Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491874
• Subject: XM_006710812.2
• Aligned Length: 2494
• Identities: 2083
• Gaps: 409

Alignment

Query    1  ATGGAGCGGCCCTGGGGAGCTGCGGACGGCCTCTCGCGCTGGCCCCATGGCCTCGGCCTCCTCCTCCTCCTGCA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GCTGCTGCCGCCGTCGACCCTCAGCCAGGACCGGCTGGACGCGCCGCCGCCGCCCGCTGCGCCGCTGCCGCGCT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GGTCTGGCCCCATCGGGGTGAGCTGGGGGCTGCGGGCGGCCGCAGCCGGGGGCGCGTTTCCCCGCGGCGGCCGT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TGGCGTCGCAGCGCGCCGGGCGAGGACGAGGAGTGCGGCCGGGTCCGGGACTTCGTCGCCAAGCTGGCCAACAA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CACGCACCAGCATGTGTTTGATGATCTCAGAGGCTCAGTATCCTTGTCCTGGGTTGGAGATAGCACTGGGGTCA  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  TTCTAGTCTTGACTACCTTCCATGTACCACTGGTAATTATGACTTTTGGACAGTCCAAGCTATATCGAAGTGAG  444
                                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------------------------------------ATGACTTTTGGACAGTCCAAGCTATATCGAAGTGAG  36

Query  445  GATTATGGGAAGAACTTTAAGGATATTACAGATCTCATCAATAACACCTTTATTCGGACTGAATTTGGCATGGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   37  GATTATGGGAAGAACTTTAAGGATATTACAGATCTCATCAATAACACCTTTATTCGGACTGAATTTGGCATGGC  110

Query  519  TATTGGTCCTGAGAACTCTGGAAAGGTGGTGTTAACAGCAGAGGTGTCTGGAGGAAGTCGTGGAGGAAGAATCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  111  TATTGGTCCTGAGAACTCTGGAAAGGTGGTGTTAACAGCAGAGGTGTCTGGAGGAAGTCGTGGAGGAAGAATCT  184

Query  593  TCAGATCATCAGATTTTGCGAAGAATTTTGTGCAAACAGATCTCCCTTTTCATCCTCTCACTCAGATGATGTAT  666
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  185  TTAGATCATCAGATTTTGCGAAGAATTTTGTGCAAACAGATCTCCCTTTTCATCCTCTCACTCAGATGATGTAT  258

Query  667  AGCCCTCAGAATTCTGATTATCTTTTAGCTCTCAGCACTGAAAATGGCCTGTGGGTGTCCAAGAATTTTGGGGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  259  AGCCCTCAGAATTCTGATTATCTTTTAGCTCTCAGCACTGAAAATGGCCTGTGGGTGTCCAAGAATTTTGGGGG  332

Query  741  AAAATGGGAAGAAATCCACAAAGCAGTATGTTTGGCCAAATGGGGATCAGACAACACCATCTTCTTTACAACCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  333  AAAATGGGAAGAAATCCACAAAGCAGTATGTTTGGCCAAATGGGGATCAGACAACACCATCTTCTTTACAACCT  406

Query  815  ATGCAAATGGCTCCTGCAAAGCTGACCTTGGGGCTCTGGAATTATGGAGAACTTCAGACTTGGGAAAAAGCTTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  407  ATGCAAATGGCTCCTGCAAAGCTGACCTTGGGGCTCTGGAATTATGGAGAACTTCAGACTTGGGAAAAAGCTTC  480

Query  889  AAAACTATTGGTGTGAAAATCTACTCATTTGGTCTTGGGGGACGTTTCCTTTTTGCCTCTGTGATGGCTGATAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  481  AAAACTATTGGTGTGAAAATCTACTCATTTGGTCTTGGGGGACGTTTCCTTTTTGCCTCTGTGATGGCTGATAA  554

Query  963  GGATACCACAAGAAGGATCCACGTTTCAACAGATCAAGGGGACACATGGAGCATGGCCCAGCTCCCCTCCGTGG  1036
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  555  GGATACAACAAGAAGGATCCACGTTTCAACAGATCAAGGGGACACATGGAGCATGGCCCAGCTCCCCTCCGTGG  628

Query 1037  GACAGGAACAGTTCTATTCTATTCTGGCAGCAAATGATGACATGGTATTCATGCATGTAGATGAACCTGGAGAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  629  GACAGGAACAGTTCTATTCTATTCTGGCAGCAAATGATGACATGGTATTCATGCATGTAGATGAACCTGGAGAC  702

Query 1111  ACTGGGTTTGGCACAATCTTTACCTCAGATGATCGAGGCATTGTCTATTCCAAGTCTTTGGACCGACATCTCTA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  703  ACTGGGTTTGGCACAATCTTTACCTCAGATGATCGAGGCATTGTCTATTCCAAGTCTTTGGACCGACATCTCTA  776

Query 1185  CACTACCACAGGCGGAGAGACGGACTTTACCAACGTGACCTCCCTCCGCGGCGTCTACATAACAAGCGTGCTCT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  777  CACTACCACAGGCGGAGAGACGGACTTTACCAACGTGACCTCCCTCCGCGGCGTCTACATAACAAGCGTGCTCT  850

Query 1259  CCGAAGATAATTCTATCCAGACCATGATCACTTTTGACCAAGGAGGAAGGTGGACGCACCTGAGGAAGCCTGAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  851  CCGAAGATAATTCTATCCAGACCATGATCACTTTTGACCAAGGAGGAAGGTGGACGCACCTGAGGAAGCCTGAA  924

