Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000492351
• Subject: NM_153047.4
• Aligned Length: 1643
• Identities: 1539
• Gaps: 72

Alignment

Query    1  ATGGGCTGTGTGCAATGTAAGGATAAAGAAGCAACAAAACTGACGGAGGAGAGGGACGGCAGCCTGAACCAGAG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCTGTGTGCAATGTAAGGATAAAGAAGCAACAAAACTGACGGAGGAGAGGGACGGCAGCCTGAACCAGAG  74

Query   75  CTCTGGGTACCGCTATGGCACAGACCCCACCCCTCAGCACTACCCCAGCTTCGGTGTGACCTCCATCCCCAACT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCTGGGTACCGCTATGGCACAGACCCCACCCCTCAGCACTACCCCAGCTTCGGTGTGACCTCCATCCCCAACT  148

Query  149  ACAACAACTTCCACGCAGCCGGGGGCCAAGGACTCACCGTCTTTGGAGGTGTGAACTCTTCGTCTCATACGGGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACAACAACTTCCACGCAGCCGGGGGCCAAGGACTCACCGTCTTTGGAGGTGTGAACTCTTCGTCTCATACGGGG  222

Query  223  ACCTTGCGTACGAGAGGAGGAACAGGAGTGACACTCTTTGTGGCCCTTTATGACTATGAAGCACGGACAGAAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACCTTGCGTACGAGAGGAGGAACAGGAGTGACACTCTTTGTGGCCCTTTATGACTATGAAGCACGGACAGAAGA  296

Query  297  TGACCTGAGTTTTCACAAAGGAGAAAAATTTCAAATATTGAACAGCTCGGAAGGAGATTGGTGGGAAGCCCGCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGACCTGAGTTTTCACAAAGGAGAAAAATTTCAAATATTGAACAGCTCGGAAGGAGATTGGTGGGAAGCCCGCT  370

Query  371  CCTTGACAACTGGAGAGACAGGTTACATTCCCAGCAATTATGTGGCTCCAGTTGACTCTATCCAGGCAGAAGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCTTGACAACTGGAGAGACAGGTTACATTCCCAGCAATTATGTGGCTCCAGTTGACTCTATCCAGGCAGAAGAG  444

Query  445  TGGTACTTTGGAAAACTTGGCCGAAAAGATGCTGAGCGACAGCTATTGTCCTTTGGAAACCCAAGAGGTACCTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGGTACTTTGGAAAACTTGGCCGAAAAGATGCTGAGCGACAGCTATTGTCCTTTGGAAACCCAAGAGGTACCTT  518

Query  519  TCTTATCCGCGAGAGTGAAACCACCAAAGGTGCCTATTCACTTTCTATCCGTGATTGGGATGATATGAAAGGAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCTTATCCGCGAGAGTGAAACCACCAAAGGTGCCTATTCACTTTCTATCCGTGATTGGGATGATATGAAAGGAG  592

Query  593  ACCATGTCAAACATTATAAAATTCGCAAACTTGACAATGGTGGATACTACATTACCACCCGGGCCCAGTTTGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACCATGTCAAACATTATAAAATTCGCAAACTTGACAATGGTGGATACTACATTACCACCCGGGCCCAGTTTGAA  666

Query  667  ACACTTCAGCAGCTTGTACAACATTACTCAGAGAGAGCTGCAGGT----------------CTCTGCTGCCGCC  724
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||..|||                ||.||.|..|..|
Sbjct  667  ACACTTCAGCAGCTTGTACAACATTACTCAGAGAAAGCTGATGGTTTGTGTTTTAACTTAACTGTGATTGCATC  740

Query  725  TAGTAGTTCCCTGTCACAAAGGGATGCCAAGGCTTACCGATCTGTCTGTCAAAACCAAAGATGTCTGGGAAATC  798
            .|||.||.|||   ||||||            |||...||| ||.||         |||||||..||||||.| 
Sbjct  741  GAGTTGTACCC---CACAAA------------CTTCTGGAT-TGGCT---------AAAGATGCTTGGGAAGT-  788

