Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491986
• Subject: NM_001354678.2
• Aligned Length: 2077
• Identities: 2025
• Gaps: 49

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------ATGGCGCCGTTCCTGCGCATCGCCTT  26
                                                            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGGGAAAGGCAGCGCCTGCCCGAGAGCCCCACTGCAGGCCCCACCATGGCGCCGTTCCTGCGCATCGCCTT  74

Query   27  CAACTCCTATGAGCTGGGCTCCCTGCAGGCCGAGGACGAGGCGAACCAGCCCTTCTGTGCCGTGAAGATGAAGG  100
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAACTCCTATGAGCTGGGCTCCCTGCAGGCCGAGGACGAGGCGAACCAGCCCTTCTGTGCCGTGAAGATGAAGG  148

Query  101  AGGCGCTCAGCACAGAGCGTGGGAAAACACTGGTGCAGAAGAAGCCGACCATGTATCCTGAGTGGAAGTCGACG  174
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGCGCTCAGCACAGAGCGTGGGAAAACACTGGTGCAGAAGAAGCCGACCATGTATCCTGAGTGGAAGTCGACG  222

Query  175  TTCGATGCCCACATCTATGAGGGGCGCGTCATCCAGATTGTGCTAATGCGGGCAGCAGAGGAGCCAGTGTCTGA  248
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTCGATGCCCACATCTATGAGGGGCGCGTCATCCAGATTGTGCTAATGCGGGCAGCAGAGGAGCCAGTGTCTGA  296

Query  249  GGTGACCGTGGGTGTGTCGGTGCTGGCCGAGCGCTGCAAGAAGAACAATGGCAAGGCTGAGTTCTGGCTGGACC  322
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGTGACCGTGGGTGTGTCGGTGCTGGCCGAGCGCTGCAAGAAGAACAATGGCAAGGCTGAGTTCTGGCTGGACC  370

Query  323  TGCAGCCTCAGGCCAAGGTGTTGATGTCTGTTCAGTATTTCCTGGAGGACGTGGATTGCAAACAGTCTATGCGC  396
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGCAGCCTCAGGCCAAGGTGTTGATGTCTGTTCAGTATTTCCTGGAGGACGTGGATTGCAAACAGTCTATGCGC  444

Query  397  AGTGAGGACGAGGCCAAGTTCCCAACGATGAACCGCCGCGGAGCCATCAAACAGGCCAAAATCCACTACATCAA  470
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGTGAGGACGAGGCCAAGTTCCCAACGATGAACCGCCGCGGAGCCATCAAACAGGCCAAAATCCACTACATCAA  518

Query  471  GAACCATGAGTTTATCGCCACCTTCTTTGGGCAACCCACCTTCTGTTCTGTGTGCAAAGACTTTGTCTGGGGCC  544
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAACCATGAGTTTATCGCCACCTTCTTTGGGCAACCCACCTTCTGTTCTGTGTGCAAAGACTTTGTCTGGGGCC  592

Query  545  TCAACAAGCAAGGCTACAAATGCAGGCAATGTAACGCTGCCATCCACAAGAAATGCATCGACAAGATCATCGGC  618
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCAACAAGCAAGGCTACAAATGCAGGCAATGTAACGCTGCCATCCACAAGAAATGCATCGACAAGATCATCGGC  666

Query  619  AGATGCACTGGCACCGCGGCCAACAGCCGGGACACTATATTCCAGAAAGAACGCTTCAACATCGACATGCCGCA  692
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGATGCACTGGCACCGCGGCCAACAGCCGGGACACTATATTCCAGAAAGAACGCTTCAACATCGACATGCCGCA  740

Query  693  CCGCTTCAAGGTTCACAACTACATGAGCCCCACCTTCTGTGACCACTGCGGCAGCCTGCTCTGGGGACTGGTGA  766
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCGCTTCAAGGTTCACAACTACATGAGCCCCACCTTCTGTGACCACTGCGGCAGCCTGCTCTGGGGACTGGTGA  814

Query  767  AGCAGGGATTAAAGTGTGAAGACTGCGGCATGAATGTGCACCATAAATGCCGGGAGAAGGTGGCCAACCTCTGC  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGCAGGGATTAAAGTGTGAAGACTGCGGCATGAATGTGCACCATAAATGCCGGGAGAAGGTGGCCAACCTCTGC  888

Query  841  GGCATCAACCAGAAGCTTTTGGCTGAGGCCTTGAACCAAGTCACCCAGAGAGCCTCCCGGAGATCAGACTCAGC  914
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGCATCAACCAGAAGCTTTTGGCTGAGGCCTTGAACCAAGTCACCCAGAGAGCCTCCCGGAGATCAGACTCAGC  962

Query  915  CTCCTCAGAGCCTGTTGGGATATATCAGGGTTTCGAGAAGAAGACCGGAGTTGCTGGGGAGGACATGCAAGACA  988
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTCCTCAGAGCCTGTTGGGATATATCAGGGTTTCGAGAAGAAGACCGGAGTTGCTGGGGAGGACATGCAAGACA  1036

