Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000491571
- Subject:
- XM_017020630.1
- Aligned Length:
- 2153
- Identities:
- 1726
- Gaps:
- 427
Alignment
Query 1 ATGAAGGTGTTGGGAAGAAGCTTCTTCTGGGTGCTGTTTCCCGTCCTTCCCTGGGCGGTGCAGGCTGTGGAGCA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAGGTGTTGGGAAGAAGCTTCTTCTGGGTGCTGTTTCCCGTCCTTCCCTGGGCGGTGCAGGCTGTGGAGCA 74
Query 75 CGAGGAGGTGGCGCAGCGTGTGATCAAACTGCACCGCGGGCGAGGGGTGGCTGCCATGCAGAGCCGGCAGTGGG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CGAGGAGGTGGCGCAGCGTGTGATCAAACTGCACCGCGGGCGAGGGGTGGCTGCCATGCAGAGCCGGCAGTGGG 148
Query 149 TCCGGGACAGCTGCAGGAAGCTCTCAGGGCTTCTCCGCCAGAAGAATGCAGTTCTGAACAAACTGAAAACTGCA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCCGGGACAGCTGCAGGAAGCTCTCAGGGCTTCTCCGCCAGAAGAATGCAGTTCTGAACAAACTGAAAACTGCA 222
Query 223 ATTGGAGCAGTGGAGAAAGACGTGGGCCTGTCGGATGAAGAGAAACTGTTTCAGGTGCACACGTTTGAAATTTT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATTGGAGCAGTGGAGAAAGACGTGGGCCTGTCGGATGAAGAGAAACTGTTTCAGGTGCACACGTTTGAAATTTT 296
Query 297 CCAGAAAGAGCTGAATGAAAGTGAAAATTCCGTTTTCCAAGCTGTCTACGGACTGCAGAGAGCCCTGCAGGGGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCAGAAAGAGCTGAATGAAAGTGAAAATTCCGTTTTCCAAGCTGTCTACGGACTGCAGAGAGCCCTGCAGGGGG 370
Query 371 ATTACAAAGATGTCGTGAACATGAAGGAGAGCAGCCGGCAGCGCCTGGAGGCCCTGAGAGAGGCTGCAATAAAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATTACAAAGATGTCGTGAACATGAAGGAGAGCAGCCGGCAGCGCCTGGAGGCCCTGAGAGAGGCTGCAATAAAG 444
Query 445 GAAGAAACAGAATATATGGAACTTCTGGCAGCAGAAAAACATCAAGTTGAAGCCCTTAAAAATATGCAACATCA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAAGAAACAGAATATATGGAACTTCTGGCAGCAGAAAAACATCAAGTTGAAGCCCTTAAAAATATGCAACATCA 518
Query 519 AAACCAAAGTTTATCCATGCTTGACGAGATTCTTGAAGATGTAAGAAAGGCAGCGGATCGTCTGGAGGAAGAGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AAACCAAAGTTTATCCATGCTTGACGAGATTCTTGAAGATGTAAGAAAGGCAGCGGATCGTCTGGAGGAAGAGA 592
Query 593 TAGAGGAACATGCTTTTGACGACAATAAATCAGTCAAGGGGGTCAATTTTGAGGCAGTTCTGAGGGTGGAGGAA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TAGAGGAACATGCTTTTGACGACAATAAATCAGTCAAGGGGGTCAATTTTGAGGCAGTTCTGAGGGTGGAGGAA 666
Query 667 GAAGAGGCCAATTCTAAGCAAAATATAACAAAACGAGAAGTGGAGGATGACTTGGGTCTTAGCATGCTGATTGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GAAGAGGCCAATTCTAAGCAAAATATAACAAAACGAGAAGTGGAGGATGACTTGGGTCTTAGCATGCTGATTGA 740
Query 741 CTCCCAGAACAACCAGTATATTTTGACCAAGCCCAGAGATTCAACCATCCCACGTGCAGATCACCACTTTATAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CTCCCAGAACAACCAGTATATTTTGACCAAGCCCAGAGATTCAACCATCCCACGTGCAGATCACCACTTTATAA 814
Query 815 AGGACATTGTTACCATAGGAATGCTGTCCTTGCCTTGTGGCTGGCTATGTACAGCCATAGGATTGCCTACAATG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGGACATTGTTACCATAGGAATGCTGTCCTTGCCTTGTGGCTGGCTATGTACAGCCATAGGATTGCCTACAATG 888
Query 889 TTTGGTTATATTATTTGTGGTGTACTTCTGGGACCTTCAGGACTAAATAGTATTAAGTCTATTGTGCAAGTGGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTTGGTTATATTATTTGTGGTGTACTTCTGGGACCTTCAGGACTAAATAGTATTAAGTCTATTGTGCAAGTGGA 962
Query 963 GACATTAGGAGAATTTGGGGTGTTTTTTACTCTTTTTCTTGTTGGCTTAGAATTTTCTCCAGAAAAGCTAAGAA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GACATTAGGAGAATTTGGGGTGTTTTTTACTCTTTTTCTTGTTGGCTTAGAATTTTCTCCAGAAAAGCTAAGAA 1036
