Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491747
• Subject: XM_005260327.2
• Aligned Length: 1549
• Identities: 1339
• Gaps: 190

Alignment

Query    1  ATGGTAGAACTAGTGATCTCACCCAGCCTCACTGTAAACAGCGATTGTCTGGATAAACTGAAGTTTAACCGTGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTAGAACTAGTGATCTCACCCAGCCTCACTGTAAACAGCGATTGTCTGGATAAACTGAAGTTTAACCGTGC  74

Query   75  TGACGCTGCTGTGTGGACTCTGAGTGACAGACAAGGCATCACCAAATCGGCCCCCCTGAGAGTGTCCCAGCTCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGACGCTGCTGTGTGGACTCTGAGTGACAGACAAGGCATCACCAAATCGGCCCCCCTGAGAGTGTCCCAGCTCT  148

Query  149  TCTCCAGATCTTGCCCACGTGTCCTCCCCCGCCAGCCTTCCACAGCCATGGCAGCCTACGGCCAGACGCAGTAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCTCCAGATCTTGCCCACGTGTCCTCCCCCGCCAGCCTTCCACAGCCATGGCAGCCTACGGCCAGACGCAGTAC  222

Query  223  AGTGCGGGGATCCAGCAGGCTACCCCCTATACAGCTTACCCACCTCCAGCACAAGCCTATGGAATCCCTTCCTT  296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  223  AGTGCGGGGATCCAGCAGGCTACCCCCTATACAGCTTACCCACCTCCAGCACAAGCCTATGGAATCCCTTCCTA  296

Query  297  CAGCACCTCACCCACTGGACAGAGCCCATACACCT---ACCAGATGCACGGCACAACAGGGTTCTATCAAGGAG  367
            |||||  |||      .||||||    |.|||.||   ||||                   |||          
Sbjct  297  CAGCA--TCA------AGACAGA----AGACAGCTTGAACCA-------------------TTC----------  329

Query  368  GAAATGGACTGGGCAACGCAGCCGGTTTCGGGAGTGTGCACCAGGACTATCCTTCCTACCCCGGCTTCCCCCAG  441
                  ..||||.||                ||||        |||      |||||                 
Sbjct  330  ------CCCTGGCCA----------------GAGT--------GGA------TTCCT-----------------  350

Query  442  AGCCAGTACCCCCAG-TATTACGGCTCATCCTACAACCCTCCCTACGTCCCGGCCAGCAGCATCTGCCCTTCGC  514
                        ||| |||   |||||                              ||||.||.||.|.||.|
Sbjct  351  ------------CAGCTAT---GGCTC------------------------------CAGCTTCAGCACCTCAC  379

Query  515  CC-CTCTCCACGTCCACCTACGTCCTCCAGGAG-GCATCTCACAACGTCCCCAACCAGAGTTCCGAGTCACTTG  586
            || ||...||                    ||| .|||   |||      ||.||||||             ||
Sbjct  380  CCACTGGACA--------------------GAGCCCAT---ACA------CCTACCAGA-------------TG  411

Query  587  C-TGGTGAATACAACACACACAATGGACCTTCCACACCAGCGAAAGAGGGAGACACAGACAGGCCACACCGGGC  659
            | .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  412  CACGGTGAATACAACACACACAATGGACCTTCCACACCAGCGAAAGAGGGAGACACAGACAGGCCGCACCGGGC  485

Query  660  CTCCGACGGGAAGCTCCGAGGCCGGTCTAAGAGGAGCAGTGACCCGTCCCCGGCAGGGGACAATGAGATTGAGC  733
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  486  CTCCGACGGGAAGCTCCGAGGCCGGTCTAAGAGGAGCAGTGACCCGTCCCCGGCAGGGGACAATGAGATTGAGC  559

