Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_00016
- Subject:
- XM_006515389.2
- Aligned Length:
- 2821
- Identities:
- 2032
- Gaps:
- 362
Alignment
Query 1 ATGGTGGACTACCACGCGGCGAACCAGTCGTACCAGTACGGCCCCAGCAGCGCGGGCAATGGCGCTGGCGGCGG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GGGCAGCATGGGCGACTACATGGCCCAGGAGGACGACTGGGACCGGGACCTGCTGCTGGACCCGGCCTGGGAGA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AGCAGCAGCGCAAGACCTTCACGGCATGGTGCAACTCCCACCTGCGGAAGGCAGGCACACAGATCGAGAACATT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GATGAGGACTTCCGAGACGGGCTCAAGCTCATGCTGCTCCTGGAGGTCATATCAGGGGAGCGGTTACCTAAGCC 296
||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||..|.|||||
Sbjct 1 ------------------------------ATGCTGCTCCTGGAGGTCATCTCAGGTGAACGCTTGGCCAAGCC 44
Query 297 GGAGCGGGGGAAGATGAGAGTGCACAAAATCAACAATGTGAACAAAGCGCTGGACTTTATTGCCAGCAAAGGCG 370
.|||.|.||.|||||||||||||||||.|||..|||.||.|||||.||..||||.||.||.|||||||||||.|
Sbjct 45 AGAGAGAGGCAAGATGAGAGTGCACAAGATCTCCAACGTCAACAAGGCCTTGGATTTCATAGCCAGCAAAGGGG 118
Query 371 TCAAGCTGGTCTCCATCGGGGCAGAAGAGATTGTGGACGGCAACGCAAAGATGACCCTGGGAATGATCTGGACC 444
||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.||.|..||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 119 TCAAGCTGGTGTCCATCGGAGCTGAAGAAATTGTGGATGGGAATGTGAAGATGACCCTGGGCATGATCTGGACC 192
Query 445 ATCATCCTTAGGTTCGCCATCCAGGACATCTCCGTGGAAGAGACCTCGGCCAAGGAAGGGCTCCTTCTCTGGTG 518
|||||.||..|.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||.|.||.||.|||||
Sbjct 193 ATCATTCTCCGCTTTGCCATCCAGGACATCTCCGTGGAAGAGACTTCAGCTAAAGAAGGGTTACTCCTGTGGTG 266
Query 519 CCAGAGAAAGACAGCCCCGTATAAGAACGTCAATGTGCAGAACTTCCACATCAGCTGGAAGGATGGTCTTGCCT 592
.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||..|.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||..|
Sbjct 267 TCAGAGGAAGACAGCCCCATATAAAAATGTCAACATCCAAAACTTCCACATCAGTTGGAAAGATGGTCTTGGTT 340
Query 593 TCAATGCCCTGATCCACCGGCACAGACCAGAGCTGATTGAGTATGACAAGCTGAGGAAGGACGACCCTGTCACC 666
||..||||.||||||||||.|||.|.||.|||.|||||||.||||..|||||..|.|||||.||.||..||||.
