Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491747
• Subject: XM_006498739.3
• Aligned Length: 1615
• Identities: 1151
• Gaps: 271

Alignment

Query    1  ATGGTAGAACTAGTGATCTCACCCAGCCTCACTGTAAACAGCGATTGTCTGGATAAACTGAAGTTTAACCGTGC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TGACGCTGCTGTGTGGACTCTGAGTGACAGACAAGGCATCACCAAATCGGCCCCCCTGAGAGTGTCCCAGCTCT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TCTCCAGATCTTGCCCACGTGTCCTCCCCCGCCAGCCTTCCACAGCCATGGCAGCCTACGGCCAGACGCAGTAC  222
                                                           |||||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct    1  -----------------------------------------------ATGGCGGCCTATGGCCAGACACAGTAC  27

Query  223  AGTGCGGGGATCCAGCAGGCTACC-CCCTATACAGCTTACCCACCTCCAGCACAAGCCTATGGAATCCC-----  290
            ||..|.||.||.|||||||| ||| |||||||||||.||||||.||||.||.|||||||||||||||||     
Sbjct   28  AGCACAGGCATTCAGCAGGC-ACCACCCTATACAGCGTACCCAACTCCGGCGCAAGCCTATGGAATCCCCCCTT  100

Query  291  --------------------------------------------------TTC-----------------CTTC  297
                                                              |||                 ||||
Sbjct  101  ACAGCATCAAGACAGAAGACAGTTTGAATCACTCCCCCAGCCAGAGCGGGTTCCTGAGCTATGGACCGAGCTTC  174

Query  298  AGCACCTCACCCACTGGACAGAGCCCATACACCTACCAGATGCACGGCACAACAGGGTTCTATCAAGGAGGAAA  371
            ||||||.|.||..|||||||||||||.||||||||||...|||||.||||..|.|||.||||||||||.|..||
Sbjct  175  AGCACCGCGCCTGCTGGACAGAGCCCCTACACCTACCCCGTGCACAGCACCGCTGGGCTCTATCAAGGCGCCAA  248

Query  372  TGGACTGGGCAACGCAGCCGGTTTCGGGAGTGTGCACCAGGACTATCCTTCCTACCCCGGCTTCCCCCAGAGCC  445
            .||||||..||||.|.||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||.||||..|.||||.||
Sbjct  249  CGGACTGACCAACACCGCTGGATTTGGGAGCGTGCACCAGGATTATCCGTCCTACCCCAGCTTTTCACAGAACC  322

Query  446  AGTACCCCCAGTATTACGGCTCATCCTACAACCCTCCCTACGTCCCGGCCAGCAGCATCTGCCCTTCGCCCCTC  519
            |||||||||||||||.|.||.||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||.|||||.|.|||||||||
Sbjct  323  AGTACCCCCAGTATTTCAGCCCATCATACAACCCGCCCTACGTCCCTGCCAGCAGCCTCTGCTCCTCGCCCCTC  396

Query  520  TCCACGTCCACCTACGTCCTCCAGGAGGCATCTCACAACGTCCCCAACCAGAGTTCCGAGTCACTTGCTGGTGA  593
            |||||||||||||||||||||||||||||..|||||||.|||||||.|||||||||.|||||.||.||.||.||
Sbjct  397  TCCACGTCCACCTACGTCCTCCAGGAGGCTCCTCACAATGTCCCCAGCCAGAGTTCTGAGTCCCTGGCCGGAGA  470

Query  594  ATACAACACACACAATGGACCTTCCACACCAGCGAAAGAGGGAGACACAGACAGGCCACACCGGGCCTCCGACG  667
            .||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||.||.|||||.||.|
Sbjct  471  CTACAACACACACAACGGACCCTCCACACCAGCAAAGGAGGGTGACACAGAGAGGCCACATCGAGCCTCGGATG  544

Query  668  GGAAGCTCCGAGGCCGGTCTAAGAGGAGCAGTGACCCGTCCCCGGCAGGGGACAATGAGATTGAGCGTGTGTTC  741
            |||||||.||.||||||||.|||||.|..||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct  545  GGAAGCTACGGGGCCGGTCAAAGAGAAATAGTGACCCTTCCCCAGCAGGAGACAATGAAATCGAGCGCGTGTTC  618

