Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000491406
- Subject:
- XM_011241057.1
- Aligned Length:
- 1257
- Identities:
- 824
- Gaps:
- 321
Alignment
Query 1 ATGAGGTTGATCCTGTTTTTTGGTGCCCTTTTTGGGCATATCTACTGTCTAGAAACATTTGTGGGAGACCAAGT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TCTTGAGATTGTACCAAGCAATGAAGAACAAATTAAAAATCTGCTACAATTGGAGGCTCAAGAACATCTCCAGC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TTGATTTTTGGAAATCACCCACCACCCCAGGGGAGACAGCCCACGTCCGAGTTCCCTTCGTCAACGTCCAGGCA 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GTCAAAGTGTTCTTGGGGTCCCAGGGAATTGCCTATTCCATCATGATTGAAGACGTGCAGGTCCTGTTGGACAA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 AGAGAATGAAGAAATGCTTTTTAA-TAGGAGAAGAGAACGGAGTGG---TAACTTCAATTTTGGGGCCTACCAT 366
|||||.||.|| .||.| |||||| |.|||| |||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1 -------------ATGCTGTTCAACCAGCA-AAGAGA---GCGTGGCACTAACTTCAACTTTGGGGCCTACCAT 57
Query 367 ACCCTGGAAGAGATTTCCCAAGAAATGGATAACCTCGTGGCTGAGCACCCCGGTCTAGTGAGCAAAGTGAATAT 440
||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 58 ACCCTGGAAGAGATTTACCAAGAAATGGATAACCTCGTGGCTGAGAACCCTGGTCTAGTGAGCAAAGTGAATAT 131
Query 441 TGGCTCTTCTTTTGAGAACCGGCCTATGAACGTGCTCAAGTTCAGCACCGGAGGAGACAAGCCAGCTATCTGGC 514
.||.||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 132 CGGTTCATCTTTTGAAAATCGGCCCATGAATGTGCTCAAGTTCAGCACCGGAGGAGACAAGCCAGCCATCTGGC 205
Query 515 TGGATGCTGGGATCCATGCTCGAGAGTGGGTTACACAAGCTACGGCACTTTGGACAGCAAATAAGATTGTTTCT 588
|.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||..|||
Sbjct 206 TTGATGCGGGGATCCACGCTCGAGAGTGGGTTACGCAAGCTACTGCACTGTGGACAGCAAATAAGATTGCGTCT 279
Query 589 GATTATGGAAAGGACCCATCCATCACTTCCATTCTGGACGCCCTGGATATCTTCCTCCTGCCAGTCACAAACCC 662
||||||||.|..||.|||.||||||||||..||||..|..|.||||||.|||||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct 280 GATTATGGGACTGATCCAGCCATCACTTCTCTTCTCAATACTCTGGATGTCTTCCTGCTGCCTGTCACGAACCC 353
Query 663 TGATGGATACGTGTTCTCTCAAACCAAAAATCGTATGTGGCGGAAGACCCGGTCCAA--GGTATCTGGAAGCCT 734
|||||||||.||||||||.||||||...||||||||||||||.|||||||||||.|| || ||.||||||.|
Sbjct 354 TGATGGATATGTGTTCTCCCAAACCTCCAATCGTATGTGGCGAAAGACCCGGTCTAAACGG--TCGGGAAGCTT 425
Query 735 CTGTGTTGGTGTGGATCCTAACCGGAACTGGGATGCAGGTTTTGGAGGACCTGGAGCCAGCAGCAACCCTTGCT 808
|||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||..|||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 426 CTGTGTTGGTGTGGATCCTAATCGGAACTGGGACGCAAATTTCGGAGGACCTGGAGCCAGTAGCAACCCTTGCT 499
Query 809 CTGATTCATACCACGGACCCAGTGCCAACTCTGAAGTTGAAGTGAAATCCATAGTGGACTTCATCAAGAGTCAT 882
|||||||||||||.|||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 500 CTGATTCATACCATGGACCCAGTCCCAATTCTGAAGTTGAAGTGAAATCCATAGTGGACTTCATCAAGAGCCAC 573
Query 883 GGAAAAGTCAAGGCCTTCATTACCCTCCACAGCTATTCCCAGCTGCTGATGTTCCCCTATGGGTACAAATGTAC 956
||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||.|
Sbjct 574 GGGAAAGTCAAAGCGTTCATTACCCTTCACAGCTATTCCCAACTGCTCATGTTCCCCTATGGCTATAAATGTGC 647
Query 957 CAAGTTAGATGACTTTGATGAGCTGAGTGAAGTGGCCCAAAAGGCTGCCCAATCTCTGAGAAGCCTGCATGGCA 1030
||||..||||||||||.||||||||..||||||||||||||.|||||||||.|||.|||.|||.||.||.||||
Sbjct 648 CAAGCCAGATGACTTTAATGAGCTGGATGAAGTGGCCCAAAGGGCTGCCCAGTCTTTGAAAAGACTCCACGGCA 721
Query 1031 CCAAGTACAAAGTGGGACCAATCTGCTCTGTCATCTACCAAGCCAGTGGAGGAAGCATTGACTGGTCCTATGAT 1104
|||..||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||.|.|||||.
Sbjct 722 CCAGTTACAAAGTGGGACCCATCTGTTCTGTCATCTACCAGGCCAGTGGCGGAAGCATCGACTGGGCTTATGAC 795
Query 1105 TATGGCATCAAGTACTCATTTGCCTTTGAACTGAGAGACACAGGGCGCTACGGCTTCCTCTTGCCAGCCCGTCA 1178
..|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||...|||.|||||||||.||||||||...||
Sbjct 796 CTTGGCATCAAATACTCATTTGCCTTTGAACTGAGAGACACAGGCTACTATGGCTTCCTCCTGCCAGCCAAGCA 869
Query 1179 GATCCTGCCCACAGCCGAGGAGACCTGGCTTGGCTTGAAGGCAATCATGGAGCATGTGCGAGACCACCCCTAT 1251
||||.||||||||||.||.|||||||||||||||.|||||.|.|||||||||||.||.||||||||||||||.
Sbjct 870 GATCTTGCCCACAGCAGAAGAGACCTGGCTTGGCCTGAAGACCATCATGGAGCACGTACGAGACCACCCCTAC 942