Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491658
• Subject: NM_001206650.2
• Aligned Length: 1049
• Identities: 760
• Gaps: 202

Alignment

Query    1  ATGGGACCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCACATCACCTGGAAGGGGGTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||.||||||||||||          
Sbjct    1  ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCATATAACCTGGAAAGGGCTCCTGCTCACAG----------  64

Query   75  AAACTTCTGGAACCTGCCTATCACT---GCTCAAGTCA-CGATTGAAGCCCTGCCACCCAAAGTTTCCGAGG--  142
                   ||||..||.||.|.|.||   .|||.|| || |.||        |.|.||||.|.|     ||||  
Sbjct   65  -------TGGAGACTCCCAAACCCTCCATCTCCAG-CAGCAAT--------TTCAACCCCAGG-----GAGGCC  117

Query  143  --GGAAGGATGTTCTTCT-ACTTGTCCACAATTTGCCTCAGAATC---TTGCTGGCTACATCTGGTACAAAGGA  210
              || |||.|||..||.| ||.|||    .||   |||.|||.||   .|||..|||||.|.||||     |||
Sbjct  118  ACGG-AGGCTGTGATTTTAACCTGT----GAT---CCTGAGACTCCAGATGCAAGCTACCTGTGGT-----GGA  178

Query  211  CAACTG-ATGG-----ACCTCTACC-ATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTC--AAATAAATA-------  268
                || ||||     .||||  || ||.||      |||.|..|.|.|| |.|||  |||..||.|       
Sbjct  179  ----TGAATGGTCAGAGCCTC--CCTATGAC------TCACAGCTTGCAG-CTGTCTGAAACCAACAGGACCCT  239

Query  269  -----TATATGGGCCTGCATACACTGGACGAGAAACAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCA  337
                 |||.|||   ||   .|||        ||||  ||||.|.||  |.| ||||    ||   ||||||  
Sbjct  240  CTACCTATTTGG---TG---TCAC--------AAAC--TATACTGCA--GGA-CCCT----AT---GAATGT--  285

Query  338  CCCGGGAAGACGCAGGATCCTA-----TACCTTACACATCATAAAG-CGAGGTGATAGGACTAGAGGAGTAACT  405
                |.||.||   |||.||.|     |.||             || ||..||||    .|.||          
Sbjct  286  ----GAAATAC---GGAACCCAGTGAGTGCC-------------AGCCGCAGTGA----CCCAG----------  325

Query  406  GGATATTTCACCTTCAA----CTTATACCTGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAACAACTCAAAACCCA  475
                   |||||.|.||    ||    ||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||.||||
Sbjct  326  -------TCACCCTGAATCTCCT----CCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAATAACTTAAACCCCA  388

Query  476  GGGAGAATAAGGATGTCTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACATTTGGTGGCTAAAT  549
            ||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  389  GGGAGAATAAGGATGTCTCAACCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACATTTGGTGGCTAAAT  462

Query  550  GGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCAACCCATTGAAAACAGGATCCTCATTCTACCCAGTGTCAC  623
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  463  GGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACGCATTGAAAACAGGATCCTCATTCTACCCAGTGTCAC  536

Query  624  GAGAAATGAAACAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGGACCGAGATGGTGGCATGCACAGTGACCCAGTCACCC  697
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||.|.|||||||||||||||||
Sbjct  537  GAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAGTGACCCAGTCACCC  610

Query  698  TGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGCATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTTCAGGAGAAAACCTC  771
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||
Sbjct  611  TGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCATTCAGGACAAAACCTC  684

Query  772  TACTTGTCCTGCTTCGCGGAATCTAACCCACCGGCAGAGTATTTTTGGACAATTAATGGGAAGTTTCAGCAATC  845
            ||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  685  TACTTGTCCTGCTTTGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGGGAAGTTTCAGCTATC  758

Query  846  AGGACAAAAGCTCTCTATCCCCCAAATTACTACAAAGCATAGAGGGCTCTATACTTGCTCTGTTCGTAACTCAG  919
            ||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  759  AGGACAAAAGCTTTCTATCCCCCAGATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTCTGTTCGTAACTCAG  832

Query  920  CCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTCGAAGTCTCTG-CTCCTTCAGGAATAGGACGTCTACCTCT  992
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||..|||||||| ||            ||||.| ||||.  
Sbjct  833  CCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCGTGACAGTCAGAGTCTCTGACT------------GGACAT-TACCC--  891

Query  993  CATTAATCCAATA  1005
                         
Sbjct  892  -------------  891