Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000492117
• Subject: XM_006534950.4
• Aligned Length: 1274
• Identities: 1135
• Gaps: 15

Alignment

Query    1  ATGAGCCTCCATTTCTTATACTACTGCAGTGAACCAACATTGGATGTGAAAATTGCCTTTTGTCAGGGATTCGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGCCTCCATTTCTTATACTACTGCAGTGAACCAACCTTGGATGTGAAAATTGCCTTTTGTCAGGGATTCGA  74

Query   75  TAAACAAGTGGATGTGTCATATATTGCCAAACATTACAACATGAGCAAAAGCAAAGTTGACAACCAGTTCTACA  148
            ||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct   75  TAAACACGTGGATGTGTCATCTATTGCCAAACATTACAACATGAGCAAAAGCAAGGTGGACAACCAGTTCTACA  148

Query  149  GTGTGGAAGTGGGAGACTCAACCTTCACAGTTCTCAAGCGCTACCAGAATCTAAAGCCTATTGGCTCTGGGGCT  222
            |||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct  149  GTGTGGAAGTGGGGGACTCAACCTTCACCGTTCTTAAGCGCTACCAGAACCTGAAGCCAATTGGCTCTGGGGCT  222

Query  223  CAGGGCATAGTTTGTGCCGCGTATGATGCTGTCCTTGACAGAAATGTGGCCATTAAGAAGCTCAGCAGACCCTT  296
            |||||.|||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGGGAATAGTCTGTGCTGCGTACGACGCTGTCCTTGACAGAAATGTGGCCATTAAGAAGCTCAGCAGACCCTT  296

Query  297  TCAGAACCAAACACATGCCAAGAGAGCGTACCGGGAGCTGGTCCTCATGAAGTGTGTGAACCATAAAAACATTA  370
            .|||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCAGAACCAAACTCACGCCAAGAGGGCTTACCGGGAGCTGGTCCTCATGAAGTGTGTGAACCATAAAAACATTA  370

Query  371  TTAGTTTATTAAATGTCTTCACACCCCAGAAAACGCTGGAGGAGTTCCAAGATGTTTACTTAGTAATGGAACTG  444
            ||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  371  TTAGCTTATTAAATGTTTTTACACCCCAGAAAACACTGGAGGAGTTCCAAGATGTCTACTTAGTGATGGAACTG  444

Query  445  ATGGATGCCAACTTATGTCAAGTGATTCAGATGGAATTAGACCATGAGCGAATGTCTTACCTGCTGTACCAAAT  518
            |||||.||||||.|.|||||.||||||||||||||..|.|||||.|||||.|||||||||.||||||||||.||
Sbjct  445  ATGGACGCCAACCTGTGTCAGGTGATTCAGATGGAGCTGGACCACGAGCGGATGTCTTACTTGCTGTACCAGAT  518

Query  519  GTTGTGTGGCATTAAGCACCTCCATTCTGCTGGAATTATTCACAGGGATTTAAAACCAAGTAACATTGTAGTCA  592
            |.||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTGTGTGGCATCAAGCACCTCCACTCCGCTGGGATCATCCACAGGGACTTAAAACCCAGTAACATTGTAGTCA  592

Query  593  AGTCTGATTGCACATTGAAAATCCTGGACTTTGGACTGGCCAGGACAGCAGGCACAAGCTTCATGATGACTCCA  666
            ||||||||||||||.||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  593  AGTCTGATTGCACACTGAAAATCCTCGACTTCGGACTGGCCAGGACAGCGGGTACAAGCTTCATGATGACTCCG  666

Query  667  TATGTGGTGACACGTTATTACAGAGCCCCTGAGGTCATCCTGGGGATGGGCTACAAGGAGAACGTGGATATATG  740
            |||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||..|.||
Sbjct  667  TATGTGGTGACGCGATATTACAGAGCCCCTGAGGTCATCCTGGGCATGGGCTACAAGGAGAACGTTGACCTGTG  740

Query  741  GTCTGTGGGATGCATTATGGGAGAAATGGTTCGCCACAAAA-------TCCTCTTTCCAGGAAGGGACTATATT  807
            |||.||.||.|||||.||||||||||||||       ||||       |.||.||.||.||.|..||..|||||
Sbjct  741  GTCAGTAGGGTGCATCATGGGAGAAATGGT-------AAAAGGCACAGTGCTGTTCCCTGGCACTGATCATATT  807

Query  808  GACCAGTGGAATAAGGTAATTGAACAACTAGGAACACCATGTCCAGAATTCATGAAGAAATTGCAACCCACAGT  881
            |||||||||||.||.||.||.||.||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  808  GACCAGTGGAACAAAGTCATCGAGCAGCTAGGAACTCCGTGTCCAGAGTTCATGAAGAAATTGCAGCCCACAGT  881

Query  882  AAGAAACTATGTGGAGAATCGGCCCAAGTATGCGGGACTCACCTTCCCCAAACTCTTCCCAGATTCCCTCTTCC  955
            .||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  882  CAGAAACTACGTGGAGAATCGGCCCAAGTACGCAGGACTCACCTTCCCCAAGCTCTTTCCAGATTCCCTCTTCC  955

Query  956  CAGCAGACTCCGAGCACAATAAACTCAAAGCCAGCCAAGCCAGGGACTTGTTGTCAAAGATGCTAGTGATTGAC  1029
            ||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||.|||||||||||
Sbjct  956  CAGCGGATTCTGAGCACAATAAACTTAAAGCCAGCCAAGCCAGGGATTTGTTGTCTAAGATGTTAGTGATTGAC  1029

Query 1030  CCAGCAAAAAGAATATCAGTGGACGACGCCTTACAGCATCCCTACATCAACGTCTGGTATGACCCAGCCGAAGT  1103
            |||||.||.||.|||||.|||||||||||..|.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||
Sbjct 1030  CCAGCGAAGAGGATATCGGTGGACGACGCACTGCAGCATCCGTACATCAACGTTTGGTACGACCCGGCTGAAGT  1103

Query 1104  GGAGGCGCCTCCACCTCAGATATATGACAAGCAGTTGGATGAAAGAGAACACACAATTGAAGAATGGAAAGAAC  1177
            ||||||||||||.||||||||||||||.||||||.||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 1104  GGAGGCGCCTCCGCCTCAGATATATGATAAGCAGCTGGATGAAAGGGAGCACACCATCGAAGAATGGAAAGAAC  1177

Query 1178  TTATCTACAAGGAAGTAATGAATTCAGAAGAAAAGACTAAAAATGGTGTAGTAAAAGGACAGCCTTCTCCTTCA  1251
            |||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||
Sbjct 1178  TTATCTACAAGGAGGTAATGAACTCAGAAGAGAAGACTAAGAATGGCGTAGTCAAAGGCCAGCCCTCGCCTTCA  1251

Query 1252  GCACAGGTGCAGCAGG  1267
            ||||||||||||||| 
Sbjct 1252  GCACAGGTGCAGCAG-  1266