Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491986
• Subject: NM_011103.3
• Aligned Length: 2034
• Identities: 1766
• Gaps: 17

Alignment

Query    1  ATGGCGCCGTTCCTGCGCATCGCCTTCAACTCCTATGAGCTGGGCTCCCTGCAGGCCGAGGACGAGGCGAACCA  74
            |||||.||.||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.|..||||||||.||.|.|||
Sbjct    1  ATGGCACCCTTCCTGCGCATCTCCTTCAATTCCTATGAGCTGGGCTCCCTGCAAGTTGAGGACGAAGCAAGCCA  74

Query   75  GCCCTTCTGTGCCGTGAAGATGAAGGAGGCGCTCAGCACAGAGCGTGGGAAAACACTGGTGCAGAAGAAGCCGA  148
            |||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct   75  GCCTTTCTGTGCTGTGAAGATGAAGGAGGCACTCAGCACAGAGCGAGGGAAGACACTGGTACAGAAGAAGCCCA  148

Query  149  CCATGTATCCTGAGTGGAAGTCGACGTTCGATGCCCACATCTATGAGGGGCGCGTCATCCAGATTGTGCTAATG  222
            ||||||||||||||||||||.|.||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct  149  CCATGTATCCTGAGTGGAAGACAACGTTCGACGCCCACATCTATGAAGGCCGTGTTATCCAGATTGTGCTGATG  222

Query  223  CGGGCAGCAGAGGAGCCAGTGTCTGAGGTGACCGTGGGTGTGTCGGTGCTGGCCGAGCGCTGCAAGAAGAACAA  296
            ||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGGGCAGCTGAAGACCCCGTGTCTGAGGTCACGGTGGGCGTGTCAGTACTGGCTGAGCGCTGCAAGAAGAACAA  296

Query  297  TGGCAAGGCTGAGTTCTGGCTGGACCTGCAGCCTCAGGCCAAGGTGTTGATGTCTGTTCAGTATTTCCTGGAGG  370
            .|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||.|||.||||||||||||||||
Sbjct  297  CGGCAAGGCTGAGTTCTGGCTGGATCTGCAGCCTCAGGCCAAGGTGCTGATGTGTGTGCAGTATTTCCTGGAGG  370

Query  371  ACGTGGATTGCAAACAGTCTATGCGCAGTGAGGACGAGGCCAAGTTCCCAACGATGAACCGCCGCGGAGCCATC  444
            |.|.|||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||.
Sbjct  371  ATGGGGATTGCAAACAGTCTATGCGTAGTGAGGAGGAGGCAAAGTTTCCAACCATGAACCGTCGTGGAGCCATT  444

Query  445  AAACAGGCCAAAATCCACTACATCAAGAACCATGAGTTTATCGCCACCTTCTTTGGGCAACCCACCTTCTGTTC  518
            |||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  445  AAACAGGCCAAGATCCACTACATCAAGAACCACGAGTTTATCGCCACCTTCTTCGGGCAGCCCACCTTCTGTTC  518

Query  519  TGTGTGCAAAGACTTTGTCTGGGGCCTCAACAAGCAAGGCTACAAATGCAGGCAATGTAACGCTGCCATCCACA  592
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  519  TGTGTGCAAAGAGTTTGTCTGGGGCCTCAACAAGCAAGGCTACAAATGCAGGCAATGCAACGCTGCCATCCACA  592

Query  593  AGAAATGCATCGACAAGATCATCGGCAGATGCACTGGCACCGCGGCCAACAGCCGGGACACTATATTCCAGAAA  666
            ||||||||||.||||||||.||||||.|.|||||||||||.||..||||.|||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  593  AGAAATGCATTGACAAGATTATCGGCCGCTGCACTGGCACTGCCACCAATAGCCGGGACACCATCTTCCAGAAA  666

Query  667  GAACGCTTCAACATCGACATGCCGCACCGCTTCAAGGTTCACAACTACATGAGCCCCACCTTCTGTGACCACTG  740
            |||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAACGCTTCAACATCGACATGCCTCACCGATTCAAGGTTTATAACTACATGAGCCCCACCTTCTGTGACCACTG  740

