Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491808
• Subject: XR_929832.2
• Aligned Length: 2381
• Identities: 1663
• Gaps: 715

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  AGTTTCCAAACTGAAGCAAGCTGTGCCCAGGTCCCTGTAACAGCAGGTGGCTTTCTGACATCAGCAGAGACTGG  74

Query    1  ----------------------------------------------------------ATGGAGCTGAGGAGTA  16
                                                                      ||||||||||||||||
Sbjct   75  TGCTTTTTCCCAGGTACAAAGGACCTCCAGACCAGAGCCAGCCAGCAGCAAAAAGAGCATGGAGCTGAGGAGTA  148

Query   17  CAGCAGCCCCCAGAGCTGAGGGCTACAGCAACGTGGGCTTCCAGAATGAAGAAAACTTTCTTGAGAACGAGAAC  90
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAGCAGCCCCCAGAGCTGAGGGCTACAGCAACGTGGGCTTCCAGAATGAAGAAAACTTTCTTGAGAACGAGAAC  222

Query   91  ACATCAGGAAACAACTCAATAAGAAGCAGAGCTGTGCAAAGCAGGGAGCACACAAACACCAA------------  152
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
Sbjct  223  ACATCAGGAAACAACTCAATAAGAAGCAGAGCTGTGCAAAGCAGGGAGCACACAAACACCAAACAGAGAATCAA  296

Query  153  --------------------------------------------------------------------------  152
                                                                                      
Sbjct  297  AGGCCACATTGGATATGACAGAAGACAAGTGCTGAGATTTGACATTATACTTCTTAGAGCACACTCAAACTGCT  370

Query  153  --------------------------------------------------------------------------  152
                                                                                      
Sbjct  371  CCACCTCCATCTATTTCCTCCCCCACCAGCTTCTGTACCATTGGTTACAAGAGCCAGGCTTATTATTTGAGACA  444

Query  153  ----------------ACAGGATGAAGAACAGGTCACAGTTGAGCAGGATTCTCCAAGAAACAGAGAACACATG  210
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTATTGGAGACTGGAGACAGGATGAAGAACAGGTCACAGTTGAGCAGGATTCTCCAAGAAACAGAGAACACATG  518

Query  211  GAGGATGATGATGAGGAGATGCAACAAAAAGGGTGTTTGGAAAGGAGGTATGACACGGTATGTGGTTTCTGTAG  284
            |||||||||||||||||||||||||||||||                                           
Sbjct  519  GAGGATGATGATGAGGAGATGCAACAAAAAG-------------------------------------------  549

Query  285  GAAACACAAAACAACTCTTCGGCACATCATCTGGGGCATTTTATTAGCAGGTTATCTGGTTATGGTGATTTCGG  358
                                                             |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  550  -------------------------------------------------GGTTATCTGGTTATGGTGATTTCGG  574

Query  359  CCTGTGTGCTGAACTTTCACAGAGCCCTTCCTCTTTTTGTGATCACCGTGGCTGCCATCTTCTTTGTTGTCTGG  432
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  575  CCTGTGTGCTGAACTTTCACAGAGCCCTTCCTCTTTTTGTGATCACCGTGGCTGCCATCTTCTTTGTTGTCTGG  648

Query  433  GATCACCTGATGGCCAAATACGAACATCGAATTGATGAGATGCTGTCTCCTGGCAGAAGGCTTCTAAACAGCCA  506
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  649  GATCACCTGATGGCCAAATACGAACATCGAATTGATGAGATGCTGTCTCCTGGCAGAAGGCTTCTAAACAGCCA  722

Query  507  TTGGTTCTGGCTGAAGTGGGTGATCTGGAGCTCCCTGGTCCTAGCAGTTATTTTCTGGTTGGCCTTTGACACTG  580
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  723  TTGGTTCTGGCTGAAGTGGGTGATCTGGAGCTCCCTGGTCCTAGCAGTTATTTTCTGGTTGGCCTTTGACACTG  796

Query  581  CCAAATTGGGTCAACAGCAGCTGGTGTCCTTCGGTGGGCTCATAATGTACATTGTCCTGTTATTTCTATTCTCC  654
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  797  CCAAATTGGGTCAACAGCAGCTGGTGTCCTTCGGTGGGCTCATAATGTACATTGTCCTGTTATTTCTATTTTCC  870

Query  655  AAGTACCCAACCAGAGTTTACTGGAGACCTGTCTTATGGGGAATCGGGCTACAGTTTCTTCTTGGGCTCTTGAT  728
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  871  AAGTACCCAACCAGAGTTTACTGGAGACCTGTCTTATGGGGAATCGGGCTACAGTTTCTTCTTGGGCTCTTGAT  944

Query  729  TCTAAGGACTGACCCTGGATTTATAGCTTTTGATTGGTTGGGCAGACAAGTTCAGACTTTTCTGGAGTACACAG  802
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  945  TCTAAGGACTGACCCTGGATTTATAGCTTTTGATTGGTTGGGCAGACAAGTTCAGACTTTTCTGGAGTACACAG  1018

Query  803  ATGCTGGTGCTTCATTTGTCTTTGGTGAGAAATACAAAGACCACTTCTTTGCATTTAAGGTCCTACCGATCGTG  876
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1019  ATGCTGGTGCTTCATTTGTCTTTGGTGAGAAATACAAAGACCACTTCTTTGCATTTAAGGTCCTGCCGATCGTG  1092