Query 1333  AACAGTGAATGTGATGCTACAGCAAAAAACAAGAATGAGTGCAGCCTTCATATTCATGCTTCCTACAGCATCTC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  925  AACAGTGAATGTGATGCTACAGCAAAAAACAAGAATGAGTGCAGCCTTCATATTCATGCTTCCTACAGCATCTC  998

Query 1407  CCAGAAACTGAATGTTCCAATGGCCCCACTCTCAGAGCCGAATGCCGTAGGCATTGTCATTGCTCATGGTAGCG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  999  CCAGAAACTGAATGTTCCAATGGCCCCACTCTCAGAGCCGAATGCCGTAGGCATTGTCATTGCTCATGGTAGCG  1072

Query 1481  TGGGGGATGCCATCTCAGTGATGGTTCCAGATGTGTACATCTCAGATGATGGGGGTTACTCCTGGACAAAGATG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1073  TGGGGGATGCCATCTCAGTGATGGTTCCAGATGTGTACATCTCAGATGATGGGGGTTACTCCTGGACAAAGATG  1146

Query 1555  CTGGAAGGACCCCACTATTACACCATCCTGGATTCTGGAGGCATCATTGTGGCCATTGAGCACAGCAGCCGTCC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1147  CTGGAAGGACCCCACTATTACACCATCCTGGATTCTGGAGGCATCATTGTGGCCATTGAGCACAGCAGCCGTCC  1220

Query 1629  TATCAATGTGATTAAGTTCTCCACAGACGAAGGTCAATGCTGGCAAACCTACACGTTCACCAGGGACCCCATCT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1221  TATCAATGTGATTAAGTTCTCCACAGACGAAGGTCAATGCTGGCAAACCTACACGTTCACCAGGGACCCCATCT  1294

Query 1703  ATTTCACTGGCCTAGCTTCAGAACCTGGAGCTAGGTCCATGAATATCAGCATTTGGGGCTTCACAGAATCTTTC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1295  ATTTCACTGGCCTAGCTTCAGAACCTGGAGCTAGGTCCATGAATATCAGCATTTGGGGCTTCACAGAATCTTTC  1368

Query 1777  CTGACCAGCCAGTGGGTCTCCTACACCATTGATTTTAAAGATATCCTTGAAAGGAACTGTGAAGAGAAGGACTA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1369  CTGACCAGCCAGTGGGTCTCCTACACCATTGATTTTAAAGATATCCTTGAAAGGAACTGTGAAGAGAAGGACTA  1442

Query 1851  TACCATATGGCTGGCACACTCCACAGACCCTGAAGATTATGAAGATGGCTGCATTTTGGGCTACAAAGAACAGT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1443  TACCATATGGCTGGCACACTCCACAGACCCTGAAGATTATGAAGATGGCTGCATTTTGGGCTACAAAGAACAGT  1516

Query 1925  TTCTGCGGCTACGCAAGTCATCCGTGTGTCAGAATGGTCGAGACTATGTTGTGACCAAGCAGCCCTCCATCTGC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1517  TTCTGCGGCTACGCAAGTCATCCGTGTGTCAGAATGGTCGAGACTATGTTGTGACCAAGCAGCCCTCCATCTGC  1590

Query 1999  CTCTGTTCCCTGGAGGACTTTCTCTGTGATTTTGGCTACTACCGTCCAGAAAATGACTCCAAGTGTGTGGAACA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1591  CTCTGTTCCCTGGAGGACTTTCTCTGTGATTTTGGCTACTACCGTCCAGAAAATGACTCCAAGTGTGTGGAACA  1664

Query 2073  GCCAGAACTGAAGGGCCACGACCTGGAGTTTTGTCTGTACGGAAGAGAAGAACACCTAACAACAAATGGGTACC  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1665  GCCAGAACTGAAGGGCCACGACCTGGAGTTTTGTCTGTACGGAAGAGAAGAACACCTAACAACAAATGGGTACC  1738

Query 2147  GGAAAATTCCAGGGGACAAATGCCAGGGTGGGGTAAATCCAGTTCGAGAAGTAAAAGACTTGAAAAAGAAATGC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1739  GGAAAATTCCAGGGGACAAATGCCAGGGTGGGGTAAATCCAGTTCGAGAAGTAAAAGACTTGAAAAAGAAATGC  1812

Query 2221  ACAAGCAACTTTTTGAGTCCGGAAAAACAGAATTCCAAGTCAAATTCTGTTCCAATTATCCTGGCCATCGTGGG  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1813  ACAAGCAACTTTTTGAGTCCGGAAAAACAGAATTCCAAGTCAAATTCTGTTCCAATTATCCTGGCCATCGTGGG  1886

Query 2295  ATTGATGCTGGTCACAGTCGTAGCAGGAGTGCTCATTGTGAAGAAATATGTCTGTGGGGGAAGGTTCCTGGTGC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1887  ATTGATGCTGGTCACAGTCGTAGCAGGAGTGCTCATTGTGAAGAAATATGTCTGTGGGGGAAGGTTCCTGGTGC  1960

Query 2369  ATCGATACTCTGTGCTGCAGCAGCATGCAGAGGCCAATGGTGTGGATGGTGTGGATGCTTTGGACACAGCCTCC  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1961  ATCGATACTCTGTGCTGCAGCAGCATGCAGAGGCCAATGGTGTGGATGGTGTGGATGCTTTGGACACAGCCTCC  2034

Query 2443  CACACTAATAAAAGTGGTTATCATGATGACTCAGATGAGGACCTCTTGGAAG  2494
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct 2035  CACACTAATAAAAGTGGTTATCATGATGACTCAGATGAGGACCTCTTGGAA-  2085