACACAGGGCGCTACGGCTTCCTCTTGCCAGCCCGTC  1177
            ...|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||...|||.|||||||||.||||||||...|
Sbjct 1104  CCTTGGCATCAAATACTCATTTGCCTTTGAACTGAGAGACACAGGCTACTATGGCTTCCTCCTGCCAGCCAAGC  1177

Query 1178  AGATCCTGCCCACAGCCGAGGAGACCTGGCTTGGCTTGAAGGCAATCATGGAGCATGTGCGAGACCACCCCTAT  1251
            |||||.||||||||||.||.|||||||||||||||.|||||.|.|||||||||||.||.||||||||||||||.
Sbjct 1178  AGATCTTGCCCACAGCAGAAGAGACCTGGCTTGGCCTGAAGACCATCATGGAGCACGTACGAGACCACCCCTAC  1251