Query  741  CGGCAGCCTGCTCTGGGGACTGGTGAAGCAGGGATTAAAGTGTGAAGACTGCGGCATGAATGTGCACCATAAAT  814
            .|||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  741  TGGCAGTTTGCTCTGGGGACTGGTGAAGCAGGGATTAAAGTGTGAAGATTGTGGCATGAATGTGCACCACAAAT  814

Query  815  GCCGGGAGAAGGTGGCCAACCTCTGCGGCATCAACCAGAAGCTTTTGGCTGAGGCCTTGAACCAAGTCACCCAG  888
            ||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  815  GCCGGGAGAAGGTGGCCAACCTGTGTGGTATCAACCAAAAGCTCTTGGCTGAGGCCTTGAACCAAGTGACCCAG  888

Query  889  AGAGCCTCCCGGAGATCAGACTCAGC----CTCCTCAGAGCCTGTTGGGATATATCAGGGTTTCGAGAAGAAGA  958
            |||.|.|||||||          |||    |.|..|||||.||||.||.|||||.|||||.||.|||||||||.
Sbjct  889  AGATCTTCCCGGA----------AGCTGGACACAACAGAGTCTGTCGGAATATACCAGGGATTTGAGAAGAAGC  952

Query  959  CCGGAGTTGCTGGGGAG-GACATGCAAGACAACAGTGGGACCTACGGCAAGATCTGGGAGGGCAGCAGCAAGTG  1031
            |.|.|||..|| ||||| |||||.|.||||||||..||||||||.|||||||||||||||||.||||.|..|||
Sbjct  953  CAGAAGTCTCT-GGGAGTGACATCCTAGACAACAACGGGACCTATGGCAAGATCTGGGAGGGGAGCACCCGGTG  1025

Query 1032  CAACATCAACAACTTCATCTTCCACAAGGTCCTGGGCAAAGGCAGCTTCGGGAAGGTGCTGCTTGGAGAGCTGA  1105
            ||.|.|..|.|||||||.||||||.||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|.||||||||
Sbjct 1026  CACCCTTGAGAACTTCACCTTCCAAAAAGTACTTGGCAAAGGCAGCTTTGGCAAGGTGCTGCTGGCAGAGCTGA  1099

Query 1106  AGGGCAGAGGAGAGTACTTTGCCATCAAGGCCCTCAAGAAGGATGTGGTCCTGATCGACGACGACGTGGAGTGC  1179
            ||||||.||...||||||||||.||||||...||.||||||||.|||||..||||.|||||.||.||.|||||.
Sbjct 1100  AGGGCAAAGACAAGTACTTTGCAATCAAGTGTCTGAAGAAGGACGTGGTGTTGATTGACGATGATGTAGAGTGT  1173

Query 1180  ACCATGGTTGAGAAGCGGGTGCTGACACTTGCCGCAGAGAATCCCTTTCTCACCCACCTCATCTGCACCTTCCA  1253
            ||||||||.|||||||||||||||.|.||.|||...||||.||||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1174  ACCATGGTGGAGAAGCGGGTGCTGGCGCTCGCCTGGGAGAGTCCCTTCCTCACCCACCTCATCTGTACCTTCCA  1247

Query 1254  GACCAAGGACCACCTGTTCTTTGTGATGGAGTTCCTCAACGGGGGGGACCTGATGTACCACATCCAGGACAAAG  1327
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||.||||||.||||||||||
Sbjct 1248  GACCAAGGACCACCTGTTCTTCGTGATGGAGTTTCTCAATGGGGGTGACCTGATGTTCCACATTCAGGACAAAG  1321

Query 1328  GCCGCTTTGAACTCTACCGTGCCACGTTTTATGCCGCTGAGATAATGTGTGGACTGCAGTTTCTACACAGCAAG  1401
            |||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1322  GCCGCTTCGAACTCTACCGGGCTACGTTTTATGCAGCTGAGATCATCTGCGGACTGCAGTTTCTACACAGCAAA  1395

