Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000491761
- Subject:
- NM_010838.4
- Aligned Length:
- 1244
- Identities:
- 965
- Gaps:
- 135
Alignment
Query 1 ATGGCTGAGCCCCGCCAGGAGTTCGAAGTGATGGAAGATCACGCTGGGACGTACGGGTTGGGGGACAGGAAAGA 74
||||||||.||.|||||||||||.||....||||||||.||.||||| |||
Sbjct 1 ATGGCTGACCCTCGCCAGGAGTTTGACACAATGGAAGACCATGCTGG------------------------AGA 50
Query 75 TCAGGGGGGCTACACCATGCACCAAGACCAAGAGGGTGACACGGACGCTGGCCTGAAAGAATCTCCCCTGCAGA 148
| |||||..|||.||||||||||||.||.||||.||||..||||.|.|
Sbjct 51 T---------TACACTCTGCTCCAAGACCAAGAAGGAGACATGGACCATGGCTTAA------------------ 97
Query 149 CCCCCACTGAGGACGGATCTGAGGAACCGGGCTCTGAAACCTCTGATGCTAAGAGCACTCCAACAGCGGAAGCT 222
||||.
Sbjct 98 ---------------------------------------------------------------------AAGCC 102
Query 223 GAAGAAGCAGGCATTGGAGACACCCCCAGCCTGGAAGACGAAGCTGCTGGTCACGTGACCCAAGCTCGCATGGT 296
||||||||||||||.|||||||||||.|.||.|||.|||.||||.|||||.||.|||||.||||||||..|||.
Sbjct 103 GAAGAAGCAGGCATCGGAGACACCCCGAACCAGGAGGACCAAGCCGCTGGGCATGTGACTCAAGCTCGTGTGGC 176
Query 297 CAGTAAAAGCAAAGACGGGACTGGAAGCGATGACAAAAAAGCCAAGGGGGCTGATGGTAAAA------CGAAGA 364
| |||||||||.||||.||||..||.||.||.|||||||||||.||||||||.|||| ||||||
Sbjct 177 C------AGCAAAGACAGGACAGGAAATGACGAGAAGAAAGCCAAGGGCGCTGATGGCAAAACCGGGGCGAAGA 244
Query 365 TCGCCACACCGCGGGGAGCAGCCCCTCCAGGCCAGAAGGGCCAGGCCAACGCCACCAGGATTCCAGCAAAAACC 438
||||||||||.||||||||||||.||||.|.||||||||||..|.||||||||||||||||.||.||.||.|||
Sbjct 245 TCGCCACACCTCGGGGAGCAGCCTCTCCGGCCCAGAAGGGCACGTCCAACGCCACCAGGATCCCGGCCAAGACC 318
Query 439 CCGCCC-GCTCCAAAGACACCACCCAGCTCTGGTGAACCTCCAAAATCAGGGGATCGCAGCGGCTACAGCAGCC 511
.||||| || ||.|||||.||.||..|.||.||||||||.||||||||.||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct 319 ACGCCCAGC-CCTAAGACTCCTCCAGGGTCAGGTGAACCACCAAAATCCGGAGAACGAAGCGGCTACAGCAGCC 391
Query 512 CCGGCTCCCCAGGCACTCCCGGCAGCCGCTCCCGCACCCCGTCCCTTCCAACCCCACCCACCCGGGAGCCCAAG 585
|||||||.||.||.||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 392 CCGGCTCTCCCGGAACGCCTGGCAGTCGCTCGCGCACCCCATCCCTACCAACACCGCCCACCCGGGAGCCCAAG 465
Query 586 AAGGTGGCAGTGGTCCGTACTCCACCCAAGTCGCCGTCTTCCGCCAAGAGCCGCCTGCAGACAGCCCCCGTGCC 659
|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||..|....|||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 466 AAGGTGGCAGTGGTCCGCACTCCCCCTAAGTCACCATCAGCTAGTAAGAGCCGCCTGCAGACTGCCCCTGTGCC 539
Query 660 CATGCCAGACCTGAAGAATGTCAAGTCCAAGATCGGCTCCACTGAGAACCTGAAGCACCAGCCGGGAGGCGGGA 733
||||||||||||.||||||||||.|||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 540 CATGCCAGACCTAAAGAATGTCAGGTCGAAGATTGGCTCTACTGAGAACCTGAAGCACCAGCCAGGAGGTGGCA 613
Query 734 AGGTGCAGATAATTAATAAGAAGCTGGATCTTAGCAACGTCCAGTCCAAGTGTGGCTCAAAGGATAATATCAAA 807
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 614 AGGTGCAGATAATTAATAAGAAGCTGGATCTTAGCAACGTCCAGTCCAAGTGTGGCTCGAAGGATAATATCAAA 687
Query 808 CACGTCCTGGGAGGCGGCAGTGTGCAAATAGTCTACAAACCAGTTGACCTGAGCAAGGTGACCTCCAAGTGTGG 881
|||||||.|||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 688 CACGTCCCGGGTGGAGGCAGTGTGCAAATAGTCTACAAGCCGGTGGACCTGAGCAAAGTGACCTCCAAGTGTGG 761
Query 882 CTCATTAGGCAACATCCATCATAAACCAGGAGGTGGCCAGGTGGAAGTAAAATCTGAGAAGCTTGACTTCAAGG 955
|||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 762 CTCGTTAGGGAACATCCATCACAAGCCAGGAGGTGGCCAGGTGGAAGTAAAATCAGAGAAGCTGGACTTCAAGG 835
Query 956 ACAGAGTCCAGTCGAAGATTGGGTCCCTGGACAATATCACCCACGTCCCTGGCGGAGGAAATAAAAAGATTGAA 1029
||||||||||||||||||||||.|||.||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||
Sbjct 836 ACAGAGTCCAGTCGAAGATTGGCTCCTTGGATAATATCACCCACGTCCCTGGAGGAGGGAATAAGAAGATTGAA 909
Query 1030 ACCCACAAGCTGACCTTCCGCGAGAACGCCAAAGCCAAGACAGACCACGGGGCGGAGATCGTGTACAAGTCGCC 1103
||||||||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||.||
Sbjct 910 ACCCACAAGCTGACCTTCAGGGAGAATGCCAAAGCCAAGACAGACCATGGAGCAGAAATTGTGTATAAGTCACC 983
Query 1104 AGTGGTGTCTGGGGACACGTCTCCACGGCATCTCAGCAATGTCTCCTCCACCGGCAGCATCGACATGGTAGACT 1177
.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 984 CGTGGTGTCTGGGGACACATCTCCACGGCACCTCAGCAATGTGTCTTCCACGGGCAGCATCGACATGGTGGACT 1057
Query 1178 CGCCCCAGCTCGCCACGCTAGCTGACGAGGTGTCTGCCTCCCTGGCCAAGCAGGGTTTGG 1237
|.||.|||||.|||||.|||||.||.||.||||||||.|||.|||||||||||||||||
Sbjct 1058 CACCACAGCTTGCCACACTAGCCGATGAAGTGTCTGCTTCCTTGGCCAAGCAGGGTTTG- 1116