Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491986
• Subject: NM_001354676.2
• Aligned Length: 2086
• Identities: 2025
• Gaps: 58

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------------ATGGCGCCGTTCCTGCG  17
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGGGAAAGGCAGCGCCTGCCCGAGAGGTCAGGGAGCCCCACTGCAGGCCCCACCATGGCGCCGTTCCTGCG  74

Query   18  CATCGCCTTCAACTCCTATGAGCTGGGCTCCCTGCAGGCCGAGGACGAGGCGAACCAGCCCTTCTGTGCCGTGA  91
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CATCGCCTTCAACTCCTATGAGCTGGGCTCCCTGCAGGCCGAGGACGAGGCGAACCAGCCCTTCTGTGCCGTGA  148

Query   92  AGATGAAGGAGGCGCTCAGCACAGAGCGTGGGAAAACACTGGTGCAGAAGAAGCCGACCATGTATCCTGAGTGG  165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGATGAAGGAGGCGCTCAGCACAGAGCGTGGGAAAACACTGGTGCAGAAGAAGCCGACCATGTATCCTGAGTGG  222

Query  166  AAGTCGACGTTCGATGCCCACATCTATGAGGGGCGCGTCATCCAGATTGTGCTAATGCGGGCAGCAGAGGAGCC  239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGTCGACGTTCGATGCCCACATCTATGAGGGGCGCGTCATCCAGATTGTGCTAATGCGGGCAGCAGAGGAGCC  296

Query  240  AGTGTCTGAGGTGACCGTGGGTGTGTCGGTGCTGGCCGAGCGCTGCAAGAAGAACAATGGCAAGGCTGAGTTCT  313
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGTGTCTGAGGTGACCGTGGGTGTGTCGGTGCTGGCCGAGCGCTGCAAGAAGAACAATGGCAAGGCTGAGTTCT  370

Query  314  GGCTGGACCTGCAGCCTCAGGCCAAGGTGTTGATGTCTGTTCAGTATTTCCTGGAGGACGTGGATTGCAAACAG  387
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGCTGGACCTGCAGCCTCAGGCCAAGGTGTTGATGTCTGTTCAGTATTTCCTGGAGGACGTGGATTGCAAACAG  444

Query  388  TCTATGCGCAGTGAGGACGAGGCCAAGTTCCCAACGATGAACCGCCGCGGAGCCATCAAACAGGCCAAAATCCA  461
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCTATGCGCAGTGAGGACGAGGCCAAGTTCCCAACGATGAACCGCCGCGGAGCCATCAAACAGGCCAAAATCCA  518

Query  462  CTACATCAAGAACCATGAGTTTATCGCCACCTTCTTTGGGCAACCCACCTTCTGTTCTGTGTGCAAAGACTTTG  535
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTACATCAAGAACCATGAGTTTATCGCCACCTTCTTTGGGCAACCCACCTTCTGTTCTGTGTGCAAAGACTTTG  592

Query  536  TCTGGGGCCTCAACAAGCAAGGCTACAAATGCAGGCAATGTAACGCTGCCATCCACAAGAAATGCATCGACAAG  609
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCTGGGGCCTCAACAAGCAAGGCTACAAATGCAGGCAATGTAACGCTGCCATCCACAAGAAATGCATCGACAAG  666

Query  610  ATCATCGGCAGATGCACTGGCACCGCGGCCAACAGCCGGGACACTATATTCCAGAAAGAACGCTTCAACATCGA  683
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATCATCGGCAGATGCACTGGCACCGCGGCCAACAGCCGGGACACTATATTCCAGAAAGAACGCTTCAACATCGA  740

Query  684  CATGCCGCACCGCTTCAAGGTTCACAACTACATGAGCCCCACCTTCTGTGACCACTGCGGCAGCCTGCTCTGGG  757
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CATGCCGCACCGCTTCAAGGTTCACAACTACATGAGCCCCACCTTCTGTGACCACTGCGGCAGCCTGCTCTGGG  814

Query  758  GACTGGTGAAGCAGGGATTAAAGTGTGAAGACTGCGGCATGAATGTGCACCATAAATGCCGGGAGAAGGTGGCC  831
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GACTGGTGAAGCAGGGATTAAAGTGTGAAGACTGCGGCATGAATGTGCACCATAAATGCCGGGAGAAGGTGGCC  888

Query  832  AACCTCTGCGGCATCAACCAGAAGCTTTTGGCTGAGGCCTTGAACCAAGTCACCCAGAGAGCCTCCCGGAGATC  905
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AACCTCTGCGGCATCAACCAGAAGCTTTTGGCTGAGGCCTTGAACCAAGTCACCCAGAGAGCCTCCCGGAGATC  962

Query  906  AGACTCAGCCTCCTCAGAGCCTGTTGGGATATATCAGGGTTTCGAGAAGAAGACCGGAGTTGCTGGGGAGGACA  979
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGACTCAGCCTCCTCAGAGCCTGTTGGGATATATCAGGGTTTCGAGAAGAAGACCGGAGTTGCTGGGGAGGACA  1036

