Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000491986
- Subject:
- XR_002959550.1
- Aligned Length:
- 2554
- Identities:
- 1924
- Gaps:
- 626
Alignment
Query 1 ------------------------------------------------------------------------AT 2
||
Sbjct 1 GGCTGGGGCACAGGAATGAGGGAAAGGCAGCGCCTGCCCGAGAGGTCAGGGAGCCCCACTGCAGGCCCCACCAT 74
Query 3 GGCGCCGTTCCTGCGCATCGCCTTCAACTCCTATGAGCTGGGCTCCCTGCAGGCCGAGGACGAGGCGAACCAGC 76
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGCGCCGTTCCTGCGCATCGCCTTCAACTCCTATGAGCTGGGCTCCCTGCAGGCCGAGGACGAGGCGAACCAGC 148
Query 77 CCTTCTGTGCCGTGAAGATGAAGGAGGCGCTCAGCACAGAGCGTGGGAAAACACTGGTGCAGAAGAAGCCGACC 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCTTCTGTGCCGTGAAGATGAAGGAGGCGCTCAGCACAGAGCGTGGGAAAACACTGGTGCAGAAGAAGCCGACC 222
Query 151 ATGTATCCTGAGTGGAAGTCGACGTTCGATGCCCACATCTATGAGGGGCGCGTCATCCAGATTGTGCTAATGCG 224
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATGTATCCTGAGTGGAAGTCGACGTTCGATGCCCACATCTATGAGGGGCGCGTCATCCAGATTGTGCTAATGCG 296
Query 225 GGCAGCAGAGGAGCCAGTGTCTGAGGTGACCGTGGGTGTGTCGGTGCTGGCCGAGCGCTGCAAGAAGAACAATG 298
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGCAGCAGAGGAGCCAGTGTCTGAGGTGACCGTGGGTGTGTCGGTGCTGGCCGAGCGCTGCAAGAAGAACAATG 370
Query 299 GCAAGGCTGAGTTCTGGCTGGACCTGCAGCCTCAGGCCAAGGTGTTGATGTCTGTTCAGTATTTCCTGGAGGAC 372
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GCAAGGCTGAGTTCTGGCTGGACCTGCAGCCTCAGGCCAAGGTGTTGATGTCTGTTCAGTATTTCCTGGAGGAC 444
Query 373 GTGGATTGCAAACAGTCTATGCGCAGTGAGGACGAGGCCAAGTTCCCAACGATGAACCGCCGCGGAGCCATCAA 446
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GTGGATTGCAAACAGTCTATGCGCAGTGAGGACGAGGCCAAGTTCCCAACGATGAACCGCCGCGGAGCCATCAA 518
Query 447 ACAGGCCAAAATCCACTACATCAAGAACCATGAGTTTATCGCCACCTTCTTTGGGCAACCCACCTTCTGTTCTG 520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 ACAGGCCAAAATCCACTACATCAAGAACCATGAGTTTATCGCCACCTTCTTTGGGCAACCCACCTTCTGTTCTG 592
Query 521 TGTGCAAAGACTTTGTCTGGGGCCTCAACAAGCAAGGCTACAAATGCAGGCAATGTAACGCTGCCATCCACAAG 594
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGTGCAAAGACTTTGTCTGGGGCCTCAACAAGCAAGGCTACAAATGCAGGCAATGTAACGCTGCCATCCACAAG 666
Query 595 AAATGCATCGACAAGATCATCGGCAGATGCACTGGCACCGCGGCCAACAGCCGGGACACTATATTCCAGAAAGA 668
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAATGCATCGACAAGATCATCGGCAGATGCACTGGCACCGCGGCCAACAGCCGGGACACTATATTCCAGAAAGA 740
Query 669 ACGCTTCAACATCGACATGCCGCACCGCTTCAAGGTTCACAACTACATGAGCCCCACCTTCTGTGACCACTGCG 742
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ACGCTTCAACATCGACATGCCGCACCGCTTCAAGGTTCACAACTACATGAGCCCCACCTTCTGTGACCACTGCG 814
