Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000491747
- Subject:
- NM_001271963.1
- Aligned Length:
- 1627
- Identities:
- 1287
- Gaps:
- 118
Alignment
Query 1 ATGGTAGAACTAGTGATCTCACCCAGCCTCACTGTAAAC-AGCGATTGTCTGGATAAACTGAAGTTTAACCGTG 73
|||.|||||.|.||||.|||||||||||||.| ||| ||| |.||.|||| |.||.|
Sbjct 1 ATGTTAGAAGTGGTGACCTCACCCAGCCTCGC----AACAAGC-AGTGACTGG---------------AGCGAG 54
Query 74 CTGAC---GCTGCTGTGTGGACTCTGAGTGACAGACAAGGCATCACCAAATCGGCCCCCCTGAGAGTGTCCCAG 144
| || |||||.|||.||||.|||||||||||..||||||||.|||||||.||..|.|||||.|||.|.|||
Sbjct 55 C--ACGGTGCTGCCGTGGGGACGCTGAGTGACAGGGAAGGCATCGCCAAATCAGCGGCTCTGAGTGTGCCTCAG 126
Query 145 CTCT--------TCTCCAGATCTTGCCCACGTGTCCTCCCCCGCCAGCCTTCCACAGCCATGGCAGCCTACGGC 210
|||| |||| || ||||||||||..||..|.|||.|.||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 127 CTCTTTGTGAAGTCTC---AT-----CCACGTGTCCCTCCTGGTCAGTCCTCCACAGCCATGGCGGCCTATGGC 192
Query 211 CAGACGCAGTACAGTGCGGGGATCCAGCAGGCTACC-CCCTATACAGCTTACCCACCTCCAGCACAAGCCTATG 283
|||||.||||||||..|.||.||.|||||||| ||| |||||||||||.||||||.||||.||.||||||||||
Sbjct 193 CAGACACAGTACAGCACAGGCATTCAGCAGGC-ACCACCCTATACAGCGTACCCAACTCCGGCGCAAGCCTATG 265
Query 284 GAATCCC-------------------------------------------------------TTC--------- 293
||||||| |||
Sbjct 266 GAATCCCCCCTTACAGCATCAAGACAGAAGACAGTTTGAATCACTCCCCCAGCCAGAGCGGGTTCCTGAGCTAT 339
Query 294 --------CTTCAGCACCTCACCCACTGGACAGAGCCCATACACCTACCAGATGCACGGCACAACAGGGTTCTA 359
||||||||||.|.||..|||||||||||||.||||||||||...|||||.||||..|.|||.||||
Sbjct 340 GGACCGAGCTTCAGCACCGCGCCTGCTGGACAGAGCCCCTACACCTACCCCGTGCACAGCACCGCTGGGCTCTA 413
Query 360 TCAAGGAGGAAATGGACTGGGCAACGCAGCCGGTTTCGGGAGTGTGCACCAGGACTATCCTTCCTACCCCGGCT 433
||||||.|..||.||||||..||||.|.||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||.|||
Sbjct 414 TCAAGGCGCCAACGGACTGACCAACACCGCTGGATTTGGGAGCGTGCACCAGGATTATCCGTCCTACCCCAGCT 487
Query 434 TCCCCCAGAGCCAGTACCCCCAGTATTACGGCTCATCCTACAACCCTCCCTACGTCCCGGCCAGCAGCATCTGC 507
|..|.||||.|||||||||||||||||.|.||.||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||.|||||
Sbjct 488 TTTCACAGAACCAGTACCCCCAGTATTTCAGCCCATCATACAACCCGCCCTACGTCCCTGCCAGCAGCCTCTGC 561
Query 508 CCTTCGCCCCTCTCCACGTCCACCTACGTCCTCCAGGAGGCATCTCACAACGTCCCCAACCAGAGTTCCGAGTC 581
.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||.|||||||.|||||||||.|||||
Sbjct 562 TCCTCGCCCCTCTCCACGTCCACCTACGTCCTCCAGGAGGCTCCTCACAATGTCCCCAGCCAGAGTTCTGAGTC 635
Query 582 ACTTGCTGGTGAATACAACACACACAATGGACCTTCCACACCAGCGAAAGAGGGAGACACAGACAGGCCACACC 655
.||.||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 636 CCTGGCCGGAGACTACAACACACACAACGGACCCTCCACACCAGCAAAGGAGGGTGACACAGAGAGGCCACATC 709
Query 656 GGGCCTCCGACGGGAAGCTCCGAGGCCGGTCTAAGAGGAGCAGTGACCCGTCCCCGGCAGGGGACAATGAGATT 729
|.|||||.||.||||||||.||.||||||||.|||||.|..||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.