Query  734  GTGTGTTCGTGTGGGACTTGGATGAGACAATAATTATTTTTCACTCCTTACTCACGGGGACATTTGCATCCAGA  807
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  560  GTGTGTTCGTGTGGGACTTGGATGAGACAATAATTATTTTTCACTCCTTACTCACGGGGACATTTGCATCCAGA  633

Query  808  TACGGGAAGGACACCACGACGTCCGTGCGCATTGGCCTTATGATGGAAGAGATGATCTTCAACCTTGCAGATAC  881
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  634  TACGGGAAGGACACCACGACGTCCGTGCGCATTGGCCTTATGATGGAAGAGATGATCTTCAACCTTGCAGATAC  707

Query  882  ACATCTGTTCTTCAATGACCTGGAGGATTGTGACCAGATCCACGTTGATGACGTCTCATCAGATGACAATGGCC  955
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  708  ACATCTGTTCTTCAATGACCTGGAGGATTGTGACCAGATCCACGTTGATGACGTCTCATCAGATGACAATGGCC  781

Query  956  AAGATTTAAGCACATACAACTTCTCCGCTGACGGCTTCCACAGTTCGGCCCCAGCAGCCAACCTGTGCCTGGGC  1029
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  782  AAGATTTAAGCACATACAACTTCTCCGCTGACGGCTTCCACAGTTCGGCCCCAGGAGCCAACCTGTGCCTGGGC  855

Query 1030  TCTGGCGTGCACGGCGGCGTGGACTGGATGAGGAAGCTGGCCTTCCGCTACCGGCGGGTGAAGGAGATGTACAA  1103
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  856  TCTGGCGTGCACGGCGGCGTGGACTGGATGAGGAAGCTGGCCTTCCGCTACCGGCGGGTGAAGGAGATGTACAA  929

Query 1104  TACCTACAAGAACAACGTTGGTGGGTTGATAGGCACTCCCAAAAGGGAGACCTGGCTACAGCTCCGAGCTGAGC  1177
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  930  TACCTACAAGAACAACGTTGGTGGGTTGATAGGCACTCCCAAAAGGGAGACCTGGCTACAGCTCCGAGCTGAGC  1003

Query 1178  TGGAAGCTCTCACAGACCTCTGGCTGACCCACTCCCTGAAGGCACTAAACCTCATCAACTCCCGGCCCAACTGT  1251
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1004  TGGAAGCTCTCACAGACCTCTGGCTGACCCACTCCCTGAAGGCACTAAACCTCATCAACTCCCGGCCCAACTGT  1077

Query 1252  GTCAATGTGCTGGTCACCACCACTCAACTAATTCCTGCCCTGGCCAAAGTCCTGCTATATGGCCTGGGGTCTGT  1325
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1078  GTCAATGTGCTGGTCACCACCACTCAACTAATTCCTGCCCTGGCCAAAGTCCTGCTATATGGCCTGGGGTCTGT  1151

Query 1326  GTTTCCTATTGAGAACATCTACAGTGCAACCAAGACAGGGAAGGAGAGCTGCTTCGAGAGGATAATGCAGAGAT  1399
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1152  GTTTCCTATTGAGAACATCTACAGTGCAACCAAGACAGGGAAGGAGAGCTGCTTCGAGAGGATAATGCAGAGAT  1225

Query 1400  TCGGCAGAAAAGCTGTCTACGTGGTGATCGGTGATGGTGTGGAAGAGGAGCAAGGAGCGAAAAAGCACAACATG  1473
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1226  TCGGCAGAAAAGCTGTCTACGTGGTGATCGGTGATGGTGTGGAAGAGGAGCAAGGAGCGAAAAAGCACAACATG  1299

Query 1474  CCTTTCTGGCGGATATCCTGCCACGCAGACCTGGAGGCACTGAGGCACGCCCTGGAGCTGGAGTATT--  1540
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
Sbjct 1300  CCTTTCTGGCGGATATCCTGCCACGCAGACCTGGAGGCACTGAGGCACGCCCTGGAGCTGGAGTATTTA  1368