Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491761
• Subject: XM_006532407.3
• Aligned Length: 1244
• Identities: 1035
• Gaps: 48

Alignment

Query    1  ATGGCTGAGCCCCGCCAGGAGTTCGAAGTGATGGAAGATCACGCTGGGACGTACGGGTTGGGGGACAGGAAAGA  74
            ||||||||.||.|||||||||||.||....||||||||.||.|||||                        |||
Sbjct    1  ATGGCTGACCCTCGCCAGGAGTTTGACACAATGGAAGACCATGCTGG------------------------AGA  50

Query   75  TCAGGGGGGCTACACCATGCACCAAGACCAAGAGGGTGACACGGACGCTGGCCTGAAAGAATCTCCCCTGCAGA  148
            |         |||||..|||.||||||||||||.||.||||.||||..||||.|.|||||.|||||||..|||.
Sbjct   51  T---------TACACTCTGCTCCAAGACCAAGAAGGAGACATGGACCATGGCTTAAAAGAGTCTCCCCCACAGC  115

Query  149  CCCCCACTGAGGACGGATCTGAGGAACCGGGCTCTGAAACCTCTGATGCTAAGAGCACTCCAACAGCGGAAGCT  222
            |||||.|.||.||.|||.|.||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct  116  CCCCCGCCGATGATGGAGCGGAGGAACCAGGGTCGGAGACCTCCGATGCTAAGAGCACTCCAACTGCTGAAGCC  189

Query  223  GAAGAAGCAGGCATTGGAGACACCCCCAGCCTGGAAGACGAAGCTGCTGGTCACGTGACCCAAGCTCGCATGGT  296
            ||||||||||||||.|||||||||||.|.||.|||.|||.||||.|||||.||.|||||.||||||||..|||.
Sbjct  190  GAAGAAGCAGGCATCGGAGACACCCCGAACCAGGAGGACCAAGCCGCTGGGCATGTGACTCAAGCTCGTGTGGC  263

Query  297  CAGTAAAAGCAAAGACGGGACTGGAAGCGATGACAAAAAAGCCAAGGGGGCTGATGGTAAAA------CGAAGA  364
            |      |||||||||.||||.||||..||.||.||.|||||||||||.||||||||.||||      ||||||
Sbjct  264  C------AGCAAAGACAGGACAGGAAATGACGAGAAGAAAGCCAAGGGCGCTGATGGCAAAACCGGGGCGAAGA  331

Query  365  TCGCCACACCGCGGGGAGCAGCCCCTCCAGGCCAGAAGGGCCAGGCCAACGCCACCAGGATTCCAGCAAAAACC  438
            ||||||||||.||||||||||||.||||.|.||||||||||..|.||||||||||||||||.||.||.||.|||
Sbjct  332  TCGCCACACCTCGGGGAGCAGCCTCTCCGGCCCAGAAGGGCACGTCCAACGCCACCAGGATCCCGGCCAAGACC  405

Query  439  CCGCCC-GCTCCAAAGACACCACCCAGCTCTGGTGAACCTCCAAAATCAGGGGATCGCAGCGGCTACAGCAGCC  511
            .||||| || ||.|||||.||.||..|.||.||||||||.||||||||.||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct  406  ACGCCCAGC-CCTAAGACTCCTCCAGGGTCAGGTGAACCACCAAAATCCGGAGAACGAAGCGGCTACAGCAGCC  478

Query  512  CCGGCTCCCCAGGCACTCCCGGCAGCCGCTCCCGCACCCCGTCCCTTCCAACCCCACCCACCCGGGAGCCCAAG  585
            |||||||.||.||.||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  479  CCGGCTCTCCCGGAACGCCTGGCAGTCGCTCGCGCACCCCATCCCTACCAACACCGCCCACCCGGGAGCCCAAG  552

Query  586  AAGGTGGCAGTGGTCCGTACTCCACCCAAGTCGCCGTCTTCCGCCAAGAGCCGCCTGCAGACAGCCCCCGTGCC  659
            |||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||..|....|||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  553  AAGGTGGCAGTGGTCCGCACTCCCCCTAAGTCACCATCAGCTAGTAAGAGCCGCCTGCAGACTGCCCCTGTGCC  626

Query  660  CATGCCAGACCTGAAGAATGTCAAGTCCAAGATCGGCTCCACTGAGAACCTGAAGCACCAGCCGGGAGGCGGGA  733
            ||||||||||||.||||||||||.|||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct  627  CATGCCAGACCTAAAGAATGTCAGGTCGAAGATTGGCTCTACTGAGAACCTGAAGCACCAGCCAGGAGGTGGCA  700

Query  734  AGGTGCAGATAATTAATAAGAAGCTGGATCTTAGCAACGTCCAGTCCAAGTGTGGCTCAAAGGATAATATCAAA  807
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  701  AGGTGCAGATAATTAATAAGAAGCTGGATCTTAGCAACGTCCAGTCCAAGTGTGGCTCGAAGGATAATATCAAA  774

Query  808  CACGTCCTGGGAGGCGGCAGTGTGCAAATAGTCTACAAACCAGTTGACCTGAGCAAGGTGACCTCCAAGTGTGG  881
            |||||||.|||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  775  CACGTCCCGGGTGGAGGCAGTGTGCAAATAGTCTACAAGCCGGTGGACCTGAGCAAAGTGACCTCCAAGTGTGG  848

Query  882  CTCATTAGGCAACATCCATCATAAACCAGGAGGTGGCCAGGTGGAAGTAAAATCTGAGAAGCTTGACTTCAAGG  955
            |||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct  849  CTCGTTAGGGAACATCCATCACAAGCCAGGAGGTGGCCAGGTGGAAGTAAAATCAGAGAAGCTGGACTTCAAGG  922

Query  956  ACAGAGTCCAGTCGAAGATTGGGTCCCTGGACAATATCACCCACGTCCCTGGCGGAGGAAATAAAAAGATTGAA  1029
            ||||||||||||||||||||||.|||.||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||
Sbjct  923  ACAGAGTCCAGTCGAAGATTGGCTCCTTGGATAATATCACCCACGTCCCTGGAGGAGGGAATAAGAAGATTGAA  996

Query 1030  ACCCACAAGCTGACCTTCCGCGAGAACGCCAAAGCCAAGACAGACCACGGGGCGGAGATCGTGTACAAGTCGCC  1103
            ||||||||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||.||
Sbjct  997  ACCCACAAGCTGACCTTCAGGGAGAATGCCAAAGCCAAGACAGACCATGGAGCAGAAATTGTGTATAAGTCACC  1070

Query 1104  AGTGGTGTCTGGGGACACGTCTCCACGGCATCTCAGCAATGTCTCCTCCACCGGCAGCATCGACATGGTAGACT  1177
            .|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 1071  CGTGGTGTCTGGGGACACATCTCCACGGCACCTCAGCAATGTGTCTTCCACGGGCAGCATCGACATGGTGGACT  1144

Query 1178  CGCCCCAGCTCGCCACGCTAGCTGACGAGGTGTCTGCCTCCCTGGCCAAGCAGGGTTTGG  1237
            |.||.|||||.|||||.|||||.||.||.||||||||.|||.||||||||||||||||| 
Sbjct 1145  CACCACAGCTTGCCACACTAGCCGATGAAGTGTCTGCTTCCTTGGCCAAGCAGGGTTTG-  1203