Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000492117
• Subject: NM_001310683.1
• Aligned Length: 1397
• Identities: 1040
• Gaps: 249

Alignment

Query    1  ATGAGCCTCCATTTCTTATACTACTGCAGTGAACCAACATTGGATGTGAAAATTGCCTTTTGTCAGGGATTCGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TAAACAAGTGGATGTGTCATATATTGCCAAACATTACAACATGAGCAAAAGCAAAGTTGACAACCAGTTCTACA  148
                                                    ||||||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------------------ATGAGCAAAAGCAAGGTGGACAACCAGTTCTACA  34

Query  149  GTGTGGAAGTGGGAGACTCAACCTTCACAGTTCTCAAGCGCTACCAGAATCTAAAGCCTATTGGCTCTGGGGCT  222
            |||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct   35  GTGTGGAAGTGGGGGACTCAACCTTCACCGTTCTTAAGCGCTACCAGAACCTGAAGCCAATTGGCTCTGGGGCT  108

Query  223  CAGGGCATAGTTTGTGCCGCGTATGATGCTGTCCTTGACAGAAATGTGGCCATTAAGAAGCTCAGCAGACCCTT  296
            |||||.|||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  109  CAGGGAATAGTCTGTGCTGCGTACGACGCTGTCCTTGACAGAAATGTGGCCATTAAGAAGCTCAGCAGACCCTT  182

Query  297  TCAGAACCAAACACATGCCAAGAGAGCGTACCGGGAGCTGGTCCTCATGAAGTGTGTGAACCATAAAAACATTA  370
            .|||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  183  CCAGAACCAAACTCACGCCAAGAGGGCTTACCGGGAGCTGGTCCTCATGAAGTGTGTGAACCATAAAAACATTA  256

Query  371  TTAGTTTATTAAATGTCTTCACACCCCAGAAAACGCTGGAGGAGTTCCAAGATGTTTACTTAGTAATGGAACTG  444
            ||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  257  TTAGCTTATTAAATGTTTTTACACCCCAGAAAACACTGGAGGAGTTCCAAGATGTCTACTTAGTGATGGAACTG  330

Query  445  ATGGATGCCAACTTATGTCAAGTGATTCAGATGGAATTAGACCATGAGCGAATGTCTTACCTGCTGTACCAAAT  518
            |||||.||||||.|.|||||.||||||||||||||..|.|||||.|||||.|||||||||.||||||||||.||
Sbjct  331  ATGGACGCCAACCTGTGTCAGGTGATTCAGATGGAGCTGGACCACGAGCGGATGTCTTACTTGCTGTACCAGAT  404

Query  519  GTTGTGTGGCATTAAGCACCTCCATTCTGCTGGAATTATTCACAGGGATTTAAAACCAAGTAACATTGTAGTCA  592
            |.||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  405  GCTGTGTGGCATCAAGCACCTCCACTCCGCTGGGATCATCCACAGGGACTTAAAACCCAGTAACATTGTAGTCA  478

Query  593  AGTCTGATTGCACATTGAAAATCCTGGACTTTGGACTGGCCAGGACAGCAGGCACAAGCTTCATGATGACTCCA  666
            ||||||||||||||.||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  479  AGTCTGATTGCACACTGAAAATCCTCGACTTCGGACTGGCCAGGACAGCGGGTACAAGCTTCATGATGACTCCG  552

Query  667  TATGTGGTGACACGTTATTACAGAGCCCCTGAGGTCATCCTGGGGATGGGCTACAAGGAGAACGTGGATATATG  740
            |||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  553  TATGTGGTGACGCGATATTACAGAGCCCCTGAGGTCATCCTGGGCATGGGCTACAAGGAGAACGTGGACATATG  626

Query  741  GTCTGTGGGATGCATTATGGGAGAAATGGTTCGCCACAAAATCCTCTTTCCAGGAAGGGACTATATTGACCAGT  814
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  627  GTCTGTGGGATGCATCATGGGAGAAATGGTTCGCCACAAAATCCTCTTTCCCGGAAGGGACTATATTGACCAGT  700

Query  815  GGAATAAGGTAATTGAACAACTAGGAACACCATGTCCAGAATTCATGAAGAAATTGCAACCCACAGTAAGAAAC  888
            ||||.||.||.||.||.||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct  701  GGAACAAAGTCATCGAGCAGCTAGGAACTCCGTGTCCAGAGTTCATGAAGAAATTGCAGCCCACAGTCAGAAAC  774

Query  889  TATGTGGAGAATCGGCCCAAGTATGCGGGACTCACCTTCCCCAAACTCTTCCCAGATTCCCTCTTCCCAGCAGA  962
            ||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct  775  TACGTGGAGAATCGGCCCAAGTACGCAGGACTCACCTTCCCCAAGCTCTTTCCAGATTCCCTCTTCCCAGCGGA  848

Query  963  CTCCGAGCACAATAAACTCAAAGCCAGCCAAGCCAGGGACTTGTTGTCAAAGATGCTAGTGATTGACCCAGCAA  1036
            .||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||.||||||||||||||||.|
Sbjct  849  TTCTGAGCACAATAAACTTAAAGCCAGCCAAGCCAGGGATTTGTTGTCTAAGATGTTAGTGATTGACCCAGCGA  922

Query 1037  AAAGAATATCAGTGGACGACGCCTTACAGCATCCCTACATCAACGTCTGGTATGACCCAGCCGAAGTGGAGGCG  1110
            |.||.|||||.|||||||||||..|.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct  923  AGAGGATATCGGTGGACGACGCACTGCAGCATCCGTACATCAACGTTTGGTACGACCCGGCTGAAGTGGAGGCG  996

Query 1111  CCTCCACCTCAGATATATGACAAGCAGTTGGATGAAAGAGAACACACAATTGAAGAATGGAAAGAACTTATCTA  1184
            |||||.||||||||||||||.||||||.||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  997  CCTCCGCCTCAGATATATGATAAGCAGCTGGATGAAAGGGAGCACACCATCGAAGAATGGAAAGAACTTATCTA  1070

Query 1185  CAAGGAAGTAATGAATTCAGAAGAAAAGACTAAAAATGGTGTAGTAAAAGGACAGCCTTCTCCTTCAGCACAGG  1258
            ||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.||||     ||||
Sbjct 1071  CAAGGAGGTAATGAACTCAGAAGAGAAGACTAAGAATGGCGTAGTCAAAGGCCAGCCCTCGCCTT-----CAGG  1139

Query 1259  TGCAGCAGG-----------------------------------------------------------------  1267
            ||||||||.                                                                 
Sbjct 1140  TGCAGCAGTGAACAGCAGTGAGAGTCTCCCTCCATCCTCGTCTGTCAACGACATCTCCTCCATGTCCACCGACC  1213

Query 1268  -----------------------------------------------------------------  1267
                                                                             
Sbjct 1214  AGACCCTCGCATCTGACACTGACAGCAGCCTGGAGGCCTCGGCGGGACCGTTGGGTTGTTGCAGG  1278