Sbjct 341 TCTGTGCCTTGATCCACCGACACCGGCCCGAGTTGATTGACTATGGAAAGCTTCGAAAGGATGATCCACTCACA 414
Query 667 AACCTGAACAATGCCTTCGAAGTGGCTGAGAAATACCTCGACATCCCCAAGATGCTGGATGCAGAGGACATCGT 740
||||||||||..|||||.||.|||||.||||..|.|||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 415 AACCTGAACACGGCCTTTGATGTGGCAGAGAGGTTCCTGGACATCCCTAAGATGCTGGATGCTGAAGACATCGT 488
Query 741 --GAACACGGCCCGGCCCGACGAGAAGGCCATAATGACCTATGTGTCCAGCTTCTACCATGCCTTTTCAGGAGC 812
|| ||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||
Sbjct 489 CGGA--ACTGCCCGGCCAGATGAGAAAGCCATTATGACTTATGTGTCTAGCTTCTATCATGCCTTCTCTGGAGC 560
Query 813 GCAGAAGGCTGAAACTGCCGCCAACCGGATCTGTAAGGTGCTGGCTGTCAACCAAGAGAACGAGCACCTGATGG 886
.||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||.|||.||||.|||||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct 561 CCAGAAGGCAGAAACAGCAGCCAATCGCATCTGCAAAGTGTTGGCGGTCAATCAAGAGAACGAGCAGCTTATGG 634
Query 887 AGGACTACGAGAAGCTGGCCAGCGACCTCCTGGAGTGGATCCGGCGCACCATCCCCTGGCTGGAGGACCGTGTG 960
|.|||||.||||||||||||||.||.||..|||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|.||.|||
Sbjct 635 AAGACTATGAGAAGCTGGCCAGTGATCTGTTGGAGTGGATCCGCCGCACCATCCCATGGCTGGAGAATCGGGTG 708
Query 961 CCCCAAAAGACTATCCAGGAGATGCAGCAGAAGCTGGAGGACTTCCGCGACTACCGGCGTGTGCACAAGCCGCC 1034
||..|.||.||.||.||.|..||||||||||||||||||||||||||.|||||..|.||..|||||||||||||
Sbjct 709 CCTGAGAACACCATGCATGCCATGCAGCAGAAGCTGGAGGACTTCCGAGACTATAGACGCCTGCACAAGCCGCC 782
Query 1035 CAAGGTGCAGGAGAAGTGCCAGCTGGAGATCAACTTCAACACGCTGCAGACCAAGCTGCGCCTCAGCAACCGGC 1108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 783 CAAGGTGCAGGAGAAGTGCCAGCTGGAGATCAACTTTAACACGCTGCAGACCAAGCTGCGGCTCAGCAACCGGC 856
Query 1109 CCGCCTTCATGCCCTCCGAGGGCAAGATGGTCTCGGACATCAACAATGGCT--GGCAGCACTTGGAGCAGGCTG 1180
|.||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||.|| |||.| |.||||.|||||.|
Sbjct 857 CTGCCTTCATGCCCTCCGAGGGCAGGATGGTCTCGGATATCAACAATGCCTGGGGCTG--CCTGGAACAGGCCG 928
Query 1181 AGAAGGGCTACGAGGAGTGGCTGCTGAATGAGATCCGCAGGCTGGAGCGGCTCGACCACCTGGCAGAGAAGTTC 1254
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||.||.|.|||||||||||||||||||||
Sbjct 929 AGAAGGGCTACGAGGAGTGGCTGCTGAATGAGATCCGGAGGCTAGAGAGGTTGGACCACCTGGCAGAGAAGTTC 1002
Query 1255 CGGCAGAAGGCCTCCATCCACGAGGCCTGGACTGACGGGAAGGAAGCCATGCTGAAGCACCGGGACTACGAGAC 1328
||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.|||||||||||...|||...|||.||.|||||
Sbjct 1003 CGGCAGAAGGCCTCCATCCATGAAGCCTGGACGGATGGCAAAGAAGCCATGCTTCGGCAGAAGGATTATGAGAC 1076
Query 1329 GGCCACACTATCGGACATCAAAGCC---CTCATTCGCAAGCACGAGGCCTTCGAGAGCGACCTGGCTGCGCACC 1399
.|||||.||.||.||.|||||.||| |||| ..|||||||||||.||.|||||.||.||||||||.||||
Sbjct 1077 AGCCACCCTGTCCGAGATCAAGGCCTTGCTCA---AGAAGCACGAGGCTTTTGAGAGTGATCTGGCTGCCCACC 1147
Query 1400 AGGACCGCGTGGAGCAGATCGCCGCCATTGCCCAGGAGCTCAACGAGCTGGATTACTACGACTC-CCACAATGT 1472
|||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||| ||| |.|||
Sbjct 1148 AGGACCGCGTGGAGCAGATTGCGGCCATTGCCCAGGAGCTTAATGAGCTGGACTACTATGACTCGCCA-AGTGT 1220
Query 1473 CAACACCCGGTGCCAGAAGATCTGTGACCAGTGGGACGCCCTCGGCTCTCTGACACATAGTCGCAGGGAAGCCC 1546
||||.|.||.|||||.|||||||||||||||||||||...||.||..||||.||.||.|..||.||||||||..