Query  742  GTGTGGGACTTGGATGAGACAATAATTATTTTTCACTCCTTACTCACGGGGACATTTGCATCCAGATACGGGAA  815
            ||.||||||.||||.||||||||.|||||.||.||||||.|.|||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  619  GTCTGGGACCTGGACGAGACAATCATTATCTTCCACTCCCTGCTCACAGGGACGTTTGCATCCAGATACGGGAA  692

Query  816  GGACACCACGACGTCCGTGCGCATTGGCCTTATGATGGAAGAGATGATCTTCAACCTTGCAGATACACATCTGT  889
            |||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||
Sbjct  693  GGACACCACGACGTCTGTGCGCATTGGCCTGATGATGGAGGAGATGATCTTCAACCTTGCTGACACACACCTGT  766

Query  890  TCTTCAATGACCTGGAGGATTGTGACCAGATCCACGTTGATGACGTCTCATCAGATGACAATGGCCAAGATTTA  963
            |||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct  767  TCTTCAATGACCTGGAGGACTGTGACCAAATCCACGTGGATGATGTCTCATCCGATGACAATGGTCAGGATTTA  840

Query  964  AGCACATACAACTTCTCCGCTGACGGCTTCCACAGTTCGGCCCCAGCAGCCAACCTGTGCCTGGGCTCTGGCGT  1037
            ||||||||||||||||||.||||.|||||||||||..||||.||||.|||||.|.||||||||||..|.||.||
Sbjct  841  AGCACATACAACTTCTCCACTGATGGCTTCCACAGCACGGCGCCAGGAGCCAGCTTGTGCCTGGGTACAGGTGT  914

Query 1038  GCACGGCGGCGTGGACTGGATGAGGAAGCTGGCCTTCCGCTACCGGCGGGTGAAGGAGATGTACAATACCTACA  1111
            .||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||.
Sbjct  915  TCATGGCGGTGTGGACTGGATGAGGAAACTGGCCTTCCGCTACCGTCGTGTGAAGGAGATGTACAACACCTACC  988

Query 1112  AGAACAACGTTGGTGGGTTGATAGGCACTCCCAAAAGGGAGACCTGGCTACAGCTCCGAGCTGAGCTGGAAGCT  1185
            ..||||||||.|||||.||||||||..||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||.||.
Sbjct  989  GCAACAACGTGGGTGGCTTGATAGGTGCTCCCAAAAGAGAGACCTGGCTGCAGCTGCGCGCCGAGCTGGAGGCC  1062

Query 1186  CTCACAGACCTCTGGCTGACCCACTCCCTGAAGGCACTAAACCTCATCAACTCCCGGCCCAACTGTGTCAATGT  1259
            ||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1063  CTGACTGACCTCTGGCTCACCCACTCCCTGAAAGCCCTCAATCTCATCAACTCTCGACCCAACTGTGTCAATGT  1136

Query 1260  GCTGGTCACCACCACTCAACTAATTCCTGCCCTGGCCAAAGTCCTGCTATATGGCCTGGGGTCTGTGTTTCCTA  1333
            |.|||||||||||||.|||||.||.|||||..|||||||.||||||||.||.||.|||||.||.|||||.||.|
Sbjct 1137  GTTGGTCACCACCACGCAACTGATCCCTGCATTGGCCAAGGTCCTGCTGTACGGTCTGGGCTCCGTGTTCCCCA  1210

Query 1334  TTGAGAACATCTACAGTGCAACCAAGACAGGGAAGGAGAGCTGCTTCGAGAGGATAATGCAGAGATTCGGCAGA  1407
            |.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.|||.|.
Sbjct 1211  TCGAGAACATCTACAGTGCGACCAAGACAGGCAAGGAGAGCTGCTTCGAAAGAATCATGCAGAGGTTTGGCCGC  1284

Query 1408  AAAGCTGTCTACGTGGTGATCGGTGATGGTGTGGAAGAGGAGCAAGGAGCGAAAAAGCACAACATGCCTTTCTG  1481
            ||||||||||||.|.|||||.||.||.||.||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1285  AAAGCTGTCTACATTGTGATAGGCGACGGGGTAGAGGAAGAGCAAGGAGCCAAAAAGCACAACATGCCTTTCTG  1358

Query 1482  GCGGATATCCTGCCACGCAGACCTGGAGGCACTGAGGCACGCCCTGGAGCTGGAGTATT--  1540
            |.||||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||.  
Sbjct 1359  GAGGATATCCTGTCATGCTGACCTGGAGGCTCTAAGGCATGCCCTGGAACTGGAGTATCTA  1419