Query 1402  GGCATCATTTACAGGGACCTCAAACTGGACAATGTGCTGTTGGACCGGGATGGCCACATCAAGATTGCCGACTT  1475
            |||||.|||||||||||||||||.||||||||||||.||.|.|||.||||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1396  GGCATTATTTACAGGGACCTCAAGCTGGACAATGTGATGCTAGACAGGGACGGCCACATCAAGATCGCTGACTT  1469

Query 1476  TGGGATGTGCAAAGAGAACATATTCGGGGAGAGCCGGGCCAGCACCTTCTGCGGCACCCCTGACTATATCGCCC  1549
            ||||||||||||||||||.|||||.||||||.|||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 1470  TGGGATGTGCAAAGAGAATATATTTGGGGAGGGCCGGGCCAGCACATTCTGCGGCACTCCTGACTACATCGCCC  1543

Query 1550  CTGAGATCCTACAGGGCCTGAAGTACACATTCTCTGTGGACTGGTGGTCTTTCGGGGTCCTTCTGTACGAGATG  1623
            ||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1544  CTGAGATCCTGCAGGGCCTGAAGTACTCCTTCTCGGTGGACTGGTGGTCTTTCGGGGTCCTCCTGTACGAAATG  1617

Query 1624  CTCATTGGCCAGTCCCCCTTCCATGGTGATGATGAGGATGAACTCTTCGAGTCCATCCGTGTGGACACGCCACA  1697
            |||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1618  CTCATCGGCCAGTCCCCCTTCCACGGCGACGATGAGGACGAGCTCTTCGAGTCCATCCGGGTGGACACACCACA  1691

Query 1698  TTATCCCCGCTGGATCACCAAGGAGTCCAAGGACATCCTGGAGAAGCTCTTTGAAAGGGAACCAACCAAGAGGC  1771
            .||||||||.||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||.||.||.|||||.||...||||||||
Sbjct 1692  CTATCCCCGTTGGATCACCAAGGAATCCAAGGACATCATGGAGAAGCTATTCGAGAGGGACCCTGACAAGAGGC  1765

Query 1772  TGGGAGTGACGGGAAACATCAAAATCCACCCCTTCTTCAAGACCATAAACTGGACTCTGCTGGAAAAGCGGAGG  1845
            |||||||.||.||||||||||..||.||||||||.||||||||.||.||||||.|.||.|||||.|||||||.|
Sbjct 1766  TGGGAGTAACAGGAAACATCAGGATTCACCCCTTTTTCAAGACTATCAACTGGTCCCTCCTGGAGAAGCGGAAG  1839

Query 1846  TTGGAGCCACCCTTCAGGCCCAAAGTGAAGTCACCCAGAGACTACAGTAACTTTGACCAGGAGTTCCTGAACGA  1919
            .|||||||.|||||.|.||||||||||||.||.||...|||||||||.||||||||||..|||||||||||.||
Sbjct 1840  GTGGAGCCGCCCTTTAAGCCCAAAGTGAAATCCCCTTCAGACTACAGCAACTTTGACCCAGAGTTCCTGAATGA  1913

Query 1920  GAAGGCGCGCCTCTCCTACAGCGACAAGAACCTCATCGACTCCATGGACCAGTCTGCATTCGCTGGCTTCTCCT  1993
            |||..|.|..||.||||.|||.||||||||||||||||||||.|||||||||...||.|||..|||||||||||
Sbjct 1914  GAAACCTCAGCTTTCCTTCAGTGACAAGAACCTCATCGACTCTATGGACCAGGAAGCCTTCCATGGCTTCTCCT  1987

Query 1994  TTGTGAACCCCAAATTCGAGCACCTCCTGGAAGATG  2029
            |||||||.|||||.||.|||||..|||||||...| 
Sbjct 1988  TTGTGAATCCCAAGTTTGAGCAATTCCTGGACATT-  2022