Query  877  GTTTTCTTCAGCACTGTGATGTCCATGCTGTACTACCTGGGACTGATGCAGTGGATTATTAGAAAGGTTGGATG  950
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1093  GTTTTCTTCAGCACTGTGATGTCCATGCTGTACTACCTGGGACTGATGCAGTGGATTATTAGAAAGGTTGGATG  1166

Query  951  GATCATGCTAGTTACTACGGGATCATCTCCTATTGAATCTGTAGTTGCTTCTGGCAATATATTTGTTGGACAAA  1024
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1167  GATCATGCTAGTTACTACGGGATCATCTCCTATTGAATCTGTAGTTGCTTCTGGCAATATATTTGTTGGACAAA  1240

Query 1025  CGGAGTCTCCACTGCTGGTCCGACCATATTTACCTTACATCACCAAGTCTGAACTCCACGCCATCATGACCGCC  1098
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1241  CGGAGTCTCCACTGCTGGTCCGACCATATTTACCTTACATCACCAAGTCTGAACTCCACGCCATCATGACCGCC  1314

Query 1099  GGGTTCTCTACCATTGCTGGAAGCGTGCTAGGTGCATACATTTCTTTTGGGGTTCCATCCTCCCACTTGTTAAC  1172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1315  GGGTTCTCTACCATTGCTGGAAGCGTGCTAGGTGCATACATTTCTTTTGGGGTTCCATCCTCCCACTTGTTAAC  1388

Query 1173  AGCGTCAGTTATGTCAGCACCTGCGTCATTGGCTGCTGCTAAACTCTTTTGGCCTGAGACAGAAAAACCTAAAA  1246
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1389  AGCGTCAGTTATGTCAGCACCTGCGTCATTGGCTGCTGCTAAACTCTTTTGGCCTGAGACAGAAAAACCTAAAA  1462

Query 1247  TAACCCTCAAGAATGCCATGAAAATGGAAAGTGGTGATTCAGGGAATCTTCTAGAAGCTGCAACACAGGGAGCA  1320
            |||||||||||||||||||||||||||||||||                    |||||||||||||||||||||
Sbjct 1463  TAACCCTCAAGAATGCCATGAAAATGGAAAGTG--------------------GAAGCTGCAACACAGGGAGCA  1516

Query 1321  TCCTCCTCCATCTCCCTGGTGGCCAACATCGCTGTGAATCTGATTGCCTTCCTGGCCCTGCTGTCTTTTATGAA  1394
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1517  TCCTCCTCCATCTCCCTGGTGGCCAACATCGCTGTGAATCTGATTGCCTTCCTGGCCCTGCTGTCTTTTATGAA  1590

Query 1395  TTCAGCCCTGTCCTGGTTTGGAAACATGTTTGACTACCCACAGCTGAGTTTTGAGCTAATCTGCTCCTACATCT  1468
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1591  TTCAGCCCTGTCCTGGTTTGGAAACATGTTTGACTACCCACAGCTGAGTTTTGAGCTAATCTGCTCCTACATCT  1664

Query 1469  TCATGCCCTTTTCCTTCATGATGGGAGTGGAATGGCAGGACAGCTTTATGGTTGCCAGACTCATAGGTTATAAG  1542
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1665  TCATGCCCTTTTCCTTCATGATGGGAGTGGAATGGCAGGACAGCTTTATGGTTGCCAGACTCATAGGTTATAAG  1738

Query 1543  ACCTTCTTCAATGAATTTGTGGCTTATGAGCACCTCTCAAAATGGATCCACTTGAGGAAAGAAGGTGGACCCAA  1616
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1739  ACCTTCTTCAATGAATTTGTGGCTTATGAGCACCTCTCAAAATGGATCCACTTGAGGAAAGAAGGTGGACCCAA  1812

Query 1617  ATTTGTAAACGGTGTGCAGCAATATATATCAATTCGTTCTGAGATAATCGCCACTTACGCTCTCTGTGGTTTTG  1690
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1813  ATTTGTAAACGGTGTGCAGCAATATATATCAATTCGTTCTGAGATAATCGCCACTTACGCTCTCTGTGGTTTTG  1886

Query 1691  CCAATATCGGGTCCCTAGGAATCGTGATCGGCGGACTCACATCCATGACTCCTTCCAGAAAGCGTGATATCGCC  1764
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1887  CCAATATCGGGTCCCTAGGAATCGTGATCGGCGGACTCACATCCATGGCTCCTTCCAGAAAGCGTGATATCGCC  1960

Query 1765  TCGGGGGCAGTGAGAGCTCTGATTGCGGGGACCGTGGCCTGCTTCATGACAGCCTGCATCGCAGGCATACTCTC  1838
            ||||||||||||||                                                            
Sbjct 1961  TCGGGGGCAGTGAG------------------------------------------------------------  1974

Query 1839  CAGCACTCCTGTGGACATCAACTGCCATCACGTTTTAGAGAATGCCTTCAACTCCACTTTCCCTGGAAACACAA  1912
                                                                                      
Sbjct 1975  --------------------------------------------------------------------------  1974

Query 1913  CCAAGGTGATAGCTTGTTGCCAAAGTCTGTTGAGCAGCACTGTTGCCAAGGGTCCTGGTGAAGTCATCCCAGGA  1986
                                                                                      
Sbjct 1975  --------------------------------------------------------------------------  1974

Query 1987  GGAAACCACAGTCTGTATTCTTTGAAGGGCTGCTGCACATTGTTGAATCCATCGACCTTTAACTGCAATGGGAT  2060
                                                                                      
Sbjct 1975  --------------------------------------------------------------------------  1974

Query 2061  CTCTAATACATTT  2073
                         
Sbjct 1975  -------------  1974