Query  980  TGCAAGACAACAGTGGGACCTACGGCAAGATCTGGGAGGGCAGCAGCAAGTGCAACATCAACAACTTCATCTTC  1053
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGCAAGACAACAGTGGGACCTACGGCAAGATCTGGGAGGGCAGCAGCAAGTGCAACATCAACAACTTCATCTTC  1110

Query 1054  CACAAGGTCCTGGGCAAAGGCAGCTTCGGGAAGGTGCTGCTTGGAGAGCTGAAGGGCAGAGGAGAGTACTTTGC  1127
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CACAAGGTCCTGGGCAAAGGCAGCTTCGGGAAGGTGCTGCTTGGAGAGCTGAAGGGCAGAGGAGAGTACTTTGC  1184

Query 1128  CATCAAGGCCCTCAAGAAGGATGTGGTCCTGATCGACGACGACGTGGAGTGCACCATGGTTGAGAAGCGGGTGC  1201
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CATCAAGGCCCTCAAGAAGGATGTGGTCCTGATCGACGACGACGTGGAGTGCACCATGGTTGAGAAGCGGGTGC  1258

Query 1202  TGACACTTGCCGCAGAGAATCCCTTTCTCACCCACCTCATCTGCACCTTCCAGACCAAGGACCACCTGTTCTTT  1275
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGACACTTGCCGCAGAGAATCCCTTTCTCACCCACCTCATCTGCACCTTCCAGACCAAGGACCACCTGTTCTTT  1332

Query 1276  GTGATGGAGTTCCTCAACGGGGGGGACCTGATGTACCACATCCAGGACAAAGGCCGCTTTGAACTCTACCGTGC  1349
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTGATGGAGTTCCTCAACGGGGGGGACCTGATGTACCACATCCAGGACAAAGGCCGCTTTGAACTCTACCGTGC  1406

Query 1350  CACGTTTTATGCCGCTGAGATAATGTGTGGACTGCAGTTTCTACACAGCAAGGGCATCATTTACAGGGACCTCA  1423
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CACGTTTTATGCCGCTGAGATAATGTGTGGACTGCAGTTTCTACACAGCAAGGGCATCATTTACAGGGACCTCA  1480

Query 1424  AACTGGACAATGTGCTGTTGGACCGGGATGGCCACATCAAGATTGCCGACTTTGGGATGTGCAAAGAGAACATA  1497
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AACTGGACAATGTGCTGCTGGACCGGGATGGCCACATCAAGATTGCCGACTTTGGGATGTGCAAAGAGAACATA  1554

Query 1498  TTCGGGGAGAGCCGGGCCAGCACCTTCTGCGGCACCCCTGACTATATCGCCCCTGAGATCCTACAGGGCCTGAA  1571
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TTCGGGGAGAGCCGGGCCAGCACCTTCTGCGGCACCCCTGACTATATCGCCCCTGAGATCCTACAGGGCCTGAA  1628

Query 1572  GTACACATTCTCTGTGGACTGGTGGTCTTTCGGGGTCCTTCTGTACGAGATGCTCATTGGCCAGTCCCCCTTCC  1645
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GTACACATTCTCTGTGGACTGGTGGTCTTTCGGGGTCCTTCTGTACGAGATGCTCATTGGCCAGTCCCCCTTCC  1702

Query 1646  ATGGTGATGATGAGGATGAACTCTTCGAGTCCATCCGTGTGGACACGCCACATTATCCCCGCTGGATCACCAAG  1719
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ATGGTGATGATGAGGATGAACTCTTCGAGTCCATCCGTGTGGACACGCCACATTATCCCCGCTGGATCACCAAG  1776

Query 1720  GAGTCCAAGGACATCCTGGAGAAGCTCTTTGAAAGGGAACCAACCAAGAGGCTGGGAGTGACGGGAAACATCAA  1793
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1777  GAGTCCAAGGACATCCTGGAGAAGCTCTTTGAAAGGGAACCAACCAAGAGGCTGGGAGTGACCGGAAACATCAA  1850

Query 1794  AATCCACCCCTTCTTCAAGACCATAAACTGGACTCTGCTGGAAAAGCGGAGGTTGGAGCCACCCTTCAGGCCCA  1867
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1851  AATCCACCCCTTCTTCAAGACCATAAACTGGACTCTGCTGGAAAAGCGGAGGTTGGAGCCACCTTTCAGGCCCA  1924

Query 1868  AAGTGAAGTCACCCAGAGACTACAGTAACTTTGACCAGGAGTTCCTGAACGAGAAGGCGCGCCTCTCCTACAGC  1941
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AAGTGAAGTCACCCAGAGACTACAGTAACTTTGACCAGGAGTTCCTGAACGAGAAGGCGCGCCTCTCCTACAGC  1998

Query 1942  GACAAGAACCTCATCGACTCCATGGACCAGTCTGCATTCGCTGGCTTCTCCTTTGTGAACCCCAAATTCGAGCA  2015
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GACAAGAACCTCATCGACTCCATGGACCAGTCTGCATTCGCTGGCTTCTCCTTTGTGAACCCCAAATTCGAGCA  2072

Query 2016  CCTCCTGGAAGATG  2029
            ||||||||||||| 
Sbjct 2073  CCTCCTGGAAGAT-  2085