Query 1037 AGGTGTGGAAGATTTCCTTACAAGGGCCGTGTTACATGACACTGTTAATGATTGCATTTGGCTTGCTGTGGGGG 1110
Sbjct 1037 -------------------------------------------------------------------------- 1036
Query 1111 CATCTCTTGCGGATCAAACCCACGCAGAGCGTCTTCATTTCCACGTGTCTGTCCTTGTCAAGCACACCCCTCGT 1184
Sbjct 1037 -------------------------------------------------------------------------- 1036
Query 1185 GTCCAGGTTCCTCATGGGCAGTGCTCGGGGTGACAAAGAAGGCGACATTGACTACAGCACCGTGCTCCTCGGCA 1258
Sbjct 1037 -------------------------------------------------------------------------- 1036
Query 1259 TGCTGGTGACGCAGGACGTGCAGCTCGGGCTCTTCATGGCCGTCATGCGGACTCTCATACAGGCGGGCGCCAGT 1332
Sbjct 1037 -------------------------------------------------------------------------- 1036
Query 1333 GCATCTTCTAGCATTGTCGTGGAAGTTCTCCGAATCCTGGTTTTGATTGGTCAGATTCTTTTTTCACTAGCGGC 1406
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ---------AGCATTGTCGTGGAAGTTCTCCGAATCCTGGTTTTGATTGGTCAGATTCTTTTTTCACTAGCGGC 1101
Query 1407 GGTTTTTCTTTTATGTCTTGTTATAAAGAAGTATCTCATTGGACCCTATTATCGGAAGCTGCACATGGAAAGCA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1102 GGTTTTTCTTTTATGTCTTGTTATAAAGAAGTATCTCATTGGACCCTATTATCGGAAGCTGCACATGGAAAGCA 1175
Query 1481 AGGGGAACAAAGAAATCCTGATCTTGGGAATATCTGCCTTTATCTTCTTAATGTTAAC---------------- 1538
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1176 AGGGGAACAAAGAAATCCTGATCTTGGGAATATCTGCCTTTATCTTCTTAATGTTAACGGTTGGCCGGTGTCAG 1249
Query 1539 -------------------------------------------------------------------------- 1538
Sbjct 1250 CCGTGCGTCATCCGGAAGGCTGCCATAAGCCTGCGTTTCGCAGAGCTGCGCTGAGGCTCCCGTGTCGCGGCCGT 1323
Query 1539 --------------------------------GGTCACGGAGCTGCTGGACGTCTCCATGGAGCTGGGCTGTTT 1580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1324 CCGGCCGGCGCGCTGATGTGGCTGCAAACCTGGGTCACGGAGCTGCTGGACGTCTCCATGGAGCTGGGCTGTTT 1397
Query 1581 CCTGGCTGGAGCGCTCGTCTCCTCTCAGGGCCCCGTGGTCACCGAGGAGATCGCCACCTCCATCGAACCCATCC 1654
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1398 CCTGGCTGGAGCGCTCGTCTCCTCTCAGGGCCCCGTGGTCACCGAGGAGATCGCCACCTCCATCGAACCCATCC 1471
Query 1655 GCGACTTCCTGGCCATCGTTTTCTTCGCCTCCATAGGGCTCCACGTGTTCCCCACGTTTGTGGCGTACGAGCTC 1728
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1472 GCGACTTCCTGGCCATCGTTTTCTTCGCCTCCATAGGGCTCCACGTGTTCCCCACGTTTGTGGCGTACGAGCTC 1545
Query 1729 ACGGTGCTGGTGTTCCTCACCTTGTCAGTGGTGGTGATGAAGTTTCTCCTGGCGGCGCTGGTCCTGTCTCTCAT 1802
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1546 ACGGTGCTGGTGTTCCTCACCTTGTCAGTGGTGGTGATGAAGTTTCTCCTGGCGGCGCTGGTCCTGTCTCTCAT 1619
Query 1803 TCTGCCGAGGAGCAGCCAGTACATCAAGTGGATCGTCTCTGCGGGGCTTGCCCAGGTCAGCGAGTTTTCCTTTG 1876
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1620 TCTGCCGAGGAGCAGCCAGTACATCAAGTGGATCGTCTCTGCGGGGCTTGCCCAGGTCAGCGAGTTTTCCTTTG 1693
Query 1877 TCCTGGGGAGCCGGGCGCGAAGAGCGGGCGTCATCTCTCGGGAGGTGTACCTCCTTATACTGAGTGTGACCACG 1950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1694 TCCTGGGGAGCCGGGCGCGAAGAGCGGGCGTCATCTCTCGGGAGGTGTACCTCCTTATACTGAGTGTGACCACG 1767
Query 1951 CTCAGCCTCTTGCTCGCCCCGGTGCTGTGGAGAGCTGCAATCACGAGGTGTGTGCCCAGACCGGAGAGACGGTC 2024
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1768 CTCAGCCTCTTGCTCGCCCCGGTGCTGTGGAGAGCTGCAATCACGAGGTGTGTGCCCAGACCGGAGAGACGGTC 1841
Query 2025 CAGCCTC 2031
|||||||
Sbjct 1842 CAGCCTC 1848