Sbjct 710 GAGCCTCGGATGGGAAGCTACGGGGCCGGTCAAAGAGAAATAGTGACCCTTCCCCAGCAGGAGACAATGAAATC 783
Query 730 GAGCGTGTGTTCGTGTGGGACTTGGATGAGACAATAATTATTTTTCACTCCTTACTCACGGGGACATTTGCATC 803
|||||.||||||||.||||||.||||.||||||||.|||||.||.||||||.|.|||||.|||||.||||||||
Sbjct 784 GAGCGCGTGTTCGTCTGGGACCTGGACGAGACAATCATTATCTTCCACTCCCTGCTCACAGGGACGTTTGCATC 857
Query 804 CAGATACGGGAAGGACACCACGACGTCCGTGCGCATTGGCCTTATGATGGAAGAGATGATCTTCAACCTTGCAG 877
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 858 CAGATACGGGAAGGACACCACGACGTCTGTGCGCATTGGCCTGATGATGGAGGAGATGATCTTCAACCTTGCTG 931
Query 878 ATACACATCTGTTCTTCAATGACCTGGAGGATTGTGACCAGATCCACGTTGATGACGTCTCATCAGATGACAAT 951
|.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 932 ACACACACCTGTTCTTCAATGACCTGGAGGACTGTGACCAAATCCACGTGGATGATGTCTCATCCGATGACAAT 1005
Query 952 GGCCAAGATTTAAGCACATACAACTTCTCCGCTGACGGCTTCCACAGTTCGGCCCCAGCAGCCAACCTGTGCCT 1025
||.||.||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||..||||.||||.|||||.|.|||||||
Sbjct 1006 GGTCAGGATTTAAGCACATACAACTTCTCCACTGATGGCTTCCACAGCACGGCGCCAGGAGCCAGCTTGTGCCT 1079
Query 1026 GGGCTCTGGCGTGCACGGCGGCGTGGACTGGATGAGGAAGCTGGCCTTCCGCTACCGGCGGGTGAAGGAGATGT 1099
|||..|.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 1080 GGGTACAGGTGTTCATGGCGGTGTGGACTGGATGAGGAAACTGGCCTTCCGCTACCGTCGTGTGAAGGAGATGT 1153
Query 1100 ACAATACCTACAAGAACAACGTTGGTGGGTTGATAGGCACTCCCAAAAGGGAGACCTGGCTACAGCTCCGAGCT 1173
||||.||||||...||||||||.|||||.||||||||..||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.
Sbjct 1154 ACAACACCTACCGCAACAACGTGGGTGGCTTGATAGGTGCTCCCAAAAGAGAGACCTGGCTGCAGCTGCGCGCC 1227
Query 1174 GAGCTGGAAGCTCTCACAGACCTCTGGCTGACCCACTCCCTGAAGGCACTAAACCTCATCAACTCCCGGCCCAA 1247
||||||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct 1228 GAGCTGGAGGCCCTGACTGACCTCTGGCTCACCCACTCCCTGAAAGCCCTCAATCTCATCAACTCTCGACCCAA 1301
Query 1248 CTGTGTCAATGTGCTGGTCACCACCACTCAACTAATTCCTGCCCTGGCCAAAGTCCTGCTATATGGCCTGGGGT 1321
|||||||||||||.|||||||||||||.|||||.||.|||||..|||||||.||||||||.||.||.|||||.|
Sbjct 1302 CTGTGTCAATGTGTTGGTCACCACCACGCAACTGATCCCTGCATTGGCCAAGGTCCTGCTGTACGGTCTGGGCT 1375
Query 1322 CTGTGTTTCCTATTGAGAACATCTACAGTGCAACCAAGACAGGGAAGGAGAGCTGCTTCGAGAGGATAATGCAG 1395
|.|||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 1376 CCGTGTTCCCCATCGAGAACATCTACAGTGCGACCAAGACAGGCAAGGAGAGCTGCTTCGAAAGAATCATGCAG 1449
Query 1396 AGATTCGGCAGAAAAGCTGTCTACGTGGTGATCGGTGATGGTGTGGAAGAGGAGCAAGGAGCGAAAAAGCACAA 1469
||.||.|||.|.||||||||||||.|.|||||.||.||.||.||.||.||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1450 AGGTTTGGCCGCAAAGCTGTCTACATTGTGATAGGCGACGGGGTAGAGGAAGAGCAAGGAGCCAAAAAGCACAA 1523
Query 1470 CATGCCTTTCTGGCGGATATCCTGCCACGCAGACCTGGAGGCACTGAGGCACGCCCTGGAGCTGGAGTATT-- 1540
|||||||||||||.||||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||.
Sbjct 1524 CATGCCTTTCTGGAGGATATCCTGTCATGCTGACCTGGAGGCTCTAAGGCATGCCCTGGAACTGGAGTATCTA 1596