Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000491658
- Subject:
- NM_001130168.2
- Aligned Length:
- 1049
- Identities:
- 758
- Gaps:
- 202
Alignment
Query 1 ATGGGACCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCACATCACCTGGAAGGGGGTCCTGCTCACAGCATCACTTTT 74
|||||.|.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGGCTCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAG---------- 64
Query 75 AAACTTCTGGAACCTGCCTATCACTGCTCAAGTCACGATTGAAGCCCTGCCACC--------CAAAGTTT---- 136
||||..||.|| ||||||| |||.| |||| ||
Sbjct 65 -------TGGAGACTCCC-----------------------AAGCCCT-CCATCTCCAGCAGCAAA--TTAAAC 105
Query 137 CCGAGGG-------GAAGGATGT--TCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCTCAGAATC---TTGCTGGCTACATC 198
||.|||| |.|||.||| .||| .||.||| .|| |||.|||.|| ..||..|||||.|.
Sbjct 106 CCCAGGGAGGCCATGGAGGCTGTGAGCTT-AACCTGT----GAT---CCTGAGACTCCGGACGCAAGCTACCTG 171
Query 199 TGGTACAAAGGACAACTG-ATGG-----ACCTCTACC-ATTACATTACATCATA---TGTAGTAGACGGTCAAA 262
|||| ||| || |||| .|||| || ||..| |||.| ||.|||.|.| |.|||
Sbjct 172 TGGT-----GGA----TGAATGGTCAGAGCCTC--CCTATGTC------TCACAGGTTGCAGTTGTC--TGAAA 226
Query 263 TAAATATATATGGGCCTGCATAC-ACTGGACGAGAAACAGTATATTCCAATGCA--TCCCTGCTGATCCAGAAT 333
..||.| ||.||..|.|.| |.|||..|..|.|.|||| ||.|||| .|||| || ||||
Sbjct 227 CCAACA-----GGACCCTCTTTCTATTGGGTGTCACAAAGTA-----CACTGCAGGACCCT----AT---GAAT 283
Query 334 GTCACCCGGGAAGACGCAGGATCCTATACCTTACACATCATAAAGCGAGGTGATAGGACTAG-AGGAGTAACTG 406
|| |.||.|| |||.||.| ||| ||..|.|| .|.|||.||
Sbjct 284 GT------GAAATAC---GGAACCCA-----------------------GTG--AGTGCCAGCCGCAGTGAC-- 321
Query 407 GATATTTCACCTTCAA----CTTATACCTGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAACAACTCAAAACCCAG 476
...||||||.|.|| || ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 322 --CCATTCACCCTGAATCTCCT----CCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAACAACTTAAAACCCAG 389
Query 477 GGAGAATAAGGATGTCTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACATTTGGTGGCTAAATG 550
|||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 390 GGAGAATAAGGATGTCTTAAACTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACATTTGGTGGCTAAATG 463
Query 551 GTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCAACCCATTGAAAACAGGATCCTCATTCTACCCAGTGTCACG 624
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 464 GTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATTCTACCCAGTGTCACG 537
Query 625 AGAAATGAAACAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGGACCGAGATGGTGGCATGCACAGTGACCCAGTCACCCT 698
|||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.|.||||||||||.|.||||.|||||||||||||
Sbjct 538 AGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATAAGGGACCAATATGGTGGCATCCGCAGTTACCCAGTCACCCT 611
Query 699 GAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGCATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTTCAGGAGAAAACCTCT 772
||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||
Sbjct 612 GAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTTCAGGAGAAGTCCTCT 685
Query 773 ACTTGTCCTGCTTC-GCGGAATCTAACCCACCGGCAGAGTATTTTTGGACAATTAATGGGAAGTTTCAGCAATC 845
|||||||||| ||| |||||.|||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 686 ACTTGTCCTG-TTCTGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGGGAAGTTTCAGCTATC 758
Query 846 AGGACAAAAGCTCTCTATCCCCCAAATTACTACAAAGCATAGAGGGCTCTATACTTGCTCTGTTCGTAACTCAG 919
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 759 AGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTCTGTTCGTAACTCAG 832
Query 920 CCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTCGAAGTCTCTG-CTCCTTCAGGAATAGGACGTCTACCTCT 992
||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||| || ||||.| ||||.
Sbjct 833 CCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTAAAAGTCTCTGACT------------GGACAT-TACCC-- 891
Query 993 CATTAATCCAATA 1005
Sbjct 892 ------------- 891