Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000492117
- Subject:
- NM_001323321.2
- Aligned Length:
- 1274
- Identities:
- 899
- Gaps:
- 129
Alignment
Query 1 ATGAGCCTCCATTTCTTATACTACTGCAGTGAACCAACATTGGATGTGAAAATTGCCTTTTGTCAGGGATTCGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TAAACAAGTGGATGTGTCATATATTGCCAAACATTACAACATGAGCAAAAGCAAAGTTGACAACCAGTTCTACA 148
|||||||.||||||...|||||||.|.||.||.|
Sbjct 1 ----------------------------------------ATGAGCAGAAGCAAGCGTGACAACAATTTTTATA 34
Query 149 GTGTGGAAGTGGGAGACTCAACCTTCACAGTTCTCAAGCGCTACCAGAATCTAAAGCCTATTGGCTCTGGGGCT 222
||||.||..|.|||||.||.||.||||||||.||.||.||.||.||||||.||||.|||||.|||||.||.|||
Sbjct 35 GTGTAGAGATTGGAGATTCTACATTCACAGTCCTGAAACGATATCAGAATTTAAAACCTATAGGCTCAGGAGCT 108
Query 223 CAGGGCATAGTTTGTGCCGCGTATGATGCTGTCCTTGACAGAAATGTGGCCATTAAGAAGCTCAGCAGACCCTT 296
||.||.|||||.||.||.||.||||||||..|.|||||.||||||||.||.||.||||||||.|||.||||.||
Sbjct 109 CAAGGAATAGTATGCGCAGCTTATGATGCCATTCTTGAAAGAAATGTTGCAATCAAGAAGCTAAGCCGACCATT 182
Query 297 TCAGAACCAAACACATGCCAAGAGAGCGTACCGGGAGCTGGTCCTCATGAAGTGTGTGAACCATAAAAACATTA 370
||||||.||.||.|||||||||.|.||.|||.|.|||||.||.||.|||||.|||||.||.||.|||||.||.|
Sbjct 183 TCAGAATCAGACTCATGCCAAGCGGGCCTACAGAGAGCTAGTTCTTATGAAATGTGTTAATCACAAAAATATAA 256
Query 371 TTAGTTTATTAAATGTCTTCACACCCCAGAAAACGCTGGAGGAGTTCCAAGATGTTTACTTAGTAATGGAACTG 444
||.|..|.||.|||||.||||||||.||||||.|.||.||.||.||.||||||||||||.||||.|||||.||.
Sbjct 257 TTGGCCTTTTGAATGTTTTCACACCACAGAAATCCCTAGAAGAATTTCAAGATGTTTACATAGTCATGGAGCTC 330
Query 445 ATGGATGCCAA-CTTATGTCAAGTGATTCAGATGGAATTAGACCATGAGCGAATGTCTTACCTGCTGTACCAAA 517
||||||||.|| ||| ||.|||||||||||||||||..||||.|||||..|||||||.|||||.||.||.||.|
Sbjct 331 ATGGATGCAAATCTT-TGCCAAGTGATTCAGATGGAGCTAGATCATGAAAGAATGTCCTACCTTCTCTATCAGA 403
Query 518 TGTTGTGTGGCATTAAGCACCTCCATTCTGCTGGAATTATTCACAGGGATTTAAAACCAAGTAACATTGTAGTC 591
||.|||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||..||||.|||||.||.|||||.||.|||||.
