Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000492117
• Subject: XM_030254518.1
• Aligned Length: 1404
• Identities: 916
• Gaps: 371

Alignment

Query    1  ATGAGCCTCCATTTCTTATACTACTGCAGTGAACCAACATTGGATGTGAAAATTGCCTTTTGTCAGGGATTCGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TAAACAAGTGGATGTGTCATATATTGCCAAACATTACAACATGAGCAAAAGCAAAGTTGACAACCAGTTCTACA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GTGTGGAAGTGGGAGACTCAACCTTCACAGTTCTCAAGCGCTACCAGAATCTAAAGCCTATTGGCTCTGGGGCT  222
                                                              .|.||..|        ||||    
Sbjct    1  --------------------------------------------------ATGAACAC--------CTGG----  12

Query  223  CAGGGCATAGTTTGTGCCGCGTATGATGCTGTCCTTGACAGAAATGTGGCCATTAAGAAGCTCAGCAGACCCTT  296
                        .||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   13  ------------AGTGCTGCGTACGACGCTGTCCTTGACAGAAATGTGGCCATTAAGAAGCTCAGCAGACCCTT  74

Query  297  TCAGAACCAAACACATGCCAAGAGAGCGTACCGGGAGCTGGTCCTCATGAAGTGTGTGAACCATAAAAACATTA  370
            .|||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCAGAACCAAACTCACGCCAAGAGGGCTTACCGGGAGCTGGTCCTCATGAAGTGTGTGAACCATAAAAACATTA  148

Query  371  TTAGTTTATTAAATGTCTTCACACCCCAGAAAACGCTGGAGGAGTTCCAAGATGTTTACTTAGTAATGGAACTG  444
            ||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  149  TTAGCTTATTAAATGTTTTTACACCCCAGAAAACACTGGAGGAGTTCCAAGATGTCTACTTAGTGATGGAACTG  222

Query  445  ATGGATGCCAACTTATGTCAAGTGATTCAGATGGAATTAGACCATGAGCGAATGTCTTACCTGCTGTACCAAAT  518
            |||||.||||||.|.|||||.||||||||||||||..|.|||||.|||||.|||||||||.||||||||||.||
Sbjct  223  ATGGACGCCAACCTGTGTCAGGTGATTCAGATGGAGCTGGACCACGAGCGGATGTCTTACTTGCTGTACCAGAT  296

Query  519  GTTGTGTGGCATTAAGCACCTCCATTCTGCTGGAATTATTCACAGGGATTTAAAACCAAGTAACATTGTAGTCA  592
            |.||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  297  GCTGTGTGGCATCAAGCACCTCCACTCCGCTGGGATCATCCACAGGGACTTAAAACCCAGTAACATTGTAGTCA  370

Query  593  AGTCTGATTGCACATTGAAAATCCTGGACTTTGGACTGGCCAGGACAGCAGGCACAAGCTTCATGATGACTCCA  666
            ||||||||||||||.||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  371  AGTCTGATTGCACACTGAAAATCCTCGACTTCGGACTGGCCAGGACAGCGGGTACAAGCTTCATGATGACTCCG  444

Query  667  TATGTGGTGACACGTTATTACAGAGCCCCTGAGGTCATCCTGGGGATGGGCTACAAGGAGAACGTGGATATATG  740
            |||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||..|.||
Sbjct  445  TATGTGGTGACGCGATATTACAGAGCCCCTGAGGTCATCCTGGGCATGGGCTACAAGGAGAACGTTGACCTGTG  518

Query  741  GTCTGTGGGATGCATTATGGGAGAAATGGTTCGCCACAAAA-------TCCTCTTTCCAGGAAGGGACTATATT  807
            |||.||.||.|||||.||||||||||||||       ||||       |.||.||.||.||.|..||..|||||
Sbjct  519  GTCAGTAGGGTGCATCATGGGAGAAATGGT-------AAAAGGCACAGTGCTGTTCCCTGGCACTGATCATATT  585

Query  808  GACCAGTGGAATAAGGTAATTGAACAACTAGGAACACCATGTCCAGAATTCATGAAGAAATTGCAACCCACAGT  881
            |||||||||||.||.||.||.||.||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  586  GACCAGTGGAACAAAGTCATCGAGCAGCTAGGAACTCCGTGTCCAGAGTTCATGAAGAAATTGCAGCCCACAGT  659

Query  882  AAGAAACTATGTGGAGAATCGGCCCAAGTATGCGGGACTCACCTTCCCCAAACTCTTCCCAGATTCCCTCTTCC  955
            .||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  660  CAGAAACTACGTGGAGAATCGGCCCAAGTACGCAGGACTCACCTTCCCCAAGCTCTTTCCAGATTCCCTCTTCC  733

Query  956  CAGCAGACTCCGAGCACAATAAACTCAAAGCCAGCCAAGCCAGGGACTTGTTGTCAAAGATGCTAGTGATTGAC  1029
            ||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||.|||||||||||
Sbjct  734  CAGCGGATTCTGAGCACAATAAACTTAAAGCCAGCCAAGCCAGGGATTTGTTGTCTAAGATGTTAGTGATTGAC  807

Query 1030  CCAGCAAAAAGAATATCAGTGGACGACGCCTTACAGCATCCCTACATCAACGTCTGGTATGACCCAGCCGAAGT  1103
            |||||.||.||.|||||.|||||||||||..|.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||
Sbjct  808  CCAGCGAAGAGGATATCGGTGGACGACGCACTGCAGCATCCGTACATCAACGTTTGGTACGACCCGGCTGAAGT  881

Query 1104  GGAGGCGCCTCCACCTCAGATATATGACAAGCAGTTGGATGAAAGAGAACACACAATTGAAGAATGGAAAGAAC  1177
            ||||||||||||.||||||||||||||.||||||.||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||
Sbjct  882  GGAGGCGCCTCCGCCTCAGATATATGATAAGCAGCTGGATGAAAGGGAGCACACCATCGAAGAATGGAAAGAAC  955

Query 1178  TTATCTACAAGGAAGTAATGAATTCAGAAGAAAAGACTAAAAATGGTGTAGTAAAAGGACAGCCTTCTCCTTCA  1251
            |||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.||||  
Sbjct  956  TTATCTACAAGGAGGTAATGAACTCAGAAGAGAAGACTAAGAATGGCGTAGTCAAAGGCCAGCCCTCGCCTT--  1027

Query 1252  GCACAGGTGCAGCAGG----------------------------------------------------------  1267
               ||||||||||||.                                                          
Sbjct 1028  ---CAGGTGCAGCAGTGAACAGCAGTGAGAGTCTCCCTCCATCCTCGTCTGTCAACGACATCTCCTCCATGTCC  1098

Query 1268  ------------------------------------------------------------------------  1267
                                                                                    
Sbjct 1099  ACCGACCAGACCCTCGCATCTGACACTGACAGCAGCCTGGAGGCCTCGGCGGGACCGTTGGGTTGTTGCAGG  1170