Sbjct 1221 CAACGCTCGTTGCCAAAAGATCTGTGACCAGTGGGACAATCTAGGGGCTCTCACTCAGAAGCGGAGGGAAGCTT 1294
Query 1547 TGGAGAAAACAGAGAAGCAGCTGGAGGCCATCGACCAGCTGCACCTGGAATACGCCAAGCGCGCGGCCCCCTTC 1620
|.|||..|||||||||||.||||||..|||||||||||||..||.|.||.|||||||||.|.||.||.||||||
Sbjct 1295 TAGAGCGAACAGAGAAGCTGCTGGAAACCATCGACCAGCTCTACTTAGAGTACGCCAAGAGGGCTGCACCCTTC 1368
Query 1621 AACAACTGGATGGAGAGCGCCATGGAGGACCTCCAGGACATGTTCATCGTCCATACCATCGAGGAGATTGAGGG 1694
|||||.|||||||||.|.||||||||||||||.|||||||..||||||||.|||||||||||||||||..||||
Sbjct 1369 AACAATTGGATGGAGGGAGCCATGGAGGACCTGCAGGACACCTTCATCGTACATACCATCGAGGAGATCCAGGG 1442
Query 1695 CCTGATCTCAGCCCATGACCAGTTCAAGTCCACCCTGCCGGACGCCGATAGGGAGCGCGAGGCCATCCTGGCCA 1768
.||||.|.||||||||||.|||||||||.|||||||.|||||.||.||.|.|||||||...|||||.||||.||
Sbjct 1443 ACTGACCACAGCCCATGAGCAGTTCAAGGCCACCCTCCCGGATGCAGACAAGGAGCGCCTCGCCATTCTGGGCA 1516
Query 1769 TCCACAAGGA---GGCCCAGAGGATCGCTGAGAGCAACCACATCAAGCTGTCGGGCAGCAACCCCTACACCACC 1839
|||||||.|| |.|| |.|||||...|||.|.|.||..||||..||.|.||||.|||||||||.||.|||
Sbjct 1517 TCCACAATGAAGTGTCC---AAGATCGTCCAGACCTATCATGTCAACATGGCAGGCACCAACCCCTATACAACC 1587
Query 1840 GTCACCCCGCAAATCATCAACTCCAAGTGGGAGAAGGTGCAGCAGCTGGTGCCAAAAC----GGGACCATGCCC 1909
.||||.||.||....|||||...|||.|||||..|.||.|.||||||.||||| | |||||||.||.|
Sbjct 1588 ATCACGCCTCAGGAGATCAATGGCAAATGGGACCATGTACGGCAGCTAGTGCC----CCGGAGGGACCAGGCTC 1657
Query 1910 TCCTGGAGGAGCAGAGCAA-GCAGCAGTCCAACGAGCACCTGCGCCGCCAGTTCGCCAGC-CAGGCCAATGTTG 1981
||...|||||.|| .|||| |||||||..|||.|||...||.|||...|||||.|.| || ||.||||||||..