Query 743 GCAGCCTGCTCTGGGGACTGGTGAAGCAGGGATTAAAGTGTGAAGACTGCGGCATGAATGTGCACCATAAATGC 816
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GCAGCCTGCTCTGGGGACTGGTGAAGCAGGGATTAAAGTGTGAAGACTGCGGCATGAATGTGCACCATAAATGC 888
Query 817 CGGGAGAAGGTGGCCAACCTCTGCGGCATCAACCAGAAGCTTTTGGCTGAGGCCTTGAACCAAGTCACCCAGAG 890
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CGGGAGAAGGTGGCCAACCTCTGCGGCATCAACCAGAAGCTTTTGGCTGAGGCCTTGAACCAAGTCACCCAGAG 962
Query 891 AGCCTCCCGGAGATCAGACTCAGCCTCCTCAGAGCCTGTTGGGATATATCAGGGTTTCGAGAAGAAGACCGGAG 964
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGCCTCCCGGAGATCAGACTCAGCCTCCTCAGAGCCTGTTGGGATATATCAGGGTTTCGAGAAGAAGACCGGAG 1036
Query 965 TTGCTGGGGAGGACATGCAAGACAACAGTGGGACCTACGGCAAGATCTGGGAGGGCAGCAGCAAGTGCAACATC 1038
||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TTGCTGGGGAGGACATGC-------------------------------------------------------- 1054
Query 1039 AACAACTTCATCTTCCACAAGGTCCTGGGCAAAGGCAGCTTCGGGAAGGTGCTGCTTGGAGAGCTGAAGGGCAG 1112
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1055 ---------------------------------------------AAGGTGCTGCTTGGAGAGCTGAAGGGCAG 1083
Query 1113 AGGAGAGTACTTTGCCATCAAGGCCCTCAAGAAGGATGTGGTCCTGATCGACGACGACGTGGAGTGCACCATGG 1186
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1084 AGGAGAGTACTTTGCCATCAAGGCCCTCAAGAAGGATGTGGTCCTGATCGACGACGACGTGGAGTGCACCATGG 1157
Query 1187 TTGAGAAGCGGGTGCTGACACTTGCCGCAGAGAATCCCTTTCTCACCCACCTCATCTGCACCTTCCAGACCAAG 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1158 TTGAGAAGCGGGTGCTGACACTTGCCGCAGAGAATCCCTTTCTCACCCACCTCATCTGCACCTTCCAGACCAAG 1231
Query 1261 GACCACCTGTTCTTTGTGATGGAGTTCCTCAACGGGGGGGACCTGATGTACCACATCCAGGACAAAGGCCGCTT 1334
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1232 GACCACCTGTTCTTTGTGATGGAGTTCCTCAACGGGGGGGACCTGATGTACCACATCCAGGACAAAGGCCGCTT 1305
Query 1335 TGAACTCTACCGTGCCACGTTTTATGCCGCTGAGATAATGTGTGGACTGCAGTTTCTACACAGCAAGGGCATCA 1408
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1306 TGAACTCTACCGTGCCACGTTTTATGCCGCTGAGATAATGTGTGGACTGCAGTTTCTACACAGCAAGGGCATCA 1379
Query 1409 TTTACAGGGACCTCAAACTGGACAATGTGCTGTTGGACCGGGATGGCCACATCAAGATTGCCGACTTTGGGATG 1482
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380 TTTACAGGGACCTCAAACTGGACAATGTGCTGCTGGACCGGGATGGCCACATCAAGATTGCCGACTTTGGGATG 1453
Query 1483 TGCAAAGAGAACATATTCGGGGAGAGCCGGGCCAGCACCTTCTGCGGCACCCCTGACTATATCGCCCCTGAGAT 1556
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1454 TGCAAAGAGAACATATTCGGGGAGAGCCGGGCCAGCACCTTCTGCGGCACCCCTGACTATATCGCCCCTGAGAT 1527
Query 1557 CCTACAGGGCCTGAAGTACACATTCTCTGTGGACTGGTGGTCTTTCGGGGTCCTTCTGTACGAGATGCTCATTG 1630