Query  989  ACAGTGGGACCTACGGCAAGATCTGGGAGGGCAGCAGCAAGTGCAACATCAACAACTTCATCTTCCACAAGGTC  1062
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACAGTGGGACCTACGGCAAGATCTGGGAGGGCAGCAGCAAGTGCAACATCAACAACTTCATCTTCCACAAGGTC  1110

Query 1063  CTGGGCAAAGGCAGCTTCGGGAAGGTGCTGCTTGGAGAGCTGAAGGGCAGAGGAGAGTACTTTGCCATCAAGGC  1136
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTGGGCAAAGGCAGCTTCGGGAAGGTGCTGCTTGGAGAGCTGAAGGGCAGAGGAGAGTACTTTGCCATCAAGGC  1184

Query 1137  CCTCAAGAAGGATGTGGTCCTGATCGACGACGACGTGGAGTGCACCATGGTTGAGAAGCGGGTGCTGACACTTG  1210
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCTCAAGAAGGATGTGGTCCTGATCGACGACGACGTGGAGTGCACCATGGTTGAGAAGCGGGTGCTGACACTTG  1258

Query 1211  CCGCAGAGAATCCCTTTCTCACCCACCTCATCTGCACCTTCCAGACCAAGGACCACCTGTTCTTTGTGATGGAG  1284
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCGCAGAGAATCCCTTTCTCACCCACCTCATCTGCACCTTCCAGACCAAGGACCACCTGTTCTTTGTGATGGAG  1332

Query 1285  TTCCTCAACGGGGGGGACCTGATGTACCACATCCAGGACAAAGGCCGCTTTGAACTCTACCGTGCCACGTTTTA  1358
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTCCTCAACGGGGGGGACCTGATGTACCACATCCAGGACAAAGGCCGCTTTGAACTCTACCGTGCCACGTTTTA  1406

Query 1359  TGCCGCTGAGATAATGTGTGGACTGCAGTTTCTACACAGCAAGGGCATCATTTACAGGGACCTCAAACTGGACA  1432
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGCCGCTGAGATAATGTGTGGACTGCAGTTTCTACACAGCAAGGGCATCATTTACAGGGACCTCAAACTGGACA  1480

Query 1433  ATGTGCTGTTGGACCGGGATGGCCACATCAAGATTGCCGACTTTGGGATGTGCAAAGAGAACATATTCGGGGAG  1506
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ATGTGCTGCTGGACCGGGATGGCCACATCAAGATTGCCGACTTTGGGATGTGCAAAGAGAACATATTCGGGGAG  1554

Query 1507  AGCCGGGCCAGCACCTTCTGCGGCACCCCTGACTATATCGCCCCTGAGATCCTACAGGGCCTGAAGTACACATT  1580
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AGCCGGGCCAGCACCTTCTGCGGCACCCCTGACTATATCGCCCCTGAGATCCTACAGGGCCTGAAGTACACATT  1628

Query 1581  CTCTGTGGACTGGTGGTCTTTCGGGGTCCTTCTGTACGAGATGCTCATTGGCCAGTCCCCCTTCCATGGTGATG  1654
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CTCTGTGGACTGGTGGTCTTTCGGGGTCCTTCTGTACGAGATGCTCATTGGCCAGTCCCCCTTCCATGGTGATG  1702

Query 1655  ATGAGGATGAACTCTTCGAGTCCATCCGTGTGGACACGCCACATTATCCCCGCTGGATCACCAAGGAGTCCAAG  1728
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ATGAGGATGAACTCTTCGAGTCCATCCGTGTGGACACGCCACATTATCCCCGCTGGATCACCAAGGAGTCCAAG  1776

Query 1729  GACATCCTGGAGAAGCTCTTTGAAAGGGAACCAACCAAGAGGCTGGGAGTGACGGGAAACATCAAAATCCACCC  1802
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GACATCCTGGAGAAGCTCTTTGAAAGGGAACCAACCAAGAGGCTGGGAGTGACCGGAAACATCAAAATCCACCC  1850

Query 1803  CTTCTTCAAGACCATAAACTGGACTCTGCTGGAAAAGCGGAGGTTGGAGCCACCCTTCAGGCCCAAAGTGAAGT  1876
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CTTCTTCAAGACCATAAACTGGACTCTGCTGGAAAAGCGGAGGTTGGAGCCACCTTTCAGGCCCAAAGTGAAGT  1924

Query 1877  CACCCAGAGACTACAGTAACTTTGACCAGGAGTTCCTGAACGAGAAGGCGCGCCTCTCCTACAGCGACAAGAAC  1950
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CACCCAGAGACTACAGTAACTTTGACCAGGAGTTCCTGAACGAGAAGGCGCGCCTCTCCTACAGCGACAAGAAC  1998

Query 1951  CTCATCGACTCCATGGACCAGTCTGCATTCGCTGGCTTCTCCTTTGTGAACCCCAAATTCGAGCACCTCCTGGA  2024
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CTCATCGACTCCATGGACCAGTCTGCATTCGCTGGCTTCTCCTTTGTGAACCCCAAATTCGAGCACCTCCTGGA  2072

Query 2025  AGATG  2029
            |||| 
Sbjct 2073  AGAT-  2076