Sbjct 1658 TCACAGAGGAACA-TGCAAGGCAGCAGCACAATGAGAGGCTACGCAAACAGTTTGGC-GCACAAGCCAATGTCA 1729
Query 1982 TGGGGCCCTGGATCCAGACCAAGATGGAGGAGATCGGGCGCATCTCCATTGAGATGAACGGGACCCTGGAGGAC 2055
|.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|.||.||||||||||||.||||.||||||||||||
Sbjct 1730 TTGGGCCCTGGATCCAGACCAAGATGGAGGAGATTGGGAGGATTTCCATTGAGATGCACGGCACCCTGGAGGAC 1803
Query 2056 CAGCTGAGCCACCTGAAGCAGTATGA-ACGCAGCATCGTGGACTACAAGCCCAACCTGGACCTGCTGGAGCAGC 2128
||.||.|||||||||..||||||||| |.| ||||||||..|.||||||||.||..|.||||.||||||| .||
Sbjct 1804 CAACTCAGCCACCTGCGGCAGTATGAGAAG-AGCATCGTCAATTACAAGCCAAAGATTGACCAGCTGGAG-TGC 1875
Query 2129 -AGCACCAGCTCATCCAGGAGGCCCTCATCTTCGACAACAAGCACACCAACTATACCATGGAGCACATCCGCGT 2201
|.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.|.|||||||||.|||||.||
Sbjct 1876 GACCACCAGCTCATCCAGGAGGCACTTATCTTTGACAATAAGCACACCAACTACAACATGGAGCATATCCGTGT 1949
Query 2202 GGGCTGGGAGCAGCTGCTCACCACCATTGCCCGCACCATCAACGAGGTGGAGAACCAGATCCTCACCCGCGACG 2275
|||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||.||.|||||||||||||||.|.|||||.||.|
Sbjct 1950 GGGCTGGGAGCAGCTGCTCACCACCATTGCCAGGACCATCAATGAAGTGGAGAACCAGATCTTGACCCGGGATG 2023
Query 2276 CCAAGGGCATCAGCCAGGAGCAGATGCAGGAGTTCCGGGCGTCCTTCAACCACTTCGACAAGGATCATGGCGGG 2349
||||.||||||||||||||.||||||.|.||.|||||.||.||.|||||||||||.|||..||||||...|||.
Sbjct 2024 CCAAAGGCATCAGCCAGGAACAGATGAACGAATTCCGCGCCTCTTTCAACCACTTTGACCGGGATCACTCCGGC 2097
Query 2350 GCGCTGGGGCCCGAGGAGTTCAAGGCCTGCCTCATCAGCCTGGGCTACGACGTGGAGAACGACC---------- 2413
.||.||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||.||||.||.||..|.|..|||||||
Sbjct 2098 ACGTTGGGTCCCGAAGAGTTCAAAGCCTGCCTCATCAGCTTGGGTTATGATATTGGCAACGACCCCCAGAAGAA 2171
Query 2414 ----GGCA----------------------------------------------------GGGTGAGGCCGAGT 2431
|||| |||.|||||.||||
Sbjct 2172 GACGGGCATGATGGACACAGACGATTTCCGCGCCTGCCTTATCTCCATGGGTTACAACATGGGAGAGGCAGAGT 2245
Query 2432 TCAACCGCATCATGAGCCTGGTCGACCCCAACCATAGC---GGCCTTGTGACCTTCCAAGCCTTCATCGACTTC 2502
|...|||.|||||||||.|.||.|||||||||| || ||..|.|||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct 2246 TTGCCCGAATCATGAGCATTGTAGACCCCAACC---GCTTGGGGGTAGTGACGTTCCAGGCCTTCATCGACTTT 2316
Query 2503 ATGTCGCGGGAGACCACCGACACGGACACGGCTGACCAGGTCATCGCTTCCTTCAAGGTCTTAGCAGGGGACAA 2576
|||||.||.|||||..|.||.||.||.||.||.||.||||||||.||||||||||||.||.|.||.||.||.||
Sbjct 2317 ATGTCCCGAGAGACGGCAGATACTGATACTGCAGATCAGGTCATGGCTTCCTTCAAGATCCTGGCTGGAGATAA 2390
Query 2577 GAACTTCATCACAGCTGAGGAGCTGCGGAGAGAGCTGCCCCCCGACCAGGCCGAGTACTGCATCGCCCGCATGG 2650
|||.|.||||||||..||.||||||||..|.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||..|.||||
Sbjct 2391 GAATTACATCACAGAGGATGAGCTGCGCCGTGAGCTGCCCCCTGACCAAGCCGAGTACTGCATCGCAAGAATGG 2464
Query 2651 CGCCATACCAGGGCCCTGACGCCGTGCCCGGTGCCCTCGACTACAAGTCCTTCTCCACGGCCTTGTATGGCGAG 2724
|.||.|||..||||||.|||.|||||||||||||..|.|||||||.|||||||||||||||..|||||||||||
Sbjct 2465 CCCCCTACGCGGGCCCCGACTCCGTGCCCGGTGCTTTAGACTACATGTCCTTCTCCACGGCACTGTATGGCGAG 2538
Query 2725 AGCGACCTG 2733
||||||||.
Sbjct 2539 AGCGACCTC 2547