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1528 CCTACAGGGCCTGAAGTACACATTCTCTGTGGACTGGTGGTCTTTCGGGGTCCTTCTGTACGAGATGCTCATTG 1601
Query 1631 GCCAGTCCCCCTTCCATGGTGATGATGAGGATGAACTCTTCGAGTCCATCCGTGTGGACACGCCACATTATCCC 1704
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1602 GCCAGTCCCCCTTCCATGGTGATGATGAGGATGAACTCTTCGAGTCCATCCGTGTGGACACGCCACATTATCCC 1675
Query 1705 CGCTGGATCACCAAGGAGTCCAAGGACATCCTGGAGAAGCTCTTTGAAAGGGAACCAACCAAGAGGCTGGGAGT 1778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1676 CGCTGGATCACCAAGGAGTCCAAGGACATCCTGGAGAAGCTCTTTGAAAGGGAACCAACCAAGAGGCTGGGAGT 1749
Query 1779 GACGGGAAACATCAAAATCCACCCCTTCTTCAAGACCATAAACTGGACTCTGCTGGAAAAGCGGAGGTTGGAGC 1852
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1750 GACCGGAAACATCAAAATCCACCCCTTCTTCAAGACCATAAACTGGACTCTGCTGGAAAAGCGGAGGTTGGAGC 1823
Query 1853 CACCCTTCAGGCCCAAAGTGAAGTCACCCAGAGACTACAGTAACTTTGACCAGGAGTTCCTGAACGAGAAGGCG 1926
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1824 CACCTTTCAGGCCCAAAGTGAAGTCACCCAGAGACTACAGTAACTTTGACCAGGAGTTCCTGAACGAGAAGGCG 1897
Query 1927 CGCCTCTCCTACAGCGACAAGAACCTCATCGACTCCATGGACCAGTCTGCATTCGCTGGCTTCTCCTTTGTGAA 2000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1898 CGCCTCTCCTACAGCGACAAGAACCTCATCGACTCCATGGACCAGTCTGCATTCGCTGGCTTCTCCTTTGTGAA 1971
Query 2001 CCCCAAATTCGAGCACCTCCTGGAAGATG--------------------------------------------- 2029
||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1972 CCCCAAATTCGAGCACCTCCTGGAAGATTGAGGTTCCTGGACAGATCAGGCTAGCCCTGCCCTCCACCCACACC 2045
Query 2030 -------------------------------------------------------------------------- 2029
Sbjct 2046 TGCCCGCTCCCCACGATAAGCACCAGTGGGACTGTGGTGACTTCTGCTGCTGGCCCCGCCCCTGCCCCCAGAGC 2119
Query 2030 -------------------------------------------------------------------------- 2029
Sbjct 2120 GTCCTTGGCTGCCGTCTGGCCGGGCTCTCATGGTACTTCCTCTGTGAACTGTGTGTGAATCTGCTTTTCCTCTG 2193
Query 2030 -------------------------------------------------------------------------- 2029
Sbjct 2194 CCTTCGGAGGGAAATTGTAAATCCTGTGTTTCATTACTTGAATGTAGTTATCTATTGAAAATATATATTATATA 2267
Query 2030 -------------------------------------------------------------------------- 2029
Sbjct 2268 CATAGACATATATATATATATAATAGGCTGTATATATTGCTCAGTAGAGAAAAACCATGGGGGACTGGTGATAT 2341
Query 2030 -------------------------------------------------------------------------- 2029
Sbjct 2342 GTTGATCTTTTTCAAAAAAATATATATATGACAAAAAAAAAAAAAAAGGAGCACAAGCTGTTTGAACCACCAGG 2415
Query 2030 -------------------------------------- 2029
Sbjct 2416 TTTATTTGTGTGTCTAAATAAACACCAAATAGTACCAA 2453