Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000492117
- Subject:
- XM_017008449.2
- Aligned Length:
- 1404
- Identities:
- 802
- Gaps:
- 584
Alignment
Query 1 ATGAGCCTCCATTTCTTATACTACTGCAGTGAACCAACATTGGATGTGAAAATTGCCTTTTGTCAGGGATTCGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TAAACAAGTGGATGTGTCATATATTGCCAAACATTACAACATGAGCAAAAGCAAAGTTGACAACCAGTTCTACA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GTGTGGAAGTGGGAGACTCAACCTTCACAGTTCTCAAGCGCTACCAGAATCTAAAGCCTATTGGCTCTGGGGCT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CAGGGCATAGTTTGTGCCGCGTATGATGCTGTCCTTGACAGAAATGTGGCCATTAAGAAGCTCAGCAGACCCTT 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 TCAGAACCAAACACATGCCAAGAGAGCGTACCGGGAGCTGGTCCTCATGAAGTGTGTGAACCATAAAAACATTA 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 TTAGTTTATTAAATGTCTTCACACCCCAGAAAACGCTGGAGGAGTTCCAAGATGTTTACTTAGTAATGGAACTG 444
|||||||||
Sbjct 1 -----------------------------------------------------------------ATGGAACTG 9
Query 445 ATGGATGCCAACTTATGTCAAGTGATTCAGATGGAATTAGACCATGAGCGAATGTCTTACCTGCTGTACCAAAT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 10 ATGGATGCCAACTTATGTCAAGTGATTCAGATGGAATTAGACCATGAGCGAATGTCTTACCTGCTGTACCAAAT 83
Query 519 GTTGTGTGGCATTAAGCACCTCCATTCTGCTGGAATTATTCACAGGGATTTAAAACCAAGTAACATTGTAGTCA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 84 GTTGTGTGGCATTAAGCACCTCCATTCTGCTGGAATTATTCACAGGGATTTAAAACCAAGTAACATTGTAGTCA 157
Query 593 AGTCTGATTGCACATTGAAAATCCTGGACTTTGGACTGGCCAGGACAGCAGGCACAAGCTTCATGATGACTCCA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 158 AGTCTGATTGCACATTGAAAATCCTGGACTTTGGACTGGCCAGGACAGCAGGCACAAGCTTCATGATGACTCCA 231
Query 667 TATGTGGTGACACGTTATTACAGAGCCCCTGAGGTCATCCTGGGGATGGGCTACAAGGAGAACGTGGATATATG 740
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 232 TATGTGGTGACACGTTATTACAGAGCCCCTGAGGTCATCCTGGGGATGGGCTACAAGGAGAACGTTGACATGTG 305
Query 741 GTCTGTGGGATGCATTATGGGAGAAATGGTTCGCCACAAAA-------TCCTCTTTCCAGGAAGGGACTATATT 807
|||.||.||.|||||.|||||||||||| |.|||| |.||.|||||.||.|..||..|||||
Sbjct 306 GTCAGTAGGGTGCATCATGGGAGAAATG-------ATAAAAGGTGCAGTGCTGTTTCCTGGCACTGATCATATT 372
Query 808 GACCAGTGGAATAAGGTAATTGAACAACTAGGAACACCATGTCCAGAATTCATGAAGAAATTGCAACCCACAGT 881
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 373 GACCAGTGGAATAAGGTAATTGAACAACTAGGAACACCATGTCCAGAATTCATGAAGAAATTGCAACCCACAGT 446
Query 882 AAGAAACTATGTGGAGAATCGGCCCAAGTATGCGGGACTCACCTTCCCCAAACTCTTCCCAGATTCCCTCTTCC 955
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 447 AAGAAACTATGTGGAGAATCGGCCCAAGTATGCGGGACTCACCTTCCCCAAACTCTTCCCAGATTCCCTCTTCC 520
Query 956 CAGCAGACTCCGAGCACAATAAACTCAAAGCCAGCCAAGCCAGGGACTTGTTGTCAAAGATGCTAGTGATTGAC 1029
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 521 CAGCGGACTCCGAGCACAATAAACTCAAAGCCAGCCAAGCCAGGGACTTGTTGTCAAAGATGCTAGTGATTGAC 594
Query 1030 CCAGCAAAAAGAATATCAGTGGACGACGCCTTACAGCATCCCTACATCAACGTCTGGTATGACCCAGCCGAAGT 1103
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 595 CCAGCAAAAAGAATATCAGTGGACGACGCCTTACAGCATCCCTACATCAACGTCTGGTATGACCCAGCCGAAGT 668
Query 1104 GGAGGCGCCTCCACCTCAGATATATGACAAGCAGTTGGATGAAAGAGAACACACAATTGAAGAATGGAAAGAAC 1177
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 669 GGAGGCGCCTCCACCTCAGATATATGACAAGCAGTTGGATGAAAGAGAACACACAATTGAAGAATGGAAAGAAC 742
Query 1178 TTATCTACAAGGAAGTAATGAATTCAGAAGAAAAGACTAAAAATGGTGTAGTAAAAGGACAGCCTTCTCCTTCA 1251
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 743 TTATCTACAAGGAAGTAATGAATTCAGAAGAAAAGACTAAAAATGGTGTAGTAAAAGGACAGCCTTCTCCTT-- 814
Query 1252 GCACAGGTGCAGCAGG---------------------------------------------------------- 1267
||||||||||||.
Sbjct 815 ---CAGGTGCAGCAGTGAACAGCAGTGAGAGTCTCCCTCCATCCTCGTCTGTCAATGACATCTCCTCCATGTCC 885
Query 1268 ------------------------------------------------------------------------ 1267
Sbjct 886 ACCGACCAGACCCTGGCATCTGACACTGACAGCAGCCTGGAAGCCTCGGCAGGACCCCTGGGTTGTTGCAGG 957