Query  799  CCTCGAGAATCCCTGCA-GTTGATC-------------AAGAGACTGGGAAATGGGCAGTTT-GGGGAAGTATG  857
                         |||| ||.|.||             ||||..|||||..| |||..|||| |..|||||.||
Sbjct  789  -------------TGCACGTCGTTCGTTGTGTCTGGAGAAGAAGCTGGGTCA-GGGGTGTTTCGCTGAAGTGTG  848

Query  858  GATGGGTACCTGGAATGGAAACACAAAAGTAGCCATAAAGACTCTTAAACCAGGCACAATGTCCCCCGAATCAT  931
            |.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  849  GCTTGGTACCTGGAATGGAAACACAAAAGTAGCCATAAAGACTCTTAAACCAGGCACAATGTCCCCCGAATCAT  922

Query  932  TCCTTGAGGAAGCGCAGATCATGAAGAAGCTGAAGCACGACAAGCTGGTCCAGCTCTATGCAGTGGTGTCTGAG  1005
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  923  TCCTTGAGGAAGCGCAGATCATGAAGAAGCTGAAGCACGACAAGCTGGTCCAGCTCTATGCAGTGGTGTCTGAG  996

Query 1006  GAGCCCATCTACATCGTCACCGAGTATATGAACAAAGGAAGTTTACTGGATTTCTTAAAAGATGGAGAAGGAAG  1079
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  997  GAGCCCATCTACATCGTCACCGAGTATATGAACAAAGGAAGTTTACTGGATTTCTTAAAAGATGGAGAAGGAAG  1070

Query 1080  AGCTCTGAAATTACCAAATCTTGTGGACATGGCAGCACAGGTGGCTGCAGGAATGGCTTACATCGAGCGCATGA  1153
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1071  AGCTCTGAAATTACCAAATCTTGTGGACATGGCAGCACAGGTGGCTGCAGGAATGGCTTACATCGAGCGCATGA  1144

Query 1154  ATTATATCCATAGAGATCTGCGATCAGCAAACATTCTAGTGGGGAATGGACTCATATGCAAGATTGCTGACTTC  1227
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1145  ATTATATCCATAGAGATCTGCGATCAGCAAACATTCTAGTGGGGAATGGACTCATATGCAAGATTGCTGACTTC  1218

Query 1228  GGATTGGCCCGATTGATAGAAGACAATGAGTACACAGCAAGACAAGGTGCAAAGTTCCCCATCAAGTGGACGGC  1301
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1219  GGATTGGCCCGATTGATAGAAGACAATGAGTACACAGCAAGACAAGGTGCAAAGTTCCCCATCAAGTGGACGGC  1292

Query 1302  CCCCGAGGCAGCCCTGTACGGGAGGTTCACAATCAAGTCTGACGTGTGGTCTTTTGGAATCTTACTCACAGAGC  1375
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1293  CCCCGAGGCAGCCCTGTACGGGAGGTTCACAATCAAGTCTGACGTGTGGTCTTTTGGAATCTTACTCACAGAGC  1366

Query 1376  TGGTCACCAAAGGAAGAGTGCCATACCCAGGCATGAACAACCGGGAGGTGCTGGAGCAGGTGGAGCGAGGCTAC  1449
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1367  TGGTCACCAAAGGAAGAGTGCCATACCCAGGCATGAACAACCGGGAGGTGCTGGAGCAGGTGGAGCGAGGCTAC  1440

Query 1450  AGGATGCCCTGCCCGCAGGACTGCCCCATCTCTCTGCATGAGCTCATGATCCACTGCTGGAAAAAGGACCCTGA  1523
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1441  AGGATGCCCTGCCCGCAGGACTGCCCCATCTCTCTGCATGAGCTCATGATCCACTGCTGGAAAAAGGACCCTGA  1514

Query 1524  AGAACGCCCCACTTTTGAGTACTTGCAGAGCTTCCTGGAAGACTACTTTACCGCGACAGAGCCCCAGTACCAAC  1597
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1515  AGAACGCCCCACTTTTGAGTACTTGCAGAGCTTCCTGGAAGACTACTTTACCGCGACAGAGCCCCAGTACCAAC  1588

Query 1598  CTGGTGAAAACCTGG  1612
            |||||||||||||| 
Sbjct 1589  CTGGTGAAAACCTG-  1602