Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491415
• Subject: XM_017010088.2
• Aligned Length: 1881
• Identities: 1394
• Gaps: 483

Alignment

Query    1  ATGTTGAACATGTGGAAGGTGCGCGAGCTGGTGGACAAAGCCACCAATGTTGTTATGAATTATTCAGAGATCGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTGAACATGTGGAAGGTGCGCGAGCTGGTGGACAAAGCCACCAATGTTGTTATGAATTATTCAGAGATCGA  74

Query   75  GTCTAAGGTTCGAGAGGCAACGAACGATGATCCTTGGGGACCTTCTGGGCAACTCATGGGAGAGATTGCCAAGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTCTAAGGTTCGAGAGGCAACGAACGATGATCCTTGGGGACCTTCTGGGCAACTCATGGGAGAGATTGCCAAGG  148

Query  149  CTACATTTATGTATGAACAATTTCCAGAACTTATGAACATGCTTTGGTCACGAATGTTAAAAGACAACAAAAAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTACATTTATGTATGAACAATTTCCAGAACTTATGAACATGCTTTGGTCACGAATGTTAAAAGACAACAAAAAG  222

Query  223  AATTGGAGAAGAGTTTATAAGTCGTTGCTGCTCCTAGCTTACCTCATAAGGAATGGATCAGAGCGTGTTGTTAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AATTGGAGAAGAGTTTATAAGTCGTTGCTGCTCCTAGCTTACCTCATAAGGAATGGATCAGAGCGTGTTGTTAC  296

Query  297  AAGTGCCAGAGAACACATTTATGATTTACGATCCCTGGAAAATTACCACTTTGTAGATGAGCATGGTAAGGATC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAGTGCCAGAGAACACATTTATGATTTACGATCCCTGGAAAATTACCACTTTGTAGATGAGCATGGTAAGGATC  370

Query  371  AAGGTATAAATATTCGACAGAAGGTGAAGGAATTGGTTGAATTTGCCCAGGATGACGACAGGCTTCGTGAAGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGGTATAAATATTCGACAGAAGGTGAAGGAATTGGTTGAATTTGCCCAGGATGACGACAGGCTTCGTGAAGAG  444

Query  445  CGAAAGAAAGCAAAGAAGAACAAAGACAAGTATGTTGGGGTTTCCTCAGACAGTGTTGGAGGATTCAGATACAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CGAAAGAAAGCAAAGAAGAACAAAGACAAGTATGTTGGGGTTTCCTCAGACAGTGTTGGAGGATTCAGATACAG  518

Query  519  TGAAAGATATGATCCTGAGCCCAAATCAAAATGGGATGAGGAGTGGGATAAAAACAAGAGTGCTTTTCCATTCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGAAAGATATGATCCTGAGCCCAAATCAAAATGGGATGAGGAGTGGGATAAAAACAAGAGTGCTTTTCCATTCA  592

Query  593  GTGATAAATTAGGTGAGCTGAGTGATAAAATTGGAAGCACAATTGATGACACCATCAGCAAGTTCCGGAGGAAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTGATAAATTAGGTGAGCTGAGTGATAAAATTGGAAGCACAATTGATGACACCATCAGCAAGTTCCGGAGGAAA  666

Query  667  GATAGAGAAGACTCTCCAGAAAGATGCAGCGACAGCGATGAGGAAAAGAAAGCGAGAAGAGGCAGATCTCCCAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GATAGAGAAGACTCTCCAGAAAGATGCAGCGACAGCGATGAGGAAAAGAAAGCGAGAAGAGGCAGATCTCCCAA  740

Query  741  AGGTGAATTCAAAGATGAAGAGGAGACTGTGACGACAAAGCATATTCATATCACACAGGCCACAGAGACCACCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGGTGAATTCAAAGATGAAGAGGAGACTGTGACGACAAAGCATATTCATATCACACAGGCCACAGAGACCACCA  814

Query  815  CAACCAGACACAAGCGCACAGCAAATCCTTCCAAAACCATTGATCTTGGAGCAGCAGCACATTACACAGGGGAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAACCAGACACAAGCGCACAGCAAATCCTTCCAAAACCATTGATCTTGGAGCAGCAGCACATTACACAGGGGAC  888

