Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000492269
• Subject: XM_006710827.4
• Aligned Length: 1321
• Identities: 1058
• Gaps: 263

Alignment

Query    1  ATGGGACTCTTGGTATTTGTGCGCAATCTGCTGCTAGCCCTCTGCCTCTTTCTGGTACTGGGATTTTTGTATTA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGACTCTTGGTATTTGTGCGCAATCTGCTGCTAGCCCTCTGCCTCTTTCTGGTACTGGGATTTTTGTATTA  74

Query   75  TTCTGCGTGGAAGCTACACTTACTCCAGTGGGAGGAGGACTCCAATTCAGTGGTTCTTTCCTTTGACTCCGCTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                              
Sbjct   75  TTCTGCGTGGAAGCTACACTTACTCCAGTGGGAGGAGGACTCCA------------------------------  118

Query  149  GACAAACACTAGGCTCAGAGTATGATCGGTTGGGCTTCCTCCTGAATCTGGACTCTAAACTGCCTGCTGAATTA  222
                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  119  ------------------AGTATGATCGGTTGGGCTTCCTCCTGAATCTGGACTCTAAACTGCCTGCTGAATTA  174

Query  223  GCCACCAAGTACGCAAACTTTTCAGAGGGAGCTTGCAAGCCTGGCTATGCTTCAGCCTTGATGACGGCCATCTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  175  GCCACCAAGTACGCAAACTTTTCAGAGGGAGCTTGCAAGCCTGGCTATGCTTCAGCCTTGATGACGGCCATCTT  248

Query  297  CCCCCGGTTCTCCAAGCCAGCACCCATGTTCCTGGATGACTCCTTTCGCAAGTGGGCTAGAATCCGGGAGTTCG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  249  CCCCCGGTTCTCCAAGCCAGCACCCATGTTCCTGGATGACTCCTTTCGCAAGTGGGCTAGAATCCGGGAGTTCG  322

Query  371  TGCCGCCTTTTGGGATCAAAGGTCAAGACAATCTGATCAAAGCCATCTTGTCAGTCACCAAAGAGTACCGCCTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  323  TGCCGCCTTTTGGGATCAAAGGTCAAGACAATCTGATCAAAGCCATCTTGTCAGTCACCAAAGAGTACCGCCTG  396

Query  445  ACCCCTGCCTTGGACAGCCTCCGCTGCCGCCGCTGCATCATCGTGGGCAATGGAGGCGTTCTTGCCAACAAGTC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  397  ACCCCTGCCTTGGACAGCCTCCGCTGCCGCCGCTGCATCATCGTGGGCAATGGAGGCGTTCTTGCCAACAAGTC  470

Query  519  TCTGGGGTCACGAATTGACGACTATGACATTGTGGTGAGACTGAATTCAGCACCAGTGAAAGGCTTTGAGAAGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  471  TCTGGGGTCACGAATTGACGACTATGACATTGTGGTGAGACTGAATTCAGCACCAGTGAAAGGCTTTGAGAAGG  544

Query  593  ACGTGGGCAGCAAAACGACACTGCGCATCACCTACCCCGAGGGCGCCATGCAGCGGCCTGAGCAGTACGAGCGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  545  ACGTGGGCAGCAAAACGACACTGCGCATCACCTACCCCGAGGGCGCCATGCAGCGGCCTGAGCAGTACGAGCGC  618

Query  667  GATTCTCTCTTTGTCCTCGCCGGCTTCAAGTGGCAGGACTTTAAGTGGTTGAAATACATCGTCTACAAGGAGAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  619  GATTCTCTCTTTGTCCTCGCCGGCTTCAAGTGGCAGGACTTTAAGTGGTTGAAATACATCGTCTACAAGGAGAG  692

Query  741  AGTGAGTGCATCGGATGGCTTCTGGAAATCTGTGGCCACTCGAGTGCCCAAGGAGCCCCCTGAGATTCGAATCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  693  AGTGAGTGCATCGGATGGCTTCTGGAAATCTGTGGCCACTCGAGTGCCCAAGGAGCCCCCTGAGATTCGAATCC  766

Query  815  TCAACCCATATTTCATCCAGGAGGCCGCCTTCACCCTCATTGGCCTGCCCTTCAACAATGGCCTCATGGGCCGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  767  TCAACCCATATTTCATCCAGGAGGCCGCCTTCACCCTCATTGGCCTGCCCTTCAACAATGGCCTCATGGGCCGG  840

Query  889  GGGAACATCCCTACCCTTGGCAGTGTGGCAGTGACCATGGCACTACACGGCTGTGACGAGGTGGCAGTCGCAGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841  GGGAACATCCCTACCCTTGGCAGTGTGGCAGTGACCATGGCACTACACGGCTGTGACGAGGTGGCAGTCGCAGG  914

Query  963  ATTTGGCTATGACATGAGCACACCCAACGCACCCCTGCACTACTATGAGACCGTTCGCATGGCAGCCATCAAAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  915  ATTTGGCTATGACATGAGCACACCCAACGCACCCCTGCACTACTATGAGACCGTTCGCATGGCAGCCATCAAAG  988

Query 1037  AG------------------------------------------------------------------------  1038
            ||                                                                        
Sbjct  989  AGCCAAGACCCCATGTGGAAAATCTGAACCCTTCTGAACTCCGCTTGCCACACTTCTGCTTTGACCACCAGCCT  1062

Query 1039  --------------------------------------------------------------------------  1038
                                                                                      
Sbjct 1063  TCCACTGATCCCAGCCTGAAACCTGGAAATCTTGGGCCAGTTCTTCAACAGCTTCTCTGCTGCTACATCTGGGT  1136

Query 1039  --------------------------------------------------TCCTGGACGCACAATATCCAGCGA  1062
                                                              ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1137  GATGGGAGGTTGTTGGAGGGAACCTCCCATCTGTGCAGATTCCTGTTTCTTCCTGGACGCACAATATCCAGCGA  1210

Query 1063  GAGAAAGAGTTTCTGCGGAAGCTGGTGAAAGCTCGCGTCATCACTGATCTAAGCAGTGGCATC  1125
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   
Sbjct 1211  GAGAAAGAGTTTCTGCGGAAGCTGGTGAAAGCTCGCGTCATCAC-------------------  1254