Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000492351
• Subject: XM_011243117.2
• Aligned Length: 1612
• Identities: 1502
• Gaps: 1

Alignment

Query    1  ATGGGCTGTGTGCAATGTAAGGATAAAGAAGCAACAAAACTGACGGAGGAGAGGGACGGCAGCCTGAACCAGAG  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCTGTGTGCAATGTAAGGATAAAGAAGCAGCGAAACTGACAGAGGAGAGGGACGGCAGCCTGAACCAGAG  74

Query   75  CTCTGGGTACCGCTATGGCACAGACCCCACCCCTCAGCACTACCCCAGCTTCGGTGTGACCTCCATCCCCAACT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct   75  CTCTGGGTACCGCTATGGCACAGACCCCACCCCTCAGCACTACCCCAGCTTCGGCGTGACCTCCATCCCGAACT  148

Query  149  ACAACAACTTCCACGCAGCCGGGGGCCAAGGACTCACCGTCTTTGGAGGTGTGAACTCTTCGTCTCATACGGGG  222
            |||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||
Sbjct  149  ACAACAACTTCCACGCAGCTGGGGGCCAGGGACTCACCGTCTTTGGGGGTGTGAACTCCTCCTCTCACACTGGG  222

Query  223  ACCTTGCGTACGAGAGGAGGAACAGGAGTGACACTCTTTGTGGCCCTTTATGACTATGAAGCACGGACAGAAGA  296
            |||.|.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  223  ACCCTACGCACGAGAGGAGGGACAGGAGTGACACTGTTTGTGGCGCTTTATGACTATGAAGCACGGACGGAAGA  296

Query  297  TGACCTGAGTTTTCACAAAGGAGAAAAATTTCAAATATTGAACAGCTCGGAAGGAGATTGGTGGGAAGCCCGCT  370
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  297  TGACCTGAGTTTTCACAAAGGAGAAAAATTTCAAATATTGAACAGCTCGGAAGGAGACTGGTGGGAAGCCCGCT  370

Query  371  CCTTGACAACTGGAGAGACAGGTTACATTCCCAGCAATTATGTGGCTCCAGTTGACTCTATCCAGGCAGAAGAG  444
            ||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  371  CCTTGACAACCGGGGAAACTGGTTACATTCCCAGCAATTACGTGGCTCCAGTTGACTCCATCCAGGCAGAAGAG  444

Query  445  TGGTACTTTGGAAAACTTGGCCGAAAAGATGCTGAGCGACAGCTATTGTCCTTTGGAAACCCAAGAGGTACCTT  518
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||..||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGGTACTTTGGAAAACTTGGCCGCAAAGATGCTGAGAGACAGCTCCTGTCCTTTGGAAACCCAAGAGGTACCTT  518

Query  519  TCTTATCCGCGAGAGTGAAACCACCAAAGGTGCCTATTCACTTTCTATCCGTGATTGGGATGATATGAAAGGAG  592
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  519  TCTTATCCGCGAGAGCGAAACCACCAAAGGTGCCTACTCACTTTCCATCCGTGATTGGGATGATATGAAAGGGG  592

Query  593  ACCATGTCAAACATTATAAAATTCGCAAACTTGACAATGGTGGATACTACATTACCACCCGGGCCCAGTTTGAA  666
            ||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct  593  ACCACGTCAAACATTATAAAATCCGCAAGCTTGACAATGGTGGATACTATATCACAACGCGGGCCCAGTTTGAA  666

Query  667  ACACTTCAGCAGCTTGTACAACATTACTCAGAGAGAGCTGCAGGTCTCTGCTGCCGCCTAGTAGTTCCCTGTCA  740
            |||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACACTTCAGCAACTGGTACAGCATTACTCAGAGAGAGCCGCAGGTCTCTGCTGCCGCCTAGTAGTTCCCTGTCA  740

Query  741  CAAAGGGATGCCAAGGCTTACCGATCTGTCTGTCAAAACCAAAGATGTCTGGGAAATCCCTCGAGAATCCCTGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAAAGGGATGCCAAGGCTTACCGATCTGTCTGTCAAAACCAAAGATGTCTGGGAAATCCCTCGAGAATCCCTGC  814