Query  889  AAAGCAAGTCCAGATCAGAATGCTTCAACCCACACACCTCAGTCTTCAGTTAAGACTTCAGTGCCTAGCAGCAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAAGCAAGTCCAGATCAGAATGCTTCAACCCACACACCTCAGTCTTCAGTTAAGACTTCAGTGCCTAGCAGCAA  962

Query  963  GTCATCTGGTGACCTTGTTGATCTGTTTGATGGCACCAGCCAGTCAACAGGAGGATCAGCTGATTTATTCGGAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTCATCTGGTGACCTTGTTGATCTGTTTGATGGCACCAGCCAGTCAACAGGAGGATCAGCTGATTTATTCGGAG  1036

Query 1037  GATTTGCTGACTTTGGCTCAGCTGCTGCATCAGGCAGTTTCCCTTCCCAAGTAACAGCAACAAGTGGGAATGGA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GATTTGCTGACTTTGGCTCAGCTGCTGCATCAGGCAGTTTCCCTTCCCAAGTAACAGCAACAAGTGGGAATGGA  1110

Query 1111  GACTTTGGTGACTGGAGTGCCTTCAACCAAGCCCCATCAGGCCCTGTTGCTTCCAGTGGCGAGTTCTTTGGCAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GACTTTGGTGACTGGAGTGCCTTCAACCAAGCCCCATCAGGCCCTGTTGCTTCCAGTGGCGAGTTCTTTGGCAG  1184

Query 1185  TGCCTCACAGCCAGCGGTAGAACTTGTTAGTGGCTCACAATCAGCTCTAGGCCCACCTCCTGCTGCCTCAAATT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGCCTCACAGCCAGCGGTAGAACTTGTTAGTGGCTCACAATCAGCTCTAGGCCCACCTCCTGCTGCCTCAAATT  1258

Query 1259  CTTCAGACCTGTTTGATCTTATGGGCTCGTCCCAGGCAACCATGACATCTTCCCAGAGTATGAATTTCTCTATG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTTCAGACCTGTTTGATCTTATGGGCTCGTCCCAGGCAACCATGACATCTTCCCAGAGTATGAATTTCTCTATG  1332

Query 1333  ATGAGCACTAACACTGTGGGACTTGGTTTGCCTATGTCAAGATCACAGAATACAGATATGGTCCAGAAATCAGT  1406
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|                       
Sbjct 1333  ATGAGCACTAACACTGTGGGACTTGGTTTGCCTATGTCAAGATCACAGATT-----------------------  1383

Query 1407  CAGCAAAACCTTGCCCTCTACTT---GGTCT---GACCCCAGTGTAAACATCAGCCTAGACAACTTACTACCTG  1474
                           |||..|||   |||.|   ||                                      
Sbjct 1384  ---------------CTCGTCTTTGGGGTATTAGGA--------------------------------------  1404

Query 1475  GTATGCAGCCTTCCAAACCCCAGCAGCCATCACTGAATACAATGATTCAGCAACAGAATATGCAGCAGCCTATG  1548
                                                                                      
Sbjct 1405  --------------------------------------------------------------------------  1404

Query 1549  AATGTGATGACTCAAAGTTTTGGAGCTGTGAACCTCAGTTCTCCATCGAACATGCTTCCTGTCCGGCCCCAAAC  1622
                                                                                      
Sbjct 1405  --------------------------------------------------------------------------  1404

Query 1623  TAATGCTTTGATAGGGGGACCCATGCCTATGAGCATGCCCAATGTGATGACTGGCACCATGGGAATGGCCCCTC  1696
                                                                                      
Sbjct 1405  --------------------------------------------------------------------------  1404

Query 1697  TTGGAAATACTCCGATGATGAACCAGAGCATGATGGGCATGAACATGAACATAGGGATGTCCGCTGCTGGGATG  1770
                                                                                      
Sbjct 1405  --------------------------------------------------------------------------  1404

Query 1771  GGCTTGACAGGCACAATGGGAATGGGCATGCCCAACATAGCCATGACTTCTGGAACTGTGCAACCCAAGCAAGA  1844
                                                                                      
Sbjct 1405  --------------------------------------------------------------------------  1404

Query 1845  TGCCTTTGCAAATTTCGCCAATTTTAGCAAA  1875
                                           
Sbjct 1405  -------------------------------  1404