Sbjct 404 TGCTGTGTGGAATCAAGCACCTTCATTCTGCTGGAATTATTCATCGGGACTTAAAGCCCAGTAATATAGTAGTA 477
Query 592 AAGTCTGATTGCACATTGAAAATCCTGGACTTTGGACTGGCCAGGACAGCAGGCACAAGCTTCATGATGACTCC 665
||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||.||
Sbjct 478 AAATCTGATTGCACTTTGAAGATTCTTGACTTCGGTCTGGCCAGGACTGCAGGAACGAGTTTTATGATGACGCC 551
Query 666 ATATGTGGTGACACGTTATTACAGAGCCCCTGAGGTCATCCTGGGGATGGGCTACAAGGAGAACGTGGATATAT 739
.|||||.|||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.|
Sbjct 552 TTATGTAGTGACTCGCTACTACAGAGCACCCGAGGTCATCCTTGGCATGGGCTACAAGGAAAACGTTGACATTT 625
Query 740 GGTCTGTGGGATGCATTATGGGAGAAATGGTTCGCCACAAA------ATCCTCTTTCCAGGAAGGGACTATATT 807
||||.||.||.|||||.||||||||||||.| |||| .|..|.||.|||||.|..||..|||||
Sbjct 626 GGTCAGTTGGGTGCATCATGGGAGAAATGAT------CAAAGGTGGTGTTTTGTTCCCAGGTACAGATCATATT 693
Query 808 GACCAGTGGAATAAGGTAATTGAACAACTAGGAACACCATGTCCAGAATTCATGAAGAAATTGCAACCCACAGT 881
||.|||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||.|||||
Sbjct 694 GATCAGTGGAATAAAGTTATTGAACAGCTTGGAACACCATGTCCTGAATTCATGAAGAAACTGCAACCAACAGT 767
Query 882 AAGAAACTATGTGGAGAATCGGCCCAAGTATGCGGGACTCACCTTCCCCAAACTCTTCCCAGATTCCCTCTTCC 955
|||.|..||.||.||.||..|.||.||.|||||.|||...|.|||....|||||||||||.|||..|||.||||
Sbjct 768 AAGGACTTACGTTGAAAACAGACCTAAATATGCTGGATATAGCTTTGAGAAACTCTTCCCTGATGTCCTTTTCC 841
Query 956 CAGCAGACTCCGAGCACAATAAACTCAAAGCCAGCCAAGCCAGGGACTTGTTGTCAAAGATGCTAGTGATTGAC 1029
||||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||.||.||.|||||.|||||.||.||.|||||.||.||.||.
Sbjct 842 CAGCTGACTCAGAACACAACAAACTTAAAGCCAGTCAGGCAAGGGATTTGTTATCCAAAATGCTGGTAATAGAT 915
Query 1030 CCAGCAAAAAGAATATCAGTGGACGACGCCTTACAGCATCCCTACATCAACGTCTGGTATGACCCAGCCGAAGT 1103
.||.|.|||||.||.||.||.||.||.||..|.||.||.||.||||||||.|||||||||||.||..|.||||.
Sbjct 916 GCATCTAAAAGGATCTCTGTAGATGAAGCTCTCCAACACCCGTACATCAATGTCTGGTATGATCCTTCTGAAGC 989
Query 1104 GGAGGCGCCTCCACCTCAGATATATGACAAGCAGTTGGATGAAAGAGAACACACAATTGAAGAATGGAAAGAAC 1177
.||.||.||.|||||..||||...||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||.
Sbjct 990 AGAAGCTCCACCACCAAAGATCCCTGACAAGCAGTTAGATGAAAGGGAACACACAATAGAAGAGTGGAAAGAAT 1063
Query 1178 TTATCTACAAGGAAGTAATGAATTCAGAAGAAAAGACTAAAAATGGTGTAGTAAAAGGACAGCCTTCTCCTTCA 1251
|.||.||.||||||||.|||.|.|..||.||.|..||.||.|||||.||..||...||.|||||.|||||||.|
Sbjct 1064 TGATATATAAGGAAGTTATGGACTTGGAGGAGAGAACCAAGAATGGAGTTATACGGGGGCAGCCCTCTCCTTTA 1137
Query 1252 GCACAGGTGCAGCAGG 1267
|||||||||||||||
Sbjct 1138 GCACAGGTGCAGCAG- 1152