Query  815  AGTTGATCAAGAGACTGGGAAATGGGCAGTTTGGGGAAGTATGGATGGGTACCTGGAATGGAAACACAAAAGTA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  815  AGTTGATCAAGAGACTGGGAAATGGGCAGTTTGGGGAAGTATGGATGGGTACCTGGAATGGAAATACAAAAGTA  888

Query  889  GCCATAAAGACTCTTAAACCAGGCACAATGTCCCCCGAATCATTCCTTGAGGAAGCGCAGATCATGAAGAAGCT  962
            |||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCCATAAAGACCCTTAAGCCAGGCACCATGTCTCCGGAGTCCTTCCTGGAGGAGGCGCAGATCATGAAGAAGCT  962

Query  963  GAAGCACGACAAGCTGGTCCAGCTCTATGCAGTGGTGTCTGAGGAGCCCATCTACATCGTCACCGAGTATATGA  1036
            ||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct  963  GAAGCATGACAAGCTGGTGCAGCTCTACGCGGTCGTGTCTGAGGAGCCCATTTACATCGTCACGGAGTACATGA  1036

Query 1037  ACAAAGGAAGTTTACTGGATTTCTTAAAAGATGGAGAAGGAAGAGCTCTGAAATTACCAAATCTTGTGGACATG  1110
            .||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1037  GCAAAGGAAGTTTGCTTGACTTCTTAAAAGATGGTGAAGGAAGAGCTCTGAAGTTGCCAAACCTTGTGGACATG  1110

Query 1111  GCAGCACAGGTGGCTGCAGGAATGGCTTACATCGAGCGCATGAATTATATCCATAGAGATCTGCGATCAGCAAA  1184
            ||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCGGCACAGGTTGCTGCAGGAATGGCTTACATCGAGCGCATGAATTATATCCACAGAGATCTGCGATCAGCAAA  1184

Query 1185  CATTCTAGTGGGGAATGGACTCATATGCAAGATTGCTGACTTCGGATTGGCCCGATTGATAGAAGACAATGAGT  1258
            |||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct 1185  CATTCTAGTGGGGAATGGACTAATTTGCAAGATTGCTGACTTTGGATTGGCTCGGTTGATTGAAGACAATGAAT  1258

Query 1259  ACACAGCAAGACAAGGTGCAAAGTTCCCCATCAAGTGGACGGCCCCCGAGGCAGCCCTGTACGGGAGGTTCACA  1332
            |||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1259  ACACAGCAAGACAAGGTGCGAAGTTTCCCATTAAGTGGACAGCCCCCGAAGCGGCCCTGTATGGAAGGTTCACA  1332

Query 1333  ATCAAGTCTGACGTGTGGTCTTTTGGAATCTTACTCACAGAGCTGGTCACCAAAGGAAGAGTGCCATACCCAGG  1406
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATCAAGTCTGACGTATGGTCTTTTGGAATCTTACTCACAGAGCTGGTCACCAAAGGAAGAGTGCCATACCCAGG  1406

Query 1407  CATGAACAACCGGGAGGTGCTGGAGCAGGTGGAGCGAGGCTACAGGATGCCCTGCCCGCAGGACTGCCCCATCT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1407  CATGAACAACCGGGAGGTGCTGGAGCAGGTGGAGAGAGGCTATAGGATGCCCTGCCCACAGGACTGCCCGATCT  1480

Query 1481  CTCTGCATGAGCTCATGATCCACTGCTGGAAAAAGGACCCTGAAGAACGCCCCACTTTTGAGTACTTGCAGAGC  1554
            |.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||||||||||||.||
Sbjct 1481  CCCTGCACGAGCTCATGATCCACTGCTGGAAAAAGGATCCGGAAGAGCGCCCGACCTTCGAGTACTTGCAGGGC  1554

Query 1555  TTCCTGGAAGACTACTTTACCGCGACAGAGCCCCAGTACCAACCTGGTGAAAACCTGG  1612
            ||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||| 
Sbjct 1555  TTCCTGGAGGACTACTTTACGGCCACAGAGCCCCAGTATCAGCCCGGTGAAAACCTG-  1611